Effective results for Streptococcus cristatus ATCC 51100 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 667
- Predicted by T4SEpre: 182
- Predicted by EffectiveELD: 202 eukaryotic-like domains, contained in 547 proteins (68 high, 479 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type IV)
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
| Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
|---|---|---|---|---|---|
| 889201.HMPREF9422_1305 | + | (PF04998) (PF04983) (PF04997) (PF00623) (PF05000) | |||
| 889201.HMPREF9422_1306 | (PF04561) (PF10385) (PF04565) (PF00562) (PF04563) (PF04560) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0308 | (PF04561) (PF10385) (PF04565) (PF00562) (PF04563) (PF04560) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0307 | + | (PF04998) (PF04983) (PF04997) (PF00623) (PF05000) | |||
| 889201.HMPREF9422_0887 | (PF07517) (PF01043) (PF07516) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_1454 | (PF02272) (PF01368) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1140 | (PF14714) (PF01926) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9422_0145 | (PF03484) (PF03147) (PF01588) PF03483 | ||||
| 889201.HMPREF9422_0912 | (PF02875) (PF08245) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_0628 | (PF00679) (PF03144) (PF06421) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1346 | (PF03947) (PF00181) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1329 | + | PF00828 | mitochondrial; (mitochondrial) | ||
| 889201.HMPREF9960_1569 | (PF01926) (PF07650) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0011 | (PF00298) (PF03946) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0843 | (PF01926) (PF07650) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1996 | (PF00298) (PF03946) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1195 | (PF02272) (PF01368) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1270 | (PF14714) (PF01926) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9960_1185 | (PF01479) (PF00163) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0201 | (PF03947) (PF00181) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1874 | (PF03484) (PF03147) (PF01588) PF03483 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1465 | (PF01479) (PF00163) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0684 | (PF00679) (PF03144) (PF06421) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0261 | PF03083 | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1229 | (PF06071) (PF01926) | (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9422_0715 | + | (ER); ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0153 | PF04103 | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0394 | (PF02517) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1136 | (PF00152) (PF01336) PF02938 | ||||
| 889201.HMPREF9422_0979 | (PF00013) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0578 | (PF13793) (PF14572) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0787 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1780 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0329 | (PF00886) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_0386 | (PF00230) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0700 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1113 | (PF07517) (PF01043) (PF07516) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0307 | (PF13177) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_1444 | (PF02463) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1715 | (PF03144) (PF00679) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1711 | (PF00156) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1627 | (PF03577) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0060 | (PF00230) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1303 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1429 | (PF00013) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1420 | (PF02096) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0339 | + | (ER); ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0336 | (PF01782) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_0530 | (PF08245) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0532 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1112 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1204 | (PF02463) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0777 | (PF08245) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0288 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0914 | (PF03144) (PF00679) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0594 | (PF01016) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1581 | (PF03577) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1546 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1692 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0615 | (PF01782) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1105 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0340 | + | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_0769 | (PF02272) (PF01368) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0036 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0902 | (PF00133) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0836 | (PF03840) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0831 | (PF03577) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1170 | (PF00230) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0640 | (PF01715) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0358 | (PF01016) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_0622 | (PF00886) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_0249 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1419 | (PF01479) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1342 | PF00252 | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0321 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0929 | (PF01479) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0612 | + | (ER); ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1660 | + | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_1409 | (PF05257) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1401 | (PF05257) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_1400 | (PF02844) PF01071 (PF02843) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1407 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1350 | PF00338 | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1750 | (PF00152) (PF01336) PF02938 | ||||
| 889201.HMPREF9960_0626 | (PF08002) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1971 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0197 | PF00338 | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1483 | + | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1481 | (PF01479) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1576 | (PF03840) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0577 | (PF00453) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1399 | + | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1025 | (PF03577) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1623 | (PF02517) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1628 | (PF09154) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_0866 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0927 | + | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9422_0775 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1694 | (PF02096) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1328 | PF00344 | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1232 | (PF01479) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1499 | (PF02875) (PF08245) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0145 | (PF05257) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0146 | (PF02844) PF01071 (PF02843) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1497 | (PF03144) (PF00679) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1365 | (PF08022) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1705 | (PF13177) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1631 | (PF00230) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0309 | (PF00275) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1510 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1514 | (PF00152) (PF01336) PF02938 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1330 | (PF00327) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0776 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1558 | + | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0687 | (PF08002) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1836 | (PF02403) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1303 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0940 | (PF00156) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0706 | (PF08282) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1836 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1544 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1549 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0672 | (PF01715) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0269 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1538 | (PF02517) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_0958 | (PF02096) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1008 | + | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_0139 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0137 | (PF05257) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0194 | (PF05257) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1521 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1508 | (PF00133) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_1294 | (PF07517) (PF01043) (PF07516) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1104 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1523 | (PF07517) (PF01043) (PF07516) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0217 | (PF00327) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0218 | + | PF00828 | (mitochondrial) | ||
| 889201.HMPREF9960_0219 | PF00344 | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_0105 | (PF03644) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_1675 | + | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_1183 | (PF12051) | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0627 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0231 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_0987 | (PF08032) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1802 | PF03083 | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1800 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0851 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0936 | (PF03144) (PF00679) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1865 | PF04103 | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0205 | PF00252 | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0733 | (PF00453) | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_0848 | PF03083 | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1878 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0900 | (PF00152) (PF01336) PF02938 | ||||
| 889201.HMPREF9422_0179 | (PF02517) | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0539 | (PF02272) (PF01368) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_0354 | + | mitochondrial | |||
| 889201.HMPREF9960_0613 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_1723 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1129 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9422_1867 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_0918 | (PF00230) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1042 | (PF08022) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1732 | (PF00230) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0685 | + | ER | |||
| 889201.HMPREF9960_1798 | (PF00204) (PF00986) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1404 | (PF11987) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0400 | (PF01649) | (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9960_0862 | + | PF00572 | |||
| 889201.HMPREF9422_1246 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0678 | + | (PF16326) | |||
| 889201.HMPREF9422_0412 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0411 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_0143 | (PF01409) (PF02912) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0965 | (PF06962) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1842 | (PF05746) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1712 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1156 | + | (PF05066) | |||
| 889201.HMPREF9960_0536 | (PF01926) (PF01018) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0249 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_0176 | (PF00204) (PF00986) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0821 | (PF00152) (PF01336) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1165 | (PF00013) (PF03726) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0432 | (PF02881) (PF02978) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0585 | (PF00521) (PF03989) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1880 | (PF12368) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1422 | (PF06071) (PF01926) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1959 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0649 | (PF02272) (PF01368) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1913 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1592 | (PF00152) (PF01336) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0110 | (PF03144) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0337 | (PF00679) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1343 | PF00189 (PF07650) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1909 | (PF03144) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0744 | + | (PF13177) | |||
| 889201.HMPREF9422_0106 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0369 | (PF00521) (PF03989) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0634 | + | (PF16326) | |||
| 889201.HMPREF9422_0813 | + | (PF01336) | |||
| 889201.HMPREF9422_1408 | (PF13793) (PF14572) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1397 | (PF01029) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0376 | (PF13793) (PF14572) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1322 | (PF01196) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1323 | (PF01000) (PF01193) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1324 | + | PF00411 | |||
| 889201.HMPREF9960_0616 | (PF00152) (PF01336) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0018 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0788 | (PF03144) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0360 | + | (PF06414) | |||
| 889201.HMPREF9422_1129 | (PF01351) | (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9422_1331 | PF03719 PF00333 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1332 | PF00861 | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1337 | PF00673 PF00281 | ||||
| 889201.HMPREF9960_0774 | (PF12368) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_0462 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_1605 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1606 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_0663 | (PF02272) (PF01368) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1233 | (PF07837) (PF02971) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0809 | (PF05746) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_1300 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1788 | + | PF00572 | |||
| 889201.HMPREF9422_1010 | (PF01029) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0495 | + | (PF01336) | |||
