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Effective results for Desulfosporosinus orientis DSM 765 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 644
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 87 eukaryotic-like domains, contained in 644 proteins (137 high, 507 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
768706.Desor_1213(PF02954) (PF00571) (PF00989) (PF13188) (PF00158)(mitochondrial)
768706.Desor_1199(PF00571) (PF00989) (PF00158)(ER)
768706.Desor_2966(PF02954) (PF00571) (PF00989) (PF13188) (PF00158)
768706.Desor_3953(PF00571) (PF00989) (PF00158) (PF02954)(mitochondrial)
768706.Desor_4209(PF02954) (PF00571) (PF00989) (PF13188) (PF00158)
768706.Desor_1178(PF02954) (PF00571) (PF13188) (PF00158)(plastid)
768706.Desor_1646PF02607 PF02310(mitochondrial); (plastid)
768706.Desor_4107(PF00571) (PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_3138(PF04879) (PF01568)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_0581(PF00158) (PF02954)mitochondrial
768706.Desor_2768(PF00989) (PF00158) (PF02954)(mitochondrial)
768706.Desor_1689(PF00989) (PF00158)(mitochondrial); mitochondrial
768706.Desor_4949(PF02906) (PF02256)(mitochondrial)
768706.Desor_2973(PF00725) (PF02737)ER; (ER)
768706.Desor_2571(PF00571) (PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_2880(PF06925) (PF04101)ER
768706.Desor_2965(PF00571) (PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_3577(PF04879) (PF01568)mitochondrial
768706.Desor_2559(PF04879) (PF01568)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_1768(PF00725) (PF02737)(mitochondrial)
768706.Desor_5478PF02310 (PF04055)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_3189PF02754 PF13183ER
768706.Desor_1757(PF02803) (PF00108)(mitochondrial)
768706.Desor_3231(PF06925) (PF04101)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_5363(PF13187) (PF02906) (PF02256)
768706.Desor_5366(PF01966)ER
768706.Desor_1641(PF06249)(mitochondrial)
768706.Desor_0846(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4589(PF01558)(mitochondrial)
768706.Desor_0023(PF01558) (PF17147) (PF01855)
768706.Desor_3137(PF00037)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_3910(PF00989)ER
768706.Desor_3917(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_0852(PF02803) (PF00108)(mitochondrial)
768706.Desor_1183(PF00939)ER
768706.Desor_1327(PF00037)(mitochondrial)
768706.Desor_3031(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4903(PF04101)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_2769(PF02028)(ER); ER
768706.Desor_0621(PF01969)(ER)
768706.Desor_1447(PF00571)(ER)
768706.Desor_0487(PF02361)ER
768706.Desor_0310(PF00909)ER
768706.Desor_3020(PF13188) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_2154(PF06445)mitochondrial
768706.Desor_5356(PF00909)ER
768706.Desor_0838(PF13188) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1053(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4803(PF00989)ER
768706.Desor_4336(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1230(PF13188) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1300(PF04055)(mitochondrial)
768706.Desor_2143(PF02028)ER
768706.Desor_4477(PF00037) (PF01568) (PF04879)
768706.Desor_0573(PF02028)ER; (ER)
768706.Desor_3170(PF00037)mitochondrial
768706.Desor_1149(PF02028)ER
768706.Desor_1141(PF00158) (PF02954)(mitochondrial)
768706.Desor_4047(PF00909)ER
768706.Desor_4045(PF00909)ER
768706.Desor_0214(PF02361)ER
768706.Desor_3459PF02754 (PF02589) PF13183
768706.Desor_1022(PF00989)(ER)
768706.Desor_1770(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_0193(PF13607)(mitochondrial)
768706.Desor_4051(PF01966)ER
768706.Desor_0350(PF00571)(mitochondrial)
768706.Desor_2069(PF04055)mitochondrial
768706.Desor_4998(PF01966)(mitochondrial)
768706.Desor_1742(PF00939)ER
768706.Desor_4195(PF06445)mitochondrial
768706.Desor_4423(PF02028)ER
768706.Desor_1902(PF10662)(mitochondrial)
768706.Desor_3858(PF14512)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_5075(PF00909)ER
768706.Desor_4211(PF00571) (PF00989) (PF00158)
768706.Desor_2719(PF14526)(mitochondrial)
768706.Desor_4155(PF13188) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4405(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4409(PF00037) (PF01855)(mitochondrial)
768706.Desor_4087(PF01558) (PF17147) (PF01855)
768706.Desor_4111(PF02361)ER
768706.Desor_3054(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4401(PF13188) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_5055(PF13187)ER
768706.Desor_1119(PF00037)(mitochondrial)
768706.Desor_0803PF01208(mitochondrial)
768706.Desor_3816(PF00037)(mitochondrial)
768706.Desor_2813(PF00037)(ER)
