Effective results for Burkholderia sp. CCGE1002 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1084
- Predicted by EffectiveT3: 389 (high confidence), 433 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 26 within, 9 before, 44 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 119
- Predicted by EffectiveELD: 30 eukaryotic-like domains, contained in 125 proteins (12 high, 113 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type III), (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
640511.BC1002_6583+(PF11790)(mitochondrial); plastid
640511.BC1002_2386+(ER)
640511.BC1002_0832(PF14347)ER
640511.BC1002_3156+(mitochondrial)
640511.BC1002_1014+(ER)
640511.BC1002_3385+ER
640511.BC1002_2391+(mitochondrial); (plastid)
640511.BC1002_5015(PF01161)ER; (ER)
640511.BC1002_3943+ER
640511.BC1002_4730+ER
640511.BC1002_4857+(ER); ER
640511.BC1002_5314+ER
640511.BC1002_1838+(mitochondrial); (plastid)
640511.BC1002_1833+(mitochondrial)
640511.BC1002_4756(PF14347)ER
640511.BC1002_6441(PF08857)mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_0919(>)ER
640511.BC1002_1054(PF01177)mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_2800+(mitochondrial)
640511.BC1002_4562+mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_5470+ER
640511.BC1002_1686+ER
640511.BC1002_2848+ER
640511.BC1002_4327+ER
640511.BC1002_4852(>)ER
640511.BC1002_5530(PF04366)(ER); ER
640511.BC1002_6230(PF01594)ER
640511.BC1002_3807+ER
640511.BC1002_3808(PF00116)ER
640511.BC1002_0592+ER
640511.BC1002_1344(>)(mitochondrial)
640511.BC1002_1966(>)ER
640511.BC1002_3267+(mitochondrial)
640511.BC1002_3260++(PF04952)
640511.BC1002_4647(PF01161)ER
640511.BC1002_5726(PF01594)ER
640511.BC1002_6523(PF01809)mitochondrial
640511.BC1002_5264(>)mitochondrial
640511.BC1002_0033+mitochondrial; plastid
640511.BC1002_0031+ER; mitochondrial
640511.BC1002_0994(PF01594)ER
640511.BC1002_3500(<)ER
640511.BC1002_4170+(ER)
640511.BC1002_0655+mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_2681(PF01220)(mitochondrial)
640511.BC1002_2475(<)(mitochondrial)
640511.BC1002_0434+ER
640511.BC1002_4217(PF01292)(ER)
640511.BC1002_1241(PF01594)(mitochondrial); (ER)
640511.BC1002_0803+ER
640511.BC1002_4476+ER
640511.BC1002_4471(PF04366)ER
640511.BC1002_3295(PF00116)(mitochondrial)
640511.BC1002_5981(PF04366)ER
640511.BC1002_2450(PF13436)ER
640511.BC1002_2457+(mitochondrial)
640511.BC1002_5186+mitochondrial
640511.BC1002_4112+ER
640511.BC1002_0561+ER
640511.BC1002_3149(>)mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_2551(>)ER; (ER)
640511.BC1002_1167(<)ER
640511.BC1002_6086+ER
640511.BC1002_4707+ER; (ER)
640511.BC1002_6248+mitochondrial
640511.BC1002_6062+ER
640511.BC1002_0527(>)ER
640511.BC1002_2594(>)ER
640511.BC1002_3183(PF01809)ER
640511.BC1002_1028(PF01177)(mitochondrial); (plastid)
640511.BC1002_1129(>)ER
640511.BC1002_4998(>)ER
640511.BC1002_2024+(ER)
640511.BC1002_0883(>)ER
640511.BC1002_2819+(ER)
640511.BC1002_2641+ER
640511.BC1002_3231+mitochondrial
640511.BC1002_0259+ER
640511.BC1002_5359+(mitochondrial); (plastid)
640511.BC1002_5520+(ER)
640511.BC1002_1082(PF00116)ER
640511.BC1002_0234+ER; (ER)
640511.BC1002_1748+ER
640511.BC1002_3662+ER
640511.BC1002_3278+ER
640511.BC1002_6744(PF01292)(ER)
640511.BC1002_0968(<)ER
640511.BC1002_4802(>)ER
640511.BC1002_4656+ER
640511.BC1002_4655(+)(PF01292)(ER)
640511.BC1002_0399+ER
640511.BC1002_1725+ER
640511.BC1002_2702(>)(mitochondrial)
