Effective results for Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 634
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 55 eukaryotic-like domains, contained in 634 proteins (18 high, 616 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
350058.Mvan_1762(PF07517) (PF07516) (PF01043)mitochondrial
350058.Mvan_1385(PF00702) (PF00122)ER
350058.Mvan_1112(PF13276) (PF00665)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_2903(PF06974) (PF03007)ER; (ER)
350058.Mvan_1375(PF00689) (PF00702) (PF00122)(mitochondrial)
350058.Mvan_2013(PF00743)(ER)
350058.Mvan_2012(PF00355)ER
350058.Mvan_1439(PF01083)ER
350058.Mvan_4151(PF02405)(mitochondrial)
350058.Mvan_1388(PF00689) (PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_1651(PF00689) (PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_0268(PF03073)(ER)
350058.Mvan_0267(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_4364(PF00589)mitochondrial
350058.Mvan_3810(PF00689) (PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_3105(PF01083)ER
350058.Mvan_3241(PF03596)ER
350058.Mvan_3245(PF04191)ER
350058.Mvan_4111(PF02405)(mitochondrial)
350058.Mvan_2415(PF00665)(mitochondrial); (plastid)
350058.Mvan_3162(PF07517) (PF07516) (PF01043)
350058.Mvan_0921(PF02405)(mitochondrial)
350058.Mvan_0923(PF02470)ER
350058.Mvan_0922(PF02470)ER
350058.Mvan_0925(PF02470)ER
350058.Mvan_0924(PF02470)(ER)
350058.Mvan_0927(PF02470)ER
350058.Mvan_0926(PF02470)ER
350058.Mvan_5525(PF00067)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_0499(PF02405)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_4147(PF02470)ER
350058.Mvan_0944(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_1648(PF00689) (PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_2218(PF02727) (PF02728) (PF01179)
350058.Mvan_0960(PF02470)ER
350058.Mvan_0963(PF02470)ER
350058.Mvan_0962(PF02470)ER
350058.Mvan_0367(PF02470)ER
350058.Mvan_0366(PF02470)ER
350058.Mvan_0365(PF02470)ER; (ER)
350058.Mvan_0364(PF02470)ER
350058.Mvan_0363(PF02470)ER
350058.Mvan_0361(PF02405)(mitochondrial)
350058.Mvan_0368(PF02470)ER
350058.Mvan_1581(PF00355)(mitochondrial)
350058.Mvan_3984(PF02405)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_3982(PF02470)ER
350058.Mvan_3980(PF02470)(ER)
350058.Mvan_3981(PF02470)ER
350058.Mvan_1776(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_1111(PF13276)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_1283(PF01083)ER
350058.Mvan_3663(PF04191)ER
350058.Mvan_5935(PF00589) PF02899(plastid)
350058.Mvan_5937(PF00589) PF02899(plastid)
350058.Mvan_3476(PF06742)ER
350058.Mvan_3642(PF03596)ER
350058.Mvan_4600(PF02470)ER
350058.Mvan_4601(PF02470)ER
350058.Mvan_4602(PF02470)ER
350058.Mvan_4604(PF02470)ER
350058.Mvan_4605(PF02405)(mitochondrial)
350058.Mvan_0854(PF09995)(ER)
350058.Mvan_0478(PF00589) PF02899(plastid)
350058.Mvan_4599(PF02470)ER
350058.Mvan_3904(PF00589) PF02899(plastid)
350058.Mvan_3685(PF04191)ER
350058.Mvan_0544(PF00106)ER; mitochondrial
350058.Mvan_5642(PF01083)ER
350058.Mvan_2853(PF02470)ER
350058.Mvan_2852(PF02470)ER
350058.Mvan_0515(PF02470)ER; (ER)
350058.Mvan_0516(PF02470)ER
350058.Mvan_0517(PF02470)ER
350058.Mvan_0518(PF02470)ER
350058.Mvan_1924(PF01083)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_4378(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_4149(PF02470)ER
350058.Mvan_4148(PF02470)ER
350058.Mvan_4146(PF02470)mitochondrial
350058.Mvan_4145(PF02470)ER
350058.Mvan_1642(PF00106)(mitochondrial); mitochondrial
350058.Mvan_3864(PF00355)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_4914(PF01073)(mitochondrial)
350058.Mvan_0136(PF02470)ER
350058.Mvan_0137(PF02470)(mitochondrial)
350058.Mvan_0135(PF02470)ER
350058.Mvan_0138(PF02470)ER
350058.Mvan_0139(PF02470)ER
350058.Mvan_3230(PF12762)ER
350058.Mvan_2884(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_3177(PF12762)ER
350058.Mvan_4224(PF06974) (PF03007)(ER)
350058.Mvan_0958(PF02405)(mitochondrial); (plastid)
350058.Mvan_3634(PF01022)(mitochondrial)
350058.Mvan_3407(PF02727) (PF02728) (PF01179)
