Metamenu

Effective results for Candidatus Koribacter versatilis Ellin345 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 375
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 57 eukaryotic-like domains, contained in 375 proteins (125 high, 250 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
204669.Acid345_3941(PF13432) (PF14559) PF13620ER
204669.Acid345_1682(PF13517) (PF13432) (PF07593)ER
204669.Acid345_4603(PF13429) (PF13432) (PF14559)ER
204669.Acid345_4515(PF01431) (PF05649)ER
204669.Acid345_4516(PF01431) (PF05649)ER
204669.Acid345_2823(PF04389) PF04253ER
204669.Acid345_3887PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_3222(PF13231) (PF13181)ER
204669.Acid345_4528PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_0424(PF13181) (PF13432)(ER); ER
204669.Acid345_3230(PF01833) (PF13418)mitochondrial
204669.Acid345_4645(PF13432) PF13620ER
204669.Acid345_2528(PF13432) (PF14559)ER
204669.Acid345_3459PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0009(PF01431) (PF05649)ER
204669.Acid345_3591PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_4489(PF13181) (PF13432)ER
204669.Acid345_3461PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_1201(PF13231) (PF13181)ER
204669.Acid345_1684(PF13517) (PF07593)ER
204669.Acid345_1963(PF13181) (PF13432)ER
204669.Acid345_0368PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0101PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_1566(PF13432) (PF14559)ER
204669.Acid345_0619PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_1690(PF13517) (PF07593)ER
204669.Acid345_0370PF12704 (PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
204669.Acid345_4284PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0909(PF13517) (PF07593)ER
204669.Acid345_2047PF12704 (PF02687)mitochondrial; (mitochondrial)
204669.Acid345_4608(PF13432) (PF14559)ER
204669.Acid345_0297PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0341PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_1491(PF01431) (PF05649)ER
204669.Acid345_0911(PF13432) (PF14559)mitochondrial
204669.Acid345_0912(PF13432) (PF14559)(ER); ER
204669.Acid345_0919(PF13517) (PF07593)ER
204669.Acid345_4630PF12704 (PF02687)ER
204669.Acid345_3005(PF13432) (PF14559)ER
204669.Acid345_1869PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_1405(PF13181) (PF13432)ER
204669.Acid345_1088PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0920(PF13517) (PF07593)(mitochondrial)
204669.Acid345_1890PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_4627PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_2466(PF04389) PF04253ER
204669.Acid345_0425(PF13517) (PF07593)(mitochondrial)
204669.Acid345_3602(PF13231) (PF13432)ER
204669.Acid345_3609PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0418PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_3615(PF14559) PF13620ER
204669.Acid345_1078(PF01431) (PF05649)ER
204669.Acid345_3500PF12704 (PF02687)ER
204669.Acid345_1618PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_1619PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_2819(PF04389) PF04253ER
204669.Acid345_1829(PF13181) (PF13432)ER
204669.Acid345_4194(PF13432) (PF14559)ER
204669.Acid345_3567PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_1933PF12704 (PF02687)mitochondrial
204669.Acid345_0460(PF13517)(mitochondrial)
204669.Acid345_2573PF13620ER
204669.Acid345_2575PF13620ER
204669.Acid345_0515(PF15902)ER
204669.Acid345_3556(PF13181)(mitochondrial)
204669.Acid345_1484(PF00139)ER
204669.Acid345_4338(PF04389)ER
204669.Acid345_0346(PF06739)(ER)
204669.Acid345_3953(PF12867)ER
