Effective results for Desulfitobacterium hafniense Y51 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 460
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 61 eukaryotic-like domains, contained in 460 proteins (102 high, 358 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
138119.DSY3896PF04879 PF00384 PF01568mitochondrial
138119.DSY2741PF04879 PF00384 PF01568(mitochondrial); plastid
138119.DSY3062PF04879 PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY3466PF04879 PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY0357PF04879 PF00384 PF01568mitochondrial
138119.DSY3470PF04879 PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY1448PF04879 PF00384 PF01568mitochondrial; (mitochondrial)
138119.DSY3752PF04879 PF00384 PF01568mitochondrial
138119.DSY0527PF04879 PF00384 PF01568(ER); ER
138119.DSY3410PF00384 PF01568mitochondrial
138119.DSY3969PF04879 PF00384(ER)
138119.DSY3365(PF13183) (PF02754)(ER)
138119.DSY0777PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY0597PF04879 PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY1240PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY1251PF00384 PF01568mitochondrial
138119.DSY4729(PF13183) (PF02754)ER
138119.DSY1713(PF13183) (PF02754)(ER)
138119.DSY3724PF00384 PF01568mitochondrial
138119.DSY2486(PF13183) (PF02754)(ER)
138119.DSY0334PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY3439(PF00037)(mitochondrial)
138119.DSY4303(PF01012) (PF00766)(mitochondrial)
138119.DSY0186PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY4534(PF02683)ER
138119.DSY1941(PF01966)ER; (ER)
138119.DSY4326(PF00037)mitochondrial; (mitochondrial)
138119.DSY3968PF00384 PF01568(plastid)
138119.DSY4010(PF00148)(mitochondrial)
138119.DSY2938(PF13173)mitochondrial; (mitochondrial)
138119.DSY0225(PF00939)ER
138119.DSY0768PF00890(ER)
138119.DSY4014PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY3301(PF01609)(mitochondrial)
138119.DSY1196(PF02683)ER
138119.DSY3058PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY1990PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY1516PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY4078PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY2851(PF01609)(mitochondrial)
138119.DSY0175(PF14526)mitochondrial
138119.DSY0590PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY2532(PF13173)(mitochondrial)
138119.DSY3862(PF00148)mitochondrial
138119.DSY0618PF00890(ER)
138119.DSY4847(PF02310)mitochondrial; (mitochondrial)
138119.DSY2443(PF00882)mitochondrial
138119.DSY1253PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY1254(PF00037)mitochondrial; (mitochondrial)
138119.DSY4285(PF00939)(mitochondrial); plastid
138119.DSY0600PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY0736PF00890ER
138119.DSY1395PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY4615PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY1266PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY2510(PF01609)(mitochondrial)
138119.DSY3803PF00890ER
138119.DSY4131PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY2042(PF02787)(ER)
138119.DSY4603PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY1277PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY1276PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY4423(PF02310)(ER)
138119.DSY2816PF00890ER
138119.DSY4702(PF00809)(ER)
138119.DSY3725PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY3720PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY3536(PF00939)ER
138119.DSY3533(PF00939)ER
138119.DSY0304(PF03601)(ER)