640511.BC1002_1499+(PF01050)plastid
640511.BC1002_1494(PF04366)(ER); ER
640511.BC1002_1939+(mitochondrial)
640511.BC1002_0606(+)+(ER)
640511.BC1002_1237(>)(mitochondrial)
640511.BC1002_4408+(ER)
640511.BC1002_2931(PF01161)mitochondrial
640511.BC1002_3789(PF01292)ER
640511.BC1002_3689+(mitochondrial)
640511.BC1002_5457(PF01177)ER
640511.BC1002_0172+(mitochondrial); (plastid)
640511.BC1002_5797+mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_1789+(mitochondrial)
640511.BC1002_4201(PF01594)ER; (ER)
640511.BC1002_1259+ER
640511.BC1002_5402(>)(mitochondrial); (ER)
640511.BC1002_4841+mitochondrial
640511.BC1002_2434+(mitochondrial); (plastid)
640511.BC1002_3903+(ER)
640511.BC1002_3459+ER; (ER)
640511.BC1002_0857+(plastid)
640511.BC1002_6288+(mitochondrial)
640511.BC1002_4503+(mitochondrial)
640511.BC1002_5032+(PF01292)
640511.BC1002_4342+(ER)
640511.BC1002_4757(PF14347)(mitochondrial)
640511.BC1002_5346(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_6589+(PF11790)
640511.BC1002_6582+mitochondrial; not used
640511.BC1002_0891+(mitochondrial)
640511.BC1002_6757(+)(ER)
640511.BC1002_5910+
640511.BC1002_0322+(plastid)
640511.BC1002_2841+(plastid)
640511.BC1002_0912(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_3079+plastid
640511.BC1002_0342(PF00116)(ER)
640511.BC1002_2226+plastid
640511.BC1002_1964(+)mitochondrial
640511.BC1002_6001+(plastid)
640511.BC1002_4078(>)(mitochondrial)
640511.BC1002_5857(PF08028)(plastid)
640511.BC1002_1772+(plastid)
640511.BC1002_4810+(plastid)
640511.BC1002_2710+(plastid)
640511.BC1002_3549(PF01292)(ER)
640511.BC1002_5269(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_2280+(plastid)
640511.BC1002_5816(+)(ER)
640511.BC1002_5246(+)(ER)
640511.BC1002_1904(+)mitochondrial
640511.BC1002_6222+plastid
640511.BC1002_1220(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_2115(>)(ER)
640511.BC1002_0075+plastid
640511.BC1002_4174+(plastid)
640511.BC1002_0672+plastid
640511.BC1002_6168+(mitochondrial)
640511.BC1002_3102(<)+
640511.BC1002_5181+(plastid)
640511.BC1002_3723(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_0137++
640511.BC1002_3914+(PF01161)
640511.BC1002_1161+(mitochondrial)
640511.BC1002_6304+(plastid)
640511.BC1002_3936(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_3169+(plastid)
640511.BC1002_5393(+)(ER)
640511.BC1002_5640(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_5005(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_0829(+)ER
640511.BC1002_2836(+)+(mitochondrial)
640511.BC1002_3402+(mitochondrial)
640511.BC1002_6047+(plastid)
640511.BC1002_4489+plastid
640511.BC1002_3970(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_2625+(plastid)
640511.BC1002_1823+(mitochondrial)
640511.BC1002_3211+(>)
640511.BC1002_1699PF04916 PF15508
640511.BC1002_3232(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_5968(+)(ER)
640511.BC1002_2782+(PF02900)
640511.BC1002_2664(+)(ER); (plastid)
640511.BC1002_3363++
640511.BC1002_6247++
640511.BC1002_3816+(PF01050)
640511.BC1002_0582+(plastid)
640511.BC1002_1769+(plastid)
640511.BC1002_1350++
640511.BC1002_2891(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_5849(+)mitochondrial
640511.BC1002_4826(PF00116)(plastid)
640511.BC1002_1958(PF01292)(plastid)
640511.BC1002_0021+(mitochondrial)
640511.BC1002_3989(+)ER
640511.BC1002_0186(+)mitochondrial; (mitochondrial)
640511.BC1002_3573(>)(PF02900)
