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Effective results for Clostridium cellulovorans 743B (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 221
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 58 eukaryotic-like domains, contained in 221 proteins (27 high, 194 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
573061.Clocel_2803(PF13290) (PF00112) PF13854ER
573061.Clocel_0982(PF13290) (PF01344) (PF00112)ER
573061.Clocel_1013(PF02368) PF00622ER; (ER)
573061.Clocel_1012(PF02368) PF00622(ER)
573061.Clocel_3099PF03442 (PF00150)ER
573061.Clocel_2607(PF13290) (PF02156)ER
573061.Clocel_2606PF03442 (PF00150)ER
573061.Clocel_2600PF03442 (PF00150)ER
573061.Clocel_2612(PF02368) (PF01344)(ER)
573061.Clocel_2575(PF02156) (PF16990)(ER)
573061.Clocel_4227(PF03412) (PF00664)mitochondrial
573061.Clocel_1477PF00759 (PF02018)ER
573061.Clocel_1476PF00759 (PF02018)ER
573061.Clocel_1478PF00759 (PF02018)ER
573061.Clocel_2821PF00759 (PF02018)ER
573061.Clocel_4119(PF02156) (PF16990)mitochondrial; (mitochondrial)
573061.Clocel_0310(PF02368) (PF01344)(ER)
573061.Clocel_2816PF00759 (PF02018)(ER)
573061.Clocel_0865(PF00664)(mitochondrial)
573061.Clocel_0864(PF00664)ER
573061.Clocel_3327PF03442ER
573061.Clocel_3326PF03442ER
573061.Clocel_2876(PF12513)(mitochondrial)
573061.Clocel_0464(PF06445)mitochondrial
573061.Clocel_2818(PF00150)ER
573061.Clocel_1305(PF02368)ER
573061.Clocel_3077(PF02368)ER
573061.Clocel_0066(PF13529)ER
573061.Clocel_1420PF00759ER
573061.Clocel_1425(PF02368)ER
573061.Clocel_1108(PF00664)(mitochondrial)
573061.Clocel_2815(PF02018)ER
573061.Clocel_1432(PF00150)(mitochondrial)
573061.Clocel_1211(PF02368)(ER)
573061.Clocel_1210(PF02368)ER
573061.Clocel_3877(PF13529)ER
573061.Clocel_3870(PF12646)(mitochondrial)
573061.Clocel_3209(PF13529)ER
573061.Clocel_2642(PF01095)mitochondrial
573061.Clocel_2484(PF00664)mitochondrial
573061.Clocel_2461(PF00664)(mitochondrial)
573061.Clocel_1175(PF02156)ER
573061.Clocel_3193(PF13290)ER
573061.Clocel_1005PF03442ER
573061.Clocel_0320(PF04286)(ER)
573061.Clocel_4180(PF02368)ER
573061.Clocel_0438(PF17124)(ER); ER
573061.Clocel_1342(PF02018)(mitochondrial)
573061.Clocel_1580(PF13529)ER
573061.Clocel_0981(PF02368)ER
573061.Clocel_0983(PF00150)ER
573061.Clocel_3408(PF13529)ER
573061.Clocel_1577(PF13638)ER
573061.Clocel_2282(PF00664)ER
573061.Clocel_1150(PF00150)(ER)
573061.Clocel_3159(PF00664)mitochondrial
573061.Clocel_0619(PF00150)ER
573061.Clocel_4053(PF16990)ER
573061.Clocel_1624PF00759ER
573061.Clocel_2900(PF02018)ER
573061.Clocel_0145(PF09394)ER
573061.Clocel_0146(PF09394)ER
573061.Clocel_0147(PF09394)ER
573061.Clocel_0148(PF02368)ER; (mitochondrial)
573061.Clocel_0149(PF00112)ER
573061.Clocel_0972(PF00664)ER
573061.Clocel_3176(PF02368)ER
573061.Clocel_4250(PF14526)(mitochondrial); (plastid)
573061.Clocel_3615(PF16990)ER
573061.Clocel_2887(PF00664)ER
573061.Clocel_3756(PF13638)ER
573061.Clocel_2718(PF02018)ER
573061.Clocel_2576PF00759(mitochondrial)
573061.Clocel_3114(PF01095)ER
573061.Clocel_3111(PF00150)ER
573061.Clocel_1997PF08235ER; mitochondrial
573061.Clocel_4124(PF02156)ER; (ER)
573061.Clocel_4236(PF00664)ER
573061.Clocel_1455(PF02368)ER
573061.Clocel_0211(PF01095)ER
573061.Clocel_0587(PF04286)ER
573061.Clocel_3359(PF00150)ER
573061.Clocel_0930PF00759mitochondrial; (mitochondrial)
573061.Clocel_4109(PF02368)ER
573061.Clocel_2741PF00759ER
573061.Clocel_0309(PF01344)ER
573061.Clocel_0905(PF00150)ER
573061.Clocel_1652(PF00664)ER
573061.Clocel_1651(PF00664)(ER); (mitochondrial)
573061.Clocel_3242(PF00150)ER
573061.Clocel_3246(PF02368)ER
573061.Clocel_2822PF00759mitochondrial; (mitochondrial)
573061.Clocel_2824PF03442ER
573061.Clocel_3662(PF00150)ER
573061.Clocel_2535(PF02368)ER
573061.Clocel_0912(PF00150)ER
573061.Clocel_1134(PF02156)ER