350058.Mvan_4501(PF04191)ER
350058.Mvan_1764(PF06974) (PF03007)(plastid)
350058.Mvan_1595(PF02405)mitochondrial
350058.Mvan_1598(PF07517) (PF07516) (PF01043)
350058.Mvan_3382(PF03073)mitochondrial
350058.Mvan_4398(PF02470)ER; (ER)
350058.Mvan_4399(PF02470)ER
350058.Mvan_4396(PF02470)ER
350058.Mvan_4394(PF02470)ER
350058.Mvan_4395(PF02470)ER
350058.Mvan_1441(PF01083)(ER)
350058.Mvan_1440(PF01083)(mitochondrial)
350058.Mvan_1543(PF12762)ER
350058.Mvan_0466(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_4400(PF02405)mitochondrial
350058.Mvan_2346(PF10604)(mitochondrial)
350058.Mvan_3939(PF04191)ER
350058.Mvan_5199(PF02470)ER
350058.Mvan_5198(PF02470)ER
350058.Mvan_5197(PF02470)ER
350058.Mvan_3344(PF01083)ER
350058.Mvan_5203(PF02405)mitochondrial; (mitochondrial)
350058.Mvan_5202(PF02470)ER
350058.Mvan_5201(PF02470)ER
350058.Mvan_5651(PF01744)ER
350058.Mvan_3977(PF02470)ER
350058.Mvan_3979(PF02470)ER
350058.Mvan_3978(PF02470)ER
350058.Mvan_5793(PF01083)ER; (ER)
350058.Mvan_1493(PF00106)mitochondrial
350058.Mvan_3896(PF00589) PF02899(plastid)
350058.Mvan_2851(PF02470)ER
350058.Mvan_2850(PF02405)(mitochondrial)
350058.Mvan_2855(PF02470)ER
350058.Mvan_2854(PF02470)ER
350058.Mvan_5804(PF01083)ER
350058.Mvan_5863(PF00689) (PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_0501(PF02470)ER
350058.Mvan_0500(PF02470)ER
350058.Mvan_0247(PF09995)(mitochondrial)
350058.Mvan_3727(PF01022)(ER)
350058.Mvan_3720(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_0525(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_3729(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_4962(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_4104(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_3740(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_3741(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_4065(PF13401)(plastid)
350058.Mvan_3101(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_3108(PF00067)(plastid)
350058.Mvan_3242(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_0908(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_1692(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_4922(PF01113)mitochondrial
350058.Mvan_2897(PF00106)(plastid)
350058.Mvan_0306(PF00665)(mitochondrial)
350058.Mvan_1955(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_4981(PF01113)(mitochondrial)
350058.Mvan_4980(PF01113)(mitochondrial)
350058.Mvan_4989(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_3601(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_1113(PF00589) PF02899
350058.Mvan_2253(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_5939(PF00589)(ER)
350058.Mvan_4415(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_3641(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_1531(PF00665)(plastid)
350058.Mvan_0555(PF13401)(mitochondrial)
350058.Mvan_4603(PF02470)(ER)
350058.Mvan_5973(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_0455(PF00589) PF02899
350058.Mvan_3681(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_0575(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_0572(PF13401)(mitochondrial)
350058.Mvan_0571(PF13518) (PF00665)
350058.Mvan_5060(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_4213(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_4184(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_5853(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_4722(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_0533(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_0116(PF00441)(ER)
350058.Mvan_4910(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_1091(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_4760(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_0134(PF02470)(ER)
350058.Mvan_0133(PF02405)(mitochondrial)
350058.Mvan_3589(PF00589) PF02899
350058.Mvan_0488(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_4103(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_1689(PF13401)(mitochondrial)
350058.Mvan_1688(PF13518) (PF00665)