204669.Acid345_3768(PF13181)(mitochondrial); (plastid)
204669.Acid345_0459(PF09286)mitochondrial; (mitochondrial)
204669.Acid345_0450(PF09286)mitochondrial
204669.Acid345_0038(PF03544)ER
204669.Acid345_3831PF13620ER
204669.Acid345_4018(PF13517)mitochondrial
204669.Acid345_3895PF13620ER
204669.Acid345_1956(PF17137)ER
204669.Acid345_3841PF13620ER
204669.Acid345_3332(PF12867)ER
204669.Acid345_0783PF13620ER
204669.Acid345_0446(PF13432)ER
204669.Acid345_0445PF13620mitochondrial; (mitochondrial)
204669.Acid345_0335PF04916ER
204669.Acid345_0532PF13620ER
204669.Acid345_4316(PF13394)mitochondrial
204669.Acid345_1775(PF03544)ER
204669.Acid345_3933(PF07676)ER
204669.Acid345_3331(PF12867)ER
204669.Acid345_3840PF13620mitochondrial
204669.Acid345_3141(PF09286)ER
204669.Acid345_1549PF13620ER
204669.Acid345_0012(PF13231)ER
204669.Acid345_1017(PF01833)ER
204669.Acid345_1012(PF00882)ER
204669.Acid345_1545PF13620ER
204669.Acid345_1788(PF09990)ER
204669.Acid345_3454(PF04366)ER
204669.Acid345_0490(PF07676)ER
204669.Acid345_2892PF13620ER
204669.Acid345_2940(PF04389)ER
204669.Acid345_3853(PF13432)ER
204669.Acid345_3321PF13620ER
204669.Acid345_3218PF13620ER
204669.Acid345_1991PF13620ER
204669.Acid345_0731(PF04185)ER
204669.Acid345_2536(PF13181)ER
204669.Acid345_2533(PF15902)ER
204669.Acid345_0315PF13620ER
204669.Acid345_0319(PF13517) (PF07593)(plastid)
204669.Acid345_4483PF13620ER
204669.Acid345_3594(PF13517)ER
204669.Acid345_1683(PF14559)ER
204669.Acid345_0784PF13620ER
204669.Acid345_2439(PF13432)ER
204669.Acid345_2438(PF09286)(ER)
204669.Acid345_4662PF13620ER
204669.Acid345_2433PF13620ER
204669.Acid345_3052(PF14559)ER
204669.Acid345_4277(PF14559)ER
204669.Acid345_0764(PF13418)ER
204669.Acid345_1816(PF04185)ER
204669.Acid345_0369PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0105(PF09286)ER
204669.Acid345_0100(PF00882)ER
204669.Acid345_1218(PF03544)ER
204669.Acid345_1181(PF04366)ER
204669.Acid345_4053PF14360mitochondrial
204669.Acid345_2980(PF13517)ER
204669.Acid345_0808(PF14559)ER
204669.Acid345_0806(PF04389)ER
204669.Acid345_4123PF13620ER
204669.Acid345_4122(PF13517)ER
204669.Acid345_3909PF13620ER
204669.Acid345_3878(PF03544)ER
204669.Acid345_3271(PF15902)mitochondrial
204669.Acid345_4615(PF02223)(mitochondrial)
204669.Acid345_0376(PF06202)ER
204669.Acid345_2609PF13620ER
204669.Acid345_0371PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_1351(PF12867)ER
204669.Acid345_3483(PF04389)ER
204669.Acid345_3484(PF07676)ER
204669.Acid345_0590(PF13432)ER
204669.Acid345_0592(PF07676)ER
204669.Acid345_4136(PF13418)ER
204669.Acid345_0900PF13620ER
204669.Acid345_2040(PF04389)ER
204669.Acid345_2299(PF13432)ER
204669.Acid345_4601(PF13432)ER
204669.Acid345_3071PF13620ER
204669.Acid345_2674PF13620ER
204669.Acid345_2673(PF09990)(ER)
204669.Acid345_2671(PF12867)ER
204669.Acid345_2670(PF13418)ER
204669.Acid345_1501PF13620ER
204669.Acid345_3657(PF03544)ER
204669.Acid345_0910PF13620ER
204669.Acid345_0918PF13620ER
204669.Acid345_1866(PF14559)ER
204669.Acid345_1868(PF02687)ER
204669.Acid345_0287(PF13432)ER
204669.Acid345_2668PF13620ER
204669.Acid345_1538PF13620ER
204669.Acid345_2716(PF07676)(mitochondrial)
204669.Acid345_0625PF13620ER
204669.Acid345_4154PF13620mitochondrial
204669.Acid345_0928(PF07678)ER
204669.Acid345_2279PF13620ER
204669.Acid345_2273(PF13517)ER
204669.Acid345_2274(PF13517)ER
204669.Acid345_2388PF13620ER
204669.Acid345_4710(PF13517)ER
204669.Acid345_0724(PF13506)ER
204669.Acid345_0723(PF13506)(ER); ER
204669.Acid345_0721PF12704 (PF02687)(ER)
204669.Acid345_0387(PF17137)ER
204669.Acid345_4380(PF13181) (PF13432) (PF14559)
