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Effective results for Bacteroides stercoris ATCC 43183 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 200
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 54 eukaryotic-like domains, contained in 200 proteins (64 high, 136 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
449673.BACSTE_03758(PF16334) (PF16335) (PF17168) (PF08760)ER
449673.BACSTE_02705(PF02838) (PF00728) PF13287ER
449673.BACSTE_03656(PF02838) (PF00728) PF13287ER
449673.BACSTE_01684(PF02838) (PF00728) PF13287ER
449673.BACSTE_02559(PF02838) (PF00728) PF13287ER
449673.BACSTE_01342(PF16889) PF07940ER
449673.BACSTE_03073(PF02838) (PF00728)ER
449673.BACSTE_00262PF16332 PF07940ER
449673.BACSTE_03661PF13287 (PF07971)ER
449673.BACSTE_03209(PF16889) PF07940ER
449673.BACSTE_00653(PF16353) (PF02929)ER
449673.BACSTE_03631(PF02929) (PF16353)ER
449673.BACSTE_01652(PF02884) (PF02278)ER
449673.BACSTE_02129PF16332 PF07940ER
449673.BACSTE_01677(PF02838) (PF00728)ER
449673.BACSTE_01676(PF16353) (PF02929)ER
449673.BACSTE_03188PF16332 PF07940ER
449673.BACSTE_02560(PF02929) (PF16353)(mitochondrial)
449673.BACSTE_03190PF16332 PF07940ER
449673.BACSTE_03197PF16332 PF07940ER
449673.BACSTE_03358(PF02884) (PF02278)ER
449673.BACSTE_03708(PF16889) PF07940ER
449673.BACSTE_03702(PF16889) PF07940ER
449673.BACSTE_03179PF16332 PF07940ER
449673.BACSTE_00362(PF07470)ER
449673.BACSTE_00368(PF00295)ER; mitochondrial
449673.BACSTE_03542(PF07971)ER
449673.BACSTE_03544(PF07971)ER
449673.BACSTE_02453(PF02278)ER
449673.BACSTE_01844(PF00295)ER
449673.BACSTE_00354(PF16387)ER
449673.BACSTE_03159(PF02544)ER
449673.BACSTE_03738(PF03415)ER
449673.BACSTE_02462(PF16011)ER
449673.BACSTE_02861(PF12437)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_00342(PF01637)(mitochondrial)
449673.BACSTE_00767(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_02470(PF07470)ER
449673.BACSTE_01346(PF13431)ER
449673.BACSTE_01741(PF16387)ER
449673.BACSTE_01300(PF00589)mitochondrial
449673.BACSTE_00747(PF03432)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_03210(PF07470)ER
449673.BACSTE_00001(PF00589)ER; (ER)
449673.BACSTE_03440(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_03202(PF07470)ER
449673.BACSTE_03203PF07940ER
449673.BACSTE_00781(PF13155)ER
449673.BACSTE_03303(PF01095)ER
449673.BACSTE_03301(PF01095)ER
449673.BACSTE_03304(PF07470)ER
449673.BACSTE_03276(PF00295)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_02255(PF13431)ER
449673.BACSTE_00465(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_00201(PF00295)ER
449673.BACSTE_02352(PF01223)ER
449673.BACSTE_02916(PF00589)mitochondrial
449673.BACSTE_00677(PF03415)ER
449673.BACSTE_00856(PF00589)mitochondrial
449673.BACSTE_00855(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_01641(PF01637)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_03539(PF07971)ER
449673.BACSTE_00990(PF00589)mitochondrial
449673.BACSTE_03755(PF06824)ER
449673.BACSTE_03757(PF07971)ER
449673.BACSTE_03657(PF06824)ER; (ER)
449673.BACSTE_02807(PF03796)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_00451(PF00589)mitochondrial
449673.BACSTE_03514(PF12437)(mitochondrial)
449673.BACSTE_03284(PF01095)ER
449673.BACSTE_03778(PF00295)ER
449673.BACSTE_03605(PF03959)ER
449673.BACSTE_01584(PF13155)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_01909(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_03707(PF07470)ER
449673.BACSTE_00890(PF01223)ER
449673.BACSTE_00409(PF00589)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_00371(PF07470)ER
449673.BACSTE_02028(PF00589)(mitochondrial); mitochondrial
449673.BACSTE_03009(PF00589)mitochondrial; (mitochondrial)
449673.BACSTE_00355(PF02838) (PF00728)