138119.DSY2934(PF01609)(mitochondrial)
138119.DSY4087PF00384 PF01568(mitochondrial)
138119.DSY4975(PF13173)(mitochondrial)
138119.DSY0508(PF01966)ER; (ER)
138119.DSY4717PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY2721(PF02310) (PF02607)(plastid)
138119.DSY3526PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY3837(PF00148)(mitochondrial); plastid
138119.DSY3836(PF00148)ER
138119.DSY3522PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY1457PF05935(ER)
138119.DSY2013(PF01609)ER
138119.DSY1116PF00890(mitochondrial)
138119.DSY0513PF00890(mitochondrial)
138119.DSY4765PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY3740(PF01966)(ER)
138119.DSY0883PF00890mitochondrial
138119.DSY3603PF00890mitochondrial
138119.DSY3512PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY3518PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY0184(PF13173)(mitochondrial)
138119.DSY3351(PF01022)mitochondrial
138119.DSY5002(PF10662)mitochondrial; (mitochondrial)
138119.DSY0526PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY4519(PF02683)ER
138119.DSY3508PF00890(ER)
138119.DSY1628(PF01012) (PF00766) (PF12838)
138119.DSY0689(PF01609)(mitochondrial)
138119.DSY5019PF04879 PF00384 PF01568
138119.DSY2020(PF00348)ER; (ER)
138119.DSY2024(PF09683)ER
138119.DSY4825(PF01609)(mitochondrial)
138119.DSY3797(PF01012) (PF00766)
138119.DSY3151(PF02310) (PF02607)
138119.DSY3155(PF02310) (PF02607)
138119.DSY0947(PF01012) (PF00766)
138119.DSY3567(PF00148)(mitochondrial)
138119.DSY3413PF04879 PF00384
138119.DSY2944(PF00037)(plastid)
138119.DSY0306(PF13183) (PF02754)
138119.DSY0048(PF12681)(mitochondrial)
138119.DSY2161(PF01966)(ER)
138119.DSY3787(PF01012) (PF00766)
138119.DSY4783PF00384 PF01568
138119.DSY0313(PF13183) (PF02754)
138119.DSY2141(PF01022)(ER)
138119.DSY2898PF00890(mitochondrial)
138119.DSY3434(PF01609)(plastid)
138119.DSY0302(PF01966)(mitochondrial)
138119.DSY1776(PF02310) (PF02607)
138119.DSY4906PF00384 PF01568
138119.DSY3236(PF02310)(ER)
138119.DSY3233(PF05034) (PF07476)
138119.DSY4274(PF01326)(mitochondrial)
138119.DSY1511(PF02310) (PF02607)
138119.DSY0586PF00384 PF01568
138119.DSY0588(PF02310) (PF02607)
138119.DSY3205(PF05698) (PF05697)
138119.DSY2332PF00384 PF01568
138119.DSY1986(PF14691) (PF02754)
138119.DSY3218(PF13183) (PF02754)
138119.DSY0299(PF00085)(mitochondrial)
138119.DSY2616PF04879 (PF12838)
138119.DSY3493(PF13353) (PF12345)
138119.DSY1089(PF01609)(plastid)
138119.DSY4610PF00384 PF01568
138119.DSY1269(PF02310) (PF02607)
138119.DSY0936(PF14691) (PF00037)
138119.DSY3647(PF02310) (PF02607)
138119.DSY1073(PF01609)(plastid)
138119.DSY4730(PF01012) (PF00766)
138119.DSY2702(PF13353) (PF12345)
138119.DSY1714(PF01012) (PF00766)
138119.DSY1049(PF14512)(mitochondrial)
138119.DSY4701(PF02310) (PF02607)
138119.DSY2717(PF02310) (PF02607)
138119.DSY3535PF00384 PF01568
138119.DSY2064(PF13183) (PF02754)
138119.DSY4973(PF02310) (PF02607)
138119.DSY2487(PF01012) (PF00766)
138119.DSY1057PF00890plastid
138119.DSY0893PF00384 PF01568
138119.DSY0873(PF14691) (PF02754)
138119.DSY3744(PF02310) (PF02607)
138119.DSY3746(PF02310) (PF02607)
138119.DSY0900(PF01609)(plastid)
138119.DSY0886PF00384 PF01568
138119.DSY3600(PF13353)(plastid)
138119.DSY3514(PF05698) (PF05697)
138119.DSY3356(PF13183) (PF02754)
138119.DSY5005(PF13353) (PF12838)
138119.DSY4517(PF13183) (PF02754)
138119.DSY2583(PF12838)(ER)
138119.DSY1921(PF13183) (PF02754)
138119.DSY1829PF00890(ER)
138119.DSY1638(PF01609)(plastid)
138119.DSY4824PF00384 PF01568
138119.DSY4821PF00384(mitochondrial)
