Effective results for Burkholderia ambifaria AMMD (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 1187
- Predicted by EffectiveT3: 294 (high confidence), 440 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 24 within, 11 before, 47 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 103
- Predicted by EffectiveELD: 23 eukaryotic-like domains, contained in 326 proteins (3 high, 323 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, Type IV, Type VI
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
| Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
|---|---|---|---|---|---|
| 339670.Bamb_5219 | + | (PF13609) | ER | ||
| 339670.Bamb_4999 | + | (PF13609) | ER | ||
| 339670.Bamb_4482 | + | (PF13609) | ER | ||
| 339670.Bamb_6314 | + | (PF13609) | (ER) | ||
| 339670.Bamb_2629 | (PF08546) (PF02558) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2544 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_5729 | (PF08546) (PF02558) | ER | |||
| 339670.Bamb_4106 | + | (PF13609) | ER; (ER) | ||
| 339670.Bamb_5063 | (PF10282) (PF04185) | ER | |||
| 339670.Bamb_4203 | (PF08546) (PF02558) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_5495 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_6042 | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1067 | (>) | (ER); (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4041 | (PF00126) | ER; (ER) | |||
| 339670.Bamb_3236 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_0021 | (PF13609) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0797 | (PF01165) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_6098 | (PF10282) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6321 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_4028 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_6157 | (PF13609) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_6153 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_1514 | (PF10282) | ER | |||
| 339670.Bamb_3003 | (PF04185) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6521 | (PF12158) | ER | |||
| 339670.Bamb_6523 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2181 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_6449 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1088 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_2610 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3564 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_0541 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_5082 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_6264 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_2527 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_3045 | + | mitochondrial; plastid | |||
| 339670.Bamb_3601 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_3836 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_2008 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_4654 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_1294 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_3663 | (PF13609) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0500 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1102 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_3852 | + | (mitochondrial); plastid | |||
| 339670.Bamb_3850 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2455 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_1045 | (PF04185) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6037 | (PF00126) | (ER); ER | |||
| 339670.Bamb_2275 | (<) | ER | |||
| 339670.Bamb_1464 | (>) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0751 | (<) | ER | |||
| 339670.Bamb_5393 | (PF00375) | (ER); mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_1259 | + | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_1783 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_6418 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_6419 | (PF00126) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1137 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_3332 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_3331 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_4764 | (+) | (PF00126) | (mitochondrial) | ||
| 339670.Bamb_4768 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_1271 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_3687 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_1138 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_6430 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_5359 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_3742 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_3746 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_1428 | (PF02010) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1424 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1840 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2744 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_6456 | (+) | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | ||
| 339670.Bamb_5407 | + | (>) | (PF15984) | ||
| 339670.Bamb_4701 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3374 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_3375 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3975 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_2762 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_3492 | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4115 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_1396 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_5073 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2708 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_0967 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4136 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_1174 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_3728 | (PF00126) | mitochondrial; ER | |||
| 339670.Bamb_1376 | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4898 | (PF00126) | ER; (ER) | |||
| 339670.Bamb_4132 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6122 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6126 | (PF10282) | ER | |||
| 339670.Bamb_1582 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_3456 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2536 | + | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_5937 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_4245 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3242 | (>) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_2306 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_5625 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_5488 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1330 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_1487 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4237 | + | mitochondrial; plastid | |||
| 339670.Bamb_2326 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_5755 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1076 | (PF13609) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6318 | + | (PF00126) | (mitochondrial) | ||
| 339670.Bamb_4036 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4037 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_4038 | (>) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_4781 | (PF13924) | ER | |||
| 339670.Bamb_6145 | + | (mitochondrial); plastid | |||
| 339670.Bamb_2341 | (PF15984) | ER; (ER) | |||
| 339670.Bamb_5998 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_0863 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_6338 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4011 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_0488 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0482 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_3015 | (PF13609) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_4595 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_2191 | (PF10282) | ER | |||
