Effective results for Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 448
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 67 eukaryotic-like domains, contained in 448 proteins (21 high, 427 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
---|---|---|---|---|---|
290402.Cbei_2787 | (PF00015) (PF12729) | ER; (ER) | |||
290402.Cbei_0665 | (PF00015) (PF12729) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3045 | (PF00015) (PF12729) | (ER); (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_4086 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_4435 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_4438 | (PF00015) (PF12729) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3524 | (PF13407) (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_4466 | (PF00015) (PF12729) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3953 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_0804 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_1723 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_4061 | (PF01228) (PF02901) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_2975 | (PF00015) (PF12729) | (ER) | |||
290402.Cbei_3119 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_4017 | (PF00015) (PF12729) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_2186 | (PF00015) (PF12729) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3356 | (PF00015) (PF12729) | mitochondrial | |||
290402.Cbei_4821 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_4828 | (PF00015) (PF12729) | (ER) | |||
290402.Cbei_4965 | (PF00015) (PF12729) | (ER) | |||
290402.Cbei_0307 | (PF00015) (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_3790 | (PF00015) (PF12729) | (ER); (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_4161 | (PF00015) (PF12729) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3920 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4745 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_3073 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3070 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_0524 | (PF00359) | ER | |||
290402.Cbei_0667 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_0664 | (PF16760) | ER | |||
290402.Cbei_1428 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_2334 | (PF00881) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_0287 | (PF00015) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_0885 | (PF10544) | ER | |||
290402.Cbei_4434 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_5059 | (PF00015) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_2494 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_1217 | (PF01966) | ER | |||
290402.Cbei_3298 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3055 | (PF02424) | ER | |||
290402.Cbei_2912 | (PF00015) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_2914 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3422 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4429 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4427 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4426 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_2481 | (PF01183) | ER | |||
290402.Cbei_0350 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_3993 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4795 | (PF06541) | ER | |||
290402.Cbei_2850 | (PF12729) | ER | |||
290402.Cbei_4182 | (PF00015) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_4450 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_0294 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_2454 | (PF13187) | ER | |||
290402.Cbei_4532 | (PF00367) | ER | |||
290402.Cbei_3961 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_0288 | (PF02915) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_2661 | (PF16472) | ER | |||
290402.Cbei_0371 | (PF06541) | ER | |||
290402.Cbei_4849 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_1026 | (PF06541) | ER | |||
290402.Cbei_3520 | (PF01418) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3701 | (PF02424) | ER | |||
290402.Cbei_2056 | (PF03358) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_1380 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3142 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_2957 | (PF16916) | ER | |||
290402.Cbei_2953 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_4463 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4462 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_2735 | (PF03358) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_4078 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4079 | (PF00398) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_4077 | (PF00015) | mitochondrial | |||
290402.Cbei_4705 | (PF00367) | ER | |||
290402.Cbei_4494 | (PF02424) | ER | |||
