Effective results for Providencia rettgeri DSM 1131 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 933
- Predicted by EffectiveT3: 242 (high confidence), 317 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 47 within, 41 before, 64 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 161
- Predicted by EffectiveELD: 18 eukaryotic-like domains, contained in 151 proteins (68 high, 83 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, (Type IV), Type VI
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
| Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
|---|---|---|---|---|---|
| 521000.PROVRETT_06415 | + | (<) | (PF10462) | (plastid) | |
| 521000.PROVRETT_06891 | + | PF00577 | ER | ||
| 521000.PROVRETT_07145 | + | PF00345 | (ER) | ||
| 521000.PROVRETT_07340 | + | PF00577 | (mitochondrial) | ||
| 521000.PROVRETT_08621 | + | + | ER | ||
| 521000.PROVRETT_05812 | (PF03222) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09000 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06606 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07082 | (PF08238) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09491 | (PF08238) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08342 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06256 | (>) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07756 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07091 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07092 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07094 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07095 | PF00345 | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08856 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08175 | + | (ER); ER | |||
| 521000.PROVRETT_05560 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09027 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07385 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08375 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06319 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_08758 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09706 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09037 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09030 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09856 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06473 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07293 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06856 | (<) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08482 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06888 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09510 | + | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09996 | (+) | + | ER | ||
| 521000.PROVRETT_09863 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07841 | (PF08238) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07846 | (PF01381) | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_08728 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07602 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06516 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06892 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07339 | + | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05888 | (>) | (ER); ER | |||
| 521000.PROVRETT_08887 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05459 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09619 | (PF01381) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_08836 | (PF08238) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08835 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05408 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06072 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_10142 | (+) | PF00577 | (mitochondrial) | ||
| 521000.PROVRETT_09876 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06696 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07584 | (>) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07326 | PF00577 | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07325 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08136 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_09660 | (PF07678) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07775 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05563 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09085 | PF00577 | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05536 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06196 | (PF08238) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06666 | (PF08238) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07825 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07827 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07828 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07139 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07138 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09545 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05428 | + | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09306 | (PF08238) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07831 | PF00345 | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06543 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07120 | (PF13415) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08293 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08296 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05944 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05945 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06706 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09243 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06252 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05562 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06556 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09268 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07152 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07974 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08787 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09084 | PF00345 | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05680 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09789 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_08307 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08306 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07978 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07813 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07786 | (<) | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05891 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07141 | (PF01381) | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_07144 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07962 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07965 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08256 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07444 | (>) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06664 | + | (>) | + | ||
| 521000.PROVRETT_08269 | (PF08238) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05694 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08645 | (PF01381) | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_09224 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08083 | (<) | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06054 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_05581 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08636 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09687 | PF00345 | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09685 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09684 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06152 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06338 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09507 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06484 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07992 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05916 | (PF08238) | ER; (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05667 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08638 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08328 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09238 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05868 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05866 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_09694 | (+) | + | mitochondrial; (mitochondrial) | ||
| 521000.PROVRETT_05855 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07187 | (PF01381) | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_07184 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07185 | PF00577 | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07886 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08302 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05549 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08628 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08626 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05835 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05668 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09972 | (PF01381) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07750 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06751 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_10080 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05611 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08297 | (+) | PF00577 | ER | ||
| 521000.PROVRETT_08298 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05805 | (<) | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_08762 | PF00577 | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_08761 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07433 | (>) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05737 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06613 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_10097 | PF00345 | ER; plastid | |||
| 521000.PROVRETT_07749 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07946 | (>) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07253 | PF00345 | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08515 | (<) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05382 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08193 | + | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08196 | PF00577 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08197 | PF00345 | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07089 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_08561 | + | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_07758 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09541 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_09010 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06419 | + | + | |||
| 521000.PROVRETT_10135 | + | PF00577 | not used | ||
| 521000.PROVRETT_07090 | (>) | PF00577 | |||
| 521000.PROVRETT_08170 | + | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_08379 | (+) | + | + | ||
| 521000.PROVRETT_08952 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_08001 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09848 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06248 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06397 | + | (PF03222) | |||
| 521000.PROVRETT_07918 | (+) | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_06096 | + | plastid | |||
| 521000.PROVRETT_09474 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06873 | + | + | |||
| 521000.PROVRETT_10059 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_10127 | + | PF00577 | |||
| 521000.PROVRETT_08156 | + | + | |||
| 521000.PROVRETT_09609 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_08734 | + | plastid | |||
| 521000.PROVRETT_09196 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_06320 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07603 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07930 | + | (PF08357) | |||
| 521000.PROVRETT_07330 | + | (PF01381) | |||
| 521000.PROVRETT_09728 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09729 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08906 | + | + | not used | ||
| 521000.PROVRETT_07793 | (+) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09457 | (<) | PF00577 | not used | ||
| 521000.PROVRETT_09458 | (>) | PF00577 | not used | ||
| 521000.PROVRETT_07928 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08223 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_05365 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08915 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_06667 | (<) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07959 | (+) | + | (mitochondrial) | ||
| 521000.PROVRETT_05654 | (+) | (ER); plastid | |||
| 521000.PROVRETT_06307 | + | ER; not used | |||
| 521000.PROVRETT_06548 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_07490 | + | (PF00102) | |||
| 521000.PROVRETT_05642 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_05304 | (PF03222) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05943 | + | (PF01381) | |||
| 521000.PROVRETT_09796 | + | (PF01501) | |||
| 521000.PROVRETT_08066 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_05432 | + | (<) | |||
| 521000.PROVRETT_07796 | + | + | |||
| 521000.PROVRETT_08919 | (>) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07156 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_07376 | (PF08238) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_07701 | (PF01381) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06813 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06968 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07382 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08719 | + | plastid | |||
| 521000.PROVRETT_07861 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08644 | (PF01381) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09221 | + | (PF01381) | |||
| 521000.PROVRETT_06026 | + | PF10548 | |||
| 521000.PROVRETT_06371 | (+) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09289 | + | + | |||