| 339670.Bamb_4299 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_5526 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_4608 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_1895 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_3035 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_4926 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_0550 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_5895 | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5897 | (PF13609) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_5092 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4415 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_6256 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6250 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_4436 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4625 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_4629 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2830 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2928 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_6063 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_5704 | + | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_4472 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_3848 | (PF13609) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_0766 | (PF09286) | ER | |||
| 339670.Bamb_5111 | (PF03659) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4858 | (PF04185) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5850 | + | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_4328 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_6216 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_6215 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1898 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_1278 | (PF04185) | ER | |||
| 339670.Bamb_1240 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_4425 | (>) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_2549 | + | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_2890 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_2935 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_4145 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_4146 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_4361 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_3755 | (PF04185) | ER | |||
| 339670.Bamb_1878 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3922 | (PF00126) | ER | |||
| 339670.Bamb_6427 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_0046 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1990 | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0452 | (PF13609) | ER | |||
| 339670.Bamb_1857 | + | (ER); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_3907 | (+) | (PF00126) | mitochondrial; (plastid) | ||
| 339670.Bamb_1226 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_2998 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5060 | (PF00375) | ER | |||
| 339670.Bamb_4126 | (PF13609) | ER; (ER) | |||
| 339670.Bamb_4380 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_3733 | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1997 | + | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3948 | (PF00126) | ER; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2715 | + | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_6481 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1620 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_5671 | (PF00126) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5908 | (PF13609) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_5423 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_6344 | (>) | ER | |||
| 339670.Bamb_5712 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_1647 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_1917 | (PF13609) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_4062 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2913 | + | ER | |||
| 339670.Bamb_5949 | (PF00126) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_4956 | + | plastid | |||
| 339670.Bamb_5573 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1680 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0798 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_4977 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_5981 | + | + | |||
| 339670.Bamb_2638 | (PF00126) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_6528 | (PF08546) (PF02558) | ||||
| 339670.Bamb_0858 | + | plastid | |||
| 339670.Bamb_3589 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4912 | (PF13609) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0065 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_6059 | + | (PF00126) | |||
| 339670.Bamb_3625 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4933 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_5086 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4427 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1551 | (+) | (mitochondrial); plastid | |||
| 339670.Bamb_2393 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_4643 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0710 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_3996 | (PF00126) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_2587 | (PF08546) (PF02558) | ||||
| 339670.Bamb_2215 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_3856 | + | + | |||
| 339670.Bamb_0196 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0433 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6033 | (+) | mitochondrial; plastid | |||
| 339670.Bamb_0526 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_5821 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4837 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_5802 | (PF01165) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4294 | (+) | ER | |||
| 339670.Bamb_3339 | (PF00126) | plastid | |||
| 339670.Bamb_4812 | + | (>) | |||
| 339670.Bamb_3681 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4971 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4485 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0670 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4170 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0615 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4708 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1614 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0096 | (<) | + | |||
| 339670.Bamb_4397 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0156 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_3186 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5624 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_6168 | + | + | |||
| 339670.Bamb_3783 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2465 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_4032 | + | (PF00126) | |||
| 339670.Bamb_5783 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0157 | (PF01165) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0273 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0487 | (>) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0072 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2361 | (PF10282) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5740 | (+) | mitochondrial; plastid | |||
| 339670.Bamb_4295 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1887 | + | plastid | |||
| 339670.Bamb_2411 | + | plastid | |||