449673.BACSTE_00619(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_02721(PF07837) (PF02971)
449673.BACSTE_01172PF13148 (PF08707)
449673.BACSTE_02079PF01610(mitochondrial)
449673.BACSTE_02077PF01610(mitochondrial)
449673.BACSTE_01355(PF00216)(mitochondrial)
449673.BACSTE_00875(PF03432)(mitochondrial)
449673.BACSTE_00877(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_02929(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_01009(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_01000(PF03432)(mitochondrial)
449673.BACSTE_03628(PF05970) (PF02689)
449673.BACSTE_03184PF16332 PF07940
449673.BACSTE_01116(PF00589)(mitochondrial)
449673.BACSTE_02486(PF05704)(mitochondrial)
449673.BACSTE_02489(PF05686)(mitochondrial)
449673.BACSTE_02017(PF03796)(mitochondrial)
449673.BACSTE_03034PF01610
449673.BACSTE_03036(PF03796)
449673.BACSTE_03030(PF13155)
449673.BACSTE_01711(PF03054)
449673.BACSTE_00603PF01610
449673.BACSTE_02600(PF00216)
449673.BACSTE_01431PF01610
449673.BACSTE_02867(PF05693)
449673.BACSTE_01096(PF03432)
449673.BACSTE_01763(PF00216)
449673.BACSTE_00341(PF02929)
449673.BACSTE_00616PF13148
449673.BACSTE_00765(PF00589)not used
449673.BACSTE_00766(PF00589)
449673.BACSTE_00760PF01610
449673.BACSTE_02138(PF00216)
449673.BACSTE_00905(PF00216)
449673.BACSTE_02612PF16269
449673.BACSTE_02474(PF03054)
449673.BACSTE_02988(PF07470)
449673.BACSTE_01775PF01610
449673.BACSTE_00335(PF00589)
449673.BACSTE_00623(PF00589)
449673.BACSTE_00023PF01610
449673.BACSTE_00024PF01610
449673.BACSTE_00242(PF00589)
449673.BACSTE_03040(PF00216)
449673.BACSTE_02062(PF13155)
449673.BACSTE_01965(PF03432)
449673.BACSTE_00109PF01610
449673.BACSTE_02279(PF02278)
449673.BACSTE_03678(PF13155)
449673.BACSTE_01405PF01610
449673.BACSTE_02891(PF00216)
449673.BACSTE_02892(PF03796)
449673.BACSTE_00005(PF00589)
449673.BACSTE_00003PF01610
449673.BACSTE_00315PF01610
449673.BACSTE_00317PF01610
449673.BACSTE_00318PF01610
449673.BACSTE_00935PF02357
449673.BACSTE_01500(PF00589)
449673.BACSTE_03048(PF00589)
449673.BACSTE_00013PF01610
449673.BACSTE_00274PF01610
449673.BACSTE_03309(PF13086)
449673.BACSTE_03781(PF00589)
449673.BACSTE_03780(PF00589)
449673.BACSTE_02254(PF00589)
449673.BACSTE_01687PF01610
449673.BACSTE_02928(PF01348)
449673.BACSTE_01022PF01610
449673.BACSTE_01026PF01610
449673.BACSTE_03551(PF07971)
449673.BACSTE_01302PF02357
449673.BACSTE_01015PF01610
449673.BACSTE_01016PF01610
449673.BACSTE_01010(PF00589)not used
449673.BACSTE_02120PF01610
449673.BACSTE_01008(PF00589)
449673.BACSTE_01007PF12873
449673.BACSTE_03620(PF01715)
449673.BACSTE_00229(PF00589)
449673.BACSTE_03532(PF01715)
449673.BACSTE_03750(PF03054)
449673.BACSTE_01491(PF00216)not used
449673.BACSTE_01490(PF00216)
449673.BACSTE_01817(PF13086)
449673.BACSTE_02975(PF03432)
449673.BACSTE_01077(PF13155)
449673.BACSTE_00188PF13148
449673.BACSTE_00187(PF08707)
449673.BACSTE_00453PF01610
449673.BACSTE_03433(PF16314)
449673.BACSTE_00236PF13148
449673.BACSTE_00235PF13148
449673.BACSTE_00232(PF03432)
449673.BACSTE_02369(PF01223)
449673.BACSTE_00732(PF01637)
449673.BACSTE_00550PF01610
449673.BACSTE_03512(PF03630)
449673.BACSTE_03289(PF00216)
449673.BACSTE_02776(PF00589)
449673.BACSTE_02009(PF05704)
449673.BACSTE_02004PF14523
449673.BACSTE_02487PF03414
449673.BACSTE_01470PF01610
449673.BACSTE_02397PF01610
449673.BACSTE_01585(PF01348)
449673.BACSTE_01901PF02357
449673.BACSTE_00723PF01610not used
449673.BACSTE_00724PF01610
449673.BACSTE_03163(PF13086)
449673.BACSTE_00891(PF01223)
449673.BACSTE_02768PF02357
449673.BACSTE_01468PF01610
449673.BACSTE_01590(PF00589)
449673.BACSTE_01288(PF05970)
449673.BACSTE_03007PF02357
449673.BACSTE_02022PF02357
449673.BACSTE_01854PF02357
449673.BACSTE_00939PF02357

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================