640511.BC1002_4965(+)(mitochondrial); (plastid)
640511.BC1002_1213++
640511.BC1002_3513+PF10908
640511.BC1002_4797+(PF06779)
640511.BC1002_5047(+)ER
640511.BC1002_1405+(mitochondrial)
640511.BC1002_2504+(plastid)
640511.BC1002_2997+(plastid)
640511.BC1002_3470+plastid
640511.BC1002_4405+(mitochondrial)
640511.BC1002_4102++
640511.BC1002_3735(PF01292)(ER)
640511.BC1002_5674(+)mitochondrial; plastid
640511.BC1002_3453+(PF05988)
640511.BC1002_4718+
640511.BC1002_4719+
640511.BC1002_4716+
640511.BC1002_0769+
640511.BC1002_2544+
640511.BC1002_0497+
640511.BC1002_0496+
640511.BC1002_5114(PF07080)
640511.BC1002_5237+
640511.BC1002_5387+
640511.BC1002_3711+
640511.BC1002_3717(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_3714+
640511.BC1002_3430+
640511.BC1002_3380+
640511.BC1002_6093+
640511.BC1002_6678(PF01177)
640511.BC1002_0833+
640511.BC1002_1810(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_1816(+)(ER)
640511.BC1002_6503(>)
640511.BC1002_4733+
640511.BC1002_4323+
640511.BC1002_6280+
640511.BC1002_1034+
640511.BC1002_1151(PF14588)
640511.BC1002_3889+
640511.BC1002_3883+
640511.BC1002_3415+
640511.BC1002_6421(PF01594)
640511.BC1002_6072+
640511.BC1002_6615+not used
640511.BC1002_3961+
640511.BC1002_3967+
640511.BC1002_2613+
640511.BC1002_2616+
640511.BC1002_4346(PF02900)
640511.BC1002_4348+
640511.BC1002_1834+
640511.BC1002_1835+
640511.BC1002_1836+
640511.BC1002_4755(>)
640511.BC1002_2581+
640511.BC1002_2583+
640511.BC1002_0728+
640511.BC1002_3191+
640511.BC1002_3196(PF01292)
640511.BC1002_5067+
640511.BC1002_5064+
640511.BC1002_1056+
640511.BC1002_1055+
640511.BC1002_1130+
640511.BC1002_1138+
640511.BC1002_0818+
640511.BC1002_3752(+)(PF01594)
640511.BC1002_3750+
640511.BC1002_5349(+)(PF01292)
640511.BC1002_5344+
640511.BC1002_6581+
640511.BC1002_6056+
640511.BC1002_4564PF10908
640511.BC1002_0905(+)(plastid)
640511.BC1002_3031+
640511.BC1002_2248+
640511.BC1002_4597+
640511.BC1002_2630+
640511.BC1002_2639(>)
640511.BC1002_4369+
640511.BC1002_4368+
640511.BC1002_4362+
640511.BC1002_4366(+)+
640511.BC1002_1854+
640511.BC1002_1851+
640511.BC1002_4774(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_0093+
640511.BC1002_2038+
640511.BC1002_2034(+)PF10908
640511.BC1002_3200+
640511.BC1002_5911+
640511.BC1002_1079+
640511.BC1002_3062+
640511.BC1002_2864+
640511.BC1002_2863+
640511.BC1002_0245+
640511.BC1002_4098+
640511.BC1002_4097+
640511.BC1002_0935+
640511.BC1002_4547(>)
640511.BC1002_3011(+)(plastid)
640511.BC1002_3018+
640511.BC1002_2658+
640511.BC1002_1878+
640511.BC1002_1872+
640511.BC1002_1301(PF01050)
640511.BC1002_1304+
640511.BC1002_3651(+)+
640511.BC1002_3655+
640511.BC1002_5552(+)+
640511.BC1002_3223+
640511.BC1002_2010+
640511.BC1002_6354+
640511.BC1002_0220+
640511.BC1002_6017+
640511.BC1002_5897+
640511.BC1002_5893+
640511.BC1002_3078+
640511.BC1002_3074+
640511.BC1002_2206+
640511.BC1002_4850+
640511.BC1002_4328+
640511.BC1002_1322(>)
640511.BC1002_3672+
640511.BC1002_6338+
640511.BC1002_1453+
640511.BC1002_3242+
640511.BC1002_6236+
640511.BC1002_0696+
640511.BC1002_3801+
640511.BC1002_4058(+)+
640511.BC1002_4057(PF14832)
640511.BC1002_4056+
640511.BC1002_4581+
640511.BC1002_5466(+)(ER)
640511.BC1002_5464+
640511.BC1002_3582(PF01220)
640511.BC1002_2196+
640511.BC1002_1752(>)
640511.BC1002_4873+
640511.BC1002_4877+
640511.BC1002_1340(>)
640511.BC1002_3614+
640511.BC1002_5516+
640511.BC1002_3261+
640511.BC1002_2059(PF06779)