204669.Acid345_0436PF13620ER
204669.Acid345_1521(PF04185)ER
204669.Acid345_0650(PF17137)ER; (ER)
204669.Acid345_4097(PF04185)ER
204669.Acid345_4093(PF13517)ER
204669.Acid345_1678PF13620ER
204669.Acid345_4364(PF03544)ER
204669.Acid345_1387(PF13517)ER
204669.Acid345_0933PF13620ER
204669.Acid345_2123(PF03544)ER
204669.Acid345_2127(PF04185)mitochondrial
204669.Acid345_2464(PF04366)ER
204669.Acid345_3021(PF15902)ER
204669.Acid345_4764(PF04366)ER
204669.Acid345_0736(PF14559)(ER); plastid
204669.Acid345_2642(PF13418)ER
204669.Acid345_0428PF13620ER
204669.Acid345_0423PF13620ER
204669.Acid345_0396(PF13231)ER
204669.Acid345_0644(PF14683)ER
204669.Acid345_4088(PF15780)ER
204669.Acid345_1066(PF15780)ER
204669.Acid345_3516(PF06662)ER
204669.Acid345_4376PF12704 (PF02687)plastid
204669.Acid345_0896(PF07676)(mitochondrial); mitochondrial
204669.Acid345_0898(PF17137)ER
204669.Acid345_2134(PF13394)(ER)
204669.Acid345_2136PF13620ER
204669.Acid345_0395PF13620ER
204669.Acid345_3350PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_0417PF13620ER
204669.Acid345_0410(PF07676)ER
204669.Acid345_0098(PF09286)mitochondrial
204669.Acid345_3506PF13620ER
204669.Acid345_1617(PF04185)ER
204669.Acid345_4189PF13620ER
204669.Acid345_4181(PF04185)ER
204669.Acid345_1295(PF01059)ER
204669.Acid345_2675PF13620ER
204669.Acid345_2101(PF03544)ER; (ER)
204669.Acid345_4745(PF01789)ER
204669.Acid345_4747(PF06739)ER
204669.Acid345_4401(PF04185)ER
204669.Acid345_0332(PF01833)ER
204669.Acid345_2758PF12704 (PF02687)(ER)
204669.Acid345_2757PF12704 (PF02687)(mitochondrial)
204669.Acid345_1592(PF13432)ER
204669.Acid345_0663PF13620ER
204669.Acid345_1624(PF15902)ER
204669.Acid345_4190PF13620ER
204669.Acid345_4193(PF07676)ER
204669.Acid345_0385(PF13517)mitochondrial; (mitochondrial)
204669.Acid345_2021(PF13432)ER
204669.Acid345_3975(PF13231)(ER)
204669.Acid345_2113(PF03544)ER
204669.Acid345_2347(PF04366)ER
204669.Acid345_2691(PF13432)ER
204669.Acid345_2760(PF12867)ER
204669.Acid345_0054PF13620ER
204669.Acid345_0053PF13620ER
204669.Acid345_0052PF13620ER
204669.Acid345_0691PF13620ER
204669.Acid345_0186PF00641ER
204669.Acid345_4212(PF13231)ER
204669.Acid345_4035(PF14559)ER; (ER)
204669.Acid345_1415PF13620ER
204669.Acid345_4691(PF09990)(ER)
204669.Acid345_2353(PF15902)ER
204669.Acid345_2681(PF04389)ER
204669.Acid345_0466(PF08326)(mitochondrial)
204669.Acid345_3088(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_2826PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_4023PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_1038(PF13231)(mitochondrial)
204669.Acid345_3848(PF04185)(plastid)
204669.Acid345_1015(PF13394)plastid
204669.Acid345_2896PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0824(PF13517) (PF07593)
204669.Acid345_0823(PF13432) (PF14559)
204669.Acid345_0955(PF04343)(mitochondrial)
204669.Acid345_3041PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0559PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_4395PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_4663PF13620(mitochondrial)
204669.Acid345_3471PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0616PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0618PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_3871(PF13432) (PF14559)
204669.Acid345_3116(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_0770(PF13181)(ER)
204669.Acid345_3647PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0604(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_1737PF04916(mitochondrial)