768706.Desor_5091(PF02589) PF13183(mitochondrial)
768706.Desor_5090PF02754 (PF02589) PF13183
768706.Desor_2728(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1139(PF02028)ER
768706.Desor_5418(PF10662)mitochondrial; (mitochondrial)
768706.Desor_0865(PF13188) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1714(PF02028)ER; (ER)
768706.Desor_3480(PF01966)ER
768706.Desor_4593(PF00989) (PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1448(PF00571)ER
768706.Desor_2522(PF00037)(mitochondrial)
768706.Desor_2832(PF01966)ER
768706.Desor_4966(PF00939)(ER)
768706.Desor_5169PF02607 PF02310
768706.Desor_0849(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_0845(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_0843(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_0842(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_1649PF02607 PF02310
768706.Desor_4105(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_4101(PF13187) (PF02906)
768706.Desor_4566(PF02589) PF13183
768706.Desor_4585PF02754 PF13183
768706.Desor_3002(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_3009(PF13188) (PF00158)
768706.Desor_3136(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_2609PF02607 PF02310
768706.Desor_2601(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_2600(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_2355(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_2354(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_2996PF02550 PF13336
768706.Desor_2995PF02550 PF13336
768706.Desor_3912PF02550 PF13336
768706.Desor_3913(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_3916(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_2514(PF01326)(mitochondrial)
768706.Desor_2771(PF01968) (PF05378)
768706.Desor_0851(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_0853PF02550 PF13336
768706.Desor_0857(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_1181(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_1182(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_1673(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_0580(PF03099)(mitochondrial)
768706.Desor_1699PF02754 PF13183
768706.Desor_1218PF02550 PF13336
768706.Desor_0617(PF01729) (PF02749)
768706.Desor_1321PF02754 PF13183
768706.Desor_3106(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_2348(PF04775) (PF08840)
768706.Desor_3219PF02754 PF13183
768706.Desor_2987(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_2981(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_5232(PF14512)(mitochondrial)
768706.Desor_1208(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_1209(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_0629(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4013(PF01966)(ER)
768706.Desor_1137PF02607 PF02310
768706.Desor_3754(PF04055)(mitochondrial)
768706.Desor_3207(PF01968) (PF05378)
768706.Desor_2084PF02607 PF02310
768706.Desor_2080PF02607 PF02310
768706.Desor_2088(PF13237) (PF02906)
768706.Desor_2978(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_2972(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_2975(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_2976(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_2570PF02550 PF13336
768706.Desor_2403PF02754 PF13183
768706.Desor_0836(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_0835(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_0839PF02550 PF13336
768706.Desor_1056(PF17147) (PF01855)
768706.Desor_4337(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4330(PF03099) (PF04055)
768706.Desor_1146PF02607 PF02310
768706.Desor_4063(PF13187)(plastid)
768706.Desor_4062(PF17147) (PF01855)
768706.Desor_4147PF02607 PF02310
768706.Desor_2361(PF01568)(ER)
768706.Desor_2368PF02607 PF02310
768706.Desor_2968PF02550 PF13336
768706.Desor_2962(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_2960(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_3306PF02754 PF13183
768706.Desor_2566(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_2568(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_2891(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_3941PF02607 PF02310
768706.Desor_4258PF00809(mitochondrial)
768706.Desor_4257PF02607 PF02310
768706.Desor_4327PF02754 PF13183
768706.Desor_1224(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_1225(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_1227(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_1229PF02550 PF13336
768706.Desor_1558PF02607 PF02310
768706.Desor_0579(PF04055)(mitochondrial)
768706.Desor_3172(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_2556(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_3957(PF02803) (PF00108)