640511.BC1002_1507(+)(plastid)
640511.BC1002_1289+
640511.BC1002_5642+
640511.BC1002_0958(>)
640511.BC1002_0959(>)
640511.BC1002_6508(>)
640511.BC1002_5858+
640511.BC1002_5859(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_5850+
640511.BC1002_1775+
640511.BC1002_4819+
640511.BC1002_4818(PF14588)
640511.BC1002_4811(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_5283+
640511.BC1002_1944+
640511.BC1002_1941+
640511.BC1002_4627+
640511.BC1002_4622+
640511.BC1002_1566(+)(PF06779)
640511.BC1002_6244(+)(PF11397)
640511.BC1002_0389+
640511.BC1002_0216+
640511.BC1002_4018(<)
640511.BC1002_0212+
640511.BC1002_6524+
640511.BC1002_5876+
640511.BC1002_3095+
640511.BC1002_3090+
640511.BC1002_6384+not used
640511.BC1002_1710+
640511.BC1002_4833(PF01177)
640511.BC1002_4831+
640511.BC1002_0442(PF01809)
640511.BC1002_5124(PF08028)
640511.BC1002_5268+
640511.BC1002_5262+
640511.BC1002_1928+
640511.BC1002_1922+
640511.BC1002_6321(PF05988)
640511.BC1002_1440+
640511.BC1002_4602+
640511.BC1002_4604+
640511.BC1002_3370+
640511.BC1002_3373+
640511.BC1002_3374+
640511.BC1002_2362+
640511.BC1002_2369+
640511.BC1002_2175(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_2170+
640511.BC1002_5749+
640511.BC1002_6102+
640511.BC1002_1739(PF01177)
640511.BC1002_0469(PF01292)
640511.BC1002_5243+
640511.BC1002_5245+
640511.BC1002_0059+
640511.BC1002_5147+
640511.BC1002_1909(PF01177)
640511.BC1002_4192+
640511.BC1002_3352+
640511.BC1002_3351(+)(ER)
640511.BC1002_3356+
640511.BC1002_2343+
640511.BC1002_0612(PF01050)
640511.BC1002_0614+
640511.BC1002_2759+
640511.BC1002_4976+
640511.BC1002_3999+
640511.BC1002_3503+
640511.BC1002_5835(PF08028)
640511.BC1002_5836(PF08028)
640511.BC1002_6126+
640511.BC1002_5019+
640511.BC1002_0401+
640511.BC1002_5224(>)
640511.BC1002_5226+
640511.BC1002_5222+
640511.BC1002_3690+
640511.BC1002_2929+
640511.BC1002_0070+
640511.BC1002_0864+
640511.BC1002_3330(PF04952)
640511.BC1002_5921+
640511.BC1002_3520+
640511.BC1002_3522+
640511.BC1002_3527+
640511.BC1002_2130+
640511.BC1002_2132(>)
640511.BC1002_6493PF05212
640511.BC1002_4436+
640511.BC1002_0794+
640511.BC1002_2493+
640511.BC1002_2492+
640511.BC1002_1478+
640511.BC1002_4232+
640511.BC1002_1472(>)
640511.BC1002_4155+
640511.BC1002_0653+
640511.BC1002_4937+
640511.BC1002_1263(+)(plastid)
640511.BC1002_2686+
640511.BC1002_1883+
640511.BC1002_1463+
640511.BC1002_6308+
640511.BC1002_2510+
640511.BC1002_2477+
640511.BC1002_0438+
640511.BC1002_5622+
640511.BC1002_6237+
640511.BC1002_1639+
640511.BC1002_6369+
640511.BC1002_3290+
640511.BC1002_3294PF10908
640511.BC1002_5987(>)
640511.BC1002_2537(>)
640511.BC1002_2981PF10908
640511.BC1002_4276(PF08857)
640511.BC1002_4118+
640511.BC1002_4116(PF02900)
640511.BC1002_1986PF04572
640511.BC1002_3725(+)(plastid)
640511.BC1002_5600+
640511.BC1002_3460(+)(PF04952)
640511.BC1002_3465+
640511.BC1002_1610+
640511.BC1002_0179+
640511.BC1002_0821+
640511.BC1002_4493(+)(ER)
640511.BC1002_2088+
640511.BC1002_0778(+)plastid
640511.BC1002_0773+
640511.BC1002_2435+
640511.BC1002_0482(+)(mitochondrial); not used
640511.BC1002_0480+not used
640511.BC1002_0503+
640511.BC1002_4252+
640511.BC1002_3704+
640511.BC1002_3707(+)(plastid)
640511.BC1002_3702+
640511.BC1002_5669+
640511.BC1002_5665(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_5663(PF08028)
640511.BC1002_4538+
640511.BC1002_0549(+)(ER)
640511.BC1002_3935+
640511.BC1002_0840(PF14588)
