Effective results for Streptosporangium roseum DSM 43021 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 1273
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 98 eukaryotic-like domains, contained in 1273 proteins (11 high, 1262 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
| Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
|---|---|---|---|---|---|
| 479432.Sros_2604 | (PF00196) (PF03704) (PF00486) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_0836 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_4208 | (PF02278) (PF08124) (PF02884) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4999 | (PF03644) (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_3784 | (PF16317) (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_2256 | (PF02278) (PF02884) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3336 | (PF00041) PF03423 | ER | |||
| 479432.Sros_7134 | (PF11721) (PF00041) | ER | |||
| 479432.Sros_1172 | (PF04542) (PF08281) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7741 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0829 | (PF03704) (PF00486) | ER | |||
| 479432.Sros_3432 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7591 | (PF00041) (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_4296 | (PF00931) (PF03704) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3384 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_3559 | (PF00041) (PF00553) | (mitochondrial); plastid | |||
| 479432.Sros_2208 | (PF00668) (PF05977) (PF13745) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_6790 | (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_2247 | (PF04542) (PF08281) | (ER) | |||
| 479432.Sros_6897 | (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0933 | (PF00041) (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_0935 | (PF00041) (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_0934 | (PF00041) (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_1025 | (PF03704) (PF00486) | ER | |||
| 479432.Sros_4464 | (PF03704) (PF00486) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_1918 | (PF02839) (PF00041) | ER | |||
| 479432.Sros_2430 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_4174 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_8724 | (PF01804) (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_6842 | (PF00668) (PF13745) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3391 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_2492 | (PF00041) (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_4874 | (PF04542) (PF08281) | (ER) | |||
| 479432.Sros_4992 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_4059 | (PF08279) | ER | |||
| 479432.Sros_6208 | (PF01494) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_1461 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_7157 | (PF01061) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7566 | (PF00553) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7565 | (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_6787 | (PF01061) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_0034 | (PF00144) | ER | |||
| 479432.Sros_1255 | (PF08281) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 479432.Sros_4557 | (PF13460) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5207 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_6414 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8158 | (PF01061) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5809 | (PF13460) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_8153 | (PF01494) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_8784 | (PF08376) | ER | |||
| 479432.Sros_7950 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4312 | (PF02225) | ER | |||
| 479432.Sros_5783 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_5782 | (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_9271 | (PF00067) | ER | |||
| 479432.Sros_3337 | PF03423 | ER | |||
| 479432.Sros_3334 | (PF00668) (PF13745) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1861 | (PF05977) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_2505 | (PF01804) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_5767 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_7113 | (PF02627) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0079 | (PF12802) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_5244 | (PF08279) | ER | |||
| 479432.Sros_7912 | (PF00754) | (ER) | |||
| 479432.Sros_7913 | (PF02322) | ER | |||
| 479432.Sros_7911 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_7914 | (PF01654) | ER | |||
| 479432.Sros_2262 | (PF13349) | ER | |||
| 479432.Sros_3800 | PF03659 | ER | |||
| 479432.Sros_4605 | (PF02322) | ER | |||
| 479432.Sros_3497 | (PF11721) | ER | |||
| 479432.Sros_7646 | (PF13460) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1396 | (PF08309) | ER | |||
| 479432.Sros_1395 | (PF08309) | ER | |||
| 479432.Sros_4416 | (PF00196) | (ER); ER | |||
| 479432.Sros_2156 | (PF12802) | (ER) | |||
| 479432.Sros_8445 | (PF01804) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_5280 | (PF12802) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7728 | (PF02983) | ER | |||
| 479432.Sros_7622 | (PF00480) (PF12802) | (ER) | |||
| 479432.Sros_4390 | (PF01804) | ER | |||
| 479432.Sros_4398 | (PF00144) | ER | |||
| 479432.Sros_5709 | (PF08352) | ER | |||
| 479432.Sros_4476 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_1117 | (PF00163) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3848 | (PF01872) | ER | |||
| 479432.Sros_8721 | (PF00144) | ER | |||
| 479432.Sros_4645 | (PF08279) | (ER); (plastid) | |||
| 479432.Sros_1589 | PF03659 | ER | |||
| 479432.Sros_2729 | (PF01494) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_3193 | (PF08376) | ER | |||
| 479432.Sros_3456 | (PF00069) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_2974 | (PF08279) | (mitochondrial); (ER) | |||
| 479432.Sros_0213 | (PF01061) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8183 | (PF02225) | ER | |||