| 339670.Bamb_3631 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3052 | (PF13609) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_5281 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6067 | (+) | mitochondrial; (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0398 | (+) | (mitochondrial); (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1115 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0769 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4647 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6003 | + | + | |||
| 339670.Bamb_3677 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0373 | + | (>) | |||
| 339670.Bamb_0376 | + | (>) | |||
| 339670.Bamb_0519 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2055 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3651 | (+) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_0680 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1819 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2894 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2938 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_6511 | + | + | |||
| 339670.Bamb_5360 | + | (PF00126) | |||
| 339670.Bamb_5174 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4775 | + | plastid | |||
| 339670.Bamb_6421 | (PF08546) (PF02558) | ||||
| 339670.Bamb_3178 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_3778 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_1852 | (>) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_5415 | + | PF07938 | |||
| 339670.Bamb_1416 | + | + | |||
| 339670.Bamb_2551 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_4738 | (PF00126) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_6469 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2129 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1014 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_2711 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6480 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3199 | (PF00126) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2427 | + | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_1915 | (PF08546) (PF02558) | ||||
| 339670.Bamb_4691 | + | (ER) | |||
| 339670.Bamb_4201 | + | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_5008 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6111 | (PF00126) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_6114 | (+) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5948 | (+) | ER | |||
| 339670.Bamb_5947 | + | (PF07080) | |||
| 339670.Bamb_5498 | (PF04444) | ||||
| 339670.Bamb_1493 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_6561 | + | ||||
| 339670.Bamb_0813 | (PF13518) | ||||
| 339670.Bamb_2671 | + | ||||
| 339670.Bamb_2675 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_1064 | + | ||||
| 339670.Bamb_3232 | (+) | (PF02566) | |||
| 339670.Bamb_5793 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_6170 | + | ||||
| 339670.Bamb_1686 | + | ||||
| 339670.Bamb_1687 | + | ||||
| 339670.Bamb_2082 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2339 | + | ||||
| 339670.Bamb_4560 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5966 | (+) | + | |||
| 339670.Bamb_2532 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2531 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5216 | (PF04444) | ||||
| 339670.Bamb_6546 | (PF13816) | ||||
| 339670.Bamb_2658 | + | ||||
| 339670.Bamb_0497 | + | ||||
| 339670.Bamb_5702 | + | ||||
| 339670.Bamb_4979 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4975 | (PF07080) | ||||
| 339670.Bamb_5778 | + | ||||
| 339670.Bamb_5774 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5510 | + | ||||
| 339670.Bamb_6158 | + | ||||
| 339670.Bamb_6156 | + | ||||
| 339670.Bamb_0003 | + | ||||
| 339670.Bamb_0007 | + | ||||
| 339670.Bamb_3001 | + | ||||
| 339670.Bamb_0037 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_2510 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5235 | + | ||||
| 339670.Bamb_2632 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6527 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1729 | + | ||||
| 339670.Bamb_3582 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4009 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4004 | + | ||||
| 339670.Bamb_4919 | + | ||||
| 339670.Bamb_4917 | + | ||||
| 339670.Bamb_4914 | + | ||||
| 339670.Bamb_4225 | + | ||||
| 339670.Bamb_1880 | + | ||||
| 339670.Bamb_3022 | + | ||||
| 339670.Bamb_3020 | + | ||||
| 339670.Bamb_1083 | + | ||||
| 339670.Bamb_2613 | (<) | ||||
| 339670.Bamb_2615 | + | ||||
| 339670.Bamb_3621 | + | ||||
| 339670.Bamb_3622 | + | ||||
| 339670.Bamb_1702 | + | ||||
| 339670.Bamb_3568 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_5885 | + | ||||
| 339670.Bamb_5085 | + | ||||
| 339670.Bamb_1141 | + | ||||
| 339670.Bamb_3812 | + | ||||
| 339670.Bamb_4639 | + | ||||
| 339670.Bamb_4632 | + | ||||
| 339670.Bamb_4631 | + | ||||
| 339670.Bamb_3049 | + | ||||
| 339670.Bamb_6079 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0898 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0891 | + | ||||
| 339670.Bamb_3546 | (+) | + | |||
| 339670.Bamb_3549 | + | ||||
| 339670.Bamb_6386 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1767 | + | ||||
| 339670.Bamb_4640 | (PF09286) | ||||
| 339670.Bamb_0565 | + | ||||
| 339670.Bamb_0562 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0563 | + | ||||
| 339670.Bamb_5211 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3833 | (PF13518) | ||||
| 339670.Bamb_1573 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_2000 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2004 | + | ||||
| 339670.Bamb_0715 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4651 | + | ||||
| 339670.Bamb_3066 | (+) | + | |||
| 339670.Bamb_3067 | + | ||||
| 339670.Bamb_3065 | + | ||||
| 339670.Bamb_3068 | + | ||||
| 339670.Bamb_0025 | + | ||||
| 339670.Bamb_2820 | + | ||||
| 339670.Bamb_6017 | + | ||||
| 339670.Bamb_6010 | + | ||||
| 339670.Bamb_1290 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3665 | + | ||||
| 339670.Bamb_4923 | + | ||||
| 339670.Bamb_2853 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0368 | (+) | + | |||
| 339670.Bamb_5847 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5845 | + | ||||
| 339670.Bamb_5594 | + | ||||
| 339670.Bamb_5596 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_5599 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_2454 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6223 | + | ||||
| 339670.Bamb_0774 | + | ||||
| 339670.Bamb_0773 | + | ||||
| 339670.Bamb_0772 | + | ||||
| 339670.Bamb_4673 | + | ||||
| 339670.Bamb_0193 | + | ||||
| 339670.Bamb_2844 | + | ||||
| 339670.Bamb_6038 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6036 | + | ||||
| 339670.Bamb_3505 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3503 | (PF00375) | ||||
| 339670.Bamb_0690 | + | ||||
| 339670.Bamb_0117 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_5829 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4199 | + | ||||
| 339670.Bamb_3875 | (PF04185) | ||||
| 339670.Bamb_2048 | + | ||||
| 339670.Bamb_6206 | (PF13518) | ||||
| 339670.Bamb_5641 | + | ||||
| 339670.Bamb_3310 | + | ||||
| 339670.Bamb_6091 | + | ||||
| 339670.Bamb_5128 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5391 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6412 | + | ||||
| 339670.Bamb_0327 | + | ||||
| 339670.Bamb_3127 | + | ||||
| 339670.Bamb_5807 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4315 | + | ||||
| 339670.Bamb_1444 | + | ||||
| 339670.Bamb_1445 | (PF13518) | ||||
| 339670.Bamb_1132 | + | ||||
| 339670.Bamb_1134 | + | ||||
| 339670.Bamb_3336 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_3333 | (PF04444) | ||||