640511.BC1002_2571+
640511.BC1002_3160+
640511.BC1002_3162+
640511.BC1002_1142+
640511.BC1002_3896(PF01594)
640511.BC1002_3898+
640511.BC1002_5391+
640511.BC1002_3762(+)(>)
640511.BC1002_5649+
640511.BC1002_2385+
640511.BC1002_6602+
640511.BC1002_6600+
640511.BC1002_3950+
640511.BC1002_3953(>)
640511.BC1002_3952+
640511.BC1002_3959(+)(PF01594)
640511.BC1002_2602+
640511.BC1002_4352+
640511.BC1002_1808+
640511.BC1002_1802+
640511.BC1002_4723(PF02900)
640511.BC1002_4721(>)
640511.BC1002_0907+
640511.BC1002_6471(PF12588)
640511.BC1002_0731+
640511.BC1002_3189+
640511.BC1002_0822(PF01161)
640511.BC1002_6296+
640511.BC1002_1126+
640511.BC1002_1128(PF04952)
640511.BC1002_4293+
640511.BC1002_6456+not used
640511.BC1002_6451PF00536
640511.BC1002_2834+
640511.BC1002_0293(+)plastid
640511.BC1002_0129+
640511.BC1002_6040+
640511.BC1002_5023(PF04952)
640511.BC1002_3975+
640511.BC1002_3972+
640511.BC1002_2628+
640511.BC1002_4377+
640511.BC1002_4371+
640511.BC1002_4378+
640511.BC1002_4379(PF01220)
640511.BC1002_4746+
640511.BC1002_0889+
640511.BC1002_6459+
640511.BC1002_5905+
640511.BC1002_1593+
640511.BC1002_0315+
640511.BC1002_2818+
640511.BC1002_2811+
640511.BC1002_2810+
640511.BC1002_0279+
640511.BC1002_0274+
640511.BC1002_5685+
640511.BC1002_6021(PF01177)
640511.BC1002_4550(PF04952)
640511.BC1002_4556+
640511.BC1002_1690+
640511.BC1002_3025+
640511.BC1002_3024+
640511.BC1002_3027+
640511.BC1002_3026+
640511.BC1002_2255+
640511.BC1002_4312+
640511.BC1002_4310(+)(PF05988)
640511.BC1002_5541+
640511.BC1002_2003+
640511.BC1002_1069+
640511.BC1002_3839+
640511.BC1002_0333(PF01594)
640511.BC1002_0271+
640511.BC1002_0270(PF00116)
640511.BC1002_0277+
640511.BC1002_5356+
640511.BC1002_2663+
640511.BC1002_1319+
640511.BC1002_1867+
640511.BC1002_1860+
640511.BC1002_3303+
640511.BC1002_5525+
640511.BC1002_5522+
640511.BC1002_2063+
640511.BC1002_6764+not used
640511.BC1002_6767(PF00116)
640511.BC1002_5942(>)
640511.BC1002_5946(PF01220)
640511.BC1002_1081+
640511.BC1002_1087(PF05988)
640511.BC1002_0681+
640511.BC1002_3811+
640511.BC1002_5319(>)
640511.BC1002_4048(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_4040+
640511.BC1002_0909+
640511.BC1002_0110+
640511.BC1002_5884(PF08028)
640511.BC1002_6684PF00536
640511.BC1002_2219+
640511.BC1002_1743+
640511.BC1002_1740+
640511.BC1002_4861(+)(ER)
640511.BC1002_3667+
640511.BC1002_5500(PF07080)not used
640511.BC1002_5503+
640511.BC1002_3270+
640511.BC1002_3272(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_2048+
640511.BC1002_2047+
640511.BC1002_4677+
640511.BC1002_6742(PF01292)
640511.BC1002_3584+
640511.BC1002_6366+
640511.BC1002_6361+
640511.BC1002_1294+
640511.BC1002_6517+
640511.BC1002_6514+
640511.BC1002_3598+
640511.BC1002_2187+
640511.BC1002_2232+
640511.BC1002_3042+
640511.BC1002_3048+
640511.BC1002_0586(PF01050)
640511.BC1002_1356+
640511.BC1002_2952+
640511.BC1002_3606+
640511.BC1002_1979(PF16155)
640511.BC1002_0003+
640511.BC1002_4658+
640511.BC1002_4653+
640511.BC1002_6725+
640511.BC1002_0394+
640511.BC1002_2729+not used
640511.BC1002_2728+not used
640511.BC1002_5711(PF08028)
640511.BC1002_5713+
640511.BC1002_5714(PF08028)
640511.BC1002_5848+
640511.BC1002_5846(PF08028)
640511.BC1002_1708(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_2976(+)(plastid)
640511.BC1002_5273+
640511.BC1002_1957+
640511.BC1002_0029+
640511.BC1002_4635(PF00116)
640511.BC1002_1576+