138119.DSY3371(PF01012) (PF00766)
138119.DSY4755(PF02310) (PF02607)
138119.DSY3080(PF01326)(mitochondrial)
138119.DSY3798(PF01012)
138119.DSY4685(PF01966)
138119.DSY0830(PF01022)
138119.DSY4532(PF01609)
138119.DSY4537(PF13155)
138119.DSY4536(PF02371)
138119.DSY3568(PF00148)
138119.DSY0946(PF01012)
138119.DSY0230(PF01966)
138119.DSY4226PF00890
138119.DSY3895(PF00037)
138119.DSY0308(PF12838)
138119.DSY2948(PF12838)
138119.DSY3412(PF00037)
138119.DSY2946(PF01966)
138119.DSY3966(PF13353)
138119.DSY2786(PF14526)
138119.DSY4036(PF01980)
138119.DSY4034(PF02371)
138119.DSY4039(PF12437)
138119.DSY4150(PF01022)
138119.DSY1150(PF01980)
138119.DSY1793(PF06777)
138119.DSY1443(PF00085)
138119.DSY1564(PF02310)
138119.DSY1378(PF12681)
138119.DSY3784(PF01012)
138119.DSY1206(PF02915)
138119.DSY2571PF05935
138119.DSY3551(PF02371)
138119.DSY0226PF05935
138119.DSY4336(PF00037)
138119.DSY2799(PF14526)
138119.DSY0036(PF12224)
138119.DSY4028(PF02371)
138119.DSY4801(PF03601)
138119.DSY1147(PF02915)
138119.DSY0764PF00890
138119.DSY3225(PF01966)
138119.DSY2314(PF01869)
138119.DSY1367(PF10369)
138119.DSY3139PF00890
138119.DSY1215(PF02915)
138119.DSY4792(PF01609)
138119.DSY3048(PF13155)
138119.DSY0961PF00890
138119.DSY4304(PF01012)
138119.DSY0363(PF00148)
138119.DSY0029(PF13155)
138119.DSY0797PF05935
138119.DSY0798(PF00939)
138119.DSY0159(PF00348)
138119.DSY1772(PF13353)
138119.DSY1778(PF01208)
138119.DSY1779(PF01869)
138119.DSY2092(PF13183)
138119.DSY3231(PF01869)
138119.DSY3238(PF01966)
138119.DSY4491(PF12838)
138119.DSY4652PF01348
138119.DSY3050(PF01966)
138119.DSY3052(PF00037)
138119.DSY0973(PF00037)not used
138119.DSY0972PF00890
138119.DSY4270(PF00148)
138119.DSY0979(PF02371)
138119.DSY4472(PF00085)
138119.DSY4471(PF00085)
138119.DSY1992(PF00037)
138119.DSY3446(PF00037)
138119.DSY0015(PF10369)
138119.DSY4009(PF00148)
138119.DSY1510(PF01208)
138119.DSY3844PF01348
138119.DSY1429(PF01966)
138119.DSY1422PF00890
138119.DSY4861(PF13173)
138119.DSY0589(PF00809)
138119.DSY1347(PF02371)
138119.DSY4645(PF12224)
138119.DSY3110(PF01966)
138119.DSY2429(PF00085)
138119.DSY0902PF00890
138119.DSY0903PF00890
138119.DSY4269(PF00148)
138119.DSY4268(PF00148)
138119.DSY0907(PF02683)
138119.DSY4267(PF00148)
138119.DSY2630(PF03063)
138119.DSY4464(PF00085)
138119.DSY4463(PF00085)
138119.DSY1981(PF01966)
138119.DSY1983(PF13353)
138119.DSY3450(PF00037)
138119.DSY3697PF00890
138119.DSY1503(PF02371)
138119.DSY1506(PF09861)
138119.DSY1509(PF00809)
138119.DSY2859(PF02787)
138119.DSY2850(PF02310)
138119.DSY0170(PF13353)
138119.DSY4106(PF01966)
138119.DSY1758(PF13183)
138119.DSY1759(PF02754)
138119.DSY3213(PF01022)
138119.DSY4673(PF01022)
138119.DSY4675(PF02683)
138119.DSY4676(PF00085)
138119.DSY4679(PF01022)
138119.DSY2457(PF10369)
138119.DSY3532(PF02754)
138119.DSY1243(PF01609)
138119.DSY4582(PF01609)
138119.DSY3074(PF13353)
138119.DSY3071(PF01326)
138119.DSY2620PF00890
138119.DSY2623(PF00882)
138119.DSY3663PF00890
138119.DSY3861(PF14526)
138119.DSY3863(PF00148)
138119.DSY3865(PF12838)
138119.DSY2847(PF01966)
138119.DSY3488(PF13353)
138119.DSY0723PF00890
138119.DSY0431(PF02915)
138119.DSY3009(PF00037)
138119.DSY4442(PF03063)
138119.DSY3710(PF02915)
138119.DSY2091(PF02754)
138119.DSY0115(PF12838)
138119.DSY0116(PF13173)
138119.DSY0606(PF04961)
138119.DSY2295(PF01869)
138119.DSY1647(PF00809)
138119.DSY1641(PF01966)
138119.DSY0737(PF13183)
138119.DSY3271(PF01966)
138119.DSY1391PF00890
138119.DSY1268(PF00809)
138119.DSY2273(PF00037)
138119.DSY2511(PF01609)
138119.DSY0285PF00890
138119.DSY2606PF00890
138119.DSY4437(PF07720)