| 521000.PROVRETT_08527 | (PF01156) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08324 | (PF01381) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07521 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_08846 | (<) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06936 | (+) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06901 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07920 | (+) | mitochondrial | |||
| 521000.PROVRETT_07180 | + | (mitochondrial); not used | |||
| 521000.PROVRETT_10130 | + | PF00577 | not used | ||
| 521000.PROVRETT_07863 | (+) | ER | |||
| 521000.PROVRETT_08627 | + | PF00345 | |||
| 521000.PROVRETT_05872 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_08891 | + | ER; not used | |||
| 521000.PROVRETT_05809 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_06131 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_05730 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09565 | (>) | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_06109 | + | + | |||
| 521000.PROVRETT_06725 | + | + | |||
| 521000.PROVRETT_10094 | + | PF00345 | not used | ||
| 521000.PROVRETT_07410 | + | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_05517 | + | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_07254 | PF00577 | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_08425 | (<) | ER; not used | |||
| 521000.PROVRETT_10007 | (<) | + | |||
| 521000.PROVRETT_08359 | + | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09486 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09489 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06241 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05818 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05652 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_05653 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09174 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05724 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07864 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06112 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06115 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06119 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06284 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06734 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06735 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07737 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08679 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08771 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_08773 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_07465 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07064 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10114 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08934 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05520 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_08564 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08169 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_08161 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08365 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09494 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08700 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09163 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09169 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08943 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08946 | (PF00707) | ||||
| 521000.PROVRETT_08945 | (PF00707) | ||||
| 521000.PROVRETT_05759 | (+) | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_05755 | PF00577 | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05757 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08016 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07367 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09943 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09944 | (PF06176) | ||||
| 521000.PROVRETT_08407 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_06257 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07659 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07722 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_07728 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10072 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07473 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07271 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07274 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_07276 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10106 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07380 | (>) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_10108 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07952 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08579 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06837 | (+) | (<) | |||
| 521000.PROVRETT_09716 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08173 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_05377 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05526 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05832 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_05522 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05523 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08713 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08716 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08715 | (PF01156) | ||||
| 521000.PROVRETT_09152 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05741 | (+) | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_09023 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_09026 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06130 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06135 | (+) | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_06136 | (<) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09849 | (PF01156) | ||||
| 521000.PROVRETT_07639 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09841 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09840 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_06717 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10047 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06405 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07047 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07288 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_07287 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_07286 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08544 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09703 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09709 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08491 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08493 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07395 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05518 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05601 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08723 | (PF07720) | ||||
| 521000.PROVRETT_09141 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_09145 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05996 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_08036 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08039 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_09031 | (PF01156) | ||||
| 521000.PROVRETT_06098 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09850 | (PF01156) | ||||
| 521000.PROVRETT_09857 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06479 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06475 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06790 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07292 | PF00345 | ||||
| 521000.PROVRETT_07291 | PF00577 | ||||
| 521000.PROVRETT_10128 | PF00345 | not used | |||
| 521000.PROVRETT_10121 | (+) | PF00577 | |||
| 521000.PROVRETT_08556 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05590 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_08801 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05618 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08737 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09605 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_05987 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09192 | (+) | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_06086 | (+) | + | |||
| 521000.PROVRETT_06087 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09463 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09467 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09469 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08721 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06866 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10024 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10029 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06463 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07117 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07112 | (PF03981) | ||||
| 521000.PROVRETT_06872 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07934 | (PF01501) | ||||
| 521000.PROVRETT_07337 | (PF01381) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07336 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09112 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09137 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09727 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_08120 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_09617 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08834 | (+) | (mitochondrial); not used | |||
| 521000.PROVRETT_08581 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08584 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09187 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05576 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_08057 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09055 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_06983 | (+) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_06985 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06076 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06071 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_05797 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10147 | PF00577 | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09872 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09873 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09877 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09988 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_10037 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_10039 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07859 | (PF03981) | ||||
| 521000.PROVRETT_09456 | (+) | PF00345 | |||
| 521000.PROVRETT_06697 | (+) | (ER) | |||
| 521000.PROVRETT_09454 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06453 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07101 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_10148 | PF00345 | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07929 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07329 | (<) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09757 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09912 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07798 | (+) | + | |||
| 521000.PROVRETT_06014 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09855 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09662 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07777 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08228 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08227 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08220 | (PF03981) | ||||
| 521000.PROVRETT_05968 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08914 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08046 | (+) | + | |||
| 521000.PROVRETT_06062 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06061 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05899 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05533 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05532 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09880 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09317 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09316 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09310 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06683 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05853 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07133 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_07004 | (PF03222) | ||||
| 521000.PROVRETT_07000 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07958 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07310 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_07512 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06482 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08692 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08506 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09673 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_08280 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08219 | (<) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08218 | (>) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08213 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05318 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05956 | (+) | (<) | |||