| 479432.Sros_9294 | (PF00931) (PF00486) (PF03704) | ||||
| 479432.Sros_6746 | (PF05977) | (ER) | |||
| 479432.Sros_4216 | (PF00440) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5805 | (PF02983) | ER | |||
| 479432.Sros_3478 | (PF12802) | (ER) | |||
| 479432.Sros_2300 | (PF00196) | (ER) | |||
| 479432.Sros_3657 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_7883 | (PF14087) | ER | |||
| 479432.Sros_9106 | (PF08309) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_6166 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_2096 | (PF07702) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1678 | (PF01061) | ER | |||
| 479432.Sros_1920 | (PF02839) | ER | |||
| 479432.Sros_8916 | (PF02983) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_6952 | (PF01872) | ER | |||
| 479432.Sros_4140 | (PF08592) | ER | |||
| 479432.Sros_1313 | (PF03704) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_1544 | (PF00069) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3980 | (PF08279) | ER | |||
| 479432.Sros_7747 | (PF00440) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_3920 | PF14447 | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3696 | (PF01872) | ER | |||
| 479432.Sros_2345 | (PF03992) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5697 | (PF08352) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3599 | (PF02839) | ER | |||
| 479432.Sros_6991 | (PF02627) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_7867 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_9167 | (PF00266) | (mitochondrial); plastid | |||
| 479432.Sros_4183 | (PF01061) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_6603 | (PF01494) | ER | |||
| 479432.Sros_3034 | (PF02225) | (ER); ER | |||
| 479432.Sros_9090 | (PF07702) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5380 | (PF08326) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1775 | (PF01061) | ER | |||
| 479432.Sros_3558 | (PF02839) | ER | |||
| 479432.Sros_7257 | (PF08279) | ER | |||
| 479432.Sros_6254 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_6663 | (PF02322) | ER | |||
| 479432.Sros_3289 | (PF01494) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_0570 | (PF00144) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_8778 | (PF01494) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_4085 | (PF00440) | (mitochondrial); plastid | |||
| 479432.Sros_4089 | (PF05977) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1562 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5020 | (PF00440) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4862 | (PF03403) | ER | |||
| 479432.Sros_9330 | (PF00196) | (ER) | |||
| 479432.Sros_6210 | (PF00144) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_5326 | (PF08279) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3895 | (PF02839) | ER | |||
| 479432.Sros_6027 | (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_1240 | (PF00041) | ER | |||
| 479432.Sros_4547 | (PF02322) | ER | |||
| 479432.Sros_3791 | (PF00931) (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_5839 | (PF13565) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4308 | (PF01061) | (ER); mitochondrial | |||
| 479432.Sros_4309 | (PF01061) | ER | |||
| 479432.Sros_5792 | (PF02225) | ER | |||
| 479432.Sros_2893 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_5216 | (PF02225) | ER | |||
| 479432.Sros_2535 | (PF13460) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_6407 | (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_0356 | (PF08376) | ER | |||
| 479432.Sros_6890 | (PF00553) | (ER); ER | |||
| 479432.Sros_8791 | PF06241 | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8795 | (PF02322) | ER | |||
| 479432.Sros_8794 | (PF01654) | (ER); plastid | |||
| 479432.Sros_4368 | (PF05977) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4361 | (PF16901) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4029 | (PF00196) | (ER) | |||
| 479432.Sros_9200 | (PF01872) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_9203 | (PF00144) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_5238 | (PF13460) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8803 | (PF03403) | ER | |||
| 479432.Sros_5436 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_2166 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0452 | (PF08279) | mitochondrial; ER | |||
| 479432.Sros_0936 | (PF00553) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_7908 | (PF02839) | ER; mitochondrial | |||
| 479432.Sros_8280 | (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_5419 | (PF01494) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_5081 | (PF01061) | (ER) | |||
| 479432.Sros_4423 | (PF13565) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8630 | (PF08279) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0043 | (PF00965) | ER | |||
| 479432.Sros_4638 | (PF00440) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_4635 | (PF13565) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_6467 | (PF00144) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_0606 | (PF00144) | (mitochondrial); (ER) | |||
| 479432.Sros_2550 | (PF00144) | ER | |||
| 479432.Sros_7736 | (PF00440) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5476 | (PF12740) | ER | |||
| 479432.Sros_5719 | (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_9154 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4405 | (PF00440) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 479432.Sros_0415 | (PF07510) | ER | |||
| 479432.Sros_0977 | (PF08279) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_0625 | (PF08376) | ER | |||
| 479432.Sros_5296 | (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_8171 | (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_5452 | (PF02839) | ER | |||
| 479432.Sros_3272 | (PF00931) | ER | |||
| 479432.Sros_3279 | (PF02322) | ER | |||
| 479432.Sros_4885 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8887 | (PF05977) | mitochondrial; ER | |||
