Effective results for Providencia stuartii ATCC 25827 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 872
- Predicted by EffectiveT3: 218 (high confidence), 336 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 49 within, 27 before, 57 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 149
- Predicted by EffectiveELD: 20 eukaryotic-like domains, contained in 111 proteins (78 high, 33 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
471874.PROSTU_00961(<)PF00577ER
471874.PROSTU_01810+PF00577(mitochondrial)
471874.PROSTU_00576(<)+ER
471874.PROSTU_04638+(>)+PF00577
471874.PROSTU_02560+ER
471874.PROSTU_03162+mitochondrial
471874.PROSTU_01543(>)ER
471874.PROSTU_02019+(mitochondrial)
471874.PROSTU_00846+(mitochondrial)
471874.PROSTU_00844+(ER)
471874.PROSTU_00621PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_00887+ER
471874.PROSTU_02957(PF02450)mitochondrial; (mitochondrial)
471874.PROSTU_04725PF00577ER
471874.PROSTU_04724PF00345ER
471874.PROSTU_02179+ER
471874.PROSTU_02174+(ER)
471874.PROSTU_02570++(plastid)
471874.PROSTU_04508PF00577ER
471874.PROSTU_03629PF00345ER
471874.PROSTU_03620+mitochondrial
471874.PROSTU_00437(>)ER
471874.PROSTU_03010+(ER)
471874.PROSTU_01624(>)ER
471874.PROSTU_01236PF00345ER
471874.PROSTU_04734PF00577(ER)
471874.PROSTU_04735PF00345ER
471874.PROSTU_01363+ER
471874.PROSTU_01367(PF03222)(ER)
471874.PROSTU_02497PF00345ER
471874.PROSTU_01566+ER
471874.PROSTU_03636PF00345ER; (ER)
471874.PROSTU_03703+ER
471874.PROSTU_03525PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_03031(>)(ER); ER
471874.PROSTU_04823+(ER)
471874.PROSTU_02939(>)ER
471874.PROSTU_04705(>)ER
471874.PROSTU_03860+ER
471874.PROSTU_02482PF00345ER
471874.PROSTU_02152+mitochondrial
471874.PROSTU_04482(PF12762)ER
471874.PROSTU_04077+ER
471874.PROSTU_00566PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_00960PF00345(ER)
471874.PROSTU_04088PF00345ER
471874.PROSTU_04087PF00577(ER)
471874.PROSTU_04082+ER
471874.PROSTU_04666+(mitochondrial)
471874.PROSTU_03720+mitochondrial
471874.PROSTU_01902+mitochondrial
471874.PROSTU_01893+ER
471874.PROSTU_00977+(mitochondrial)
471874.PROSTU_03540+ER
471874.PROSTU_00190PF00577ER
471874.PROSTU_00191PF00345ER
471874.PROSTU_04070+(mitochondrial)
471874.PROSTU_04509PF00345ER
471874.PROSTU_04056(>)ER
471874.PROSTU_01119+ER
471874.PROSTU_01625PF00577(ER); ER
471874.PROSTU_01626PF00345(ER)
471874.PROSTU_04038+ER
471874.PROSTU_03289+ER
471874.PROSTU_03515(>)(ER)
471874.PROSTU_00506+(mitochondrial)
471874.PROSTU_02850(<)ER
471874.PROSTU_04040PF00345ER
471874.PROSTU_02178+ER
471874.PROSTU_01630(>)ER
471874.PROSTU_02454PF00345ER
471874.PROSTU_01926(PF12762)ER; (ER)
471874.PROSTU_03070PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_03674+(ER)
471874.PROSTU_01811PF00345(mitochondrial)
471874.PROSTU_03098(PF03222)ER
471874.PROSTU_04214+ER
471874.PROSTU_04851PF00577ER
471874.PROSTU_04036+ER
471874.PROSTU_03937(>)mitochondrial
