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Effective results for Parabacteroides distasonis ATCC 8503 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 279
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 69 eukaryotic-like domains, contained in 279 proteins (50 high, 229 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
435591.BDI_0977(PF16334) (PF16335) (PF17168) (PF08760)(ER)
435591.BDI_0025(PF00984) (PF03720) (PF03721)ER
435591.BDI_0027(PF00984) (PF03720) (PF03721)ER
435591.BDI_1272(PF02838) (PF00728) (PF07691)(ER); ER
435591.BDI_2521(PF02838) (PF00728) (PF13287)ER
435591.BDI_1578(PF03721) (PF03720) (PF00984)ER
435591.BDI_2219(PF03721) (PF03720) (PF00984)ER
435591.BDI_2726(PF14684) (PF07676)ER
435591.BDI_2720(PF14684) (PF07676)ER
435591.BDI_1966(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_1965(PF02687) (PF12704)(mitochondrial); mitochondrial
435591.BDI_1962(PF02687) (PF12704)mitochondrial; (mitochondrial)
435591.BDI_1960(PF02687) (PF12704)(mitochondrial)
435591.BDI_1961(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_1958(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_0349(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_0348(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_3475(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_3181PF07971 (PF13287) (PF07691)(ER)
435591.BDI_1636(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_1634(PF02687) (PF12704)(mitochondrial)
435591.BDI_1635(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_1633(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_2215(PF03721) (PF03720) (PF00984)(ER)
435591.BDI_3305(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_0785(PF02687) (PF12704)(ER); mitochondrial
435591.BDI_0007(PF09112) (PF09113)ER
435591.BDI_2889PF13495 (PF00589)(mitochondrial); mitochondrial
435591.BDI_3355(PF02687) (PF12704)mitochondrial; (mitochondrial)
435591.BDI_0665(PF02838) (PF00728) (PF13287)(ER)
435591.BDI_0050(PF02838) (PF00728)ER
435591.BDI_3811PF13495 (PF00589)(mitochondrial)
435591.BDI_1308(PF00984) (PF03720) (PF03721)(ER)
435591.BDI_1956(PF02687) (PF12704)(mitochondrial)
435591.BDI_2947(PF02838) (PF00728)ER
435591.BDI_1438(PF02687) (PF12704)mitochondrial
435591.BDI_1970(PF02687) (PF12704)(mitochondrial)
435591.BDI_3822(PF00984) (PF03720) (PF03721)
435591.BDI_0767(PF02275)(mitochondrial); plastid
435591.BDI_2922(PF04488)(mitochondrial)
435591.BDI_2926PF17170ER
435591.BDI_1142(PF02838)ER
435591.BDI_1418(PF00953)ER
435591.BDI_3143PF07971mitochondrial
435591.BDI_3140PF07971ER
435591.BDI_3637(PF03031)(mitochondrial)
435591.BDI_3144PF07971ER
435591.BDI_1969(PF02687)mitochondrial
435591.BDI_3030(PF07691)ER
435591.BDI_0553(PF00216)(mitochondrial)
435591.BDI_2930PF17170ER
435591.BDI_2932PF17170ER
435591.BDI_2933PF17170ER
435591.BDI_1594(PF00953)ER
435591.BDI_2739(PF13287)ER
435591.BDI_2731PF07971ER
435591.BDI_1827(PF06439)ER
435591.BDI_3468(PF02687)mitochondrial
435591.BDI_3195(PF14684)ER
435591.BDI_2836(PF02687) (PF12704)(mitochondrial)
435591.BDI_1618PF07971ER
435591.BDI_1619PF07971ER
435591.BDI_1292(PF00216)mitochondrial
435591.BDI_1901(PF06439)ER
435591.BDI_1836(PF02719)(ER)
435591.BDI_3615(PF02719)mitochondrial; (mitochondrial)
