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Effective results for Cyanothece sp. PCC 7424 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 604
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 191 eukaryotic-like domains, contained in 604 proteins (88 high, 516 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
65393.PCC7424_4609PF12323 (PF07282)mitochondrial
65393.PCC7424_1677PF12323 (PF07282)mitochondrial
65393.PCC7424_0751PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2899(PF13414) (PF00515)ER
65393.PCC7424_5131(PF13414) (PF00515)ER
65393.PCC7424_1343PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2664(PF00035) (PF14622)(ER)
65393.PCC7424_2663PF12323 (PF07282)mitochondrial
65393.PCC7424_0394PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_1692PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_4512PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_3537PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2005(PF13414) (PF00515)ER
65393.PCC7424_3959(PF00035) (PF14622)(mitochondrial)
65393.PCC7424_4920PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_4771PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_0927(PF13414) (PF09295)ER
65393.PCC7424_3807(PF00805) (PF00515)ER
65393.PCC7424_4909(PF13676) (PF00560) (PF16095) (PF08477)
65393.PCC7424_5163PF12323 (PF07282)(mitochondrial); mitochondrial
65393.PCC7424_4155(PF06206)ER
65393.PCC7424_1618(PF13414)ER
65393.PCC7424_4021(PF08446) (PF00360) (PF01590)
65393.PCC7424_2562(PF13414)ER
65393.PCC7424_1041(PF02113)ER
65393.PCC7424_2743PF05419ER
65393.PCC7424_4735PF00685(mitochondrial)
65393.PCC7424_4736PF00685(mitochondrial)
65393.PCC7424_1257(PF13414)(ER)
65393.PCC7424_4042(PF00924)ER
65393.PCC7424_0035(PF08446) (PF00360) (PF01590)
65393.PCC7424_2261(PF13414)ER
65393.PCC7424_4547PF12740ER
65393.PCC7424_4546PF12740(mitochondrial)
65393.PCC7424_1660PF08881ER
65393.PCC7424_0284(PF04481)(mitochondrial)
65393.PCC7424_0823(PF13414) (PF00515)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2659(PF13414)ER; (ER)
65393.PCC7424_3253(PF08477) (PF16095) (PF00560)
65393.PCC7424_3414(PF13847)ER
65393.PCC7424_1452PF04278ER
65393.PCC7424_1453PF04278ER
65393.PCC7424_4333(PF02113)ER
65393.PCC7424_4449(PF00924)ER
65393.PCC7424_1129(PF01789)ER
65393.PCC7424_1905PF08881ER
65393.PCC7424_1906PF08881ER
65393.PCC7424_0742(PF04983)(mitochondrial); mitochondrial
65393.PCC7424_3241PF12740mitochondrial
65393.PCC7424_2719(PF12483)ER
65393.PCC7424_3409(PF05685)(mitochondrial)
65393.PCC7424_5033(PF12600)ER
65393.PCC7424_5109PF05419ER
65393.PCC7424_4679(PF13847)ER
65393.PCC7424_1130(PF00515)ER
65393.PCC7424_1133(PF13676) (PF05729) (PF13646)
65393.PCC7424_4275(PF06480)ER
65393.PCC7424_1733(PF00515)(mitochondrial); mitochondrial
65393.PCC7424_0172(PF07282)mitochondrial
65393.PCC7424_4814(PF06480)ER
65393.PCC7424_2906(PF07466)mitochondrial
65393.PCC7424_1412(PF00924)ER
65393.PCC7424_4866(PF07444)ER
65393.PCC7424_1105PF11371ER
65393.PCC7424_0615(PF11805)ER
65393.PCC7424_0507PF13301ER
65393.PCC7424_0508(PF00924)ER
65393.PCC7424_3261(PF01737)ER
65393.PCC7424_2352(PF08446) (PF00360) (PF01590)
65393.PCC7424_4892(PF00924)ER
65393.PCC7424_4093(PF01590)ER
65393.PCC7424_1115(PF00805)ER
65393.PCC7424_1750(PF00805)(mitochondrial)
65393.PCC7424_0395(PF06514)ER
65393.PCC7424_0791(PF12159)ER
65393.PCC7424_3329(PF02325)ER
65393.PCC7424_4314(PF12849)ER
65393.PCC7424_1569PF13301ER
65393.PCC7424_1169(PF00924)ER
65393.PCC7424_1300(PF13326)ER
65393.PCC7424_1946PF00685mitochondrial; (mitochondrial)
65393.PCC7424_3063(PF11016)ER
65393.PCC7424_3190(PF00400)mitochondrial
65393.PCC7424_3669(PF03040)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2626(PF00515)ER
65393.PCC7424_2009(PF01007)mitochondrial
65393.PCC7424_2954(PF13599)ER
65393.PCC7424_1794(PF12849)ER
