Effective results for Lentisphaera araneosa HTCC2155 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1000
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 74 eukaryotic-like domains, contained in 1000 proteins (484 high, 516 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
313628.LNTAR_17568PF00884 (PF16757) PF16347 (PF01120)ER
313628.LNTAR_05564PF06283 (PF00754) (PF08305) (PF00034)(ER)
313628.LNTAR_01687PF06283 (PF08305) (PF00034)ER; (ER)
313628.LNTAR_22334(PF07488) (PF03648) (PF07477)ER
313628.LNTAR_22819(PF07859) (PF00754) (PF13472)ER
313628.LNTAR_22364(PF07488) (PF03648) (PF07477)ER
313628.LNTAR_21580(PF00754) PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_09786PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_05684PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_17133PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_09664PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_07134PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_07224PF14707 PF00884ER
313628.LNTAR_13637PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22734PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_05614PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_01000PF14707 PF00884ER
313628.LNTAR_17148(PF00034) PF06439ER
313628.LNTAR_09761PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22709PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_19487PF14707 PF00884ER
313628.LNTAR_09691PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_23074(PF07859) (PF13472)ER
313628.LNTAR_25285PF14707 PF00884ER
313628.LNTAR_17448PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_20012(PF13290) (PF13472)ER
313628.LNTAR_05221PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_13652PF14707 PF00884ER
313628.LNTAR_16918PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22714PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22399PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_11726PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_01200PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_12066PF06283 (PF00034)ER
313628.LNTAR_11266PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_09254PF13385 (PF13287)ER
313628.LNTAR_22404PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_23114PF06283 (PF00034)ER
313628.LNTAR_11101PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_11376PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_12441(PF13287) (PF07691)ER
313628.LNTAR_21575PF06283 (PF00034)ER
313628.LNTAR_09726PF06283 (PF00754)(mitochondrial)
313628.LNTAR_22324PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_00950(PF00754) (PF01120)ER
313628.LNTAR_06719PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_25135(PF14498) (PF13229)ER
313628.LNTAR_11346PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_24521PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_24526PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_06724PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_06729PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22234PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_14652PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_18043PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_05609PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_05599(PF00754) PF00884ER