471874.PROSTU_04043PF00345ER
471874.PROSTU_04041PF00577ER
471874.PROSTU_02683+ER
471874.PROSTU_03536+ER
471874.PROSTU_00520PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_00460+(mitochondrial)
471874.PROSTU_00788+ER
471874.PROSTU_00013(>)(mitochondrial)
471874.PROSTU_01014PF00345mitochondrial
471874.PROSTU_02271(>)ER
471874.PROSTU_02655PF00577ER
471874.PROSTU_02654PF00345ER
471874.PROSTU_02650PF00345ER
471874.PROSTU_02653PF00345ER
471874.PROSTU_03652(>)(ER)
471874.PROSTU_02607(>)ER
471874.PROSTU_04520+ER
471874.PROSTU_00828PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_00533PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_04060+ER
471874.PROSTU_01689+ER
471874.PROSTU_03681+ER
471874.PROSTU_00643+ER
471874.PROSTU_03353+ER
471874.PROSTU_03352+ER
471874.PROSTU_00493(>)ER
471874.PROSTU_04421+ER
471874.PROSTU_01071(PF12762)ER
471874.PROSTU_04089(<)ER
471874.PROSTU_02255++PF00620
471874.PROSTU_01503(PF02450)mitochondrial; (mitochondrial)
471874.PROSTU_02746(>)ER
471874.PROSTU_00807+mitochondrial
471874.PROSTU_02337+ER
471874.PROSTU_04766PF00345ER
471874.PROSTU_01991PF00345ER
471874.PROSTU_01990PF00577ER; (ER)
471874.PROSTU_01036(>)ER
471874.PROSTU_00474+(>)PF09612
471874.PROSTU_01064(>)(ER); ER
471874.PROSTU_04541(>)ER
471874.PROSTU_01451+ER
471874.PROSTU_03964PF00345ER
471874.PROSTU_03963PF00577mitochondrial; (mitochondrial)
471874.PROSTU_02496PF00577ER
471874.PROSTU_01237PF00577(mitochondrial)
471874.PROSTU_01526+ER
471874.PROSTU_02467+(ER)
471874.PROSTU_03565+ER
471874.PROSTU_00916PF03400mitochondrial; (mitochondrial)
471874.PROSTU_00594+(mitochondrial)
471874.PROSTU_02793(>)ER
471874.PROSTU_04637+ER
471874.PROSTU_04636(+)PF00345(ER); (plastid)
471874.PROSTU_04120PF03400(mitochondrial)
471874.PROSTU_02513++(plastid)
471874.PROSTU_02510(PF03222)(ER)
471874.PROSTU_00301+ER
471874.PROSTU_01955+(mitochondrial)
471874.PROSTU_03556PF00345ER
471874.PROSTU_03553PF00345ER
471874.PROSTU_03392+ER
471874.PROSTU_03390PF00345ER
471874.PROSTU_03396+ER
471874.PROSTU_04058+(ER)
471874.PROSTU_00359+(ER)
471874.PROSTU_02706(+)ER
471874.PROSTU_03164(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_02013(+)ER; (ER)
471874.PROSTU_00847+(ER)
471874.PROSTU_02956+(mitochondrial)
471874.PROSTU_04652+(mitochondrial)
471874.PROSTU_02716(+)(mitochondrial); (plastid)
471874.PROSTU_03626(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_01756+(ER)
471874.PROSTU_03026+
471874.PROSTU_03530(<)ER; not used
471874.PROSTU_00944(+)+(plastid)
471874.PROSTU_03511+(ER)
471874.PROSTU_00162++
471874.PROSTU_04601+(mitochondrial)
471874.PROSTU_04640(+)ER
471874.PROSTU_02036+(mitochondrial)
471874.PROSTU_02038+(mitochondrial)
471874.PROSTU_04220+plastid
471874.PROSTU_00375(<)+
471874.PROSTU_04037PF00345(ER)
471874.PROSTU_04095+PF10703
471874.PROSTU_03866(<)ER; not used
471874.PROSTU_03045(>)(ER)
471874.PROSTU_03877++
471874.PROSTU_01904++
471874.PROSTU_00404+(<)