| 889201.HMPREF9960_1835 | (PF00521) (PF03989) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0236 | (PF07837) (PF02971) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0470 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0213 | (PF00204) (PF00986) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1056 | (PF00318) | (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9422_0697 | (PF00152) (PF01336) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1792 | (PF03596) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0484 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1003 | (PF11987) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1840 | (PF00204) (PF00986) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0138 | (PF13793) (PF14572) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0225 | (PF01196) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9960_0224 | (PF01000) (PF01193) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0223 | + | PF00411 | |||
| 889201.HMPREF9960_1445 | (PF06962) | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9422_0180 | (PF00521) (PF03989) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0519 | (PF03144) (PF00009) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1258 | PF03083 | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0031 | + | (PF01509) | |||
| 889201.HMPREF9960_0210 | PF00673 PF00281 | ||||
| 889201.HMPREF9960_0216 | PF03719 PF00333 | ||||
| 889201.HMPREF9960_1989 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1271 | (PF01154) (PF08540) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0521 | (PF02881) (PF02978) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0939 | + | (ER) | |||
| 889201.HMPREF9960_0204 | PF00189 (PF07650) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0915 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1876 | (PF01409) (PF02912) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0697 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0055 | (PF00013) (PF03726) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0302 | (PF02875) (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0430 | + | (PF01509) | |||
| 889201.HMPREF9960_1654 | + | (PF06414) | |||
| 889201.HMPREF9960_1762 | + | (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9960_1053 | (PF00133) (PF13603) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0772 | (PF01926) (PF01018) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1468 | (PF09359) | (mitochondrial) | |||
| 889201.HMPREF9422_1599 | (PF00133) (PF13603) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0913 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1596 | (PF00318) | (plastid) | |||
| 889201.HMPREF9422_1912 | + | (PF13177) | |||
| 889201.HMPREF9422_1735 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1737 | (PF08544) (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1139 | (PF01154) (PF08540) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0046 | + | (PF05066) | |||
| 889201.HMPREF9960_0267 | (PF08282) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1400 | (PF02576) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1401 | (PF13184) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1405 | (PF02033) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0310 | (PF01479) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0713 | (PF01487) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0716 | (PF03714) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0158 | (PF01048) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0156 | (PF01048) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1339 | (PF08282) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0977 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0570 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_1818 | (PF05257) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0861 | PF00380 | ||||
| 889201.HMPREF9960_0866 | (PF08032) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0869 | (PF05697) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1452 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1455 | (PF03948) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1702 | (PF13331) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1706 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1144 | (PF03477) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0677 | (PF13735) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1224 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0097 | (PF00814) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0095 | (PF00814) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1414 | (PF05167) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1419 | (PF01180) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1237 | (PF00156) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0389 | (PF09154) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0880 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_1127 | (PF00343) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0362 | (PF11798) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0708 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0562 | (PF08713) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0566 | (PF04127) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0565 | (PF01268) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0982 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0597 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0892 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_1868 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1849 | (PF01029) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1845 | (PF08282) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0599 | (PF01487) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1443 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1937 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1936 | (PF01479) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1718 | (PF00162) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1714 | PF00177 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1713 | (PF00164) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1155 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1154 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0669 | (PF02517) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1548 | (PF03652) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1549 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0089 | (PF08002) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0408 | (PF01351) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0407 | (PF01926) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1933 | (PF02463) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0337 | (PF01746) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1684 | (PF05257) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0355 | (PF13155) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0609 | (PF08459) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0602 | (PF01326) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0603 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_1757 | (PF00466) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0596 | (PF00829) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0828 | (PF02229) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1140 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1891 | (PF02527) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1895 | (PF01795) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1544 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1382 | (PF06042) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1383 | (PF05491) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1163 | (PF01048) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0650 | (PF00156) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0436 | (PF00958) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0736 | (PF02224) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0349 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0342 | (PF08459) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0501 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0166 | (PF01180) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0168 | (PF00156) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0614 | (PF01746) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1102 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_1745 | PF03483 | ||||
