Effective results for Acetonema longum DSM 6540 (eggnog40)
Summary
Number of putative secreted proteins: 168
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 40 eukaryotic-like domains, contained in 168 proteins (32 high, 136 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None
Protein based results
Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)
Protein | EffectiveT3 | EffectiveCCBD | T4SEpre | EffectiveELD | Predotar |
---|---|---|---|---|---|
1009370.ALO_16087 | (PF01558) (PF01855) (PF10371) PF17147 (PF12838) | ||||
1009370.ALO_10714 | (PF01558) (PF01855) (PF10371) PF17147 | ||||
1009370.ALO_13424 | (PF01558) (PF01855) (PF10371) PF17147 | ||||
1009370.ALO_19132 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_18350 | (PF06725) | ER | |||
1009370.ALO_07908 | (PF02906) (PF12838) (PF02256) | ||||
1009370.ALO_13464 | (PF00163) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_11224 | (PF03600) | mitochondrial | |||
1009370.ALO_11824 | (PF13246) | mitochondrial | |||
1009370.ALO_15022 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_03476 | (PF00163) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_05238 | (PF13857) | ER | |||
1009370.ALO_03249 | (PF06725) | ER | |||
1009370.ALO_16127 | (PF00939) | ER | |||
1009370.ALO_05775 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_09399 | (PF00939) | ER | |||
1009370.ALO_12154 | (PF07670) | (ER); ER | |||
1009370.ALO_16672 | (PF12838) | ER | |||
1009370.ALO_03631 | PF13332 | (ER) | |||
1009370.ALO_02831 | (PF03483) | (mitochondrial); (plastid) | |||
1009370.ALO_03836 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_16057 | (PF00939) | ER | |||
1009370.ALO_13519 | (PF00939) | (ER) | |||
1009370.ALO_12231 | (PF00939) | ER | |||
1009370.ALO_15427 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_10329 | (PF06725) | ER | |||
1009370.ALO_14007 | (PF06925) | ER; (ER) | |||
1009370.ALO_01554 | (PF13237) | ER | |||
1009370.ALO_19612 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_00255 | (PF12838) | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_06045 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_17111 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_16712 | PF13332 | mitochondrial; (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_04031 | PF13332 | (ER); ER | |||
1009370.ALO_01579 | (PF13857) | (ER) | |||
1009370.ALO_01205 | (PF06925) | mitochondrial; ER | |||
1009370.ALO_01749 | (PF00809) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_12736 | (PF06725) | ER | |||
1009370.ALO_16412 | (PF03600) | ER | |||
1009370.ALO_10249 | (PF06725) | ER | |||
1009370.ALO_13409 | (PF01558) (PF01855) PF17147 | ||||
1009370.ALO_03936 | (PF02906) (PF12838) (PF02256) | ||||
1009370.ALO_19737 | PF17147 (PF01855) | ||||
1009370.ALO_02451 | (PF01558) | (ER) | |||
1009370.ALO_14262 | (PF13237) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_08370 | (PF12838) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_17201 | PF00349 PF03727 | ||||
1009370.ALO_02461 | PF17147 (PF01855) | ||||
1009370.ALO_05558 | PF13332 | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_10094 | (PF09861) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_17251 | PF17147 (PF01855) | ||||
1009370.ALO_02801 | (PF02421) (PF07670) | ||||
1009370.ALO_20902 | (PF02421) (PF07670) | ||||
1009370.ALO_12149 | (PF07670) | (ER) | |||
1009370.ALO_21766 | (PF13291) | (ER) | |||
1009370.ALO_06448 | (PF14413) (PF04446) | ||||
1009370.ALO_03166 | (PF01558) | (plastid) | |||
1009370.ALO_00685 | (PF02971) (PF07837) | ||||
1009370.ALO_19427 | PF17147 (PF01855) | ||||
1009370.ALO_17116 | (PF03600) | (ER) | |||
1009370.ALO_07798 | PF17147 (PF01855) | ||||
1009370.ALO_21671 | (PF12838) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_21676 | PF17147 (PF01855) | ||||
1009370.ALO_06333 | (PF02906) (PF02256) | ||||
1009370.ALO_16602 | (PF02421) (PF07670) | ||||
1009370.ALO_04903 | PF00349 PF03727 | ||||
1009370.ALO_13139 | PF17147 (PF01855) | ||||
1009370.ALO_13134 | (PF12838) | (mitochondrial) | |||
1009370.ALO_13509 | (PF06968) | ||||
1009370.ALO_15487 | PF13332 | ||||
1009370.ALO_15482 | PF13332 | ||||
1009370.ALO_15137 | (PF00809) | ||||
1009370.ALO_04453 | (PF07670) | ||||
1009370.ALO_04458 | (PF02421) | ||||
1009370.ALO_09369 | (PF00809) | ||||