471874.PROSTU_04205++
471874.PROSTU_01117(+)(>)(PF02657)
471874.PROSTU_01116(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_03063(<)(plastid)
471874.PROSTU_02334(>)(ER)
471874.PROSTU_00501+
471874.PROSTU_04159+plastid
471874.PROSTU_01309(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_02455+PF00577
471874.PROSTU_02692(+)(<)(mitochondrial)
471874.PROSTU_02274+(mitochondrial)
471874.PROSTU_02075(<)+
471874.PROSTU_03419+(>)
471874.PROSTU_00516(+)(ER)
471874.PROSTU_00332+(>)
471874.PROSTU_00039+(plastid)
471874.PROSTU_02113(<)(mitochondrial)
471874.PROSTU_02206+(mitochondrial)
471874.PROSTU_04573(+)ER
471874.PROSTU_02680(>)(PF02224)
471874.PROSTU_02068+plastid
471874.PROSTU_00527(<)(ER); not used
471874.PROSTU_01734+plastid
471874.PROSTU_01275(+)(ER)
471874.PROSTU_02907(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_02159+(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_04833(+)(ER)
471874.PROSTU_03135++
471874.PROSTU_00810++
471874.PROSTU_01000+ER; not used
471874.PROSTU_02322+(ER)
471874.PROSTU_04831+(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_03750(+)ER
471874.PROSTU_00473(+)(ER); ER
471874.PROSTU_01667++
471874.PROSTU_04408(+)+(mitochondrial)
471874.PROSTU_04347(<)(mitochondrial)
471874.PROSTU_04600+(plastid)
471874.PROSTU_03562+(plastid)
471874.PROSTU_03564(+)(ER)
471874.PROSTU_02998(PF03222)(ER)
471874.PROSTU_00020++
471874.PROSTU_00132PF03400(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_00131PF03400(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_03228+(plastid)
471874.PROSTU_04325+(mitochondrial)
471874.PROSTU_03552(>)PF00345
471874.PROSTU_00582(+)(ER); (plastid)
471874.PROSTU_03838+(ER)
471874.PROSTU_00140(>)(PF02657)not used
471874.PROSTU_03835++
471874.PROSTU_03943+(mitochondrial)
471874.PROSTU_02167(+)ER; not used
471874.PROSTU_01890(>)
471874.PROSTU_02363+
471874.PROSTU_02162+not used
471874.PROSTU_01940+
471874.PROSTU_02015(+)plastid
471874.PROSTU_03546(+)(PF13683)not used
471874.PROSTU_03499(>)
471874.PROSTU_00445(PF06176)
471874.PROSTU_00842PF03981
471874.PROSTU_00623+
471874.PROSTU_00718+
471874.PROSTU_00710+not used
471874.PROSTU_00714+not used
471874.PROSTU_02986+
471874.PROSTU_02952+
471874.PROSTU_00159+not used
471874.PROSTU_01152+
471874.PROSTU_01088+not used
471874.PROSTU_04174+
471874.PROSTU_03849+
471874.PROSTU_03847+
471874.PROSTU_02378+
471874.PROSTU_02572(>)
471874.PROSTU_02578(+)(ER)
471874.PROSTU_03628PF00577
471874.PROSTU_03716PF03400
471874.PROSTU_03714+
471874.PROSTU_03713+
471874.PROSTU_01978+
471874.PROSTU_02005+
471874.PROSTU_03531(<)not used
471874.PROSTU_02393(+)(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_03445+
471874.PROSTU_02012+
471874.PROSTU_01053+
471874.PROSTU_04184+
471874.PROSTU_00897+
471874.PROSTU_00893+
471874.PROSTU_00546+
471874.PROSTU_00388+
471874.PROSTU_00384+
471874.PROSTU_00386+
471874.PROSTU_00768+not used
471874.PROSTU_00764+
471874.PROSTU_04593+