| 339670.Bamb_4810 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1867 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_4815 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1398 | (PF15984) | ||||
| 339670.Bamb_4766 | + | ||||
| 339670.Bamb_3938 | + | ||||
| 339670.Bamb_1270 | + | ||||
| 339670.Bamb_3684 | + | ||||
| 339670.Bamb_3682 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1135 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0903 | + | ||||
| 339670.Bamb_6434 | (+) | (PF00126) | |||
| 339670.Bamb_0659 | + | ||||
| 339670.Bamb_0300 | + | ||||
| 339670.Bamb_4159 | (PF13609) | ||||
| 339670.Bamb_3100 | + | ||||
| 339670.Bamb_4379 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4372 | + | ||||
| 339670.Bamb_4371 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4370 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_4487 | + | ||||
| 339670.Bamb_5356 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3740 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3744 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_0602 | + | ||||
| 339670.Bamb_5168 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5162 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6031 | + | ||||
| 339670.Bamb_4749 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1215 | + | ||||
| 339670.Bamb_0922 | + | ||||
| 339670.Bamb_2745 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6453 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_4175 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4176 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0580 | + | ||||
| 339670.Bamb_3161 | + | ||||
| 339670.Bamb_1188 | (PF12158) | ||||
| 339670.Bamb_2983 | + | ||||
| 339670.Bamb_2981 | + | ||||
| 339670.Bamb_4250 | + | ||||
| 339670.Bamb_4251 | + | ||||
| 339670.Bamb_3378 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0341 | + | ||||
| 339670.Bamb_2179 | + | ||||
| 339670.Bamb_6089 | + | ||||
| 339670.Bamb_4725 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3970 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1230 | + | ||||
| 339670.Bamb_4841 | + | ||||
| 339670.Bamb_6471 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_6474 | + | ||||
| 339670.Bamb_6475 | + | ||||
| 339670.Bamb_3494 | + | ||||
| 339670.Bamb_4662 | + | ||||
| 339670.Bamb_1397 | (+) | (PF15984) | |||
| 339670.Bamb_1124 | + | ||||
| 339670.Bamb_4331 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0423 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2703 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6498 | (PF13609) | ||||
| 339670.Bamb_1613 | (PF14588) | ||||
| 339670.Bamb_1612 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_1617 | PF12588 | ||||
| 339670.Bamb_4139 | + | ||||
| 339670.Bamb_1942 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2947 | + | ||||
| 339670.Bamb_2940 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5913 | + | ||||
| 339670.Bamb_3725 | + | ||||
| 339670.Bamb_3726 | + | ||||
| 339670.Bamb_3722 | (+) | plastid | |||
| 339670.Bamb_5316 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2475 | + | ||||
| 339670.Bamb_1618 | + | ||||
| 339670.Bamb_0155 | + | ||||
| 339670.Bamb_0154 | + | ||||
| 339670.Bamb_3263 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3269 | (+) | (PF13609) | |||
| 339670.Bamb_2721 | + | ||||
| 339670.Bamb_0983 | + | ||||
| 339670.Bamb_1634 | + | ||||
| 339670.Bamb_3459 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3457 | + | ||||
| 339670.Bamb_3185 | + | ||||
| 339670.Bamb_0213 | + | ||||
| 339670.Bamb_1037 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1355 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2513 | + | ||||
| 339670.Bamb_2113 | + | ||||
| 339670.Bamb_2119 | + | ||||
| 339670.Bamb_0179 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_5443 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_5031 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6101 | + | ||||
| 339670.Bamb_3888 | + | ||||
| 339670.Bamb_3474 | + | ||||
| 339670.Bamb_1657 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1656 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5626 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5627 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5482 | + | ||||
| 339670.Bamb_4680 | + | ||||
| 339670.Bamb_4684 | + | ||||
| 339670.Bamb_1332 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5667 | + | ||||
| 339670.Bamb_1483 | + | ||||
| 339670.Bamb_4440 | + | ||||
| 339670.Bamb_0823 | + | ||||
| 339670.Bamb_0822 | + | ||||
| 339670.Bamb_2682 | + | ||||
| 339670.Bamb_2688 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_6378 | + | ||||
| 339670.Bamb_6371 | + | ||||
| 339670.Bamb_4058 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3225 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3222 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5015 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6164 | + | ||||
| 339670.Bamb_3417 | + | ||||
| 339670.Bamb_3415 | + | ||||
| 339670.Bamb_3413 | + | ||||
| 339670.Bamb_1674 | + | ||||
| 339670.Bamb_0784 | + | ||||
| 339670.Bamb_0033 | + | ||||
| 339670.Bamb_0036 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1313 | (+) | (PF00126) | |||
| 339670.Bamb_2469 | + | ||||
| 339670.Bamb_2525 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3204 | + | ||||
| 339670.Bamb_4966 | + | ||||
| 339670.Bamb_4967 | + | ||||
| 339670.Bamb_5786 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5781 | + | ||||
| 339670.Bamb_5789 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_0406 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_5567 | + | ||||
| 339670.Bamb_6144 | (<) | ||||
| 339670.Bamb_3434 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3437 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1931 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_5996 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5229 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_6082 | (+) | mitochondrial | |||
| 339670.Bamb_6559 | + | ||||
| 339670.Bamb_0861 | + | ||||
| 339670.Bamb_6337 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6336 | + | ||||
| 339670.Bamb_2563 | (PF13518) | ||||
| 339670.Bamb_1730 | + | ||||
| 339670.Bamb_1737 | + | ||||
| 339670.Bamb_3597 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0483 | + | ||||
| 339670.Bamb_4904 | + | ||||
| 339670.Bamb_4905 | + | ||||
| 339670.Bamb_5457 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2484 | + | ||||
| 339670.Bamb_5451 | + | ||||
| 339670.Bamb_5509 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_5500 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1501 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1505 | + | ||||
| 339670.Bamb_4461 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3014 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4594 | + | ||||
| 339670.Bamb_1029 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5245 | + | not used | |||
| 339670.Bamb_5241 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2625 | + | ||||
| 339670.Bamb_2198 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2193 | + | ||||
| 339670.Bamb_1716 | + | ||||
| 339670.Bamb_1717 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1710 | (PF13924) | ||||
| 339670.Bamb_3579 | + | ||||
| 339670.Bamb_3573 | + | ||||
| 339670.Bamb_4927 | (+) | (PF02566) | |||
| 339670.Bamb_5525 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_5522 | + | ||||
| 339670.Bamb_4438 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1159 | + | ||||
| 339670.Bamb_3806 | + | ||||
| 339670.Bamb_6271 | + | ||||
