Metamenu

Effective results for Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 172
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 28 eukaryotic-like domains, contained in 172 proteins (30 high, 142 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
457570.Nther_1255(PF06695)ER
457570.Nther_0728(PF04069)ER
457570.Nther_1248(PF12838) (PF01512)(mitochondrial)
457570.Nther_2048(PF04069)ER
457570.Nther_2830(PF13518)ER
457570.Nther_2053(PF04069)ER
457570.Nther_2454(PF03553)ER
457570.Nther_2453PF06746ER; (mitochondrial)
457570.Nther_2635(PF04069)ER
457570.Nther_0412(PF01558) (PF17147) (PF01855)
457570.Nther_1834(PF03553)ER
457570.Nther_1827(PF04069)ER
457570.Nther_0957PF14851ER
457570.Nther_0889(PF04069)ER
457570.Nther_2498(PF13353)(mitochondrial)
457570.Nther_1557(PF12799)ER
457570.Nther_1090(PF04069)ER
457570.Nther_0921(PF03553)ER
457570.Nther_1620(PF04069)ER
457570.Nther_1086(PF12838)ER
457570.Nther_1088(PF01558) (PF17147) (PF01855)
457570.Nther_0913(PF13237)(mitochondrial); mitochondrial
457570.Nther_0266(PF02371)(mitochondrial); mitochondrial
457570.Nther_0121(PF04069)ER
457570.Nther_0672(PF04069)ER
457570.Nther_1608(PF04069)ER
457570.Nther_0647(PF12838)mitochondrial
457570.Nther_2649(PF03553)ER
457570.Nther_1045(PF12799)ER
457570.Nther_0499(PF12838)ER
457570.Nther_2723(PF03553)ER; (ER)
457570.Nther_2651(PF03553)ER
457570.Nther_0623(PF06695)ER
457570.Nther_1016(PF04069)ER
457570.Nther_0021(PF01558) (PF17147) (PF01855)
457570.Nther_1484(PF01558)(mitochondrial)
457570.Nther_2608(PF12799)ER; (ER)
457570.Nther_2818(PF07837) (PF02971)
457570.Nther_0099(PF12838) (PF01512)
457570.Nther_1558(PF14512)(plastid)
457570.Nther_1081(PF13237) (PF01512)
457570.Nther_2697(PF01558)(ER)
457570.Nther_2593(PF13237) (PF01512)
457570.Nther_1677(PF17147) (PF01855)
457570.Nther_0494(PF13237) (PF01512)
457570.Nther_0539(PF13237) (PF01512)
457570.Nther_0708PF02117ER; not used
457570.Nther_2679(PF03553)(ER)
457570.Nther_0022(PF17147) (PF01855)
457570.Nther_1482(PF17147) (PF01855)
457570.Nther_1250(PF07085)
457570.Nther_1745(PF13353)
457570.Nther_2078(PF02371)
457570.Nther_2477(PF13353)
457570.Nther_1923PF00078
457570.Nther_1922PF00078
457570.Nther_1925(PF02371)
457570.Nther_1814(PF02811)
457570.Nther_1034(PF02371)
457570.Nther_2917(PF06071)
457570.Nther_2828(PF01527)
457570.Nther_2826PF06888
457570.Nther_2823(PF02811)
457570.Nther_0758(PF01527)
457570.Nther_2136(PF13353)
457570.Nther_2131(PF01527)
457570.Nther_0970(PF13353)
457570.Nther_0975PF00078
457570.Nther_0976PF00078
457570.Nther_1112(PF02371)
457570.Nther_2838PF00078
457570.Nther_0185(PF13518)
457570.Nther_2426PF00078
457570.Nther_2586(PF02371)
457570.Nther_2459(PF13518)
457570.Nther_2636(PF03553)
457570.Nther_1901PF00078
457570.Nther_1831(PF02371)
457570.Nther_1835(PF06071)
457570.Nther_2126(PF14512)
457570.Nther_1592(PF01527)
457570.Nther_1572(PF05637)
457570.Nther_2025(PF02811)
457570.Nther_2028(PF02811)
457570.Nther_0799(PF01527)
457570.Nther_0555(PF13353)
457570.Nther_1820PF00078
457570.Nther_0428(PF04961)
457570.Nther_0318(PF12838)
457570.Nther_0764(PF01527)
457570.Nther_0762(PF01527)
457570.Nther_0169(PF02371)
457570.Nther_0094(PF07085)
457570.Nther_0095(PF02811)
457570.Nther_0093(PF13237)
457570.Nther_0091(PF07085)
457570.Nther_1786(PF13353)
457570.Nther_0546(PF07085)
457570.Nther_0549(PF02811)
457570.Nther_2329(PF04961)
457570.Nther_2148(PF12838)
457570.Nther_2146(PF02371)
457570.Nther_1387PF00078
457570.Nther_0235(PF02371)
457570.Nther_0239(PF13353)
457570.Nther_2550PF00078
457570.Nther_2775(PF01558)
457570.Nther_2774PF06888
457570.Nther_2776(PF01855)
457570.Nther_2778PF00078
457570.Nther_1978(PF01527)
457570.Nther_2554(PF01527)
457570.Nther_0142PF00078
457570.Nther_1528(PF01527)
457570.Nther_1530(PF01527)
457570.Nther_2375PF00078
457570.Nther_0126(PF13353)
457570.Nther_0128(PF13237)
457570.Nther_1439(PF02811)
457570.Nther_1432(PF13237)
457570.Nther_0697PF00078
457570.Nther_1507(PF01527)
457570.Nther_0584PF00078
457570.Nther_1618PF00078
457570.Nther_2185PF00078
457570.Nther_2698(PF01855)
457570.Nther_1985(PF01527)
457570.Nther_0904(PF13353)
457570.Nther_2425(PF02371)
457570.Nther_0640(PF03266)
457570.Nther_2734(PF02371)
457570.Nther_2736(PF02371)
457570.Nther_1995(PF02811)
457570.Nther_1455PF00078
457570.Nther_1678(PF12838)
457570.Nther_1675(PF01558)
457570.Nther_2438(PF13353)
457570.Nther_2652PF00078
457570.Nther_0812PF00078
457570.Nther_0256(PF01527)
457570.Nther_2886(PF13353)
457570.Nther_0714(PF01527)
457570.Nther_1714PF00078
457570.Nther_0624PF00078
457570.Nther_2242(PF03553)
457570.Nther_2662(PF12838)
457570.Nther_1060(PF12799)
457570.Nther_1479(PF02811)
457570.Nther_0703(PF01512)
457570.Nther_0704(PF12838)
457570.Nther_2525(PF01527)
457570.Nther_2704(PF13518)
457570.Nther_1879(PF13237)
457570.Nther_1878PF00078
457570.Nther_0527(PF13518)
457570.Nther_2418(PF12838)
457570.Nther_2671(PF03553)
457570.Nther_0387(PF13518)
457570.Nther_0836(PF12838)
457570.Nther_1126(PF13353)
457570.Nther_1128(PF13353)
457570.Nther_1463PF00078
457570.Nther_1265(PF13353)
457570.Nther_0028(PF13518)
457570.Nther_0025(PF12838)
457570.Nther_0024(PF01558)
457570.Nther_1481(PF12838)
457570.Nther_0737(PF13518)
457570.Nther_0736(PF03553)
457570.Nther_2067PF00078
457570.Nther_2269(PF13518)
457570.Nther_2606(PF02371)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================