1009370.ALO_11729 | (PF09861) | ||||
1009370.ALO_11764 | (PF05683) | ||||
1009370.ALO_06298 | (PF06777) | ||||
1009370.ALO_06160 | (PF06968) | ||||
1009370.ALO_19742 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_17980 | (PF03483) | ||||
1009370.ALO_15452 | (PF03063) | ||||
1009370.ALO_20267 | PF13332 | ||||
1009370.ALO_01524 | (PF14512) | ||||
1009370.ALO_06378 | (PF03063) | ||||
1009370.ALO_07808 | (PF01558) | ||||
1009370.ALO_07393 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_19237 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_11214 | (PF02906) | ||||
1009370.ALO_07813 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_15472 | PF13332 | ||||
1009370.ALO_02466 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_14477 | (PF14512) | ||||
1009370.ALO_13992 | (PF00809) | ||||
1009370.ALO_03736 | (PF03169) | ||||
1009370.ALO_05950 | (PF06725) | ||||
1009370.ALO_11759 | (PF05681) | ||||
1009370.ALO_17751 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_06155 | (PF06968) | ||||
1009370.ALO_07738 | (PF02403) | not used | |||
1009370.ALO_12925 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_16467 | (PF03169) | ||||
1009370.ALO_15467 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_09709 | (PF13291) | ||||
1009370.ALO_13942 | (PF13597) | ||||
1009370.ALO_18225 | (PF03483) | ||||
1009370.ALO_05765 | (PF09861) | ||||
1009370.ALO_10144 | (PF13857) | ||||
1009370.ALO_01449 | (PF05683) | ||||
1009370.ALO_17256 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_16781 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_14412 | (PF13597) | ||||
1009370.ALO_12975 | (PF05683) | ||||
1009370.ALO_01454 | (PF05681) | ||||
1009370.ALO_21414 | (PF02906) | ||||
1009370.ALO_13149 | (PF01558) | ||||
1009370.ALO_17241 | (PF01558) | ||||
1009370.ALO_15242 | (PF00809) | ||||
1009370.ALO_02836 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_20597 | (PF01969) | ||||
1009370.ALO_04503 | (PF06725) | ||||
1009370.ALO_09079 | (PF06925) | ||||
1009370.ALO_06723 | (PF03169) | ||||
1009370.ALO_21424 | (PF02906) | ||||
1009370.ALO_21224 | (PF06968) | ||||
1009370.ALO_06933 | (PF03483) | ||||
1009370.ALO_05645 | (PF02906) | ||||
1009370.ALO_20142 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_21896 | (PF13291) | ||||
1009370.ALO_09589 | (PF09861) | ||||
1009370.ALO_04833 | (PF07670) | ||||
1009370.ALO_04838 | (PF07670) | ||||
1009370.ALO_12980 | (PF05681) | ||||
1009370.ALO_00330 | (PF05681) | ||||
1009370.ALO_00335 | (PF05683) | ||||
1009370.ALO_19437 | (PF01558) | ||||
1009370.ALO_16856 | (PF13246) | ||||
1009370.ALO_17071 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_07873 | (PF02906) | ||||
1009370.ALO_06683 | (PF16760) | ||||
1009370.ALO_05790 | (PF06968) | ||||
1009370.ALO_05488 | (PF13291) | ||||
1009370.ALO_13434 | (PF07670) | ||||
1009370.ALO_16717 | PF13332 | ||||
1009370.ALO_15377 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_03146 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_21686 | (PF01558) | ||||
1009370.ALO_18100 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_06323 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_13429 | (PF07670) | ||||
1009370.ALO_05153 | (PF02403) | ||||
1009370.ALO_08330 | (PF01969) | ||||
1009370.ALO_19442 | (PF02933) | ||||
1009370.ALO_17136 | (PF03063) | ||||
1009370.ALO_06338 | (PF13237) | ||||
1009370.ALO_01414 | (PF03063) | ||||
1009370.ALO_08305 | PF13332 | not used | |||
1009370.ALO_08233 | (PF13237) | ||||
1009370.ALO_10654 | (PF05681) | ||||
1009370.ALO_10659 | (PF05683) | ||||
1009370.ALO_01424 | (PF12838) | ||||
1009370.ALO_06348 | (PF00809) | ||||
1009370.ALO_19727 | (PF01558) | ||||
1009370.ALO_17965 | (PF03483) | ||||
1009370.ALO_15017 | (PF09861) | ||||
1009370.ALO_03931 | (PF13237) | ||||
1009370.ALO_12281 | (PF13597) | ||||
1009370.ALO_08310 | PF13332 | not used |
Detailed merged results for each protein sequence
- Detailed merged results as table (merge_results.html)
- Detailed merged results as tab delimited file (merge_results.csv)
Individual results for each protein sequence
- EffectiveELD predictions (PROTEINS.ELD.TXT)
- Predotar predictions using animal/human model (Predotar_output_modelANIMAL.TXT)
- Predotar predictions using plant model (Predotar_output_modelPLANT.TXT)