313628.LNTAR_07734PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_06809PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_09791PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_07609(PF00034) PF06439ER
313628.LNTAR_10991PF00884 PF16347ER; (ER)
313628.LNTAR_21585(PF16757) (PF01120)(mitochondrial)
313628.LNTAR_09931PF06283 (PF00034)ER
313628.LNTAR_07729PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_06834PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_07059PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22964(PF00034) PF06439ER
313628.LNTAR_22764PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_15742PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22809PF06283 (PF00754)ER
313628.LNTAR_08699PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_08529PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_24511PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_22804PF06283 (PF00754)ER
313628.LNTAR_16533PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_09484PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_11416PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_08534PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_00665(PF00034) (PF07691)ER
313628.LNTAR_00360(PF08305) (PF00034)ER
313628.LNTAR_07279PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_04546(PF00034) PF06439ER
313628.LNTAR_17113PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_17118PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_23759(PF07859) (PF01738)ER
313628.LNTAR_18278PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_09971PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_17588PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_07784PF00884 PF16347ER
313628.LNTAR_21390(PF00034) PF06439ER; (ER)
313628.LNTAR_06899(PF00034) (PF13472)ER
313628.LNTAR_22619(PF02350)(mitochondrial)
313628.LNTAR_09816PF00884ER
313628.LNTAR_22299PF03629ER
313628.LNTAR_16943PF00884ER
313628.LNTAR_16948PF06283ER
313628.LNTAR_23744PF06283ER
313628.LNTAR_22434PF00884ER; (ER)
313628.LNTAR_22439PF00884(mitochondrial)
313628.LNTAR_11041PF00884ER
313628.LNTAR_11421PF00884ER
313628.LNTAR_11191PF00884(ER)
313628.LNTAR_17863PF03629ER
313628.LNTAR_00450(PF07876)ER
313628.LNTAR_00455PF06283ER
313628.LNTAR_17918PF00884ER
313628.LNTAR_00525PF06283ER
313628.LNTAR_00030(PF01738)ER
313628.LNTAR_01030PF00884ER
313628.LNTAR_05664PF00884ER
313628.LNTAR_20072(PF00754)ER
313628.LNTAR_17138PF00884ER
313628.LNTAR_01817(PF00069)ER; (ER)
313628.LNTAR_00940PF00884ER
313628.LNTAR_12501(PF00069)ER
313628.LNTAR_20818PF06283ER
313628.LNTAR_07684PF00884ER
313628.LNTAR_07229PF00884ER
313628.LNTAR_03949(PF07859)ER
313628.LNTAR_03764PF00884ER
313628.LNTAR_06884PF00884ER
313628.LNTAR_06889PF00884(mitochondrial)
313628.LNTAR_08979(PF00754)ER
313628.LNTAR_15172(PF01223)ER
313628.LNTAR_13632PF00884ER
313628.LNTAR_03439PF00884ER
313628.LNTAR_09771PF00884ER
313628.LNTAR_19492PF03629ER
313628.LNTAR_19497(PF14498)ER
313628.LNTAR_23089(PF13472)ER
313628.LNTAR_23084(PF14498)ER
313628.LNTAR_11671PF00884(ER); ER
313628.LNTAR_17453(PF13229)(mitochondrial)