471874.PROSTU_00364+
471874.PROSTU_03635PF00577
471874.PROSTU_01962+
471874.PROSTU_01244+
471874.PROSTU_00427+
471874.PROSTU_02347(+)(PF10462)
471874.PROSTU_00555+
471874.PROSTU_00950+
471874.PROSTU_04122+
471874.PROSTU_00779+
471874.PROSTU_00775+
471874.PROSTU_00773PF03981
471874.PROSTU_00082+
471874.PROSTU_00083+
471874.PROSTU_00080+
471874.PROSTU_01096+not used
471874.PROSTU_00173+
471874.PROSTU_00370(>)
471874.PROSTU_04252(<)
471874.PROSTU_04099+
471874.PROSTU_03998+
471874.PROSTU_03148+
471874.PROSTU_04072(PF03222)
471874.PROSTU_03861+
471874.PROSTU_01355(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_01600(<)
471874.PROSTU_02483PF00577
471874.PROSTU_01590+
471874.PROSTU_04674+
471874.PROSTU_02558(>)
471874.PROSTU_02730+
471874.PROSTU_03731(+)(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_01917PF06148
471874.PROSTU_01913+
471874.PROSTU_03287(>)
471874.PROSTU_03041(>)
471874.PROSTU_02248(PF00707)
471874.PROSTU_03462+
471874.PROSTU_03191+
471874.PROSTU_03193PF10703
471874.PROSTU_03803(<)
471874.PROSTU_01230+
471874.PROSTU_00983+
471874.PROSTU_00740+
471874.PROSTU_02839+
471874.PROSTU_02992+
471874.PROSTU_00348+
471874.PROSTU_02990+
471874.PROSTU_04243+
471874.PROSTU_01359+
471874.PROSTU_04069(+)mitochondrial; not used
471874.PROSTU_01604(+)(>)
471874.PROSTU_01162(PF13683)
471874.PROSTU_01618+
471874.PROSTU_01619+
471874.PROSTU_01345+
471874.PROSTU_02124+
471874.PROSTU_02121(+)(ER); not used
471874.PROSTU_03724(+)+
471874.PROSTU_01909+
471874.PROSTU_03294+
471874.PROSTU_02059+
471874.PROSTU_02058+
471874.PROSTU_02055+
471874.PROSTU_02054(+)(ER)
471874.PROSTU_02050+
471874.PROSTU_03614+
471874.PROSTU_03619+
471874.PROSTU_01854+
471874.PROSTU_02821+
471874.PROSTU_02755+
471874.PROSTU_02076+
471874.PROSTU_03609(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_00199+
471874.PROSTU_00196+
471874.PROSTU_00456(>)
471874.PROSTU_04603+
471874.PROSTU_04272+
471874.PROSTU_04029+
471874.PROSTU_01753(PF02224)
471874.PROSTU_01752+
471874.PROSTU_01757+
471874.PROSTU_04504+
471874.PROSTU_01115(PF12762)not used
471874.PROSTU_04187(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_03882+
471874.PROSTU_01246(+)(>)
471874.PROSTU_04337+
471874.PROSTU_03068(>)
471874.PROSTU_03665+
471874.PROSTU_01993+
471874.PROSTU_03668(+)(plastid)
471874.PROSTU_00599+
471874.PROSTU_03084(PF13683)
471874.PROSTU_00216+
471874.PROSTU_00735+
471874.PROSTU_00262+
471874.PROSTU_03922+
471874.PROSTU_04535+
471874.PROSTU_00329+
471874.PROSTU_01395+
471874.PROSTU_01038(>)
471874.PROSTU_01748+
471874.PROSTU_01031PF03981
471874.PROSTU_01741+
471874.PROSTU_01106(PF02873)
471874.PROSTU_04199(+)(plastid)
471874.PROSTU_01328+
471874.PROSTU_04681+
471874.PROSTU_04683+not used
471874.PROSTU_04684+
471874.PROSTU_02691+
471874.PROSTU_03275+
471874.PROSTU_03671+
471874.PROSTU_03415+
471874.PROSTU_03305+not used
471874.PROSTU_00519+
471874.PROSTU_03090+
471874.PROSTU_01578+
471874.PROSTU_00241+