| 479432.Sros_3462 | (PF04542) (PF08281) | (ER) | |||
| 479432.Sros_1917 | (PF00553) | ER | |||
| 479432.Sros_7185 | (PF01872) | ER | |||
| 479432.Sros_2473 | (PF08352) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_2479 | (PF02983) | ER | |||
| 479432.Sros_3253 | (PF03403) | ER | |||
| 479432.Sros_4203 | (PF02225) | ER | |||
| 479432.Sros_8037 | (PF16889) | ER | |||
| 479432.Sros_3403 | (PF00163) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3408 | (PF01061) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3375 | (PF00480) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_8206 | (PF12802) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_1566 | (PF08592) | ER | |||
| 479432.Sros_7893 | PF06241 | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_0817 | (PF13349) | ER | |||
| 479432.Sros_0812 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_5375 | (PF07510) | ER | |||
| 479432.Sros_3230 | (PF13460) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4224 | (PF01872) | ER | |||
| 479432.Sros_4226 | (PF04542) (PF08281) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4221 | (PF03403) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4222 | (PF05977) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4516 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5141 | (PF03704) (PF00486) | (ER) | |||
| 479432.Sros_6172 | (PF01494) | ER | |||
| 479432.Sros_0793 | (PF02225) | ER | |||
| 479432.Sros_0247 | (PF00135) | ER | |||
| 479432.Sros_5960 | (PF01025) | ER | |||
| 479432.Sros_5968 | (PF13469) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4154 | (PF08592) | ER | |||
| 479432.Sros_3746 | (PF08592) | (ER) | |||
| 479432.Sros_2448 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_4973 | (PF00266) | mitochondrial; ER | |||
| 479432.Sros_5510 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7209 | (PF03403) | ER | |||
| 479432.Sros_6636 | (PF12740) | ER | |||
| 479432.Sros_6982 | (PF01872) | (ER) | |||
| 479432.Sros_1180 | (PF13460) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3589 | (PF05147) | ER | |||
| 479432.Sros_6846 | (PF02839) | ER | |||
| 479432.Sros_0112 | (PF00069) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 479432.Sros_7263 | (PF00069) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3395 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_3396 | (PF00754) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_0283 | (PF02839) | ER | |||
| 479432.Sros_0284 | (PF14087) | ER | |||
| 479432.Sros_8919 | (PF02983) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_8918 | (PF02983) | (ER) | |||
| 479432.Sros_8917 | (PF02983) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_8260 | (PF00480) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_8915 | (PF02983) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5398 | (PF08279) | ER | |||
| 479432.Sros_5395 | (PF13460) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3144 | (PF05977) | ER; mitochondrial | |||
| 479432.Sros_3140 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_3707 | (PF02026) | ER | |||
| 479432.Sros_3705 | (PF16889) | ER | |||
| 479432.Sros_0545 | (PF03992) | ER | |||
| 479432.Sros_1551 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_6264 | (PF00440) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_0735 | (PF03704) (PF00486) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4133 | (PF08279) | ER | |||
| 479432.Sros_2496 | (PF01494) | mitochondrial | |||
| 479432.Sros_3724 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_3727 | (PF00480) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_3723 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_4096 | (PF01872) | (ER) | |||
| 479432.Sros_2003 | (PF00754) | ER | |||
| 479432.Sros_2002 | (PF00135) | ER; (ER) | |||
| 479432.Sros_8952 | (PF02225) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
| 479432.Sros_4517 | (PF04542) (PF08281) | (ER) | |||
| 479432.Sros_2210 | (PF13460) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4851 | (PF08352) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5620 | (PF00144) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5825 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_8509 | (PF00069) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7979 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4051 | (PF00196) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0759 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_1805 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4558 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_6577 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_8781 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_7958 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_2424 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_2420 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_2069 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_6433 | (PF00069) (PF05147) | ||||
| 479432.Sros_6557 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_6558 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_1611 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4012 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5768 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_9216 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_7112 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_8480 | (PF02401) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1215 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_1211 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_0678 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_2293 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4548 | (PF01654) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_9233 | (PF13469) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5449 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4606 | (PF01636) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4604 | (PF01654) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_3636 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8855 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_1393 | (PF05221) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1173 | (PF16901) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_6700 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4254 | (PF12900) | (ER) | |||