640511.BC1002_6250(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_1184(<)
640511.BC1002_0933+
640511.BC1002_2375+
640511.BC1002_0100+
640511.BC1002_2700+
640511.BC1002_2706+
640511.BC1002_4024+
640511.BC1002_4025+
640511.BC1002_5487(>)
640511.BC1002_2143+
640511.BC1002_3086+
640511.BC1002_5869+
640511.BC1002_0451+
640511.BC1002_5131+
640511.BC1002_2918+
640511.BC1002_0041+
640511.BC1002_4611+
640511.BC1002_1555(PF14588)
640511.BC1002_0603+
640511.BC1002_2760+
640511.BC1002_6351(+)+
640511.BC1002_6426+
640511.BC1002_6424+
640511.BC1002_1234+
640511.BC1002_2163(>)
640511.BC1002_2167+
640511.BC1002_5755(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_0986+
640511.BC1002_2294+
640511.BC1002_2297(+)(plastid)
640511.BC1002_4406(PF08028)
640511.BC1002_5803(PF02900)
640511.BC1002_6132+
640511.BC1002_5236+
640511.BC1002_6643+
640511.BC1002_1911+
640511.BC1002_4182+
640511.BC1002_5371+
640511.BC1002_3321(PF01050)
640511.BC1002_0990+
640511.BC1002_0668+
640511.BC1002_4969(+)(mitochondrial)
640511.BC1002_4968(+)(PF01292)
640511.BC1002_4792(+)(plastid)
640511.BC1002_0562+
640511.BC1002_4887+
640511.BC1002_2483+
640511.BC1002_2484+
640511.BC1002_5172+
640511.BC1002_1734+
640511.BC1002_0929+
640511.BC1002_0640PF10908
640511.BC1002_0647(+)plastid
640511.BC1002_5451+
640511.BC1002_1667(+)ER
640511.BC1002_1891(+)(>)
640511.BC1002_3533+
640511.BC1002_6316+
640511.BC1002_2465+
640511.BC1002_1428+
640511.BC1002_0466+
640511.BC1002_1640+
640511.BC1002_2691+
640511.BC1002_2692+
640511.BC1002_5408+
640511.BC1002_5403(PF07080)
640511.BC1002_1410+
640511.BC1002_6191(+)(plastid)
640511.BC1002_4847(PF04952)
640511.BC1002_2445+
640511.BC1002_4699(PF02900)
640511.BC1002_4695(PF08028)
640511.BC1002_4694(<)
640511.BC1002_0226+
640511.BC1002_4900+
640511.BC1002_4908+
640511.BC1002_5429+
640511.BC1002_0814+
640511.BC1002_3642+
640511.BC1002_3288+
640511.BC1002_0749+
640511.BC1002_0744+
640511.BC1002_4400+
640511.BC1002_5196+
640511.BC1002_1193+
640511.BC1002_4109+
640511.BC1002_4106+
640511.BC1002_4103+
640511.BC1002_5675+
640511.BC1002_3458+
640511.BC1002_1606(PF14588)
640511.BC1002_6656PF00536
640511.BC1002_0556+
640511.BC1002_0550+
640511.BC1002_3924+not used
640511.BC1002_3925+
640511.BC1002_4710(+)
640511.BC1002_3151(+)
640511.BC1002_0472(+)
640511.BC1002_1174(+)
640511.BC1002_3715+
640511.BC1002_3386(+)
640511.BC1002_2395(+)
640511.BC1002_0741(+)
640511.BC1002_0538(+)
640511.BC1002_0140(+)
640511.BC1002_6504(+)
640511.BC1002_4731(+)
640511.BC1002_6464(+)
640511.BC1002_3176(+)
640511.BC1002_3170(+)
640511.BC1002_6282(+)
640511.BC1002_6422(+)
640511.BC1002_6073(+)
640511.BC1002_5037(+)
640511.BC1002_5038(+)
640511.BC1002_4349(+)
640511.BC1002_1832(+)
640511.BC1002_4750(+)
640511.BC1002_0729(+)
640511.BC1002_5933(+)
640511.BC1002_0723(+)
640511.BC1002_3192(+)
640511.BC1002_3195(+)
640511.BC1002_5063(+)
640511.BC1002_1050(+)
640511.BC1002_1139(+)
640511.BC1002_3759(+)
640511.BC1002_6587(+)
640511.BC1002_6055(+)
640511.BC1002_6058(+)
640511.BC1002_3030(+)
640511.BC1002_0895(+)
640511.BC1002_0896(+)
640511.BC1002_6756(+)
640511.BC1002_1526(+)
640511.BC1002_1439(+)
640511.BC1002_2795(+)
640511.BC1002_2797(+)
640511.BC1002_2861(+)
640511.BC1002_4096(+)
640511.BC1002_4092(+)
640511.BC1002_3019(+)
640511.BC1002_2262(+)
640511.BC1002_2263(+)
640511.BC1002_2654(+)
640511.BC1002_1308(+)
640511.BC1002_5551(+)
640511.BC1002_3227(+)
640511.BC1002_6352(+)
640511.BC1002_1095(+)
640511.BC1002_5304(+)