471874.PROSTU_00337+
471874.PROSTU_00804+
471874.PROSTU_04857+not used
471874.PROSTU_04850PF00345
471874.PROSTU_01001+
471874.PROSTU_01483+
471874.PROSTU_04075+not used
471874.PROSTU_04518+
471874.PROSTU_03930(<)
471874.PROSTU_02688+
471874.PROSTU_01792+
471874.PROSTU_02067+
471874.PROSTU_03537+
471874.PROSTU_03331+
471874.PROSTU_00529+
471874.PROSTU_00526+
471874.PROSTU_00236+
471874.PROSTU_00656(>)
471874.PROSTU_03404+
471874.PROSTU_00996(>)
471874.PROSTU_02457+
471874.PROSTU_04204+
471874.PROSTU_04022+
471874.PROSTU_04561+
471874.PROSTU_01493+
471874.PROSTU_04150+
471874.PROSTU_04152+
471874.PROSTU_01013PF00577
471874.PROSTU_02277+
471874.PROSTU_02273+
471874.PROSTU_01787+
471874.PROSTU_02659PF00577
471874.PROSTU_02305(>)
471874.PROSTU_03259(>)
471874.PROSTU_02783(<)
471874.PROSTU_01876(>)
471874.PROSTU_01877+
471874.PROSTU_03327+not used
471874.PROSTU_03325+
471874.PROSTU_00539+
471874.PROSTU_00536(+)(ER)
471874.PROSTU_00821+
471874.PROSTU_00532(+)(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_02865+
471874.PROSTU_01923+
471874.PROSTU_04811+
471874.PROSTU_00792(+)+
471874.PROSTU_00794+
471874.PROSTU_04815+
471874.PROSTU_02885(+)(<)
471874.PROSTU_02886+
471874.PROSTU_02887+
471874.PROSTU_04231PF00577not used
471874.PROSTU_04411(PF12949)
471874.PROSTU_04837+not used
471874.PROSTU_04832+
471874.PROSTU_04364+
471874.PROSTU_00259(<)
471874.PROSTU_04495(<)
471874.PROSTU_01060+
471874.PROSTU_04548+
471874.PROSTU_03173+
471874.PROSTU_04745+
471874.PROSTU_02644(<)
471874.PROSTU_02082+
471874.PROSTU_02790(<)
471874.PROSTU_04063+
471874.PROSTU_02226+
471874.PROSTU_01042+
471874.PROSTU_04103+
471874.PROSTU_03350(+)+
471874.PROSTU_00819+
471874.PROSTU_03244+
471874.PROSTU_04422+
471874.PROSTU_00078+
471874.PROSTU_00072+
471874.PROSTU_04221+
471874.PROSTU_01614+
471874.PROSTU_02249(PF00707)
471874.PROSTU_04173+
471874.PROSTU_04170(PF07720)
471874.PROSTU_01670+
471874.PROSTU_01074+
471874.PROSTU_04553+
471874.PROSTU_03902+
471874.PROSTU_02749+
471874.PROSTU_01218+
471874.PROSTU_01210+
471874.PROSTU_04664+
471874.PROSTU_02529+
471874.PROSTU_02416+
471874.PROSTU_02504+
471874.PROSTU_03236+
471874.PROSTU_01006+not used
471874.PROSTU_01692(+)(PF03222)
471874.PROSTU_03121+
471874.PROSTU_03340(>)
471874.PROSTU_02629+
471874.PROSTU_00246+
471874.PROSTU_00248(+)(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_01070+not used
471874.PROSTU_04835+
471874.PROSTU_04765PF00577
471874.PROSTU_02165+
471874.PROSTU_00110(+)(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_04531(>)
471874.PROSTU_00116+not used
471874.PROSTU_01411+
471874.PROSTU_01198+
471874.PROSTU_00204+
471874.PROSTU_01440+
471874.PROSTU_04106+
471874.PROSTU_04100PF10703
471874.PROSTU_01048(+)(ER); not used
471874.PROSTU_04580(>)
471874.PROSTU_02246(+)ER; not used
471874.PROSTU_02405+
471874.PROSTU_03806+
471874.PROSTU_01530+
471874.PROSTU_01533(PF13683)
471874.PROSTU_02620+
471874.PROSTU_02623+