313628.LNTAR_00445PF00884ER
313628.LNTAR_15957PF13385ER
313628.LNTAR_11701(PF01738)ER
313628.LNTAR_17928(PF07859)ER
313628.LNTAR_01005PF00884ER
313628.LNTAR_05679PF00884ER
313628.LNTAR_20067(PF00754)ER
313628.LNTAR_06419PF00884ER
313628.LNTAR_05699PF00884(ER)
313628.LNTAR_17143PF00884ER
313628.LNTAR_01170PF06283ER
313628.LNTAR_25050PF03629ER
313628.LNTAR_07699PF00884ER
313628.LNTAR_21530(PF00754)ER
313628.LNTAR_07124PF00884ER
313628.LNTAR_20933(PF00034)mitochondrial; ER
313628.LNTAR_20938PF06439ER
313628.LNTAR_07344PF00884ER
313628.LNTAR_02157PF00884ER
313628.LNTAR_03939(PF03659)ER
313628.LNTAR_12396(PF00251)ER
313628.LNTAR_22639(PF05448)ER
313628.LNTAR_08909(PF09423)ER
313628.LNTAR_25315(PF13472)ER
313628.LNTAR_09766PF00884ER
313628.LNTAR_11281PF00884ER
313628.LNTAR_23894(PF00665)(mitochondrial)
313628.LNTAR_12881(PF00034)ER
313628.LNTAR_07906PF00884ER
313628.LNTAR_22414(PF13472)ER
313628.LNTAR_09504PF06283ER
313628.LNTAR_23479PF00884ER
313628.LNTAR_11061PF00884ER
313628.LNTAR_11441PF00884ER
313628.LNTAR_23099(PF13472)ER
313628.LNTAR_23094PF00884ER
313628.LNTAR_10821PF06439(mitochondrial); (plastid)
313628.LNTAR_09184PF00884ER
313628.LNTAR_08944PF00884ER
313628.LNTAR_11716PF02371mitochondrial; (mitochondrial)
313628.LNTAR_00945PF00884ER
313628.LNTAR_25190PF00884ER
313628.LNTAR_16227(PF00034)ER
313628.LNTAR_17623PF00884ER
313628.LNTAR_20017(PF13287)ER
313628.LNTAR_07114PF00884ER
313628.LNTAR_25265PF00884ER
313628.LNTAR_07209PF00884ER
313628.LNTAR_02307PF06439ER
313628.LNTAR_07204PF00884ER
313628.LNTAR_07574PF03629ER
313628.LNTAR_13437(PF00069)(mitochondrial)
313628.LNTAR_16608(PF13229)ER
313628.LNTAR_16603PF00884ER
313628.LNTAR_12096PF00884ER
313628.LNTAR_03324(PF00092)ER
313628.LNTAR_23119PF00884ER
313628.LNTAR_15557(PF00754)ER
313628.LNTAR_09756PF00884ER
313628.LNTAR_22244PF06439ER
313628.LNTAR_21590(PF01120)ER
313628.LNTAR_11271PF00884ER
313628.LNTAR_11276PF00884(ER); ER
313628.LNTAR_16598PF06439ER
313628.LNTAR_23714(PF00034)ER
313628.LNTAR_22409PF00884ER
313628.LNTAR_09539(PF13472)ER
313628.LNTAR_15737PF00884ER
313628.LNTAR_12106(PF07691)ER
313628.LNTAR_08754PF13385ER
313628.LNTAR_11126PF00884ER
313628.LNTAR_14042PF03629ER
313628.LNTAR_11721PF00884(ER); ER
313628.LNTAR_17893PF00884ER
313628.LNTAR_17898PF00884ER
313628.LNTAR_00485(PF13472)ER
313628.LNTAR_17388PF00884ER
313628.LNTAR_05456(PF00092)ER
313628.LNTAR_23029PF00884ER
313628.LNTAR_20138PF13385ER; (ER)
313628.LNTAR_06769PF00884ER
313628.LNTAR_07219PF00884ER
313628.LNTAR_21350PF06439ER
313628.LNTAR_07214PF00884ER; (ER)
313628.LNTAR_21605(PF00034)ER
313628.LNTAR_21355(PF00034)ER
313628.LNTAR_20913PF03629ER
313628.LNTAR_21175PF00884(ER)
313628.LNTAR_07104PF00884ER
313628.LNTAR_16618(PF00034)ER
313628.LNTAR_16613PF00884ER
313628.LNTAR_08614PF00884ER
313628.LNTAR_22274PF00884ER
313628.LNTAR_09746PF00884ER
313628.LNTAR_22654PF03629ER
313628.LNTAR_22874(PF01738)ER
313628.LNTAR_22879(PF05448)ER
313628.LNTAR_22659PF06439ER
313628.LNTAR_11396PF06283ER
313628.LNTAR_09529(PF00754)(mitochondrial)
313628.LNTAR_23059PF00884ER
313628.LNTAR_11131PF00884ER
313628.LNTAR_08434(PF03441)(mitochondrial)
313628.LNTAR_24114PF00884ER
313628.LNTAR_17888PF00884ER
313628.LNTAR_17398PF00884ER
313628.LNTAR_16623PF00884(mitochondrial); mitochondrial