| 339670.Bamb_6272 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6279 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0721 | + | ||||
| 339670.Bamb_0051 | + | ||||
| 339670.Bamb_2388 | (PF14588) | ||||
| 339670.Bamb_2385 | (<) | ||||
| 339670.Bamb_2387 | + | ||||
| 339670.Bamb_3037 | + | ||||
| 339670.Bamb_4920 | + | ||||
| 339670.Bamb_2603 | + | ||||
| 339670.Bamb_6512 | + | ||||
| 339670.Bamb_1778 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0552 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_0555 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_5890 | (+) | + | |||
| 339670.Bamb_5892 | + | ||||
| 339670.Bamb_5728 | + | ||||
| 339670.Bamb_5095 | + | ||||
| 339670.Bamb_5091 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_4417 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6252 | (PF00375) | ||||
| 339670.Bamb_6253 | + | ||||
| 339670.Bamb_6251 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0706 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4620 | + | ||||
| 339670.Bamb_4623 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3059 | + | ||||
| 339670.Bamb_3057 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2838 | + | ||||
| 339670.Bamb_0881 | + | ||||
| 339670.Bamb_5602 | PF12588 | ||||
| 339670.Bamb_0887 | + | ||||
| 339670.Bamb_0888 | + | ||||
| 339670.Bamb_1289 | + | ||||
| 339670.Bamb_3530 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6393 | + | ||||
| 339670.Bamb_1750 | + | ||||
| 339670.Bamb_3284 | + | ||||
| 339670.Bamb_2221 | (PF10282) | ||||
| 339670.Bamb_6053 | + | ||||
| 339670.Bamb_2224 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0571 | (+) | (PF02566) | |||
| 339670.Bamb_3846 | (PF16013) | ||||
| 339670.Bamb_3843 | + | ||||
| 339670.Bamb_1563 | + | ||||
| 339670.Bamb_4864 | + | ||||
| 339670.Bamb_3072 | + | ||||
| 339670.Bamb_1866 | + | ||||
| 339670.Bamb_0180 | (<) | ||||
| 339670.Bamb_5118 | + | ||||
| 339670.Bamb_2854 | + | ||||
| 339670.Bamb_3980 | + | ||||
| 339670.Bamb_4363 | + | ||||
| 339670.Bamb_3679 | (+) | plastid | |||
| 339670.Bamb_3518 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3516 | (+) | + | |||
| 339670.Bamb_0372 | + | ||||
| 339670.Bamb_0377 | + | ||||
| 339670.Bamb_5855 | + | ||||
| 339670.Bamb_5588 | + | ||||
| 339670.Bamb_2053 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_6210 | + | ||||
| 339670.Bamb_4663 | + | ||||
| 339670.Bamb_3099 | + | ||||
| 339670.Bamb_3098 | + | ||||
| 339670.Bamb_5135 | + | ||||
| 339670.Bamb_2404 | + | ||||
| 339670.Bamb_2403 | + | ||||
| 339670.Bamb_1243 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2263 | + | ||||
| 339670.Bamb_0530 | + | ||||
| 339670.Bamb_0538 | + | ||||
| 339670.Bamb_3139 | + | ||||
| 339670.Bamb_4301 | (PF13609) | ||||
| 339670.Bamb_4309 | + | ||||
| 339670.Bamb_5304 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1144 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3301 | (PF09286) | ||||
| 339670.Bamb_3306 | (<) | ||||
| 339670.Bamb_2543 | + | ||||
| 339670.Bamb_2817 | + | ||||
| 339670.Bamb_1814 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2898 | + | ||||
| 339670.Bamb_5612 | + | ||||
| 339670.Bamb_1267 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_0301 | + | ||||
| 339670.Bamb_0306 | + | ||||
| 339670.Bamb_6405 | + | ||||
| 339670.Bamb_2247 | + | ||||
| 339670.Bamb_2240 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2243 | + | ||||
| 339670.Bamb_5810 | + | ||||
| 339670.Bamb_5812 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4366 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_2402 | + | ||||
| 339670.Bamb_1877 | + | ||||
| 339670.Bamb_1873 | + | ||||
| 339670.Bamb_1008 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_4779 | + | ||||
| 339670.Bamb_3692 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_3695 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0916 | + | ||||
| 339670.Bamb_6428 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6424 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6426 | (PF14588) | ||||
| 339670.Bamb_1994 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1193 | + | ||||
| 339670.Bamb_5693 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5439 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2163 | (+) | (>) | |||
| 339670.Bamb_0108 | + | ||||
| 339670.Bamb_0109 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0106 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1220 | + | ||||
| 339670.Bamb_6198 | + | ||||
| 339670.Bamb_0934 | + | ||||
| 339670.Bamb_2284 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_6443 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_3488 | + | ||||
| 339670.Bamb_3487 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_0597 | + | ||||
| 339670.Bamb_0594 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3158 | + | ||||
| 339670.Bamb_2994 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5416 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1832 | + | ||||
| 339670.Bamb_2144 | + | ||||
| 339670.Bamb_0121 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4735 | (+) | plastid | |||
| 339670.Bamb_4734 | + | ||||
| 339670.Bamb_4731 | + | ||||
| 339670.Bamb_3965 | + | ||||
| 339670.Bamb_3964 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3962 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2900 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_3969 | (+) | + | |||
| 339670.Bamb_0313 | + | ||||
| 339670.Bamb_6467 | + | ||||
| 339670.Bamb_1603 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1608 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_0608 | + | ||||
| 339670.Bamb_5955 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_4122 | + | ||||
| 339670.Bamb_5951 | (PF07080) | ||||
| 339670.Bamb_5381 | (PF04185) | ||||
| 339670.Bamb_5389 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5003 | (<) | ||||
| 339670.Bamb_5004 | + | ||||
| 339670.Bamb_1388 | + | ||||
| 339670.Bamb_2126 | + | ||||
| 339670.Bamb_0410 | + | ||||
| 339670.Bamb_5045 | + | ||||
| 339670.Bamb_4344 | + | ||||
| 339670.Bamb_2713 | (PF13518) | ||||
| 339670.Bamb_2712 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_2718 | (+) | (mitochondrial) | |||
| 339670.Bamb_0976 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_0972 | + | ||||
| 339670.Bamb_3444 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1978 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_1979 | + | ||||
| 339670.Bamb_3198 | (PF04185) | ||||
| 339670.Bamb_3190 | (PF12158) | ||||
| 339670.Bamb_0084 | + | ||||
| 339670.Bamb_5677 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_4503 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_1364 | + | ||||
| 339670.Bamb_6341 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_6347 | (>) | ||||
| 339670.Bamb_0167 | + | ||||
| 339670.Bamb_5710 | (<) | ||||
| 339670.Bamb_3273 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_3272 | (PF09286) | ||||
| 339670.Bamb_3276 | + | ||||
| 339670.Bamb_5866 | + | ||||
| 339670.Bamb_4263 | + | ||||
| 339670.Bamb_4262 | + | ||||
| 339670.Bamb_4265 | + | ||||
| 339670.Bamb_5025 | (PF14588) | ||||
| 339670.Bamb_2739 | + | not used | |||
| 339670.Bamb_0997 | + | ||||
| 339670.Bamb_2939 | + | ||||
| 339670.Bamb_4690 | + | ||||
| 339670.Bamb_4696 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_4527 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1340 | + | ||||
| 339670.Bamb_1345 | (+) | (ER) | |||
| 339670.Bamb_5733 | (PF02566) | ||||
| 339670.Bamb_6585 | (PF04444) | ||||
| 339670.Bamb_4065 | + | ||||
| 339670.Bamb_3251 | + | ||||
| 339670.Bamb_3254 | (PF01165) | ||||
| 339670.Bamb_5007 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5556 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_1130 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_3409 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_1934 | + | ||||