471874.PROSTU_02336+
471874.PROSTU_03298+
471874.PROSTU_02756+
471874.PROSTU_02758+
471874.PROSTU_02779(+)(plastid)
471874.PROSTU_03590+
471874.PROSTU_03592(<)
471874.PROSTU_03579+
471874.PROSTU_03373+
471874.PROSTU_01007+
471874.PROSTU_04406+
471874.PROSTU_00471+
471874.PROSTU_00729+
471874.PROSTU_04808+
471874.PROSTU_04806+
471874.PROSTU_02968+
471874.PROSTU_04371+
471874.PROSTU_01453+
471874.PROSTU_04578+
471874.PROSTU_01057(PF13683)
471874.PROSTU_02618+
471874.PROSTU_02140+
471874.PROSTU_01980(PF13683)
471874.PROSTU_03807(>)
471874.PROSTU_02186+
471874.PROSTU_01520(+)(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_02613(>)
471874.PROSTU_03991+
471874.PROSTU_02767(>)
471874.PROSTU_01026+
471874.PROSTU_03583+
471874.PROSTU_02290(PF02657)
471874.PROSTU_02293+
471874.PROSTU_02299(>)
471874.PROSTU_00469+
471874.PROSTU_00466+
471874.PROSTU_01012(+)(plastid)
471874.PROSTU_00917+
471874.PROSTU_00867+
471874.PROSTU_00608+
471874.PROSTU_00607+
471874.PROSTU_00602+
471874.PROSTU_00603+
471874.PROSTU_01849+
471874.PROSTU_00597(PF13683)
471874.PROSTU_00592(PF13683)
471874.PROSTU_00130(+)(mitochondrial); not used
471874.PROSTU_02795+
471874.PROSTU_01424+
471874.PROSTU_01080(PF02873)
471874.PROSTU_04121+
471874.PROSTU_01680+
471874.PROSTU_04202+
471874.PROSTU_02519(<)
471874.PROSTU_02774+
471874.PROSTU_03138+
471874.PROSTU_02289+
471874.PROSTU_01957+not used
471874.PROSTU_02285+
471874.PROSTU_03551(+)PF00577
471874.PROSTU_03391PF00577
471874.PROSTU_03486+
471874.PROSTU_03485+
471874.PROSTU_01099(>)
471874.PROSTU_00858(>)
471874.PROSTU_02509+
471874.PROSTU_02602(+)(mitochondrial)
471874.PROSTU_01312+
471874.PROSTU_03440+
471874.PROSTU_00705+
471874.PROSTU_04145(>)
471874.PROSTU_03839+
471874.PROSTU_04357+not used
471874.PROSTU_00144+
471874.PROSTU_00142+not used
471874.PROSTU_01097+
471874.PROSTU_04135+
471874.PROSTU_04130PF03981
471874.PROSTU_00818+
471874.PROSTU_02368(+)
471874.PROSTU_02565(+)
471874.PROSTU_02563(+)
471874.PROSTU_00296(+)
471874.PROSTU_02160(+)not used
471874.PROSTU_02708(+)
471874.PROSTU_03381(+)
471874.PROSTU_03383(+)
471874.PROSTU_02389(+)
471874.PROSTU_00448(+)
471874.PROSTU_00932(+)
471874.PROSTU_00934(+)
471874.PROSTU_00882(+)not used
471874.PROSTU_00716(+)
471874.PROSTU_02918(+)
471874.PROSTU_02953(+)
471874.PROSTU_04377(+)
471874.PROSTU_03794(+)not used
471874.PROSTU_02377(+)
471874.PROSTU_02373(+)
471874.PROSTU_02574(+)
471874.PROSTU_03622(+)
471874.PROSTU_03719(+)
471874.PROSTU_02000(+)
471874.PROSTU_01054(+)
471874.PROSTU_00436(+)
471874.PROSTU_00438(+)
471874.PROSTU_00381(+)
471874.PROSTU_00769(+)not used
471874.PROSTU_00095(+)
471874.PROSTU_00097(+)not used
471874.PROSTU_01621(+)
471874.PROSTU_01623(+)
471874.PROSTU_01418(+)
471874.PROSTU_04732(+)
471874.PROSTU_02500(+)
471874.PROSTU_03810(+)
471874.PROSTU_01700(+)not used
471874.PROSTU_03856(+)
471874.PROSTU_02540(+)
471874.PROSTU_02722(+)
471874.PROSTU_02728(+)
471874.PROSTU_03709(+)