290402.Cbei_0011 | (PF07892) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_2380 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_2414 | (PF03851) | mitochondrial | |||
290402.Cbei_3578 | (PF13787) | ER | |||
290402.Cbei_3935 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4665 | (PF01183) | ER | |||
290402.Cbei_2970 | (PF01790) | ER | |||
290402.Cbei_4486 | (PF13407) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3625 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_4012 | (PF00015) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_1668 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4726 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_4724 | (PF00015) | (ER) | |||
290402.Cbei_4725 | PF12733 | ER; (ER) | |||
290402.Cbei_4832 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_0108 | (PF16472) | ER | |||
290402.Cbei_1455 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_2505 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_2377 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_2374 | (PF13787) | ER | |||
290402.Cbei_4918 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_1085 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_0939 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3135 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3003 | (PF13187) | ER | |||
290402.Cbei_3343 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3347 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_4585 | (PF03358) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_2839 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_4696 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_0273 | (PF03358) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
290402.Cbei_4969 | (PF00881) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_4966 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_2233 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_0872 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_0875 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_3484 | (PF03358) | (mitochondrial); mitochondrial | |||
290402.Cbei_3804 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_3939 | (PF13407) | ER | |||
290402.Cbei_3320 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_4762 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_4763 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_4761 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_4764 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_4765 | PF12733 | ER | |||
290402.Cbei_3671 | (PF00015) | ER | |||
290402.Cbei_3672 | (PF14566) | ER | |||
290402.Cbei_1920 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_0245 | (PF08125) (PF01232) | ||||
290402.Cbei_3279 | (PF16916) | (ER) | |||
290402.Cbei_0531 | (PF08125) (PF01232) | ||||
290402.Cbei_4083 | (PF08125) (PF01232) | ||||
290402.Cbei_1598 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_1009 | (PF01228) (PF02901) | ||||
290402.Cbei_4524 | (PF03358) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_1773 | (PF02906) (PF02256) | ||||
290402.Cbei_1771 | (PF03460) (PF01077) | ||||
290402.Cbei_0749 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_4985 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_1011 | (PF01228) (PF02901) | ||||
290402.Cbei_3526 | (PF13187) (PF00881) | ||||
290402.Cbei_0763 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_1552 | (PF08495) (PF10442) | ||||
290402.Cbei_5020 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_2738 | (PF00359) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_0973 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_0705 | (PF01228) (PF02901) | ||||
290402.Cbei_4702 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_4703 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_3619 | (PF03358) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_3948 | (PF00881) | plastid | |||
290402.Cbei_0832 | (PF03460) (PF01077) | ||||
290402.Cbei_1833 | (PF08125) (PF01232) | ||||
290402.Cbei_1838 | (PF08125) (PF01232) | ||||
290402.Cbei_0715 | (PF13187) (PF00881) | ||||
290402.Cbei_4807 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_1443 | (PF13802) (PF16338) | ||||
290402.Cbei_3024 | (PF03460) (PF01077) | ||||
290402.Cbei_4658 | (PF08125) (PF01232) | ||||
290402.Cbei_4653 | (PF13802) (PF16338) | ||||
290402.Cbei_4655 | (PF13802) (PF16338) | ||||
290402.Cbei_4642 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_4000 | (PF02906) (PF02256) | ||||
290402.Cbei_3643 | (PF13187) (PF00881) | ||||
290402.Cbei_2776 | (PF03460) (PF01077) | ||||
290402.Cbei_2770 | (PF08495) (PF10442) | ||||
290402.Cbei_3910 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_2191 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_3001 | (PF03460) (PF01077) | ||||