| 479432.Sros_9374 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5284 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1945 | (PF00440) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_4397 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4643 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_1583 | (PF00480) (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_0980 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_9297 | (PF00440) | (ER) | |||
| 479432.Sros_4661 | (PF03596) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5132 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3479 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_0352 | (PF00480) (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_7885 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_5300 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5547 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_7785 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0335 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4168 | (PF13370) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_4166 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4167 | (PF00891) (PF16864) | ||||
| 479432.Sros_4165 | (PF00891) (PF16864) | ||||
| 479432.Sros_0869 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5698 | (PF08352) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5691 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_2421 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_4908 | (PF00135) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7454 | (PF00480) (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_0291 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_0844 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3571 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_8595 | (PF13469) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_7275 | (PF01636) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_5064 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_0729 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_8920 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4120 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_4127 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5383 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5325 | (PF13460) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8711 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_7258 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_0087 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3539 | (PF00480) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_5223 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8192 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_6836 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_6834 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_4701 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_2036 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_5026 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5027 | (PF00144) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_0765 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_0762 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_7514 | (PF00891) (PF16864) | ||||
| 479432.Sros_2201 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_4989 | (PF00728) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7983 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4320 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_8324 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_6028 | (PF00144) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1062 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_0530 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_0538 | PF08213 | (mitochondrial); not used | |||
| 479432.Sros_7966 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4137 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8309 | (PF07702) | (ER) | |||
| 479432.Sros_1047 | (PF08279) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5819 | (PF00480) (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_5775 | (PF08352) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_7127 | (PF02627) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_7126 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5230 | (PF02627) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8807 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8160 | (PF12802) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_3346 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_5257 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_3360 | (PF00440) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_1600 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_8740 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7652 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_1022 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3442 | (PF00069) | (ER) | |||
| 479432.Sros_7631 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_5459 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_8416 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_0193 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3468 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_7778 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3642 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_7610 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0344 | (PF13460) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_1406 | (PF00069) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_6945 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4519 | (PF00144) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8013 | (PF05977) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_2088 | (PF03704) | (ER) | |||
