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Effective results for Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 254
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 48 eukaryotic-like domains, contained in 254 proteins (46 high, 208 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
485916.Dtox_0559PF14478 (PF00395)ER
485916.Dtox_1972PF12733 PF14478ER
485916.Dtox_1963PF14478 (PF00395)ER
485916.Dtox_2889PF12733 PF03442ER
485916.Dtox_0747(PF13565) (PF13358)mitochondrial
485916.Dtox_1981PF12733 PF14478ER
485916.Dtox_3489(PF13290) (PF00395)ER
485916.Dtox_0436(PF13290) (PF00395)ER
485916.Dtox_3495(PF13287) (PF00395)ER
485916.Dtox_0422PF03442 (PF00395)ER
485916.Dtox_1827(PF13290) (PF00395)ER
485916.Dtox_2681(PF00395)ER
485916.Dtox_2425PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_3552PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_1833PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_1831PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_4323PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_1979PF14478(mitochondrial); mitochondrial
485916.Dtox_0149PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_0560PF14478ER
485916.Dtox_3301(PF01609)(mitochondrial)
485916.Dtox_2546(PF02694)ER
485916.Dtox_2545(PF02694)ER
485916.Dtox_2897PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_3546(PF02694)ER
485916.Dtox_1965PF14478ER
485916.Dtox_1961(PF00395)ER
485916.Dtox_0796(PF00037)(mitochondrial)
485916.Dtox_0623PF03442ER
485916.Dtox_0800(PF01184)(ER); ER
485916.Dtox_1998(PF04286)ER
485916.Dtox_3843(PF00395)ER
485916.Dtox_1982(PF00395)ER; (ER)
485916.Dtox_1987PF14478ER
485916.Dtox_3582(PF00395)ER; (ER)
485916.Dtox_3696PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_3928PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_2533(PF02694)ER
485916.Dtox_3267(PF00395)ER
485916.Dtox_0918(PF01930)ER
485916.Dtox_3919PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_3464PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_3710(PF01609)(mitochondrial)
485916.Dtox_3719PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_0618(PF00395)ER
485916.Dtox_1524(PF00239)mitochondrial; (mitochondrial)
485916.Dtox_2500(PF01609)(mitochondrial)
485916.Dtox_2505PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_0921PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_3900(PF01609)(mitochondrial)
485916.Dtox_3478(PF00395)ER
485916.Dtox_3493PF12733ER
485916.Dtox_3496(PF13287)ER
485916.Dtox_3498(PF00395)ER
485916.Dtox_2888PF12733(mitochondrial); (plastid)
485916.Dtox_1894PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_0410(PF00395)ER
485916.Dtox_1277(PF00037)(ER)
485916.Dtox_4146(PF00395)ER
485916.Dtox_4147(PF00395)mitochondrial
485916.Dtox_2803(PF00037)(mitochondrial)
485916.Dtox_3281PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_2943(PF01609)(mitochondrial)
485916.Dtox_4157(PF00395)(ER)
485916.Dtox_1450PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_2014(PF00395)ER
485916.Dtox_2015(PF00395)ER
485916.Dtox_2238PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_2908PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_4160(PF00395)ER
485916.Dtox_0089(PF00395)ER
485916.Dtox_0675(PF00395)ER
485916.Dtox_0523(PF01609)(mitochondrial)
485916.Dtox_2030PF13551 PF13592 (PF13358)
485916.Dtox_3985(PF00395)ER
485916.Dtox_3986(PF00395)ER
485916.Dtox_3982(PF00395)ER
485916.Dtox_3763(PF03951)ER
485916.Dtox_1823(PF01609)(mitochondrial)
485916.Dtox_1634(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_1372(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_0147(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_1145(PF03692)(mitochondrial)
485916.Dtox_1966(PF02361)(mitochondrial)
485916.Dtox_3946PF03727 PF00349
485916.Dtox_1353(PF00037)(ER)
485916.Dtox_0168(PF02906) (PF02256)
485916.Dtox_3926(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_0172(PF02906) (PF02256)
485916.Dtox_2531(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_3484(PF00395)(ER)
485916.Dtox_4287(PF01930)(ER)
485916.Dtox_2472(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_2513(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_3734(PF02361)(mitochondrial)
485916.Dtox_1651(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_1479(PF00395)(mitochondrial)
485916.Dtox_1043(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_3829(PF02256) (PF02906)