350058.Mvan_0482(PF00665)(mitochondrial)
350058.Mvan_4319(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_2207(PF00589) PF02899
350058.Mvan_2147(PF00589) PF02899
350058.Mvan_5497(PF00589) PF02899
350058.Mvan_2928(PF13518) (PF00665)
350058.Mvan_2927(PF13401)(mitochondrial)
350058.Mvan_1012(PF00106)plastid
350058.Mvan_4449(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_0492(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_3427(PF00743)(ER)
350058.Mvan_0512(PF00589) PF02899
350058.Mvan_3678(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_3677(PF03625)(plastid)
350058.Mvan_3670(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_3659(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_2522(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_0675(PF00067)(ER)
350058.Mvan_0463(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_5773(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_5418(PF00589) PF02899
350058.Mvan_5411(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_2501(PF13518) (PF00665)
350058.Mvan_2502(PF13401)(mitochondrial)
350058.Mvan_2345(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_1065(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_0444(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_5193(PF00106)plastid
350058.Mvan_3700(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_0583(PF13276) (PF00665)
350058.Mvan_5200(PF02470)(ER)
350058.Mvan_4654(PF00665)(plastid)
350058.Mvan_0546(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_4076(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_0539(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_4190(PF00848) (PF00355)
350058.Mvan_1615(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_0228(PF06974) (PF03007)
350058.Mvan_4881(PF00106)(mitochondrial)
350058.Mvan_0506(PF01022)(mitochondrial)
350058.Mvan_0505(PF00702) (PF00122)
350058.Mvan_3281(PF00589) PF02899
350058.Mvan_2016(PF02958)
350058.Mvan_4150(PF02470)
350058.Mvan_4152(PF02405)
350058.Mvan_4961(PF13738)
350058.Mvan_4960(PF00106)
350058.Mvan_3269(PF00589)
350058.Mvan_3267(PF00872)
350058.Mvan_3264(PF00665)
350058.Mvan_2600(PF00441)
350058.Mvan_2601(PF00441)
350058.Mvan_2604(PF13622)
350058.Mvan_4159(PF13459)
350058.Mvan_0265(PF00441)
350058.Mvan_2034(PF00106)
350058.Mvan_2031(PF00067)
350058.Mvan_4179(PF13459)
350058.Mvan_4176(PF13459)
350058.Mvan_4175(PF00067)
350058.Mvan_4170(PF13459)
350058.Mvan_3747(PF00589)
350058.Mvan_3742(PF01527)
350058.Mvan_1962(PF06742)
350058.Mvan_3819(PF01022)
350058.Mvan_0106(PF00106)
350058.Mvan_0104(PF04072)
350058.Mvan_3107(PF04072)
350058.Mvan_3109(PF13738)
350058.Mvan_3243(PF01022)
350058.Mvan_6051(PF00106)
350058.Mvan_2198(PF13622)
350058.Mvan_1269(PF00441)
350058.Mvan_1519(PF13738)
350058.Mvan_2974(PF12471)
350058.Mvan_2975(PF07958)
350058.Mvan_0906(PF00441)
350058.Mvan_5506(PF01022)
350058.Mvan_4115(PF13459)
350058.Mvan_1476(PF00441)
350058.Mvan_1691(PF01527)
350058.Mvan_4007(PF00441)
350058.Mvan_1998(PF00441)
350058.Mvan_1997(PF00441)
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350058.Mvan_4205(PF00441)
350058.Mvan_4200(PF00441)
350058.Mvan_1826(PF03625)
350058.Mvan_4671(PF00441)
350058.Mvan_1008(PF13622)
350058.Mvan_0753(PF00106)
350058.Mvan_0203(PF03055)
350058.Mvan_0758(PF10604)
350058.Mvan_3719(PF01527)
350058.Mvan_3322(PF09995)
350058.Mvan_3323(PF00441)
350058.Mvan_3324(PF00106)
350058.Mvan_0982(PF00106)
350058.Mvan_2059(PF13738)
350058.Mvan_4191(PF00106)
350058.Mvan_0690(PF00106)
350058.Mvan_1954(PF01527)
350058.Mvan_2873(PF00106)
350058.Mvan_2875(PF00441)
350058.Mvan_2876(PF00441)
350058.Mvan_5264(PF00106)
350058.Mvan_0738(PF04072)
350058.Mvan_0226(PF00441)
350058.Mvan_0221(PF00441)
350058.Mvan_4880(PF00067)
350058.Mvan_2070(PF00106)
350058.Mvan_2825(PF13622)
350058.Mvan_0504(PF03625)
350058.Mvan_4940(PF03055)
350058.Mvan_0245(PF00067)
350058.Mvan_0246(PF00067)
350058.Mvan_0243(PF13401)
350058.Mvan_5849(PF13459)
350058.Mvan_5844(PF13452)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================