768706.Desor_5248(PF01968) (PF05378)
768706.Desor_5249(PF01968) (PF05378)
768706.Desor_1142PF02607 PF02310
768706.Desor_4317(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_0782(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_0568(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1568(PF02906) (PF02256)
768706.Desor_2999(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_3095PF02754 PF13183
768706.Desor_2546(PF00989) (PF00158)
768706.Desor_2540(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_2944PF02607 PF02310
768706.Desor_2949PF02607 PF02310
768706.Desor_5015(PF02971) (PF07837)
768706.Desor_5011(PF04055)(plastid)
768706.Desor_1150(PF00571) (PF00158)
768706.Desor_5275(PF05034) (PF07476)
768706.Desor_1771(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_4279PF02754 PF13183
768706.Desor_1371(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_0515(PF04055)(mitochondrial)
768706.Desor_2939(PF01968) (PF05378)
768706.Desor_5463PF02754 PF13183
768706.Desor_1166(PF00989) (PF00158)
768706.Desor_0767PF02754 PF13183
768706.Desor_4425(PF01968) (PF05378)
768706.Desor_0187PF02754 PF13183
768706.Desor_3522(PF14512)(mitochondrial)
768706.Desor_1900(PF00939)(ER)
768706.Desor_2921(PF06925) (PF04101)
768706.Desor_2077(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1172(PF13187)(mitochondrial)
768706.Desor_1174(PF03099) (PF02237)
768706.Desor_1179(PF03099) (PF02237)
768706.Desor_0108(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_1751(PF00989) (PF00158)
768706.Desor_1756(PF00725) (PF02737)
768706.Desor_1357(PF13188) (PF00158)
768706.Desor_4433(PF04879) (PF01568)
768706.Desor_1594(PF00037) (PF01855)
768706.Desor_0402(PF01729) (PF02749)
768706.Desor_2864PF02607 PF02310
768706.Desor_3993(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_2489PF02310 (PF04055)
768706.Desor_5060(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_1290PF02754 PF13183
768706.Desor_2712(PF00158) (PF02954)
768706.Desor_2715PF02607 PF02310
768706.Desor_1108PF02754 PF13183
768706.Desor_4530PF03727 PF00349
768706.Desor_4151PF02607 PF02310
768706.Desor_4153PF02607 PF02310
768706.Desor_0418PF02607 PF02310
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768706.Desor_2396(PF14526)
768706.Desor_3460(PF02589)
768706.Desor_3747(PF04055)
768706.Desor_3210(PF04055)
768706.Desor_2027(PF04055)
768706.Desor_2618(PF01969)
768706.Desor_5041(PF01966)
768706.Desor_2734PF00809
768706.Desor_2610PF01208
768706.Desor_5425(PF01633)
768706.Desor_3748(PF04055)
768706.Desor_4397PF00809
768706.Desor_1639(PF13534)
768706.Desor_5559(PF04055)
768706.Desor_1631(PF00158)
768706.Desor_1387(PF01966)
768706.Desor_1250(PF01597)
768706.Desor_4557(PF04055)
768706.Desor_1254(PF03601)
768706.Desor_1256(PF03601)
768706.Desor_4559PF13336
768706.Desor_3961(PF01966)
768706.Desor_4601(PF02361)
768706.Desor_2799PF00809
768706.Desor_3075(PF00085)
768706.Desor_2257(PF01695)
768706.Desor_3818(PF00989)
768706.Desor_3250(PF00037)
768706.Desor_3701(PF04055)
768706.Desor_2653(PF13187)
768706.Desor_3490(PF04055)
768706.Desor_3927(PF00085)
768706.Desor_3929PF05935
768706.Desor_3928(PF00085)
768706.Desor_1704(PF03099)
768706.Desor_2037(PF03063)
768706.Desor_5413(PF13534)
768706.Desor_5410(PF06249)
768706.Desor_1138PF00809
768706.Desor_1398(PF01869)
768706.Desor_5349(PF01966)
768706.Desor_5569(PF04055)
768706.Desor_0868(PF12806)
768706.Desor_0719(PF01966)
768706.Desor_1623(PF04055)
768706.Desor_0860(PF00037)
768706.Desor_1404(PF13534)
768706.Desor_1243(PF00085)
768706.Desor_1247PF05935
768706.Desor_1244(PF00085)
768706.Desor_1248(PF00939)
768706.Desor_0660(PF00037)
768706.Desor_0448(PF00037)
768706.Desor_3067(PF12806)
768706.Desor_3397(PF04055)
768706.Desor_3663(PF00989)
768706.Desor_5620(PF00571)
768706.Desor_3805(PF13237)
768706.Desor_3716(PF00989)
768706.Desor_3245(PF01969)
768706.Desor_3246(PF00731)
768706.Desor_3488(PF04055)
768706.Desor_2622PF01208
768706.Desor_3930PF05935
768706.Desor_3939PF01208
768706.Desor_2534(PF12806)
768706.Desor_2536(PF12806)
768706.Desor_2759(PF00085)
768706.Desor_5573(PF00571)
768706.Desor_5576(PF00571)
768706.Desor_1650PF00809
768706.Desor_0707(PF00731)
768706.Desor_4282(PF09861)
768706.Desor_1478(PF14526)
768706.Desor_1471(PF02915)
768706.Desor_1270(PF13237)
768706.Desor_4577(PF03601)
768706.Desor_1278(PF04055)
768706.Desor_0675(PF01695)
768706.Desor_4592(PF00037)
768706.Desor_4757(PF00571)
768706.Desor_0455PF02310
768706.Desor_1535PF02310
768706.Desor_3232(PF00882)
768706.Desor_1875(PF01558)
768706.Desor_1876(PF13607)
768706.Desor_4403PF01208
768706.Desor_2831(PF04055)
768706.Desor_2525(PF06445)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================