| 339670.Bamb_1935 | (+) | (plastid) | |||
| 339670.Bamb_0229 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5635 | + | ||||
| 339670.Bamb_5637 | + | ||||
| 339670.Bamb_5943 | (PF00126) | ||||
| 339670.Bamb_5491 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4547 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3795 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1284 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1492 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1060 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1061 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3162 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3238 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4953 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4224 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4959 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5799 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5572 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5579 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6175 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2080 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2086 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2338 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0246 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1041 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5965 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1306 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1301 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6544 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0498 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0499 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3211 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3213 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6154 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1512 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0001 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0262 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4583 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5985 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2635 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2630 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2633 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6522 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0855 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5297 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4916 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5757 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5752 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1536 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1530 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0069 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2373 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3024 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1081 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6058 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6055 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1709 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0443 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6262 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0737 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0734 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2521 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3044 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3042 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2809 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6078 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0895 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3542 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6387 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0387 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2237 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0566 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0567 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0712 | + | ||||
| 339670.Bamb_3061 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4462 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3993 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3524 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1748 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0360 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4844 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1107 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6227 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3083 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0434 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3501 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0527 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5824 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3878 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5310 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2471 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1461 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1469 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3316 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6094 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5124 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6410 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5808 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3129 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2064 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2062 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5147 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5144 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2888 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4769 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1273 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0901 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0650 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1807 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4153 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3109 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3108 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4481 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5680 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2443 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2442 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3749 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3748 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1427 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1421 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1846 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1059 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5167 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1216 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1211 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0923 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0921 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2985 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3767 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3379 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1073 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2175 