485916.Dtox_3530(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_1902(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_1423(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_0080(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_1606(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_1603(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_1852(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_1859(PF13565) (PF13358)
485916.Dtox_0079(PF03460) (PF01077)
485916.Dtox_1626(PF01609)
485916.Dtox_0532(PF00037)not used
485916.Dtox_1557(PF02915)
485916.Dtox_1558(PF01880)
485916.Dtox_2689(PF12323)
485916.Dtox_2754(PF12323)
485916.Dtox_3525(PF03692)
485916.Dtox_2974(PF01930)
485916.Dtox_3574(PF13534)
485916.Dtox_4318(PF03951)
485916.Dtox_3887(PF04383)
485916.Dtox_3882(PF01609)
485916.Dtox_3883(PF04383)
485916.Dtox_3150(PF00239)
485916.Dtox_0232(PF01609)
485916.Dtox_1309(PF04286)
485916.Dtox_1305PF16760
485916.Dtox_0838(PF01609)
485916.Dtox_2781(PF00239)
485916.Dtox_2777(PF00697)
485916.Dtox_0045(PF00037)
485916.Dtox_0318(PF02361)
485916.Dtox_1150(PF02361)
485916.Dtox_1379(PF00037)
485916.Dtox_3554(PF12323)
485916.Dtox_2577(PF00239)
485916.Dtox_4029(PF13541)
485916.Dtox_0786PF16760
485916.Dtox_1787(PF04383)
485916.Dtox_0562(PF02361)
485916.Dtox_1560(PF02915)
485916.Dtox_1504(PF12224)
485916.Dtox_2140(PF02915)
485916.Dtox_2327(PF03063)
485916.Dtox_3542PF16760
485916.Dtox_1969PF12733
485916.Dtox_3439(PF13534)
485916.Dtox_0027(PF01409)
485916.Dtox_1684(PF01964)
485916.Dtox_0374(PF01419)
485916.Dtox_1220(PF13541)
485916.Dtox_1221(PF00037)
485916.Dtox_1351(PF13534)
485916.Dtox_1355(PF13534)
485916.Dtox_3208(PF00037)not used
485916.Dtox_1997(PF04286)
485916.Dtox_0341(PF01980)
485916.Dtox_1233(PF00037)
485916.Dtox_1432(PF01609)
485916.Dtox_1348(PF13534)
485916.Dtox_3322PF13513
485916.Dtox_1988PF12733
485916.Dtox_4074(PF13541)
485916.Dtox_0173(PF00037)
485916.Dtox_0178(PF02906)
485916.Dtox_4294(PF02915)
485916.Dtox_0751(PF00239)
485916.Dtox_1533PF02037
485916.Dtox_1241(PF00239)
485916.Dtox_3850(PF12323)
485916.Dtox_2192(PF01184)
485916.Dtox_0910(PF00697)
485916.Dtox_3913(PF12224)
485916.Dtox_3462(PF01609)
485916.Dtox_3001(PF01930)
485916.Dtox_1743(PF01184)
485916.Dtox_1527(PF00239)
485916.Dtox_1526(PF00239)
485916.Dtox_1522(PF00239)
485916.Dtox_2747(PF09419)
485916.Dtox_3778(PF03692)
485916.Dtox_2291(PF13534)
485916.Dtox_0922(PF01609)
485916.Dtox_2276PF02002
485916.Dtox_3904(PF13597)
485916.Dtox_3476(PF01980)
485916.Dtox_3473(PF02361)
485916.Dtox_3497(PF01980)
485916.Dtox_1464(PF12323)
485916.Dtox_1266(PF03692)
485916.Dtox_1267(PF00037)
485916.Dtox_2515(PF01609)
485916.Dtox_2516(PF01609)
485916.Dtox_2869(PF03538)
485916.Dtox_2868(PF12255)
485916.Dtox_3285(PF00239)
485916.Dtox_2266(PF00037)
485916.Dtox_3647(PF01930)
485916.Dtox_2438(PF00239)
485916.Dtox_3806(PF01609)
485916.Dtox_3802(PF12323)
485916.Dtox_0383(PF01609)
485916.Dtox_0417(PF12323)
485916.Dtox_0256(PF13541)
485916.Dtox_1071(PF13597)
485916.Dtox_1270(PF03063)
485916.Dtox_2258(PF00037)not used
485916.Dtox_3814(PF12323)
485916.Dtox_3032(PF03692)
485916.Dtox_0135(PF13358)
485916.Dtox_1862(PF01609)
485916.Dtox_1668(PF02915)
485916.Dtox_1282(PF13534)
485916.Dtox_2396(PF01409)
485916.Dtox_2716(PF02915)
485916.Dtox_2714(PF01880)
485916.Dtox_2933(PF03063)
485916.Dtox_3532(PF02915)
485916.Dtox_3533(PF02915)
485916.Dtox_3759(PF03951)
485916.Dtox_3752PF03442
485916.Dtox_3413(PF01609)
485916.Dtox_1878(PF13597)
485916.Dtox_1708(PF02906)
485916.Dtox_3780(PF03063)
485916.Dtox_0899(PF12323)
485916.Dtox_2654(PF02361)
485916.Dtox_2236(PF00239)
485916.Dtox_2342PF12733
485916.Dtox_2211(PF13358)
485916.Dtox_0083(PF03692)
485916.Dtox_0082(PF01535)
485916.Dtox_1841(PF01609)
485916.Dtox_1596(PF01964)
485916.Dtox_1597(PF01964)
485916.Dtox_0467(PF01609)
485916.Dtox_1600(PF03063)
485916.Dtox_1609(PF03063)
485916.Dtox_0511(PF01609)
485916.Dtox_2000(PF00239)
485916.Dtox_2229(PF01609)
485916.Dtox_2223(PF01609)
485916.Dtox_2739(PF00697)
485916.Dtox_3604PF16760
485916.Dtox_3996(PF03951)
485916.Dtox_3775PF02002
485916.Dtox_0457(PF12323)
485916.Dtox_0985(PF03692)
485916.Dtox_2212(PF02915)
485916.Dtox_0851(PF00239)
485916.Dtox_2966(PF00239)
485916.Dtox_3505(PF00037)
485916.Dtox_3504(PF00037)
485916.Dtox_3760(PF03951)
485916.Dtox_1821(PF01609)
485916.Dtox_0190(PF00239)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================