573061.Clocel_2819PF00759(ER)
573061.Clocel_4318(PF06445) (PF00165)
573061.Clocel_1426(PF03412) (PF00664)
573061.Clocel_2717(PF06165) (PF17167)
573061.Clocel_2017(PF06245)(mitochondrial)
573061.Clocel_0646(PF06165) (PF17167)
573061.Clocel_0740(PF03412) (PF00664)
573061.Clocel_2848(PF03412) (PF00664)
573061.Clocel_1481(PF09359)(mitochondrial)
573061.Clocel_0143(PF03412) (PF00664)
573061.Clocel_0816(PF03412) (PF00664)
573061.Clocel_4261(PF03412) (PF00664)
573061.Clocel_0391(PF06165) (PF17167)
573061.Clocel_1947(PF02156) (PF16990)
573061.Clocel_2715(PF06165) (PF17167)
573061.Clocel_0032(PF06165) (PF17167)
573061.Clocel_4224(PF03412) (PF00664)
573061.Clocel_2170(PF03266)(plastid)
573061.Clocel_3341(PF14526)(mitochondrial)
573061.Clocel_0442(PF17124)(ER)
573061.Clocel_0462(PF13518)
573061.Clocel_3988(PF00438)
573061.Clocel_0656(PF06777)
573061.Clocel_4160(PF08000)
573061.Clocel_0674(PF01416)
573061.Clocel_1239(PF00664)
573061.Clocel_1238(PF00664)
573061.Clocel_1424(PF01095)
573061.Clocel_3040(PF00438)
573061.Clocel_2400(PF10042)
573061.Clocel_0408(PF14512)
573061.Clocel_0344(PF13353)
573061.Clocel_3456(PF07478)
573061.Clocel_3455PF08638
573061.Clocel_3699(PF01416)
573061.Clocel_1214(PF07478)
573061.Clocel_0502(PF14249)
573061.Clocel_4339PF10469
573061.Clocel_3429(PF03063)
573061.Clocel_2647(PF08357)
573061.Clocel_2485(PF00664)
573061.Clocel_1178(PF10042)
573061.Clocel_1177(PF13353)
573061.Clocel_1171(PF03596)
573061.Clocel_0183(PF14526)
573061.Clocel_0186(PF06445)
573061.Clocel_3433(PF06968)
573061.Clocel_2076(PF13353)
573061.Clocel_0365(PF03063)
573061.Clocel_3982(PF12224)
573061.Clocel_2587(PF03063)
573061.Clocel_2281(PF00664)
573061.Clocel_3887(PF13246)
573061.Clocel_1027(PF13353)
573061.Clocel_3085(PF07478)
573061.Clocel_3158(PF00664)
573061.Clocel_1147(PF09359)
573061.Clocel_3892(PF04505)
573061.Clocel_3890(PF04505)
573061.Clocel_3146(PF06245)
573061.Clocel_1812(PF13353)
573061.Clocel_3556(PF02732)
573061.Clocel_0775(PF12224)
573061.Clocel_1637(PF13353)
573061.Clocel_4262(PF05147)
573061.Clocel_0973(PF00664)
573061.Clocel_3175(PF13638)
573061.Clocel_0809(PF13518)
573061.Clocel_4256(PF05147)
573061.Clocel_2703(PF06445)
573061.Clocel_1055(PF13518)
573061.Clocel_1053(PF14526)
573061.Clocel_2094(PF13353)
573061.Clocel_0940(PF13353)
573061.Clocel_0941(PF13353)
573061.Clocel_1944(PF08000)
573061.Clocel_3169(PF01633)
573061.Clocel_3167(PF01633)
573061.Clocel_2886(PF00664)
573061.Clocel_3287(PF14526)
573061.Clocel_1198(PF03063)
573061.Clocel_1064(PF03596)
573061.Clocel_1069(PF06445)
573061.Clocel_0829(PF14311)
573061.Clocel_1996(PF13518)
573061.Clocel_3362(PF14512)
573061.Clocel_4122(PF13353)
573061.Clocel_4127(PF13353)
573061.Clocel_3292(PF06445)
573061.Clocel_4231(PF03063)
573061.Clocel_1299(PF01416)
573061.Clocel_0210(PF14526)
573061.Clocel_1077PF04916
573061.Clocel_0588(PF04286)
573061.Clocel_2999(PF08000)
573061.Clocel_4228(PF05147)
573061.Clocel_4225(PF05147)
573061.Clocel_1516(PF03063)
573061.Clocel_1460(PF12847)
573061.Clocel_2372(PF06968)
573061.Clocel_3829(PF00664)
573061.Clocel_1082(PF13518)
573061.Clocel_2190PF06355
573061.Clocel_0490(PF06968)
573061.Clocel_3345(PF06445)
573061.Clocel_3504(PF00438)
573061.Clocel_0693(PF07478)
573061.Clocel_3830(PF00664)
573061.Clocel_3905(PF00664)
573061.Clocel_3906(PF00664)
573061.Clocel_2235(PF13353)
573061.Clocel_2232(PF14512)
573061.Clocel_3126(PF07478)
573061.Clocel_0875(PF05147)
573061.Clocel_3337(PF00664)
573061.Clocel_1657(PF01991)
573061.Clocel_1898(PF13353)
573061.Clocel_4209(PF13518)
573061.Clocel_0684(PF06968)
573061.Clocel_1400(PF13246)
573061.Clocel_3665(PF13353)
573061.Clocel_3666(PF13353)
573061.Clocel_2536(PF02368)
573061.Clocel_2229(PF12847)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================