471874.PROSTU_01961(+)
471874.PROSTU_02590(+)
471874.PROSTU_03451(+)
471874.PROSTU_03452(+)
471874.PROSTU_00551(+)not used
471874.PROSTU_00392(+)
471874.PROSTU_00774(+)
471874.PROSTU_00065(+)not used
471874.PROSTU_00175(+)
471874.PROSTU_04251(+)
471874.PROSTU_03997(+)
471874.PROSTU_01771(+)
471874.PROSTU_03864(+)
471874.PROSTU_01357(+)
471874.PROSTU_01356(+)
471874.PROSTU_02153(+)
471874.PROSTU_01593(+)
471874.PROSTU_01591(+)
471874.PROSTU_01595(+)
471874.PROSTU_02738(+)
471874.PROSTU_03732(+)
471874.PROSTU_01918(+)
471874.PROSTU_02020(+)
471874.PROSTU_02021(+)not used
471874.PROSTU_02024(+)
471874.PROSTU_02025(+)
471874.PROSTU_01820(+)
471874.PROSTU_03463(+)
471874.PROSTU_04557(+)
471874.PROSTU_00965(+)
471874.PROSTU_00743(+)
471874.PROSTU_00744(+)
471874.PROSTU_00183(+)
471874.PROSTU_00181(+)
471874.PROSTU_01400(+)
471874.PROSTU_03981(+)
471874.PROSTU_04719(+)
471874.PROSTU_01402(+)
471874.PROSTU_01765(+)
471874.PROSTU_01167(+)
471874.PROSTU_01349(+)not used
471874.PROSTU_02231(+)not used
471874.PROSTU_02237(+)
471874.PROSTU_03729(+)
471874.PROSTU_01903(+)
471874.PROSTU_03610(+)
471874.PROSTU_03477(+)
471874.PROSTU_00401(+)
471874.PROSTU_04393(+)
471874.PROSTU_00015(+)
471874.PROSTU_00976(+)
471874.PROSTU_00972(+)not used
471874.PROSTU_00970(+)
471874.PROSTU_02327(+)
471874.PROSTU_02823(+)
471874.PROSTU_00756(+)
471874.PROSTU_00758(+)
471874.PROSTU_04208(+)
471874.PROSTU_01193(+)
471874.PROSTU_04017(+)
471874.PROSTU_00356(+)
471874.PROSTU_00354(+)
471874.PROSTU_04275(+)
471874.PROSTU_01888(+)
471874.PROSTU_04055(+)
471874.PROSTU_03889(+)
471874.PROSTU_04181(+)
471874.PROSTU_04180(+)
471874.PROSTU_03881(+)
471874.PROSTU_01628(+)
471874.PROSTU_02133(+)
471874.PROSTU_03690(+)
471874.PROSTU_02043(+)
471874.PROSTU_03062(+)
471874.PROSTU_03669(+)
471874.PROSTU_04155(+)
471874.PROSTU_00700(+)
471874.PROSTU_00695(+)not used
471874.PROSTU_00693(+)
471874.PROSTU_02508(+)
471874.PROSTU_03921(+)
471874.PROSTU_04049(+)
471874.PROSTU_01372(+)
471874.PROSTU_01320(+)
471874.PROSTU_01379(+)
471874.PROSTU_01252(+)
471874.PROSTU_02218(+)not used
471874.PROSTU_01929(+)
471874.PROSTU_02073(+)not used
471874.PROSTU_03071(+)
471874.PROSTU_03679(+)not used
471874.PROSTU_03410(+)
471874.PROSTU_03300(+)
471874.PROSTU_00640(+)
471874.PROSTU_00517(+)not used
471874.PROSTU_00886(+)
471874.PROSTU_00201(+)
471874.PROSTU_00489(+)
471874.PROSTU_00687(+)
471874.PROSTU_04260(+)
471874.PROSTU_04341(+)
471874.PROSTU_04215(+)
471874.PROSTU_04210(+)
471874.PROSTU_01481(+)
471874.PROSTU_02686(+)
471874.PROSTU_01796(+)
471874.PROSTU_02666(+)
471874.PROSTU_03243(+)
471874.PROSTU_02066(+)
471874.PROSTU_03645(+)
471874.PROSTU_00105(+)
471874.PROSTU_01109(+)not used
471874.PROSTU_03028(+)
471874.PROSTU_03330(+)
471874.PROSTU_03332(+)
471874.PROSTU_00524(+)
471874.PROSTU_02875(+)
471874.PROSTU_00782(+)
471874.PROSTU_01631(+)
471874.PROSTU_00012(+)
471874.PROSTU_03825(+)
471874.PROSTU_00104(+)
