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Effective results for Chloroflexus aurantiacus J-10-fl (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 218
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 39 eukaryotic-like domains, contained in 218 proteins (7 high, 211 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
324602.Caur_1385(PF13439) (PF00534)(mitochondrial)
324602.Caur_3759(PF13439) (PF00534)(mitochondrial)
324602.Caur_1919(PF00534) (PF13579)(mitochondrial)
324602.Caur_2126(PF13579) (PF13692)(mitochondrial)
324602.Caur_0649(PF13415) PF13854ER
324602.Caur_1059(PF13185) (PF13492)ER
324602.Caur_0077(PF00534) (PF13579)(mitochondrial)
324602.Caur_0991(PF00534) (PF13579)mitochondrial; (ER)
324602.Caur_1370(PF13439) (PF00534)(ER)
324602.Caur_3444(PF13439) (PF00534)(mitochondrial)
324602.Caur_0160(PF00534) (PF13579)(mitochondrial)
324602.Caur_1539(PF13579) (PF13692)mitochondrial
324602.Caur_3475(PF00534) (PF13579)(mitochondrial); mitochondrial
324602.Caur_3649(PF13231)mitochondrial
324602.Caur_0129(PF02374)mitochondrial
324602.Caur_0125(PF02374)mitochondrial
324602.Caur_0634(PF13231)ER
324602.Caur_0413(PF03209)mitochondrial
324602.Caur_0708(PF13231)(ER)
324602.Caur_1657(PF01740)ER
324602.Caur_1474(PF01740)ER
324602.Caur_2078(PF06739)(ER); plastid
324602.Caur_2816(PF13185)(ER)
324602.Caur_3650(PF13231)(ER)
324602.Caur_3233(PF01909)ER
324602.Caur_0130(PF02374)mitochondrial; (mitochondrial)
324602.Caur_1711PF03415mitochondrial
324602.Caur_0402(PF13185)ER
324602.Caur_0711(PF13231)ER
324602.Caur_0710(PF13231)ER
324602.Caur_3287(PF13579)mitochondrial; (plastid)
324602.Caur_1442(PF13185)(ER)
324602.Caur_1446(PF10162)ER
324602.Caur_2666(PF01740)(ER)
324602.Caur_2938(PF02374)mitochondrial
324602.Caur_3282(PF02844) (PF02843)(ER)
324602.Caur_1878(PF00534)(mitochondrial)
324602.Caur_0471(PF02374)mitochondrial
324602.Caur_1678(PF08239)ER
324602.Caur_2129(PF00534) (PF13579)(mitochondrial)
324602.Caur_2236(PF12773)ER
324602.Caur_0879(PF11852)ER
324602.Caur_0647PF03415ER
324602.Caur_0642(PF00534) (PF13579)(mitochondrial)
324602.Caur_1846(PF10013)(mitochondrial)
324602.Caur_0469(PF13559)ER
324602.Caur_0466(PF13185)mitochondrial
324602.Caur_1339(PF13231)ER
324602.Caur_1035(PF13185)(mitochondrial); (plastid)
324602.Caur_3341(PF13185)ER
324602.Caur_3767(PF13231)ER
324602.Caur_0682(PF03209)mitochondrial; (mitochondrial)
324602.Caur_1130(PF12483)ER
324602.Caur_1313(PF11852)ER
324602.Caur_1651(PF13185)ER
324602.Caur_2117(PF13439) (PF00534)(plastid)
324602.Caur_2592(PF03209)ER
324602.Caur_2754(PF13185)ER; (ER)
324602.Caur_2753(PF13185)ER
324602.Caur_3378(PF13185)(mitochondrial)
324602.Caur_3884(PF13231)ER
324602.Caur_3404(PF13559)ER
324602.Caur_1832(PF13185)ER; (ER)
324602.Caur_1639(PF11790)ER
324602.Caur_1309(PF01740)(mitochondrial); (plastid)
324602.Caur_1948(PF01740)ER
324602.Caur_3784(PF13692)ER
324602.Caur_1803(PF14684)ER
324602.Caur_1366(PF01078)(ER)
324602.Caur_3540(PF11790)mitochondrial
324602.Caur_1775PF03415(mitochondrial)
324602.Caur_1421(PF08239)(mitochondrial)
324602.Caur_3596(PF13559)mitochondrial
324602.Caur_3597(PF13559)ER; (ER)
324602.Caur_0746(PF08239)mitochondrial; (mitochondrial)
324602.Caur_0742(PF13439) (PF00534)(mitochondrial)
324602.Caur_2858(PF06739)ER
324602.Caur_3070(PF08239)ER
324602.Caur_0172(PF13559)ER
324602.Caur_1245(PF00534) (PF13579)(ER)
324602.Caur_2531(PF14684)ER
324602.Caur_0650PF03415ER
324602.Caur_2500(PF01000) (PF01193)(plastid)
324602.Caur_2611(PF13185)(mitochondrial)
324602.Caur_1643(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_3241(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_0709(PF13579) (PF13692)
324602.Caur_3253(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_2256(PF13439) (PF13692)
324602.Caur_3542(PF01740)(ER)
324602.Caur_0629(PF02844) (PF02843)
324602.Caur_1283(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_2396(PF01000) (PF01193)