| 521000.PROVRETT_08075 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_08073 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06050 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09099 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_09418 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07354 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07352 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10012 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_07839 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10081 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05813 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07011 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07013 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07540 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07541 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07945 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06044 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06043 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_06049 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05392 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05645 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08681 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08687 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08184 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08449 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_09642 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05685 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05946 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08664 | (+) | + | |||
| 521000.PROVRETT_09794 | (+) | (PF01501) | |||
| 521000.PROVRETT_09797 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06704 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05431 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05969 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09423 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09333 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07724 | (PF01156) | ||||
| 521000.PROVRETT_06824 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10077 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_07803 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07801 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06318 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06225 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07571 | PF00577 | ||||
| 521000.PROVRETT_07570 | PF00345 | ||||
| 521000.PROVRETT_07153 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07154 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08994 | (+) | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_08478 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08475 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08789 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09656 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05339 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05338 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05688 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08304 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09088 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09252 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08896 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05449 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05448 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09431 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09435 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09439 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06145 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_06147 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_06141 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_06037 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09327 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06810 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08382 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07787 | (PF03222) | ||||
| 521000.PROVRETT_06492 | (+) | (PF02902) | |||
| 521000.PROVRETT_06782 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06564 | (PF08238) | ||||
| 521000.PROVRETT_07964 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09115 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08250 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06618 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09275 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_08720 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05329 | (+) | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_09692 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08088 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08885 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05584 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06685 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_05450 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06330 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08738 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09353 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05980 | (+) | (mitochondrial); not used | |||
| 521000.PROVRETT_09911 | (+) | + | not used | ||
| 521000.PROVRETT_09998 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06798 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_06978 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06970 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06971 | (+) | ER; not used | |||
| 521000.PROVRETT_06884 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07683 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07516 | (+) | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_06324 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06488 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07990 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07426 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07421 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07359 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07358 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08989 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_08619 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07436 | (+) | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_07226 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_07225 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_07228 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_09284 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09281 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08415 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06430 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08523 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05669 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05912 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09230 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_09239 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05861 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05867 | PF00577 | ||||
| 521000.PROVRETT_08743 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06388 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05484 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05489 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_05488 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05715 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05719 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06164 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06017 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09906 | (+) | (>) | |||
| 521000.PROVRETT_05765 | (+) | (plastid) | |||
| 521000.PROVRETT_06904 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09359 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_06740 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06795 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07697 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07507 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07984 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07983 | (+) | + | |||
| 521000.PROVRETT_07188 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07341 | PF00345 | ||||
| 521000.PROVRETT_07237 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06616 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08247 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09597 | (+) | + | |||
| 521000.PROVRETT_09592 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07848 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05672 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08332 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_06868 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_08754 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05834 | PF00577 | ||||
| 521000.PROVRETT_05472 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06495 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05491 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_05707 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_05702 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09579 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06006 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08710 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 521000.PROVRETT_07753 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09771 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06749 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_06594 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06351 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09780 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05599 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06347 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07241 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07247 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08435 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06348 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07596 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08005 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06204 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08508 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08505 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_09588 | (+) | + | |||
| 521000.PROVRETT_05399 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05641 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08182 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09740 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09436 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05803 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_09106 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08965 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05734 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09363 | (<) | ||||
| 521000.PROVRETT_06829 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09960 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09967 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08451 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05786 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08590 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_10091 | (+) | PF00577 | |||
| 521000.PROVRETT_10096 | PF00577 | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08650 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_06139 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07417 | (PF03222) | ||||
| 521000.PROVRETT_07522 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08656 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_07258 | (+) | (mitochondrial); not used | |||
| 521000.PROVRETT_08284 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08287 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05418 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_05606 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_09773 | + | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05388 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08289 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_05381 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_08190 | (PF01381) | ||||
| 521000.PROVRETT_08199 | (>) | ||||
| 521000.PROVRETT_07669 | + | ||||
| 521000.PROVRETT_09480 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05811 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09179 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08973 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05726 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09006 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07867 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09955 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09952 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06288 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06732 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07733 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10061 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07396 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07467 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08509 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05787 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08356 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06442 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06569 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05521 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09769 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06728 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09495 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09498 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08387 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05537 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05625 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05627 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08703 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09559 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08944 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09941 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06125 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06254 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07727 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07102 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07474 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06623 