65393.PCC7424_3835(PF13436)ER
65393.PCC7424_2839(PF01590)ER
65393.PCC7424_0666(PF03647)ER
65393.PCC7424_5069(PF01590)(mitochondrial); (plastid)
65393.PCC7424_2019(PF02153)ER
65393.PCC7424_2942(PF13414)ER
65393.PCC7424_4931(PF01716)ER
65393.PCC7424_5080(PF11317)(mitochondrial)
65393.PCC7424_5088(PF04839)ER; (ER)
65393.PCC7424_4200PF00685(ER)
65393.PCC7424_4208(PF11152)ER
65393.PCC7424_1548(PF13599)ER
65393.PCC7424_4113(PF13847)ER
65393.PCC7424_0121(PF13304)mitochondrial
65393.PCC7424_0541(PF12849)ER
65393.PCC7424_0540(PF00924)mitochondrial
65393.PCC7424_3825PF12740ER
65393.PCC7424_2809(PF12849)(mitochondrial); (plastid)
65393.PCC7424_3313(PF06480)ER
65393.PCC7424_2972(PF00805)ER
65393.PCC7424_4925(PF02113)ER
65393.PCC7424_4747(PF10716)ER
65393.PCC7424_4746(PF11460)ER
65393.PCC7424_0934(PF00515)ER
65393.PCC7424_3030(PF02325)ER
65393.PCC7424_3363(PF00400)ER
65393.PCC7424_2965PF12323 (PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_4354(PF13414)ER
65393.PCC7424_1183(PF02507)ER
65393.PCC7424_0327(PF13469)(ER)
65393.PCC7424_1454PF04278ER
65393.PCC7424_1855(PF01590)mitochondrial
65393.PCC7424_2683(PF05685)(mitochondrial)
65393.PCC7424_3575(PF06480)ER
65393.PCC7424_3482PF05419ER
65393.PCC7424_2177(PF11910)(mitochondrial)
65393.PCC7424_5186(PF00924)ER
65393.PCC7424_4906(PF11909)mitochondrial
65393.PCC7424_4014(PF07444)ER; (ER)
65393.PCC7424_0868(PF01094)(ER)
65393.PCC7424_0864(PF12862)ER
65393.PCC7424_1995PF16166(ER)
65393.PCC7424_0717(PF08662) (PF00400) (PF13676)
65393.PCC7424_2344(PF00924)ER
65393.PCC7424_3628(PF00805) (PF13599)
65393.PCC7424_1508(PF00400) (PF13676)
65393.PCC7424_1507(PF13676) (PF05729)
65393.PCC7424_1275(PF00805) (PF13599)
65393.PCC7424_1479(PF00805) (PF13599)
65393.PCC7424_1025(PF00805) (PF13599)
65393.PCC7424_4384PF12740(ER)
65393.PCC7424_0246(PF00805) (PF13599)
65393.PCC7424_0815(PF00284) (PF00283)
65393.PCC7424_0814(PF00283)(ER); not used
65393.PCC7424_3608PF02427(mitochondrial)
65393.PCC7424_3737PF13301(ER)
65393.PCC7424_4617(PF13676) PF05419
65393.PCC7424_5235(PF01590)(mitochondrial)
65393.PCC7424_0822PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_0537PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_3127(PF01590)(ER)
65393.PCC7424_3388(PF00689) (PF13246)
65393.PCC7424_2382(PF02113)(ER)
65393.PCC7424_3324PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_3245(PF00400) (PF13676)
65393.PCC7424_3621PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_4987(PF13676) PF05419
65393.PCC7424_0778PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_1369(PF00101)(mitochondrial)
65393.PCC7424_1740(PF12849)(plastid)
65393.PCC7424_1748(PF00400)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2599(PF00400)(ER)
65393.PCC7424_5275(PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_5303(PF00400) (PF13676)
65393.PCC7424_0156(PF13646) (PF03130)
65393.PCC7424_0401PF07464 (PF13414)
65393.PCC7424_3077(PF13676)(mitochondrial)
65393.PCC7424_3850(PF13872) (PF13871)
65393.PCC7424_3673(PF00360) (PF01590)
65393.PCC7424_2038(PF13646) (PF03130)
65393.PCC7424_2033(PF13304)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2329PF11371(mitochondrial)
65393.PCC7424_4792(PF00400) (PF13676)
65393.PCC7424_1763(PF05729) (PF13646)
65393.PCC7424_0364(PF01241)plastid
65393.PCC7424_0964PF08417(ER)
65393.PCC7424_1940(PF01679)ER; not used
65393.PCC7424_3446(PF00805)(mitochondrial)
65393.PCC7424_2003(PF07466)(ER)
65393.PCC7424_4233(PF02468)ER; not used
65393.PCC7424_1953PF00685(mitochondrial)
65393.PCC7424_3231PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_2540(PF05969)(ER); not used
65393.PCC7424_5065(PF00689) (PF13246)
65393.PCC7424_2948PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_2494(PF13872) (PF13871)
65393.PCC7424_3317(PF01679)ER; not used
65393.PCC7424_3951(PF16639) (PF01333)