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0118 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4728 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3979 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1239 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1238 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0943 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2766 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6472 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6473 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0616 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0612 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3146 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3143 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3149 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1393 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2156 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0132 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3951 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5076 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5078 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2871 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2702 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2875 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4135 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1175 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0091 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5665 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4391 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2494 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5445 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3720 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3729 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5313 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2130 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0158 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4890 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4895 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1943 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2726 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0988 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1589 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1962 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5608 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5931 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1356 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2942 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4078 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4079 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3248 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5917 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6108 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1651 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2303 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2308 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5483 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2689 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4233 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2099 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0785 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0254 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1311 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2468 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5200 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2666 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3202 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4787 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5563 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5566 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2348 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1056 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4572 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5994 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5225 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5221 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2642 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6331 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1731 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1734 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1738 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1739 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4013 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4010 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0481 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2487 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1504 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2366 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4506 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4593 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2627 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1712 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3578 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5748 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5528 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3033 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5263 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2410 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2607 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3638 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1775 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5098 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5093 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3825 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1546 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2018 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2011 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0708 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0702 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4627 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5282 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3619 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3615 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1758 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3287 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0395 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0392 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0579 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0570 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0577 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0576 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3840 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1561 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6235 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2486 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4645 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4644 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4811 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2589 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0055 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4987 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4989 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5859 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5582 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2448 