| 889201.HMPREF9422_0767 | (PF01458) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0294 | (PF00156) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0299 | (PF03462) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0908 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0904 | (PF01479) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0834 | (PF01668) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0837 | (PF00471) | not used | |||
| 889201.HMPREF9422_0832 | (PF03848) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0839 | (PF01121) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1155 | (PF00471) | not used | |||
| 889201.HMPREF9960_1256 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1887 | (PF01048) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1556 | (PF03477) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1550 | (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1421 | (PF01195) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1427 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1950 | (PF08282) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1958 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0924 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1771 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0555 | (PF03477) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0641 | (PF01926) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1205 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0429 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0350 | (PF01326) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0356 | (PF00829) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1354 | (PF02410) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0115 | (PF01765) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1359 | (PF01588) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0629 | (PF01479) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1771 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_1773 | (PF00275) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0240 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0939 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_0248 | (PF01926) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0806 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1562 | PF02916 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1414 | (PF00156) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0444 | (PF00156) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1412 | + | ||||
| 889201.HMPREF9422_1965 | + | not used | |||
| 889201.HMPREF9422_1340 | PF00366 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1341 | (PF00831) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1344 | (PF00237) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1345 | (PF00203) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1347 | PF00276 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1348 | (PF00573) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1349 | PF00297 | ||||
| 889201.HMPREF9960_1905 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_1904 | (PF01765) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1900 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0747 | (PF01048) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0164 | (PF06042) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0163 | (PF05491) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1580 | (PF03848) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1584 | (PF02229) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1343 | (PF02367) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1349 | (PF01926) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0329 | (PF05257) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1167 | (PF08282) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1763 | (PF01926) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0254 | (PF16320) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0253 | (PF00466) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0635 | (PF13735) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1103 | (PF03652) | ||||
| 889201.HMPREF9960_1101 | (PF08245) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0763 | (PF01245) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0643 | (PF02517) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1354 | (PF16757) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1759 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0623 | (PF02517) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0624 | (PF12344) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0759 | (PF01795) | ||||
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| 889201.HMPREF9422_1278 | (PF01326) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1908 | (PF01048) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1274 | (PF01326) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1270 | + | not used | |||
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| 889201.HMPREF9422_1059 | (PF01926) | ||||
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| 889201.HMPREF9960_0698 | + | ||||
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| 889201.HMPREF9960_1506 | (PF01479) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0279 | (PF01326) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0273 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0275 | (PF01326) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0305 | (PF02517) | ||||
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| 889201.HMPREF9960_1096 | (PF03477) | ||||
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| 889201.HMPREF9422_1467 | (PF12051) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0911 | (PF01250) | ||||
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| 889201.HMPREF9422_1609 | PF01071 | ||||
| 889201.HMPREF9422_1285 | (PF01588) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1736 | (PF00288) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1049 | (PF01588) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1739 | (PF01250) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0152 | (PF01926) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1138 | (PF00368) | ||||
| 889201.HMPREF9422_1133 | (PF11798) | ||||
| 889201.HMPREF9960_0683 | (PF01479) | ||||
| 889201.HMPREF9422_0150 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0045 | + | ||||
| 889201.HMPREF9960_0384 | + |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- T4SEpre bpbAac predictions (T4SEpre_bpbAac_FinalResult.csv)
- T4SEpre psAac predictions (T4SEpre_psAac_FinalResult.csv)
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)
Genome based results
Summary
- Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
- Functional Type III secretion system: N.D.
- Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
Estimated copy number = 0 (0/0 KEGG proteins)
- Functional Type VI secretion system: N.D.
Individual results for each secretion system
Parameters:
==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================
Estimated copy number = 0 (0/0 KEGG proteins)
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