313628.LNTAR_12296PF06283ER
313628.LNTAR_16938PF00884ER
313628.LNTAR_15227(PF01223)ER
313628.LNTAR_22644(PF13472)ER
313628.LNTAR_22464PF00884ER
313628.LNTAR_09089PF00884ER
313628.LNTAR_18188PF15508ER
313628.LNTAR_14662PF00884ER
313628.LNTAR_23599(PF00092)ER
313628.LNTAR_09469PF00884(ER); ER
313628.LNTAR_22519(PF01738)ER
313628.LNTAR_09464(PF13472)ER
313628.LNTAR_11106PF00884ER
313628.LNTAR_11036PF00884ER
313628.LNTAR_09264PF00884ER
313628.LNTAR_01352(PF13472)ER
313628.LNTAR_06164(PF01120)ER
313628.LNTAR_17743PF03629ER
313628.LNTAR_25255(PF14885)ER
313628.LNTAR_06709PF00884ER
313628.LNTAR_21375PF06439ER
313628.LNTAR_21405(PF02350)(mitochondrial)
313628.LNTAR_21570PF00884ER
313628.LNTAR_07494PF00884ER
313628.LNTAR_07499PF03629ER
313628.LNTAR_01220PF00884ER
313628.LNTAR_08126(PF07876)ER
313628.LNTAR_22075PF06439ER
313628.LNTAR_03644(PF13472)ER
313628.LNTAR_03649(PF07998)ER
313628.LNTAR_09721PF06439ER
313628.LNTAR_12911PF00884ER
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313628.LNTAR_22060(PF13229)ER
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313628.LNTAR_17128PF00884ER
313628.LNTAR_06654PF00884ER
313628.LNTAR_06879PF00884ER
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313628.LNTAR_07259PF00884ER
313628.LNTAR_13577(PF00034)ER
313628.LNTAR_19045PF00884(ER)
313628.LNTAR_19512(PF01738)ER
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313628.LNTAR_17288(PF00754)(plastid)
313628.LNTAR_21385(PF04542) PF11732
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313628.LNTAR_22419PF00884(ER)
313628.LNTAR_09189(PF13290) PF13385
313628.LNTAR_25260PF03629(mitochondrial)
313628.LNTAR_09404(PF07876)(mitochondrial)
313628.LNTAR_07109PF14707 PF00884
313628.LNTAR_03599PF00884 PF16347
313628.LNTAR_06964PF02371(mitochondrial)
313628.LNTAR_07394PF00884 PF16347
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313628.LNTAR_09644PF00884 PF16347
313628.LNTAR_09589(PF07876)(mitochondrial)
313628.LNTAR_20057(PF12831)(plastid)
313628.LNTAR_09891PF00884 PF16347not used
313628.LNTAR_22214PF00884(mitochondrial)
313628.LNTAR_16818PF02371(mitochondrial)
313628.LNTAR_11901PF02371(mitochondrial)
313628.LNTAR_23629PF14707 PF00884
313628.LNTAR_10086PF02371(mitochondrial)
313628.LNTAR_00920(PF00754) (PF01120)
313628.LNTAR_21435(PF08305) (PF00034)
313628.LNTAR_08884PF00884(mitochondrial)
313628.LNTAR_15647(PF00665)(mitochondrial)
313628.LNTAR_21215PF00884 PF16347
313628.LNTAR_06914(PF09423)(plastid)
313628.LNTAR_09489PF00884 PF16347
313628.LNTAR_17498(PF04542)(mitochondrial)
313628.LNTAR_07679PF00884(ER)
313628.LNTAR_16528PF00884 PF16347
313628.LNTAR_23299PF02371(mitochondrial)
313628.LNTAR_13582PF13385(mitochondrial)
313628.LNTAR_08824(PF01610)(mitochondrial)
313628.LNTAR_19502PF00884 PF16347
313628.LNTAR_11056(PF05598) (PF01609)
313628.LNTAR_20042PF02371(mitochondrial)
313628.LNTAR_08964PF00078
313628.LNTAR_19602PF06283
313628.LNTAR_22924PF00078
313628.LNTAR_09781PF00884
313628.LNTAR_08369(PF00069)
313628.LNTAR_22724(PF00069)
313628.LNTAR_16898(PF00069)
313628.LNTAR_11331PF00078
313628.LNTAR_07926PF02371
313628.LNTAR_15387PF13495
313628.LNTAR_11511(PF00872)
313628.LNTAR_11046(PF00069)
313628.LNTAR_18028(PF04542)
313628.LNTAR_10111(PF00665)not used