290402.Cbei_0698 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_1479 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_2523 | (PF03460) (PF01077) | ||||
290402.Cbei_2527 | (PF08495) (PF10442) | ||||
290402.Cbei_1892 | (PF08495) (PF10442) | ||||
290402.Cbei_1890 | (PF01418) (PF01380) | ||||
290402.Cbei_4110 | (PF02906) (PF02256) | ||||
290402.Cbei_3796 | (PF02906) (PF02256) | ||||
290402.Cbei_4977 | (PF00367) | (mitochondrial) | |||
290402.Cbei_0315 | (PF01228) (PF02901) | ||||
290402.Cbei_3470 | (PF08495) (PF10442) | ||||
290402.Cbei_0785 | (PF03460) (PF01077) | ||||
290402.Cbei_0327 | (PF02906) | ||||
290402.Cbei_3531 | (PF13187) | not used | |||
290402.Cbei_0525 | (PF00359) | ||||
290402.Cbei_3267 | (PF01183) | ||||
290402.Cbei_0062 | (PF01790) | ||||
290402.Cbei_4777 | (PF16916) | ||||
290402.Cbei_4772 | (PF00015) | ||||
290402.Cbei_0662 | (PF14691) | ||||
290402.Cbei_4319 | (PF00258) | ||||
290402.Cbei_4318 | (PF10371) | ||||
290402.Cbei_1423 | (PF01790) | ||||
290402.Cbei_0244 | (PF00359) | ||||
290402.Cbei_4791 | (PF00015) | ||||
290402.Cbei_0246 | (PF01380) | ||||
290402.Cbei_4799 | (PF01380) | ||||
290402.Cbei_0249 | (PF00881) | ||||
290402.Cbei_0338 | (PF00923) | ||||
290402.Cbei_0334 | (PF00359) | ||||
290402.Cbei_2248 | (PF00398) | ||||
290402.Cbei_3862 | (PF01326) | ||||
290402.Cbei_3046 | (PF03358) | ||||
290402.Cbei_1932 | (PF00465) | ||||
290402.Cbei_3302 | (PF03984) | ||||
290402.Cbei_3273 | (PF00367) | ||||
290402.Cbei_0530 | (PF01380) | ||||
290402.Cbei_1434 | PF03063 | ||||
290402.Cbei_2904 | (PF01380) | ||||
290402.Cbei_3453 | (PF14526) | ||||
290402.Cbei_4439 | (PF06968) | ||||
290402.Cbei_2301 | (PF10544) | ||||
290402.Cbei_2498 | (PF00359) | ||||
290402.Cbei_2492 | (PF13187) | ||||
290402.Cbei_0346 | (PF00881) | ||||
290402.Cbei_2497 | (PF00359) | ||||
290402.Cbei_2276 | PF03063 | ||||
290402.Cbei_3057 | (PF00881) | ||||
290402.Cbei_0433 | (PF02810) | ||||
290402.Cbei_1520 | (PF06968) | ||||
290402.Cbei_0301 | (PF06968) | ||||
290402.Cbei_0502 | (PF00882) | ||||
290402.Cbei_4883 | (PF06777) | ||||
290402.Cbei_4552 | (PF00465) | ||||
290402.Cbei_4556 | (PF01380) | ||||
290402.Cbei_4158 | (PF00367) | ||||
290402.Cbei_3516 | (PF01326) | ||||
290402.Cbei_4428 | (PF13407) | ||||
290402.Cbei_3737 | (PF03358) | ||||
290402.Cbei_5060 | (PF02810) | ||||
290402.Cbei_2003 | (PF00148) | ||||
290402.Cbei_2002 | (PF00148) | ||||
290402.Cbei_2005 | (PF00148) | ||||
290402.Cbei_2004 | (PF00148) | ||||
290402.Cbei_2487 | (PF02810) | ||||
290402.Cbei_3990 | (PF14526) | ||||
290402.Cbei_3843 | (PF12464) | ||||
290402.Cbei_3847 | (PF14526) | ||||
290402.Cbei_1918 | (PF00367) | ||||
290402.Cbei_1914 | (PF06968) | ||||
290402.Cbei_3217 | (PF00302) | ||||
290402.Cbei_3215 | (PF00881) | ||||
290402.Cbei_3213 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_0514 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_0631 | (PF00148) | ||||
290402.Cbei_0632 | (PF00148) | ||||
290402.Cbei_3083 | (PF00881) | ||||
290402.Cbei_4523 | (PF00881) | ||||
290402.Cbei_4185 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_4188 | (PF13187) | ||||
290402.Cbei_3438 | (PF12464) | ||||
290402.Cbei_4454 | (PF00923) | ||||
290402.Cbei_4983 | (PF00367) | ||||
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290402.Cbei_4693 | (PF03358) | ||||
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290402.Cbei_2742 | (PF00923) | ||||
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290402.Cbei_3909 | (PF12464) | ||||
290402.Cbei_0226 | (PF00834) | ||||
290402.Cbei_2490 | (PF02915) | ||||
290402.Cbei_3018 | (PF00258) | ||||
290402.Cbei_3015 | (PF00258) | ||||
290402.Cbei_3014 | PF03063 | ||||
290402.Cbei_3017 | (PF00258) | ||||
290402.Cbei_3486 | (PF00015) | ||||
290402.Cbei_1893 | (PF00015) | ||||
290402.Cbei_4203 | (PF14691) | ||||
290402.Cbei_4379 | (PF13599) | ||||
290402.Cbei_4370 | (PF04493) | ||||
290402.Cbei_4682 | (PF00015) | ||||
290402.Cbei_2753 | (PF00465) | ||||
290402.Cbei_4976 | (PF01418) | ||||
290402.Cbei_4970 | (PF03358) | ||||
290402.Cbei_0317 | (PF00923) | ||||
290402.Cbei_0319 | (PF00882) | ||||
290402.Cbei_1223 | PF04184 | ||||
290402.Cbei_0867 | (PF00834) | ||||
290402.Cbei_3069 | (PF02915) | ||||
290402.Cbei_3257 | (PF02915) | ||||
290402.Cbei_3781 | (PF14691) | ||||
290402.Cbei_3783 | (PF00015) | ||||
290402.Cbei_0074 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_4766 | PF12733 | ||||
290402.Cbei_2816 | (PF14526) | ||||
290402.Cbei_4165 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_4163 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_1416 | (PF02915) | ||||
290402.Cbei_0786 | PF03063 | ||||
290402.Cbei_3906 | (PF00881) | ||||
290402.Cbei_4416 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_2325 | (PF02915) | ||||
290402.Cbei_2320 | (PF00367) | ||||
290402.Cbei_2322 | (PF01966) | ||||
290402.Cbei_0255 | (PF08840) |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)