| 479432.Sros_3932 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_0790 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5961 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_6327 | (PF05977) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_2438 | (PF00069) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7441 | (PF00069) (PF05147) | ||||
| 479432.Sros_7442 | (PF00067) | plastid | |||
| 479432.Sros_7449 | (PF02278) (PF08124) | ||||
| 479432.Sros_5168 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_2188 | (PF00891) (PF16864) | ||||
| 479432.Sros_2180 | (PF00480) (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_2186 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_3767 | (PF00668) (PF08242) | ||||
| 479432.Sros_7072 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_8722 | (PF00196) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5531 | (PF00480) (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_0281 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3709 | (PF00067) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_4285 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_5881 | (PF00069) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_1007 | (PF05977) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_7244 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4138 | (PF01494) | (ER) | |||
| 479432.Sros_0096 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_2491 | (PF02126) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_7038 | (PF00480) | (plastid) | |||
| 479432.Sros_4451 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_4097 | (PF00440) | (ER) | |||
| 479432.Sros_5583 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_5582 | (PF00668) (PF13745) | ||||
| 479432.Sros_4872 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_3060 | (PF00728) (PF00754) | ||||
| 479432.Sros_1294 | (PF00480) (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_1038 | (PF03704) (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_3290 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_6827 | (PF00440) | (mitochondrial) | |||
| 479432.Sros_2900 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_5371 | (PF04542) (PF08281) | ||||
| 479432.Sros_9243 | (PF06441) | ||||
| 479432.Sros_4538 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_4537 | (PF03055) | ||||
| 479432.Sros_3509 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_3508 | (PF08352) | ||||
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| 479432.Sros_9120 | (PF07702) | ||||
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| 479432.Sros_5175 | (PF00440) | ||||
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| 479432.Sros_7234 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_6738 | (PF00480) | ||||
| 479432.Sros_0272 | (PF01129) | ||||
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| 479432.Sros_0275 | (PF01061) | ||||
| 479432.Sros_0279 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_8253 | (PF13370) | ||||
| 479432.Sros_0316 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5992 | (PF01061) | ||||
| 479432.Sros_7593 | (PF13349) | ||||
| 479432.Sros_4164 | (PF01494) | ||||
| 479432.Sros_1192 | (PF02575) | ||||
| 479432.Sros_1193 | (PF02575) | ||||
| 479432.Sros_0863 | (PF00144) | ||||
| 479432.Sros_8044 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5694 | (PF13580) | ||||
| 479432.Sros_5693 | (PF00144) | ||||
| 479432.Sros_6338 | (PF03070) | ||||
| 479432.Sros_7061 | (PF04542) | ||||
| 479432.Sros_7069 | (PF13370) | ||||
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| 479432.Sros_3960 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_3968 | (PF01636) | ||||
| 479432.Sros_4287 | (PF13271) | ||||
| 479432.Sros_4459 | (PF00266) | ||||
| 479432.Sros_4934 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_9334 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_3036 | (PF08352) | ||||
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| 479432.Sros_0727 | (PF00144) | ||||
| 479432.Sros_3382 | (PF00440) | ||||
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| 479432.Sros_4121 | (PF00668) | ||||
| 479432.Sros_2819 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_9099 | (PF02575) | ||||
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| 479432.Sros_5388 | (PF12802) | ||||
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| 479432.Sros_5897 | (PF00069) | ||||
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| 479432.Sros_0553 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_8714 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_1549 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_3944 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_3941 | (PF01636) | ||||
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| 479432.Sros_1057 | (PF08242) | ||||
| 479432.Sros_6255 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_0700 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_6664 | (PF05977) | ||||
| 479432.Sros_6662 | (PF01654) | ||||
| 479432.Sros_3050 | (PF13271) | ||||
| 479432.Sros_7820 | (PF07510) | ||||
| 479432.Sros_0083 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_2832 | (PF01872) | ||||
| 479432.Sros_2839 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_0883 | (PF08445) | ||||
| 479432.Sros_2488 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_6397 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_4501 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_4502 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_1023 | (PF01872) | ||||
| 479432.Sros_4508 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_3280 | (PF01654) | ||||
| 479432.Sros_9094 | (PF00728) | ||||