471874.PROSTU_02473(+)
471874.PROSTU_01105(+)
471874.PROSTU_02275(+)
471874.PROSTU_01784(+)
471874.PROSTU_02651(+)
471874.PROSTU_03251(+)
471874.PROSTU_02191(+)
471874.PROSTU_02605(+)
471874.PROSTU_02868(+)
471874.PROSTU_02229(+)
471874.PROSTU_00648(+)
471874.PROSTU_02591(+)
471874.PROSTU_02881(+)
471874.PROSTU_04239(+)
471874.PROSTU_04235(+)
471874.PROSTU_04782(+)
471874.PROSTU_04788(+)
471874.PROSTU_04363(+)
471874.PROSTU_03272(+)
471874.PROSTU_04493(+)
471874.PROSTU_01460(+)
471874.PROSTU_04019(+)
471874.PROSTU_02265(+)
471874.PROSTU_02078(+)
471874.PROSTU_02461(+)
471874.PROSTU_02469(+)
471874.PROSTU_02088(+)
471874.PROSTU_03221(+)
471874.PROSTU_02080(+)
471874.PROSTU_02087(+)
471874.PROSTU_03133(+)
471874.PROSTU_03354(+)
471874.PROSTU_00319(+)
471874.PROSTU_04743(+)not used
471874.PROSTU_03120(+)
471874.PROSTU_02993(+)
471874.PROSTU_01615(+)
471874.PROSTU_04829(+)not used
471874.PROSTU_00102(+)
471874.PROSTU_04172(+)
471874.PROSTU_01673(+)
471874.PROSTU_01747(+)
471874.PROSTU_02635(+)
471874.PROSTU_01693(+)
471874.PROSTU_03692(+)
471874.PROSTU_00232(+)
471874.PROSTU_00925(+)
471874.PROSTU_00240(+)
471874.PROSTU_00249(+)
471874.PROSTU_01745(+)
471874.PROSTU_04819(+)
471874.PROSTU_04816(+)
471874.PROSTU_00114(+)not used
471874.PROSTU_04101(+)
471874.PROSTU_04534(+)
471874.PROSTU_02247(+)
471874.PROSTU_02402(+)
471874.PROSTU_02624(+)
471874.PROSTU_03757(+)
471874.PROSTU_03754(+)
471874.PROSTU_03056(+)
471874.PROSTU_04224(+)
471874.PROSTU_03110(+)
471874.PROSTU_03570(+)
471874.PROSTU_02195(+)
471874.PROSTU_03370(+)
471874.PROSTU_02192(+)
471874.PROSTU_00271(+)
471874.PROSTU_04015(+)
471874.PROSTU_00587(+)
471874.PROSTU_01380(+)
471874.PROSTU_00291(+)
471874.PROSTU_01184(+)
471874.PROSTU_01458(+)not used
471874.PROSTU_01459(+)
471874.PROSTU_00040(+)
471874.PROSTU_02094(+)
471874.PROSTU_01988(+)
471874.PROSTU_01989(+)
471874.PROSTU_02436(+)
471874.PROSTU_02185(+)
471874.PROSTU_02531(+)
471874.PROSTU_01025(+)
471874.PROSTU_03584(+)
471874.PROSTU_00827(+)not used
471874.PROSTU_03364(+)
471874.PROSTU_04613(+)
471874.PROSTU_00601(+)
471874.PROSTU_04452(+)
471874.PROSTU_00146(+)
471874.PROSTU_04510(+)
471874.PROSTU_00283(+)
471874.PROSTU_00289(+)
471874.PROSTU_04298(+)
471874.PROSTU_04294(+)
471874.PROSTU_03953(+)
471874.PROSTU_02528(+)
471874.PROSTU_01081(+)
471874.PROSTU_01735(+)
471874.PROSTU_02193(+)
471874.PROSTU_02511(+)
471874.PROSTU_04323(+)
471874.PROSTU_02092(+)
471874.PROSTU_02286(+)
471874.PROSTU_00302(+)
471874.PROSTU_00927(+)
471874.PROSTU_02470(+)not used
471874.PROSTU_00701(+)not used
471874.PROSTU_00721(+)
471874.PROSTU_04284(+)
471874.PROSTU_01555(+)
471874.PROSTU_04751(+)
471874.PROSTU_03358(+)
471874.PROSTU_04419(+)
471874.PROSTU_00120(+)not used

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 1.1 (11/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 1.375 (11/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================