Metamenu

Genomes encoding eukaryotic-like proteins

PF12760 Transposase zinc-ribbon domain

Copy number in non-pathogens:
Mean=0.14 Stddev=0.64

Genomes significantly enriched in this eukaryotic-like domain (ELD; score >= 4):

Genome Class* ELD score Number of proteins containing this domain
Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 s 76 49
Haemophilus parasuis 29755 s 6 4
Xanthomonas massiliensis s 4 3
Paenibacillus phocaensis s 13 9
Xanthomonas translucens pv. translucens DSM 18974 s 4 3
Ruminococcus albus 7 = DSM 20455 s 13 9
Pasteurella bettyae CCUG 2042 s 7 5
Prevotella nigrescens CC14M s 6 4
Rodentibacter pneumotropicus DSM 21403 s 4 3
Bradyrhizobium elkanii USDA 3259 s 4 3
Mesorhizobium erdmanii USDA 3471 s 7 5
Cohnella thermotolerans DSM 17683 s 6 4
Bradyrhizobium elkanii USDA 3254 s 4 3
Clostridiales bacterium NK3B98 s 4 3
Paenibacillus sp. oral taxon 786 str. D14 s 6 4
Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum str. GSPB1386 s 4 3
Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 12 str. 1096 p 4 3
Xanthomonas citri pv. malvacearum X18 s 4 3
Xanthomonas citri pv. malvacearum X20 s 6 4
Xanthomonas cassavae CFBP 4642 s 15 10
Xanthomonas citri pv. glycines CFBP 7119 s 6 4
Haemophilus parasuis D74 s 6 4
Haemophilus parasuis 84-15995 s 6 4
Actinobacillus minor NM305 s 4 3
Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii str. ICPB 11122 s 6 4
Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii str. ICPB 10535 s 27 18
Ruminococcus albus AD2013 s 9 6
Haemophilus somnus 2336 s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A s 91 59
Tannerella forsythia 92A2 s 7 5
Haemophilus ducreyi 35000HP s 6 4
[Haemophilus] parasuis p 6 4
Endozoicomonas numazuensis s 10 7
Xanthomonas citri pv. glycines str. 8ra s 4 3
Haemophilus influenzae s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 7 5
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 7 5
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 7 5
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 4 3
Aeromonas veronii s 4 3
Faecalibaculum rodentium s 6 4
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 77 50
Pasteurellaceae bacterium NI1060 s 6 4
Aeromonas caviae s 4 3
Xanthomonas citri subsp. malvacearum s 4 3
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 83 54
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 65 42
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 82 53
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 85 55
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 65 42
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 65 42
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 72 47
Xanthomonas oryzae pv. oryzae s 62 40
Haemophilus parainfluenzae s 4 3
Xanthomonas citri subsp. malvacearum s 4 3
Xanthomonas citri pv. glycines str. 8ra s 6 4
Xanthomonas gardneri s 4 3
Faecalibaculum rodentium s 4 3
Paenibacillus apiarius s 6 4

*p=pathogen;s=symbiont