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6212 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6211 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4660 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3121 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2876 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6026 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1797 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0683 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0681 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2261 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0536 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0532 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4307 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5301 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2079 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2070 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1472 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1470 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1477 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4821 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4820 | (+) | not used | |||
| 339670.Bamb_2896 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2937 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0303 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0652 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2791 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6408 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0339 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2242 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1456 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1004 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4802 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4808 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0910 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0644 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0043 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1999 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3775 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3347 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0833 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6361 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1228 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1224 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0935 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4104 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4107 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4103 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4108 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3150 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3156 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3159 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2995 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2991 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3710 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6290 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1417 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3365 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1178 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4737 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2901 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4123 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5952 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4387 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2978 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2976 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5478 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3736 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3739 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1386 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1018 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1012 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4715 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4714 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4244 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4718 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3949 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1593 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1595 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0624 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3443 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5673 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5345 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2422 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4886 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4086 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5863 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2736 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6135 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_0994 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1641 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3467 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5929 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1341 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_1163 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2695 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4063 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_5674 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3891 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3894 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_6115 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3407 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_3408 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_2318 | (+) | ||||
| 339670.Bamb_4712 | (+) |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveT3 predictions using new standard model 2.0.1 (PROTEINS.NEW.EFFECTIVET3)
- EffectiveT3 predictions using old standard model 1.0.1 (PROTEINS.OLD.EFFECTIVET3)
- EffectiveCCBD predictions (PROTEINS.CHAPERONES.TXT)
- T4SEpre bpbAac predictions (T4SEpre_bpbAac_FinalResult.csv)
- T4SEpre psAac predictions (T4SEpre_psAac_FinalResult.csv)
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)
Genome based results
Summary
- Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
- Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
Estimated copy number = 2.3 (23/10 KEGG proteins)
- Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
Estimated copy number = 0.6 (6/10 KEGG proteins)
- Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
Estimated copy number = 2.25 (18/8 KEGG proteins)
Individual results for each secretion system
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type III secretion system (T3_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type IV secretion system (T4_top100_COGS.xls)
- List of 100 most important COGs/NOGs for prediction of functional Type VI secretion system (T6_top100_COGS.xls)
- List of COGs assigned to Type III secretion system in KEGG (T3SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type IV secretion system in KEGG (T4SS_KEGG_cmp.xls)
- List of COGs assigned to Type VI secretion system in KEGG (T6SS_KEGG_cmp.xls)
Parameters:
==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================
Estimated copy number = 2.3 (23/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 0.6 (6/10 KEGG proteins)
Estimated copy number = 2.25 (18/8 KEGG proteins)
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