324602.Caur_3757(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_1918(PF13579) (PF13692)
324602.Caur_2015(PF01743)(mitochondrial)
324602.Caur_0899(PF13492)(plastid)
324602.Caur_0891(PF13439) (PF13692)
324602.Caur_1707(PF00534) (PF13579)
324602.Caur_0084(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_1594(PF00534) (PF13579)
324602.Caur_2225(PF13185) (PF13492)
324602.Caur_0866(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_3509(PF01909)(mitochondrial)
324602.Caur_3761(PF13439) (PF13692)
324602.Caur_1317(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_2591(PF11965) (PF02514)
324602.Caur_0842(PF01740)(ER)
324602.Caur_3371(PF11965) (PF02514)
324602.Caur_3151(PF11965) (PF02514)
324602.Caur_0230(PF01740)(ER)
324602.Caur_3785(PF13439) (PF13692)
324602.Caur_1801(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_3550(PF13579) (PF13692)
324602.Caur_1788(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_0964(PF13439) (PF13692)
324602.Caur_3443(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_1761(PF00534) (PF12038)
324602.Caur_1509(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_1233(PF01740)(mitochondrial)
324602.Caur_2520(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_3458(PF01740)(ER)
324602.Caur_3073(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_2646(PF13185) (PF13492)
324602.Caur_0105(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_1741(PF13692)(ER)
324602.Caur_1747(PF00534)plastid
324602.Caur_1522(PF13439) (PF00534)
324602.Caur_1060(PF01740)
324602.Caur_2516(PF01740)
324602.Caur_2868(PF01909)
324602.Caur_1899(PF01909)
324602.Caur_1729(PF13185)
324602.Caur_0419(PF01078)
324602.Caur_0703(PF13492)
324602.Caur_1656(PF00454)
324602.Caur_1383(PF13492)
324602.Caur_2077(PF06739)
324602.Caur_2323(PF01743)
324602.Caur_3651(PF08239)
324602.Caur_0960(PF13185)
324602.Caur_2325(PF01743)
324602.Caur_3036(PF13185)
324602.Caur_1717(PF08239)
324602.Caur_1289(PF01740)
324602.Caur_2060(PF00025)
324602.Caur_2064(PF13185)
324602.Caur_1706(PF08239)
324602.Caur_0270(PF13185)
324602.Caur_1674(PF01740)
324602.Caur_1677(PF13492)
324602.Caur_0890(PF13692)
324602.Caur_0872(PF13231)
324602.Caur_0460(PF13185)
324602.Caur_2004(PF01740)
324602.Caur_2130(PF13185)
324602.Caur_2824(PF13185)
324602.Caur_2357(PF01740)
324602.Caur_2354(PF01740)
324602.Caur_3516(PF01740)
324602.Caur_3510(PF01909)
324602.Caur_3174(PF13492)
324602.Caur_0187(PF00534)
324602.Caur_1585(PF08239)
324602.Caur_1584(PF13185)
324602.Caur_0982(PF00534)
324602.Caur_2101(PF01909)
324602.Caur_3185(PF01740)
324602.Caur_2586(PF13185)
324602.Caur_0857(PF01740)
324602.Caur_3762(PF13692)
324602.Caur_1559(PF01740)
324602.Caur_0995(PF08239)
324602.Caur_3089(PF08239)
324602.Caur_2972(PF12773)
324602.Caur_2971(PF08239)
324602.Caur_1955(PF01740)
324602.Caur_2650(PF12773)
324602.Caur_0233(PF04893)
324602.Caur_1127(PF13185)
324602.Caur_1308(PF01740)
324602.Caur_1307(PF01740)
324602.Caur_1012(PF01740)
324602.Caur_3782(PF13231)
324602.Caur_2154(PF00847)
324602.Caur_1575(PF01909)
324602.Caur_2579(PF02514)
324602.Caur_3229(PF13185)
324602.Caur_3225(PF01909)
324602.Caur_0035(PF08239)
324602.Caur_0369(PF14684)
324602.Caur_1782(PF01740)
324602.Caur_2099(PF01909)
324602.Caur_2549(PF13231)
324602.Caur_2324(PF01743)
324602.Caur_3543(PF01740)
324602.Caur_2432PF05279
324602.Caur_1173(PF12773)
324602.Caur_1171(PF13185)
324602.Caur_2550(PF13231)
324602.Caur_1762PF12315
324602.Caur_1508(PF00534)
324602.Caur_1501(PF13231)
324602.Caur_2734(PF01740)
324602.Caur_3927(PF04893)
324602.Caur_3928(PF04893)
324602.Caur_3459(PF01740)
324602.Caur_1862(PF13185)
324602.Caur_3077(PF01909)
324602.Caur_2629(PF13185)
324602.Caur_1743(PF00534)
324602.Caur_1255(PF01078)
324602.Caur_2056(PF13185)
324602.Caur_3279(PF02374)
324602.Caur_3357(PF12773)
324602.Caur_3495(PF01909)
324602.Caur_3878(PF01740)
324602.Caur_0117(PF01078)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================