313628.LNTAR_23259PF02371
313628.LNTAR_10826(PF04542)
313628.LNTAR_03994PF02371
313628.LNTAR_00850(PF07726)
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313628.LNTAR_02217PF00078
313628.LNTAR_08719PF09138
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313628.LNTAR_03504(PF06176)
313628.LNTAR_04981(PF07726)
313628.LNTAR_16993(PF00251)
313628.LNTAR_09821(PF01609)
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313628.LNTAR_18690(PF01610)
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313628.LNTAR_19982(PF00251)
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313628.LNTAR_09951PF06439not used
313628.LNTAR_14202PF00078
313628.LNTAR_08684(PF04542)
313628.LNTAR_08689(PF00069)
313628.LNTAR_23194(PF04542)
313628.LNTAR_23354(PF00665)
313628.LNTAR_11636PF02371
313628.LNTAR_23229(PF00069)
313628.LNTAR_25345(PF04542)
313628.LNTAR_17493(PF00069)
313628.LNTAR_25340PF13385
313628.LNTAR_10451(PF00069)
313628.LNTAR_01040(PF04542)
313628.LNTAR_20623(PF00872)
313628.LNTAR_01917(PF00872)
313628.LNTAR_06459(PF00069)
313628.LNTAR_06699(PF12831)
313628.LNTAR_06694(PF04542)
313628.LNTAR_23199(PF00069)
313628.LNTAR_00630PF00339
313628.LNTAR_13487(PF01609)
313628.LNTAR_06079(PF00069)
313628.LNTAR_08839PF02371
313628.LNTAR_03754(PF11539)
313628.LNTAR_13172(PF01610)
313628.LNTAR_12376(PF00251)
313628.LNTAR_19622(PF05448)
313628.LNTAR_15182(PF04542)
313628.LNTAR_09639(PF00069)
313628.LNTAR_04996(PF04542)
313628.LNTAR_09634(PF04542)
313628.LNTAR_12196(PF05598)
313628.LNTAR_03409(PF00034)not used
313628.LNTAR_24990PF00078
313628.LNTAR_11316(PF00665)
313628.LNTAR_09549PF03629
313628.LNTAR_23349(PF00872)
313628.LNTAR_25572(PF02403)
313628.LNTAR_17483PF00078
313628.LNTAR_00475(PF01609)
313628.LNTAR_00980(PF04542)
313628.LNTAR_00500(PF00069)
313628.LNTAR_05001(PF00092)
313628.LNTAR_00690(PF04542)
313628.LNTAR_25150PF00884
313628.LNTAR_25627(PF00069)not used
313628.LNTAR_01902PF02371
313628.LNTAR_01907(PF05598)
313628.LNTAR_19322PF02371
313628.LNTAR_06689(PF00069)
313628.LNTAR_19892(PF00069)
313628.LNTAR_06664(PF05598)
313628.LNTAR_01125(PF07726)
313628.LNTAR_03189(PF13366)
313628.LNTAR_02077(PF03441)
313628.LNTAR_02764(PF04542)
313628.LNTAR_08221PF02371
313628.LNTAR_12967PF13495
313628.LNTAR_22179PF13385
313628.LNTAR_16953(PF13229)
313628.LNTAR_15282(PF00092)
313628.LNTAR_18675PF02371
313628.LNTAR_11431(PF00069)
313628.LNTAR_15602(PF07726)
313628.LNTAR_11321PF00884
313628.LNTAR_07936(PF01609)
313628.LNTAR_04006(PF00665)
313628.LNTAR_10121(PF01610)
313628.LNTAR_11186(PF00069)
313628.LNTAR_08559PF13385
313628.LNTAR_08554(PF04542)
313628.LNTAR_23249PF02371
313628.LNTAR_25562(PF02350)not used
313628.LNTAR_24818(PF00872)
313628.LNTAR_10691(PF00665)
313628.LNTAR_00465(PF01738)
313628.LNTAR_13987(PF00665)
313628.LNTAR_17618PF00078
313628.LNTAR_10586(PF04542)
313628.LNTAR_17273(PF00069)
313628.LNTAR_17053(PF04542)
313628.LNTAR_17058PF13385
313628.LNTAR_05276(PF04542)
313628.LNTAR_13372(PF01609)not used
313628.LNTAR_06279PF13495
313628.LNTAR_03884(PF01609)
313628.LNTAR_06099(PF01610)
313628.LNTAR_06094(PF01610)
313628.LNTAR_08036(PF00069)
313628.LNTAR_08031(PF04542)
313628.LNTAR_03959(PF00069)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================