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08749 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10101 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09569 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09959 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06964 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08376 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08377 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09202 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08718 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08717 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09229 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08950 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05749 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06134 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06622 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10043 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06394 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06409 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06404 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09181 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07284 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07447 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10138 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08545 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09705 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05519 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05513 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08810 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08722 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09146 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08920 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05775 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09858 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09851 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06874 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06870 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07677 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06501 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06508 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07907 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08559 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09878 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07754 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09739 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09736 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09735 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08481 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05347 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05342 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05982 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06880 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09195 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09199 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05506 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08023 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05357 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09519 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06080 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05769 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08881 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09865 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07840 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10027 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06469 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06898 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07597 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07598 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06458 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09815 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10150 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09614 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09612 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08580 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05974 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05976 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08901 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05400 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05577 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08050 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09054 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06078 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05881 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06850 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06457 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06456 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06451 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07610 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07039 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06529 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07922 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09962 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08206 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06879 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07502 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08969 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05961 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08911 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09265 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06656 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06658 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09065 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06996 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05829 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06067 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06060 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05896 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06191 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06195 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09889 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05629 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10001 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07629 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07626 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05792 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08694 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09671 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05429 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07855 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09417 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06304 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06941 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06334 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06540 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06542 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08292 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08081 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09936 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05309 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06250 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07804 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09934 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06310 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06221 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06222 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06224 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06550 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06551 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06414 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07200 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09060 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08775 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_10140 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_08275 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05440 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05446 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09430 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05785 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06819 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07147 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07963 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07368 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07769 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09801 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08794 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06665 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08260 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08264 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08648 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08729 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05580 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09132 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06240 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06156 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09356 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07779 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06481 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06570 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07995 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08931 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08520 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05952 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09512 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08252 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08522 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05919 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09345 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07955 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07954 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07168 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_07981 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06797 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07232 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08249 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08536 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06642 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05674 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05706 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09373 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06912 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06911 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09319 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06596 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06592 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_06689 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_05846 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08357 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07245 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_09120 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09531 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08507 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08189 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08968 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09563 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07397 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06105 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09814 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_09813 | (+) | not used | |||
| 521000.PROVRETT_05511 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07419 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_07413 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08114 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_06903 | (+) | ||||
| 521000.PROVRETT_08609 | (+) |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveT3 predictions using new standard model 2.0.1 (PROTEINS.NEW.EFFECTIVET3)
- EffectiveT3 predictions using old standard model 1.0.1 (PROTEINS.OLD.EFFECTIVET3)
- EffectiveCCBD predictions (PROTEINS.CHAPERONES.TXT)
- T4SEpre bpbAac predictions (T4SEpre_bpbAac_FinalResult.csv)
- T4SEpre psAac predictions (T4SEpre_psAac_FinalResult.csv)
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)
Genome based results
Summary
- Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
- Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
Estimated copy number = 1.0 (10/10 KEGG proteins)
- Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
- Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
Estimated copy number = 1.25 (10/8 KEGG proteins)
Individual results for each secretion system
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type III secretion system (T3_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type IV secretion system (T4_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type VI secretion system (T6_top100_COGS.xls)
- List of COGs assigned to Type III secretion system in KEGG (T3SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type IV secretion system in KEGG (T4SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type VI secretion system in KEGG (T6SS_KEGG_cmp.xls)
Parameters:
==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================
Estimated copy number = 1.0 (10/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 1.25 (10/8 KEGG proteins)
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