435591.BDI_0750(PF00589)mitochondrial; (mitochondrial)
435591.BDI_2918PF17170ER
435591.BDI_0350(PF02275)ER
435591.BDI_2912(PF03051)ER
435591.BDI_0359PF12812ER
435591.BDI_2138(PF00589)(mitochondrial)
435591.BDI_2131(PF13384)(mitochondrial)
435591.BDI_1620PF07971ER
435591.BDI_1330(PF16117)ER
435591.BDI_1627PF07971ER
435591.BDI_2225(PF00953)ER
435591.BDI_3265(PF00589)mitochondrial
435591.BDI_3087(PF10988)ER
435591.BDI_3086(PF10988)ER
435591.BDI_3085(PF10988)ER
435591.BDI_3084(PF10988)ER
435591.BDI_2079(PF14707)ER
435591.BDI_3670(PF07676)ER
435591.BDI_3090PF17170ER
435591.BDI_1649(PF05592)ER
435591.BDI_1319(PF05592)ER
435591.BDI_2114(PF07676)ER
435591.BDI_1317(PF05592)ER
435591.BDI_1481(PF07676)ER; (ER)
435591.BDI_2200(PF02357)mitochondrial; (mitochondrial)
435591.BDI_1796(PF05592)ER
435591.BDI_3242(PF00953)ER
435591.BDI_1869(PF06439)ER
435591.BDI_3423PF17170ER
435591.BDI_2876(PF06439)ER
435591.BDI_2870(PF00216)(mitochondrial)
435591.BDI_0305(PF13384)(mitochondrial)
435591.BDI_0013(PF00589)mitochondrial
435591.BDI_0016(PF00953)ER
435591.BDI_2473(PF06439)ER
435591.BDI_1654(PF07168)ER
435591.BDI_1270(PF06439)ER
435591.BDI_3437(PF12895)ER
435591.BDI_2868PF17170(ER)
435591.BDI_0649(PF15891)ER
435591.BDI_2243(PF00589)mitochondrial
435591.BDI_1661(PF02687)mitochondrial
435591.BDI_1463(PF00984) (PF03721) (PF03720)
435591.BDI_3914(PF06439)ER
435591.BDI_1208(PF07691)ER
435591.BDI_3220(PF09825)ER
435591.BDI_2646(PF06439)ER
435591.BDI_1689(PF06439)ER
435591.BDI_1684(PF13320)ER
435591.BDI_3139(PF05592)ER
435591.BDI_1675(PF14707)ER
435591.BDI_3902(PF13384)(mitochondrial)
435591.BDI_2414(PF05592)ER
435591.BDI_3238(PF00984) (PF03720) (PF03721)
435591.BDI_2321(PF14707)(ER)
435591.BDI_2320(PF14707)ER; (ER)
435591.BDI_2748(PF06439)ER
435591.BDI_3341(PF08011)mitochondrial
435591.BDI_0489(PF06439)ER
435591.BDI_0666PF07971ER
435591.BDI_0062(PF07676)ER
435591.BDI_0064(PF07676)ER
435591.BDI_0116(PF10988)ER
435591.BDI_1195(PF06439)ER
435591.BDI_2532(PF00589)mitochondrial; (mitochondrial)
435591.BDI_1227PF17170ER
435591.BDI_2249(PF03051)ER
435591.BDI_3756(PF00589)(mitochondrial)
435591.BDI_3758(PF07676)ER
435591.BDI_3591(PF12895)ER
435591.BDI_3579(PF07676)ER
435591.BDI_2988(PF07676)ER; (ER)
435591.BDI_0299(PF00953)ER
435591.BDI_0128(PF02719)(mitochondrial)
435591.BDI_3816(PF02719)mitochondrial
435591.BDI_3813(PF13384)(mitochondrial)
435591.BDI_3212PF17170ER
435591.BDI_2349(PF13415)ER
435591.BDI_3217PF17170ER
435591.BDI_3743(PF07676)ER
435591.BDI_2612(PF16011)ER; (ER)
435591.BDI_2183PF07971ER
435591.BDI_3102(PF07691)ER; (ER)
435591.BDI_3581(PF07676)ER
435591.BDI_2997PF17170ER
435591.BDI_0049PF17170ER
435591.BDI_0739(PF13384)(mitochondrial)
435591.BDI_2332PF07971ER
435591.BDI_2427(PF13320)ER
435591.BDI_1550(PF02275)ER
435591.BDI_2517PF17170ER
435591.BDI_2514(PF07676)ER
435591.BDI_2287(PF03051)ER
435591.BDI_1959(PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
435591.BDI_1957(PF02687)ER; (mitochondrial)
435591.BDI_1955(PF02687)mitochondrial
435591.BDI_0144(PF06439)ER
435591.BDI_2946PF13859ER
435591.BDI_3165PF17170ER
435591.BDI_3386(PF04450)ER
435591.BDI_3387PF07971(ER); ER
435591.BDI_0441(PF03721) (PF00984) (PF03720)
435591.BDI_0716(PF13384)(mitochondrial)
435591.BDI_0154PF17170ER