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| 479432.Sros_8081 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_8080 | (PF00069) | ||||
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| 479432.Sros_8085 | (PF02575) | ||||
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| 479432.Sros_6838 | (PF00668) | ||||
| 479432.Sros_2973 | (PF06441) | ||||
| 479432.Sros_5651 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_4086 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5654 | (PF01872) | ||||
| 479432.Sros_6646 | (PF01636) | ||||
| 479432.Sros_6643 | (PF13565) | ||||
| 479432.Sros_8965 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_8342 | (PF03992) | ||||
| 479432.Sros_5611 | (PF00135) | ||||
| 479432.Sros_5619 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_4698 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_1004 | (PF00266) | ||||
| 479432.Sros_3518 | (PF00144) | ||||
| 479432.Sros_3519 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_2203 | (PF00668) | ||||
| 479432.Sros_8573 | (PF01327) | ||||
| 479432.Sros_6583 | (PF00266) | ||||
| 479432.Sros_5586 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_9333 | (PF01061) | ||||
| 479432.Sros_4066 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_6211 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_2057 | (PF00440) | ||||
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| 479432.Sros_5911 | (PF08352) | ||||
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| 479432.Sros_0021 | (PF08445) | ||||
| 479432.Sros_7314 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_7316 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_5218 | (PF06441) | ||||
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| 479432.Sros_3114 | (PF07702) | ||||
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| 479432.Sros_9078 | (PF00440) | ||||
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| 479432.Sros_5235 | (PF00440) | ||||
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| 479432.Sros_6422 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_6425 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_6521 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_3175 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_3177 | (PF00144) | ||||
| 479432.Sros_3172 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_3173 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_8800 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_1995 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_4342 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_4340 | (PF03992) | ||||
| 479432.Sros_4341 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_7698 | (PF00266) | ||||
| 479432.Sros_5432 | (PF01636) | ||||
| 479432.Sros_8111 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_8110 | (PF00266) | ||||
| 479432.Sros_8117 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_8115 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_9194 | (PF13460) | not used | |||
| 479432.Sros_9190 | (PF02575) | ||||
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| 479432.Sros_5755 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_5753 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_9221 | (PF05977) | ||||
| 479432.Sros_2165 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_2167 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_3345 | (PF00668) | ||||
| 479432.Sros_3344 | (PF00668) | ||||
| 479432.Sros_3348 | (PF00668) | ||||
| 479432.Sros_0454 | (PF01636) | ||||
| 479432.Sros_0451 | (PF06441) | ||||
| 479432.Sros_8619 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_8615 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_8610 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_8116 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_7487 | (PF01494) | ||||
| 479432.Sros_9052 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_4618 | (PF06441) | ||||
| 479432.Sros_1229 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_4612 | (PF00560) | ||||
| 479432.Sros_5306 | (PF00480) | ||||
| 479432.Sros_2753 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_2751 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_6197 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_5256 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_2280 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_6442 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_6441 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_5447 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_8863 | (PF00144) | ||||
| 479432.Sros_3157 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_8861 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_3155 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_3159 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_8869 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_8868 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_7673 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_7672 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_7671 | (PF12900) | ||||
| 479432.Sros_8286 | (PF13349) | ||||
| 479432.Sros_8134 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5731 | (PF01636) | ||||
| 479432.Sros_5089 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5083 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_6292 | (PF00480) | ||||
| 479432.Sros_1417 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_1412 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_3369 | (PF06032) | ||||
| 479432.Sros_3365 | (PF06032) | ||||
| 479432.Sros_3812 | (PF13580) | ||||
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| 479432.Sros_0041 | (PF13349) | ||||
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| 479432.Sros_2030 | (PF01636) | ||||
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| 479432.Sros_6179 | (PF08352) | ||||
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| 479432.Sros_2085 | (PF08352) | ||||
