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Effective results for Desulfuromonas acetoxidans DSM 684 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 173
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 28 eukaryotic-like domains, contained in 173 proteins (11 high, 162 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
281689.Dace_2858(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_0593(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_0591(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_1518(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_2434(PF00990) (PF13426)ER; (ER)
281689.Dace_2700(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_0709(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_1837(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_1356(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_0050(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_1279(PF00990) (PF13426)ER; (ER)
281689.Dace_1300(PF00990) (PF13426)ER
281689.Dace_3079(PF00990)ER
281689.Dace_3105(PF11074)mitochondrial; (mitochondrial)
281689.Dace_2859(PF00990)ER
281689.Dace_0236(PF00990)mitochondrial; (mitochondrial)
281689.Dace_3113(PF00990)(mitochondrial)
281689.Dace_3116(PF00990)ER
281689.Dace_1336(PF00990)ER
281689.Dace_0378(PF00990)ER
281689.Dace_3057PF06467ER
281689.Dace_0589(PF00990)ER
281689.Dace_2936(PF00990)ER
281689.Dace_1298(PF00990)ER
281689.Dace_1347(PF00990)ER
281689.Dace_0365(PF00990)ER
281689.Dace_3139(PF00990)ER
281689.Dace_3134(PF00990)(ER); mitochondrial
281689.Dace_3136(PF00990)ER
281689.Dace_1510(PF13426)ER
281689.Dace_0957PF02026mitochondrial
281689.Dace_1251PF14874ER
281689.Dace_2945(PF13426)ER
281689.Dace_1169(PF00990)ER
281689.Dace_0162(PF00990) (PF13426)(mitochondrial)
281689.Dace_2404(PF00990)(mitochondrial)
281689.Dace_2159(PF13426)ER
281689.Dace_2976(PF00990)ER
281689.Dace_2975(PF00990)ER
281689.Dace_0152(PF00990)ER
281689.Dace_1001(PF09835)mitochondrial
281689.Dace_2702(PF00990)ER
281689.Dace_1039(PF13426)ER
281689.Dace_1873(PF00990)ER; (ER)
281689.Dace_0737(PF00990)ER
281689.Dace_1930(PF00990)ER
281689.Dace_2905(PF00990)ER
281689.Dace_1121(PF00990)ER
281689.Dace_1833(PF09835)mitochondrial
281689.Dace_1058(PF13426)ER
281689.Dace_0877(PF00990)(mitochondrial)
281689.Dace_1138(PF00990)ER
281689.Dace_2102(PF09837)mitochondrial
281689.Dace_0272(PF13426)ER
281689.Dace_1442(PF00990)mitochondrial
281689.Dace_0930(PF13426)(mitochondrial)
281689.Dace_2129(PF09837)mitochondrial
281689.Dace_2786(PF04452)mitochondrial
281689.Dace_0654(PF00990)ER
281689.Dace_2877(PF03959)ER
281689.Dace_1301(PF00990)ER
281689.Dace_1874(PF13426)ER
281689.Dace_0252(PF00990)ER
281689.Dace_0139(PF00990)ER
281689.Dace_1799(PF00990)ER
281689.Dace_2724(PF00990) (PF13426)
281689.Dace_2674(PF00990)(plastid)
281689.Dace_3066(PF00990)(mitochondrial)
281689.Dace_1985(PF00990) (PF13426)
281689.Dace_1605(PF06293)(plastid)
281689.Dace_1525(PF00990) (PF13426)
281689.Dace_2943(PF00990) (PF13426)
281689.Dace_0706(PF13401)(mitochondrial)
281689.Dace_1935(PF00990) (PF13426)not used
281689.Dace_1453(PF09837)ER
281689.Dace_0314(PF12038)(plastid)
281689.Dace_2104(PF00990)plastid
281689.Dace_1303(PF00990) (PF13426)
281689.Dace_0921(PF00990) (PF13426)
281689.Dace_0353(PF00990)
281689.Dace_2474(PF13276)
281689.Dace_1327(PF13276)
281689.Dace_0693(PF13276)
281689.Dace_3061(PF01715)
281689.Dace_2044(PF02915)
281689.Dace_1537(PF13426)
281689.Dace_1243(PF00990)
281689.Dace_0592(PF00990)
281689.Dace_0977(PF02915)
281689.Dace_0803(PF13276)
281689.Dace_0585(PF13426)
281689.Dace_1299(PF00990)
281689.Dace_0214(PF01715)
281689.Dace_0741(PF05673)
281689.Dace_0216(PF13401)
281689.Dace_1617(PF06293)
281689.Dace_1615(PF06293)
281689.Dace_0967PF01880
281689.Dace_0260(PF00990)
281689.Dace_2952(PF13426)
281689.Dace_1287(PF13426)
281689.Dace_1196PF01880
281689.Dace_1190PF01880
281689.Dace_1604(PF06293)
281689.Dace_1778(PF00990)
281689.Dace_0554(PF05673)
281689.Dace_0393(PF02915)
281689.Dace_0951PF02026
281689.Dace_3140(PF00990)
281689.Dace_2723PF07260
281689.Dace_2855(PF13426)
281689.Dace_0945(PF13426)
281689.Dace_0839(PF02915)
281689.Dace_2390(PF13401)
281689.Dace_2406PF01880
281689.Dace_1572(PF13276)
281689.Dace_1393(PF13276)
281689.Dace_1717(PF00990)
281689.Dace_1006(PF13276)
281689.Dace_1009(PF13401)
281689.Dace_3092(PF00025)
281689.Dace_1144(PF05673)
281689.Dace_2561PF03131
281689.Dace_1815(PF00990)
281689.Dace_1927(PF06245)
281689.Dace_3084(PF00990)
281689.Dace_3086(PF00990)
281689.Dace_3172(PF13401)
281689.Dace_3178(PF13276)
281689.Dace_2177(PF09835)
281689.Dace_2287(PF04452)
281689.Dace_2609(PF00990)
281689.Dace_2606(PF02915)
281689.Dace_1807(PF00862)
281689.Dace_0047(PF00990)
281689.Dace_0519(PF13426)
281689.Dace_0465(PF03063)
281689.Dace_2161(PF02915)
281689.Dace_0724(PF00990)
281689.Dace_1583(PF06293)
281689.Dace_0477(PF05697)
281689.Dace_0872(PF00990)
281689.Dace_0747(PF13276)
281689.Dace_2028(PF06245)
281689.Dace_2339(PF13276)
281689.Dace_0668(PF08695)
281689.Dace_2801(PF00990)
281689.Dace_1224(PF00990)
281689.Dace_1044(PF00990)
281689.Dace_0065(PF00990)not used
281689.Dace_3219(PF04452)
281689.Dace_2109(PF05697)
281689.Dace_2743(PF13401)
281689.Dace_1694(PF00990)
281689.Dace_0675(PF13597)not used
281689.Dace_0674(PF13597)
281689.Dace_0679(PF03063)
281689.Dace_1216(PF13401)
281689.Dace_0413(PF13426)
281689.Dace_2138(PF09837)
281689.Dace_2641PF05735
281689.Dace_1111(PF13426)
281689.Dace_0641(PF00990)
281689.Dace_0337(PF13597)not used
281689.Dace_0338(PF13597)
281689.Dace_3016(PF00990)
281689.Dace_0653(PF13426)
281689.Dace_1651(PF13276)
281689.Dace_0785(PF03063)not used
281689.Dace_0326(PF00990)
281689.Dace_1792(PF00990)
281689.Dace_2844(PF03063)
281689.Dace_0688(PF00990)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================