640511.BC1002_3796(+)
640511.BC1002_0202(+)
640511.BC1002_6012(+)
640511.BC1002_3077(+)
640511.BC1002_2675(+)
640511.BC1002_2672(+)
640511.BC1002_4853(+)
640511.BC1002_4858(+)
640511.BC1002_3241(+)
640511.BC1002_6750+
640511.BC1002_6753(+)
640511.BC1002_1524(+)
640511.BC1002_5016(+)
640511.BC1002_5953(+)
640511.BC1002_5326(+)
640511.BC1002_4582(+)
640511.BC1002_4586(+)
640511.BC1002_3581(+)
640511.BC1002_0214(+)
640511.BC1002_4878(+)
640511.BC1002_1346(+)
640511.BC1002_1349(+)
640511.BC1002_3613(+)
640511.BC1002_3585(+)
640511.BC1002_3262(+)
640511.BC1002_4641(+)
640511.BC1002_6738(+)
640511.BC1002_1288(+)
640511.BC1002_5701(+)
640511.BC1002_5708(+)
640511.BC1002_5853(+)
640511.BC1002_1362(+)
640511.BC1002_3639(+)
640511.BC1002_2941(+)
640511.BC1002_5280(+)not used
640511.BC1002_5289(+)
640511.BC1002_5288(+)
640511.BC1002_1946(+)
640511.BC1002_0011(+)
640511.BC1002_0384(+)
640511.BC1002_3844(+)
640511.BC1002_3840(+)
640511.BC1002_2157(+)
640511.BC1002_6526(+)
640511.BC1002_6522(+)
640511.BC1002_6388(+)
640511.BC1002_1717(+)
640511.BC1002_1712(+)
640511.BC1002_4837(+)
640511.BC1002_1924(+)
640511.BC1002_0528(+)
640511.BC1002_0635(+)
640511.BC1002_4034(+)
640511.BC1002_2179(+)
640511.BC1002_2284(+)
640511.BC1002_5817(+)
640511.BC1002_1483(+)
640511.BC1002_1738(+)
640511.BC1002_5107(+)
640511.BC1002_5102(+)
640511.BC1002_5247(+)
640511.BC1002_2902(+)
640511.BC1002_1907(+)
640511.BC1002_4198(+)
640511.BC1002_6734(+)
640511.BC1002_2345(+)
640511.BC1002_4975(+)
640511.BC1002_1222(+)
640511.BC1002_3997(+)
640511.BC1002_0403(+)
640511.BC1002_2922(+)
640511.BC1002_2928(+)
640511.BC1002_0863(+)
640511.BC1002_1204(+)
640511.BC1002_6499(+)
640511.BC1002_0790(+)
640511.BC1002_0514(+)
640511.BC1002_4895(+)
640511.BC1002_5202(+)
640511.BC1002_4234(+)
640511.BC1002_1471(+)
640511.BC1002_4157(+)
640511.BC1002_2304(+)
640511.BC1002_1653(+)not used
640511.BC1002_1658(+)
640511.BC1002_4939(+)
640511.BC1002_4932(+)
640511.BC1002_1260(+)
640511.BC1002_6167(+)
640511.BC1002_2471(+)
640511.BC1002_4219(+)
640511.BC1002_4138(+)
640511.BC1002_1249(+)
640511.BC1002_1243(+)
640511.BC1002_0118(+)
640511.BC1002_4475(+)
640511.BC1002_3296(+)
640511.BC1002_2530(+)
640511.BC1002_2533(+)
640511.BC1002_3469(+)
640511.BC1002_3462(+)
640511.BC1002_6647(+)
640511.BC1002_0568(+)
640511.BC1002_6345(+)
640511.BC1002_6344(+)
640511.BC1002_4499(+)
640511.BC1002_2086(+)
640511.BC1002_0771(+)
640511.BC1002_0772(+)
640511.BC1002_3144(+)
640511.BC1002_3140(+)
640511.BC1002_2552(+)
640511.BC1002_2430(+)
640511.BC1002_2439(+)
640511.BC1002_0481(+)
640511.BC1002_0509(+)
640511.BC1002_1164(+)
640511.BC1002_3443(+)
640511.BC1002_6081(+)
640511.BC1002_4534(+)
640511.BC1002_1791(+)
640511.BC1002_0546(+)
640511.BC1002_3934(+)
640511.BC1002_0849(+)
640511.BC1002_0841(+)
640511.BC1002_0941(+)
640511.BC1002_1144(+)
640511.BC1002_5641(+)
640511.BC1002_2381(+)
640511.BC1002_6249(+)
640511.BC1002_4511(+)
640511.BC1002_4512(+)
640511.BC1002_6601(+)
640511.BC1002_5008(+)
640511.BC1002_1800(+)
640511.BC1002_4724(+)
640511.BC1002_0902(+)
640511.BC1002_0084(+)
640511.BC1002_6476(+)
640511.BC1002_3186(+)
640511.BC1002_6298(+)
640511.BC1002_1026(+)
640511.BC1002_2832(+)
640511.BC1002_3409(+)
640511.BC1002_6596(+)
640511.BC1002_5026(+)
640511.BC1002_0504(+)
640511.BC1002_4992(+)
640511.BC1002_3979(+)
640511.BC1002_3977(+)
640511.BC1002_2624(+)
640511.BC1002_2626(+)
640511.BC1002_3216(+)