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| 479432.Sros_1682 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_1684 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_5353 | (PF00440) | ||||
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| 479432.Sros_7444 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_7445 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_5515 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_5166 | (PF04542) | ||||
| 479432.Sros_6155 | (PF12900) | ||||
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| 479432.Sros_4744 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_1515 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_7206 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_7207 | (PF08352) | ||||
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| 479432.Sros_6983 | (PF00067) | ||||
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| 479432.Sros_4172 | (PF03992) | ||||
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| 479432.Sros_4178 | (PF00067) | ||||
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| 479432.Sros_2189 | (PF01494) | ||||
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| 479432.Sros_3766 | (PF00668) | ||||
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| 479432.Sros_7460 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_5532 | (PF02585) | ||||
| 479432.Sros_5537 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_8728 | (PF02627) | ||||
| 479432.Sros_0111 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_1539 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_1535 | (PF03055) | ||||
| 479432.Sros_3973 | (PF02627) | ||||
| 479432.Sros_2549 | (PF01061) | ||||
| 479432.Sros_3191 | PF03936 | ||||
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| 479432.Sros_4115 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_9083 | (PF02627) | ||||
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| 479432.Sros_3564 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_8859 | (PF01061) | ||||
| 479432.Sros_5560 | (PF07702) | ||||
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| 479432.Sros_4280 | (PF01636) | ||||
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| 479432.Sros_1001 | (PF07702) | ||||
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| 479432.Sros_1559 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_5800 | (PF00196) | ||||
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| 479432.Sros_8931 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_8930 | (PF08352) | ||||
| 479432.Sros_8935 | (PF01061) | ||||
| 479432.Sros_0093 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_0091 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_6079 | (PF05977) | ||||
| 479432.Sros_0898 | (PF04542) | ||||
| 479432.Sros_0895 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_2497 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_6384 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_3541 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_7386 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_7380 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_7034 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_2239 | (PF07510) | ||||
| 479432.Sros_3081 | (PF13580) | ||||
| 479432.Sros_8769 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_8099 | (PF02575) | ||||
| 479432.Sros_8764 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_6806 | (PF00486) | ||||
| 479432.Sros_6800 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_0156 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_0154 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_4093 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_4095 | (PF08279) | ||||
| 479432.Sros_1579 | (PF00069) | ||||
| 479432.Sros_2008 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_2000 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5054 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_2005 | (PF02126) | ||||
| 479432.Sros_2004 | (PF02126) | ||||
| 479432.Sros_0718 | (PF07702) | ||||
| 479432.Sros_4875 | (PF13474) | ||||
| 479432.Sros_4879 | (PF00135) | ||||
| 479432.Sros_3063 | (PF00480) | ||||
| 479432.Sros_3061 | (PF00480) | ||||
| 479432.Sros_7526 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_2820 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_2824 | (PF01327) | ||||
| 479432.Sros_5606 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5601 | (PF01327) | ||||
| 479432.Sros_2923 | (PF03070) | ||||
| 479432.Sros_5608 | (PF01139) | ||||
| 479432.Sros_1039 | (PF01494) | ||||
| 479432.Sros_3524 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_3293 | (PF03992) | ||||
| 479432.Sros_4471 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_4473 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_0508 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_0503 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_8744 | (PF00067) | ||||
| 479432.Sros_4071 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_4073 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_4076 | (PF00144) | ||||
| 479432.Sros_5038 | (PF01636) | ||||
| 479432.Sros_5035 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_5033 | (PF13565) | ||||
| 479432.Sros_2022 | (PF01494) | ||||
| 479432.Sros_0773 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_1821 | (PF08376) | ||||
| 479432.Sros_5623 | (PF00440) | ||||
| 479432.Sros_5626 | (PF13460) | ||||
| 479432.Sros_6032 | (PF00196) | ||||
| 479432.Sros_9024 | (PF12802) | ||||
| 479432.Sros_4685 | (PF13565) | ||||
| 479432.Sros_4684 | (PF12900) |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)
Genome based results
Summary
- Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
- Functional Type III secretion system: N.D.
- Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
- Functional Type VI secretion system: N.D.
Individual results for each secretion system
Parameters:
==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================
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