138119.DSY4434(PF02371)
138119.DSY1886(PF01966)
138119.DSY3646(PF00809)
138119.DSY4546(PF12224)
138119.DSY4959(PF01409)
138119.DSY1653(PF03063)
138119.DSY0417(PF13353)
138119.DSY4600(PF01022)
138119.DSY2460(PF01966)
138119.DSY1278(PF00037)
138119.DSY1270(PF01208)
138119.DSY4731(PF01012)
138119.DSY3730(PF01326)
138119.DSY0380(PF04961)
138119.DSY1899(PF01966)
138119.DSY3650PF05935
138119.DSY2704(PF02754)
138119.DSY4554PF01348
138119.DSY0250(PF01208)
138119.DSY4142(PF00085)
138119.DSY4143(PF01022)
138119.DSY4141(PF02683)
138119.DSY4146(PF01022)
138119.DSY1470(PF14512)
138119.DSY4384(PF14691)
138119.DSY2928(PF01966)
138119.DSY1715(PF01012)
138119.DSY0621(PF01869)
138119.DSY4090PF01568
138119.DSY3250(PF09861)
138119.DSY0403(PF00085)
138119.DSY0402(PF01609)
138119.DSY0400PF05935
138119.DSY4966(PF10662)
138119.DSY0409(PF06249)
138119.DSY4630(PF01022)
138119.DSY4633(PF13155)
138119.DSY1048(PF01022)
138119.DSY1040(PF12838)
138119.DSY1043(PF01208)
138119.DSY4700(PF01208)
138119.DSY4709(PF00037)
138119.DSY3728PF00890
138119.DSY0398(PF02787)
138119.DSY0396(PF13353)
138119.DSY2719(PF00809)
138119.DSY0249(PF02310)
138119.DSY3530(PF12838)
138119.DSY3531(PF02754)
138119.DSY0247(PF00939)
138119.DSY0659(PF00085)
138119.DSY0511PF00890
138119.DSY4080(PF12838)
138119.DSY1678(PF01609)
138119.DSY2395(PF09419)
138119.DSY4972(PF00809)
138119.DSY4626(PF01609)
138119.DSY2488(PF01012)
138119.DSY5020(PF13353)
138119.DSY3289(PF01966)
138119.DSY3285(PF13173)
138119.DSY4403(PF01022)
138119.DSY4400(PF01022)
138119.DSY4406(PF12437)
138119.DSY0897(PF00037)
138119.DSY0890(PF00037)
138119.DSY0875(PF01966)
138119.DSY2720(PF01208)
138119.DSY0271(PF01409)
138119.DSY2836(PF05698)
138119.DSY0276PF00890
138119.DSY1458(PF03959)
138119.DSY1456(PF00085)
138119.DSY0641(PF02371)
138119.DSY0083(PF02310)
138119.DSY0086(PF01980)
138119.DSY2014(PF01609)
138119.DSY1604(PF14526)
138119.DSY2123(PF01326)
138119.DSY2232(PF00348)
138119.DSY2235(PF00348)
138119.DSY1022(PF01966)
138119.DSY1021(PF01966)
138119.DSY1027(PF01966)
138119.DSY3290(PF09861)
138119.DSY1336(PF01966)
138119.DSY3745(PF01208)
138119.DSY0866(PF14691)
138119.DSY2732(PF01869)
138119.DSY0862(PF01609)
138119.DSY4219(PF01326)
138119.DSY3519(PF13353)
138119.DSY4173(PF03063)
138119.DSY1933(PF01966)
138119.DSY0076(PF14526)
138119.DSY0073(PF01609)
138119.DSY2009(PF01609)
138119.DSY0183(PF13173)
138119.DSY4199(PF01208)
138119.DSY4191(PF03601)
138119.DSY2135(PF02371)
138119.DSY4995(PF06249)
138119.DSY4990(PF00085)
138119.DSY3192(PF02915)
138119.DSY2221(PF13353)
138119.DSY2223(PF13353)
138119.DSY0528(PF00037)
138119.DSY2355(PF04961)
138119.DSY2351(PF00348)
138119.DSY1851(PF02371)
138119.DSY0853(PF02371)
138119.DSY2745(PF01869)
138119.DSY0986(PF01208)
138119.DSY0213PF00890
138119.DSY1629(PF01012)
138119.DSY4796(PF01609)
138119.DSY2215(PF01609)
138119.DSY2212(PF00348)
138119.DSY2852(PF01609)
138119.DSY4799(PF03601)
138119.DSY2361(PF14691)
138119.DSY3160(PF01966)
138119.DSY0840(PF01609)
138119.DSY2753PF04184
138119.DSY0849(PF01609)
138119.DSY0993(PF00037)
138119.DSY0207(PF00809)
138119.DSY0206(PF01966)
138119.DSY3881(PF09861)
138119.DSY1951(PF01022)
138119.DSY4353(PF14336)
138119.DSY3407(PF02915)
138119.DSY3404(PF14691)
138119.DSY0964(PF00939)
138119.DSY3970(PF12838)
138119.DSY0050PF01348
138119.DSY2027(PF00348)
138119.DSY4820PF01568
138119.DSY3372(PF01012)
138119.DSY3376(PF03063)
138119.DSY3088(PF03266)
138119.DSY4756(PF01208)
138119.DSY4754(PF00809)
138119.DSY3087(PF02754)
138119.DSY1304(PF01609)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================