640511.BC1002_3217(+)
640511.BC1002_1595(+)
640511.BC1002_1109(+)
640511.BC1002_1107(+)
640511.BC1002_0318(+)
640511.BC1002_0319(+)
640511.BC1002_2812(+)
640511.BC1002_2817(+)
640511.BC1002_4551(+)
640511.BC1002_1696(+)
640511.BC1002_3021(+)
640511.BC1002_3020(+)
640511.BC1002_2252(+)
640511.BC1002_4313(+)
640511.BC1002_1842(+)
640511.BC1002_4764(+)not used
640511.BC1002_1060(+)
640511.BC1002_2785(+)
640511.BC1002_0335(+)
640511.BC1002_3788(+)
640511.BC1002_6008(+)
640511.BC1002_2660(+)
640511.BC1002_2666(+)
640511.BC1002_3365(+)
640511.BC1002_1861(+)
640511.BC1002_3648(+)
640511.BC1002_3256(+)
640511.BC1002_0621+
640511.BC1002_5943(+)
640511.BC1002_6242(+)
640511.BC1002_4123(+)
640511.BC1002_0688(+)
640511.BC1002_6241(+)
640511.BC1002_0356(+)
640511.BC1002_4042(+)
640511.BC1002_4043(+)
640511.BC1002_5085(+)
640511.BC1002_4867(+)
640511.BC1002_4862(+)
640511.BC1002_3668(+)
640511.BC1002_3660(+)not used
640511.BC1002_3666(+)
640511.BC1002_3665(+)
640511.BC1002_2046(+)
640511.BC1002_3879(+)
640511.BC1002_0211(+)
640511.BC1002_2959(+)
640511.BC1002_5299(+)
640511.BC1002_1977(+)
640511.BC1002_1976(+)
640511.BC1002_0009(+)
640511.BC1002_0001(+)
640511.BC1002_4652(+)
640511.BC1002_0240(+)
640511.BC1002_5362(+)
640511.BC1002_4000(+)
640511.BC1002_5847(+)
640511.BC1002_1709(+)
640511.BC1002_4820(+)
640511.BC1002_3625(+)
640511.BC1002_3628(+)
640511.BC1002_5270(+)
640511.BC1002_3367(+)
640511.BC1002_6037(+)
640511.BC1002_0107(+)
640511.BC1002_2708(+)
640511.BC1002_5484(+)
640511.BC1002_2149(+)
640511.BC1002_5865(+)
640511.BC1002_1722(+)
640511.BC1002_1724(+)
640511.BC1002_6118(+)
640511.BC1002_2910(+)
640511.BC1002_5257(+)
640511.BC1002_0045(+)
640511.BC1002_0049(+)
640511.BC1002_6270(+)
640511.BC1002_3347(+)
640511.BC1002_0607(+)
640511.BC1002_0600(+)
640511.BC1002_2761(+)
640511.BC1002_3986(+)
640511.BC1002_0189(+)
640511.BC1002_0188(+)
640511.BC1002_0182(+)
640511.BC1002_3574(+)
640511.BC1002_5751(+)
640511.BC1002_0981(+)
640511.BC1002_6138(+)
640511.BC1002_0068(+)
640511.BC1002_4187(+)not used
640511.BC1002_3786(+)
640511.BC1002_3329(+)
640511.BC1002_2335(+)
640511.BC1002_0660+
640511.BC1002_2747(+)
640511.BC1002_3515(+)
640511.BC1002_4794(+)
640511.BC1002_6485(+)
640511.BC1002_1451(+)
640511.BC1002_1455(+)
640511.BC1002_5826(+)
640511.BC1002_4885(+)
640511.BC1002_2486(+)
640511.BC1002_3684(+)
640511.BC1002_3308(+)
640511.BC1002_4942(+)
640511.BC1002_1896(+)
640511.BC1002_2121(+)
640511.BC1002_6315(+)
640511.BC1002_1785(+)
640511.BC1002_1783(+)
640511.BC1002_5152(+)
640511.BC1002_5109(+)
640511.BC1002_0825(+)
640511.BC1002_6346(+)
640511.BC1002_0052(+)
640511.BC1002_1250(+)not used
640511.BC1002_2690(+)
640511.BC1002_4466(+)
640511.BC1002_4690(+)
640511.BC1002_3472(+)
640511.BC1002_3476(+)
640511.BC1002_4906(+)
640511.BC1002_1865(+)
640511.BC1002_3900(+)
640511.BC1002_3907(+)
640511.BC1002_3904(+)
640511.BC1002_0811(+)
640511.BC1002_2523(+)
640511.BC1002_2421(+)
640511.BC1002_5193(+)
640511.BC1002_5801+
640511.BC1002_4249(+)
640511.BC1002_1992(+)
640511.BC1002_3732(+)
640511.BC1002_3734(+)
640511.BC1002_5672(+)
640511.BC1002_5671(+)
640511.BC1002_6542(+)
640511.BC1002_0559(+)
640511.BC1002_3926(+)
640511.BC1002_3922(+)
640511.BC1002_5444(+)
640511.BC1002_5443(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 0.4 (4/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 2.5 (20/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================