65393.PCC7424_2201PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_2209PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_4215(PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_0935(PF03055)(ER)
65393.PCC7424_1334PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_2141PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_1184(PF01701)ER; not used
65393.PCC7424_2751(PF05729) (PF13646)
65393.PCC7424_0328PF00685(mitochondrial)
65393.PCC7424_0454(PF13414) (PF00515)
65393.PCC7424_0102(PF02533)(ER); not used
65393.PCC7424_3974(PF07282)(mitochondrial)
65393.PCC7424_4586(PF02153)(ER)
65393.PCC7424_2226PF12323 (PF07282)
65393.PCC7424_0661(PF13646) (PF03130)
65393.PCC7424_4763PF08527 (PF03068)
65393.PCC7424_4765(PF05729) PF05419
65393.PCC7424_4013(PF06596)ER; not used
65393.PCC7424_0867(PF01241)(plastid)
65393.PCC7424_2342(PF06298)ER; not used
65393.PCC7424_4715(PF02806)
65393.PCC7424_5175(PF11264)
65393.PCC7424_5176(PF06206)
65393.PCC7424_5178(PF05685)
65393.PCC7424_1053PF05419
65393.PCC7424_1051(PF05685)
65393.PCC7424_1298(PF05685)
65393.PCC7424_1291PF00685
65393.PCC7424_0674(PF01590)
65393.PCC7424_4024PF05542
65393.PCC7424_0271(PF13847)
65393.PCC7424_1874(PF13469)
65393.PCC7424_1870(PF05421)
65393.PCC7424_3006(PF06745)
65393.PCC7424_3594(PF00400)
65393.PCC7424_2407(PF01909)
65393.PCC7424_2530(PF08855)
65393.PCC7424_4561(PF04423)
65393.PCC7424_2245(PF02941)
65393.PCC7424_4362(PF02806)
65393.PCC7424_4361(PF07282)
65393.PCC7424_5141(PF07693)
65393.PCC7424_4497(PF11347)
65393.PCC7424_5149(PF10063)
65393.PCC7424_1049(PF00124)
65393.PCC7424_2287(PF01761)
65393.PCC7424_4383(PF13469)
65393.PCC7424_0399(PF00223)
65393.PCC7424_1606(PF13304)
65393.PCC7424_1861(PF13304)
65393.PCC7424_0809(PF00805)
65393.PCC7424_3106(PF01590)
65393.PCC7424_0903(PF13304)
65393.PCC7424_3920(PF00689)
65393.PCC7424_2745(PF03040)
65393.PCC7424_4554(PF12617)
65393.PCC7424_4553(PF02531)
65393.PCC7424_4821(PF05019)
65393.PCC7424_4958(PF01590)
65393.PCC7424_4959PF05419
65393.PCC7424_4739(PF05685)
65393.PCC7424_5156(PF01555)
65393.PCC7424_3949(PF00515)
65393.PCC7424_0386(PF00805)
65393.PCC7424_1706(PF00124)
65393.PCC7424_1670(PF00076)
65393.PCC7424_1679(PF05685)
65393.PCC7424_1387(PF06485)
65393.PCC7424_4049PF16865
65393.PCC7424_4043(PF00504)not used
65393.PCC7424_0813PF02419not used
65393.PCC7424_0812(PF01788)not used
65393.PCC7424_0819(PF05685)
65393.PCC7424_0656(PF00076)
65393.PCC7424_1493(PF05685)
65393.PCC7424_0724(PF05685)
65393.PCC7424_3545(PF05685)
65393.PCC7424_3116PF08417
65393.PCC7424_2547(PF04983)
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65393.PCC7424_2429(PF05685)
65393.PCC7424_2432(PF09511)
65393.PCC7424_2227(PF13847)
65393.PCC7424_4902(PF13414)
65393.PCC7424_4907(PF01909)
65393.PCC7424_5058(PF05685)
65393.PCC7424_4762(PF05685)
65393.PCC7424_4450(PF01555)
65393.PCC7424_1622PF05419
65393.PCC7424_1536(PF05685)
65393.PCC7424_1533(PF11833)
65393.PCC7424_4169(PF01555)
65393.PCC7424_0663(PF00924)
65393.PCC7424_1440(PF05685)
65393.PCC7424_4017(PF05685)
65393.PCC7424_0861(PF07282)
65393.PCC7424_0007(PF05685)
65393.PCC7424_0003(PF14249)
65393.PCC7424_0462(PF12452)
65393.PCC7424_0463(PF06480)
65393.PCC7424_0467PF04755
65393.PCC7424_0713(PF05685)
65393.PCC7424_3166PF04755
65393.PCC7424_3010(PF05685)
65393.PCC7424_3907(PF01909)
65393.PCC7424_3905(PF01927)
65393.PCC7424_0258(PF01909)
65393.PCC7424_3748(PF02943)
65393.PCC7424_3580(PF05729)
65393.PCC7424_3347(PF14159)
65393.PCC7424_2987(PF00805)
65393.PCC7424_2189PF08417
65393.PCC7424_5196(PF12576)
65393.PCC7424_4370(PF01909)
65393.PCC7424_4804PF16166
65393.PCC7424_4974(PF01555)
65393.PCC7424_1403PF10184
65393.PCC7424_4978(PF11360)
65393.PCC7424_4979(PF11210)
65393.PCC7424_0428(PF00515)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================