204669.Acid345_1505PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_1506PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0915(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_0917(PF13432)(plastid)
204669.Acid345_4631PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0289PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0754PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0722PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_1708PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_3525PF13620(mitochondrial)
204669.Acid345_2395(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_0737(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_0732(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_3604PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_4377PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_1285PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_2130(PF07837) (PF02971)
204669.Acid345_4414PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_4405(PF03544)(ER)
204669.Acid345_4572PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_0984PF12704 (PF02687)
204669.Acid345_1052(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_3980(PF13181) (PF13432)
204669.Acid345_0263(PF07676)
204669.Acid345_3085(PF03544)
204669.Acid345_1029(PF00643)
204669.Acid345_1151(PF07676)
204669.Acid345_2219(PF07676)
204669.Acid345_3227(PF02223)
204669.Acid345_4520(PF04343)
204669.Acid345_4234(PF07676)
204669.Acid345_0148(PF03544)
204669.Acid345_4664(PF04389)
204669.Acid345_4783PF00837
204669.Acid345_2555(PF13429)
204669.Acid345_4220(PF09752)
204669.Acid345_2154(PF12867)
204669.Acid345_4643(PF13394)
204669.Acid345_1018(PF01833)
204669.Acid345_4493(PF04343)
204669.Acid345_1304(PF01059)
204669.Acid345_2098(PF12867)
204669.Acid345_0956(PF04343)
204669.Acid345_3216(PF08123)
204669.Acid345_3214(PF03544)
204669.Acid345_3133(PF03544)
204669.Acid345_0794(PF07676)
204669.Acid345_3259(PF06202)
204669.Acid345_4480(PF13231)
204669.Acid345_3593(PF12867)
204669.Acid345_0176(PF13394)
204669.Acid345_0810(PF03544)
204669.Acid345_0814(PF06202)
204669.Acid345_4117(PF14559)
204669.Acid345_4118(PF07676)
204669.Acid345_4392(PF07676)
204669.Acid345_4390(PF07676)
204669.Acid345_0560(PF03544)
204669.Acid345_1362(PF04389)
204669.Acid345_0802(PF13394)
204669.Acid345_4727(PF13231)
204669.Acid345_4728(PF13432)
204669.Acid345_2605(PF07998)
204669.Acid345_1220(PF13432)
204669.Acid345_0343(PF01087)
204669.Acid345_4455(PF12867)
204669.Acid345_0638PF13620
204669.Acid345_1494(PF03544)
204669.Acid345_3254(PF14559)
204669.Acid345_1881(PF13432)
204669.Acid345_1887(PF04505)
204669.Acid345_1886(PF04505)
204669.Acid345_1862(PF03544)
204669.Acid345_4015(PF13506)
204669.Acid345_4155(PF07676)
204669.Acid345_3825(PF02223)
204669.Acid345_1586(PF12867)
204669.Acid345_2389(PF14792)
204669.Acid345_0725(PF13231)
204669.Acid345_1703(PF01087)
204669.Acid345_3527(PF14559)
204669.Acid345_1671(PF12867)
204669.Acid345_1675PF00837
204669.Acid345_2012(PF12867)
204669.Acid345_2263(PF12867)
204669.Acid345_4391(PF07676)
204669.Acid345_4087(PF13181)
204669.Acid345_4771(PF08695)
204669.Acid345_0708(PF00025)
204669.Acid345_0077(PF03544)
204669.Acid345_1075(PF12867)
204669.Acid345_0676(PF03544)
204669.Acid345_1272(PF05189)
204669.Acid345_1103PF13620
204669.Acid345_0881(PF13394)
204669.Acid345_2241PF08740
204669.Acid345_0245(PF03544)
204669.Acid345_2024(PF13231)
204669.Acid345_2696(PF01087)
204669.Acid345_1583(PF13231)
204669.Acid345_2836(PF12867)
204669.Acid345_3981(PF12867)
204669.Acid345_2164(PF12867)
204669.Acid345_3368(PF07676)
204669.Acid345_2354(PF12867)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================