435591.BDI_1153(PF06439)ER
435591.BDI_0546PF13495 (PF00589)
435591.BDI_1250PF03727 PF00349
435591.BDI_3851(PF00589)(ER)
435591.BDI_0420PF13495 (PF00589)
435591.BDI_0554PF08707 PF13148
435591.BDI_1590PF08707 PF13148
435591.BDI_1600PF13495 (PF00589)
435591.BDI_3609PF13495 (PF00589)
435591.BDI_1228(PF14684) (PF07676)
435591.BDI_2025(PF02687) (PF12704)
435591.BDI_0741(PF00589)(mitochondrial)
435591.BDI_1290(PF13155) (PF01807)
435591.BDI_3503(PF13155) (PF01807)
435591.BDI_0320(PF12437)(mitochondrial)
435591.BDI_1848(PF13155) (PF01807)
435591.BDI_2111(PF01715)(plastid)
435591.BDI_1318(PF05592)(ER)
435591.BDI_3645(PF07837) (PF02971)
435591.BDI_2919(PF08011) (PF09820)
435591.BDI_2898(PF08011) (PF09820)
435591.BDI_3430(PF08011) (PF09820)
435591.BDI_2462(PF06439)(ER)
435591.BDI_3904(PF13155) (PF01807)
435591.BDI_0119PF13495 (PF00589)
435591.BDI_2409(PF02687)(ER)
435591.BDI_3576(PF02687) (PF12704)
435591.BDI_3574(PF02687) (PF12704)
435591.BDI_1359PF13495 (PF00589)
435591.BDI_0296PF13495 (PF00589)
435591.BDI_0294PF08707 PF13148
435591.BDI_3819PF08707 PF13148
435591.BDI_1421PF13495 (PF00589)
435591.BDI_2516(PF08011) (PF09820)
435591.BDI_3156(PF08011) (PF09820)
435591.BDI_0943(PF00216)
435591.BDI_0944(PF00216)
435591.BDI_3771(PF12437)
435591.BDI_1258(PF00589)
435591.BDI_1413(PF04991)
435591.BDI_1389(PF12895)
435591.BDI_2490(PF00953)
435591.BDI_3525(PF00216)
435591.BDI_0423(PF02719)
435591.BDI_1286(PF04488)
435591.BDI_3289(PF16314)
435591.BDI_1829(PF00958)
435591.BDI_1828(PF00958)
435591.BDI_1342(PF16401)
435591.BDI_1343(PF09820)
435591.BDI_0742(PF00589)
435591.BDI_2128PF13148
435591.BDI_2124(PF00589)
435591.BDI_1341(PF16401)
435591.BDI_0572(PF02719)
435591.BDI_3500(PF00589)
435591.BDI_1756PF07971
435591.BDI_1021(PF00589)
435591.BDI_2226(PF02357)
435591.BDI_2229(PF00589)
435591.BDI_3263(PF04383)
435591.BDI_3312(PF00589)
435591.BDI_2141(PF13155)
435591.BDI_1841(PF01128)
435591.BDI_3300(PF00589)
435591.BDI_1265(PF00589)
435591.BDI_3243(PF02357)
435591.BDI_3245(PF00589)
435591.BDI_3429(PF09820)
435591.BDI_0010(PF02838)
435591.BDI_0015(PF02357)
435591.BDI_2278(PF00589)
435591.BDI_2301(PF03630)
435591.BDI_2269(PF02357)
435591.BDI_2311(PF05970)
435591.BDI_1847(PF02357)
435591.BDI_1840(PF04991)
435591.BDI_3136(PF00589)
435591.BDI_0498(PF00589)
435591.BDI_1679(PF00216)
435591.BDI_1471(PF04991)
435591.BDI_2241(PF04383)
435591.BDI_1995(PF00216)
435591.BDI_2623(PF00216)
435591.BDI_1351(PF01128)
435591.BDI_0126(PF02719)
435591.BDI_2962(PF04383)
435591.BDI_3602(PF00216)
435591.BDI_3516(PF00589)
435591.BDI_0286(PF01715)
435591.BDI_0131(PF00216)
435591.BDI_2974(PF00589)
435591.BDI_1426(PF00728)
435591.BDI_3828(PF01128)
435591.BDI_3821(PF08011)
435591.BDI_2282(PF00216)
435591.BDI_3944PF16269
435591.BDI_3831(PF02719)
435591.BDI_2700(PF01128)
435591.BDI_1940(PF05970)
435591.BDI_2385(PF00216)
435591.BDI_1150(PF00216)
435591.BDI_2004(PF05693)
435591.BDI_1397(PF02178)
435591.BDI_1573PF07959
435591.BDI_3627(PF04991)
435591.BDI_3625(PF01128)
435591.BDI_3159(PF04488)
435591.BDI_3023(PF16401)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

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EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
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