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Effective results for Eggerthella lenta DSM 2243 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 305
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 30 eukaryotic-like domains, contained in 305 proteins (91 high, 214 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
479437.Elen_0497(PF01568) (PF00384) PF04879(mitochondrial)
479437.Elen_0112(PF01568) (PF00384) PF04879mitochondrial
479437.Elen_0607(PF01568) (PF00384) PF04879(mitochondrial)
479437.Elen_3031(PF01568) (PF00384) PF04879mitochondrial
479437.Elen_0507(PF01568) (PF00384) PF04879mitochondrial
479437.Elen_0501(PF01568) (PF00384) PF04879mitochondrial
479437.Elen_2787(PF01568) (PF00384) PF04879(ER)
479437.Elen_0515(PF01568) (PF00384) PF04879mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_0511(PF01568) (PF00384) PF04879mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_1190(PF01568) (PF00384)(mitochondrial)
479437.Elen_1739(PF01568) (PF00384) PF04879(ER)
479437.Elen_0471(PF01568) (PF00384)(mitochondrial)
479437.Elen_2385(PF01568) (PF00384) PF04879(mitochondrial)
479437.Elen_0422(PF01568) (PF00384) PF04879(ER)
479437.Elen_0694(PF13187) (PF00037)ER
479437.Elen_1011(PF01568) (PF00384)(mitochondrial)
479437.Elen_0528PF00890(mitochondrial)
479437.Elen_0520(PF00196)(mitochondrial)
479437.Elen_0655(PF00174)ER
479437.Elen_0656(PF00174)ER
479437.Elen_1476(PF13787)ER
479437.Elen_1444(PF06541)ER
479437.Elen_2532(PF00196)ER
479437.Elen_0491(PF00037)ER
479437.Elen_0675(PF00196)ER
479437.Elen_0077(PF09394)ER
479437.Elen_0071PF00890(ER)
479437.Elen_0072(PF00196)ER
479437.Elen_2764(PF00037)mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_2763(PF00037)ER
479437.Elen_2768(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_0482(PF13187)ER; (ER)
479437.Elen_2962(PF13787)ER
479437.Elen_0116(PF00037)(mitochondrial)
479437.Elen_1738(PF00037)(ER)
479437.Elen_1881(PF02357)(mitochondrial); mitochondrial
479437.Elen_2779(PF00196)(mitochondrial)
479437.Elen_2778PF00890(mitochondrial)
479437.Elen_0619(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_0615(PF00196)ER
479437.Elen_0617(PF00196)mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_0611(PF00037)ER
479437.Elen_0298(PF00174)(mitochondrial)
479437.Elen_0299(PF00174)(ER)
479437.Elen_1091(PF00174)ER
479437.Elen_1092(PF00174)(ER); (mitochondrial)
479437.Elen_1949(PF02274)(mitochondrial)
479437.Elen_0462(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_2941(PF13415)ER; (ER)
479437.Elen_0606(PF00196)ER
479437.Elen_0133(PF00196)ER
479437.Elen_2374(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_3021PF00890mitochondrial
479437.Elen_1389(PF00196)ER
479437.Elen_1567(PF00196)ER
479437.Elen_0442(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_0445(PF00196)mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_0447(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_0157(PF00196)ER
479437.Elen_0154(PF00196)ER
479437.Elen_1775(PF02643)mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_2505(PF00037)(mitochondrial); (plastid)
479437.Elen_1592(PF00196)ER; (ER)
479437.Elen_2930PF00890(mitochondrial)
479437.Elen_0437PF00890(ER)
479437.Elen_0364(PF00196)ER
479437.Elen_0367PF00890mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_0368(PF00196)ER
479437.Elen_0163(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_1291(PF00196)ER
479437.Elen_1903(PF00196)ER
479437.Elen_1588(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_3051(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_0394(PF00174)ER
479437.Elen_0393(PF00174)ER
479437.Elen_0392(PF00196)(ER); (plastid)
479437.Elen_0171(PF00196)(mitochondrial); plastid
479437.Elen_0172PF00890mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_0086PF00890ER
479437.Elen_2824(PF00196)mitochondrial
479437.Elen_2827PF00890ER
479437.Elen_2919(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_3088(PF02361)ER
479437.Elen_0341(PF00196)(ER)
479437.Elen_0181(PF00196)ER
479437.Elen_0184(PF00196)(ER); ER
479437.Elen_0185(PF11070)ER
479437.Elen_2108(PF00196)(mitochondrial)
479437.Elen_2453(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_2699(PF00196)ER
479437.Elen_2858(PF00037)(mitochondrial)
479437.Elen_2859(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_0406(PF00196)(ER)
479437.Elen_0977PF00890mitochondrial; (mitochondrial)
479437.Elen_0976(PF00196)mitochondrial
479437.Elen_0971(PF00196)ER
479437.Elen_1006(PF01568) (PF00384) PF04879
479437.Elen_2114(PF00196)ER; (ER)
479437.Elen_1869(PF01568) (PF00384)(ER)
479437.Elen_1493(PF02361)(ER)
479437.Elen_1013(PF00174)ER
479437.Elen_1014(PF00174)ER; (ER)
479437.Elen_2786(PF00196)ER; (ER)
479437.Elen_0330(PF02361)ER
479437.Elen_0529(PF00196)(mitochondrial)
479437.Elen_0523(PF00196)(mitochondrial)
479437.Elen_1674(PF00185) (PF02729)
479437.Elen_1696(PF06541)(ER)
479437.Elen_2405(PF01568) (PF00384)
479437.Elen_2753(PF01568) (PF00384)
479437.Elen_2961(PF13787)(ER)
479437.Elen_0676(PF00185) (PF02729)
479437.Elen_0670(PF00185) (PF02729)
479437.Elen_0078(PF09394)plastid
479437.Elen_2291PF00890(ER)
479437.Elen_0486PF00890(mitochondrial)
479437.Elen_0489(PF00196)(ER)
479437.Elen_2191(PF00185) (PF02729)
479437.Elen_0616PF00890(ER)
479437.Elen_0123(PF00196)(ER)
479437.Elen_1093(PF00196)(ER)
479437.Elen_1948(PF00185) (PF02729)
479437.Elen_2708(PF00185) (PF02729)
479437.Elen_0596PF00890(mitochondrial)
479437.Elen_1575(PF13187)(mitochondrial)
479437.Elen_3026(PF00037) (PF13187)
479437.Elen_0452(PF01568) (PF00384)
479437.Elen_2035(PF04991)(ER)
479437.Elen_2485(PF02361)(plastid)
479437.Elen_0166PF00890(mitochondrial)
479437.Elen_2905(PF02274)(mitochondrial)
479437.Elen_0421(PF00196)(plastid)
479437.Elen_2306(PF02361)(mitochondrial)
479437.Elen_0413(PF00185) (PF02729)
479437.Elen_0988PF00890(mitochondrial)
479437.Elen_2698PF00890(ER)
479437.Elen_0405PF00890(ER)
479437.Elen_0997(PF02361)(plastid)
479437.Elen_0500(PF00196)(mitochondrial)
479437.Elen_0323(PF02361)(mitochondrial)
479437.Elen_0208PF00890(ER)
479437.Elen_0514(PF00196)(plastid)
479437.Elen_0519PF00890(ER)
479437.Elen_0518(PF00196)(ER)
479437.Elen_0335(PF02361)plastid
479437.Elen_1682(PF01568) (PF00384)
479437.Elen_0522PF00890
479437.Elen_0524PF00890
479437.Elen_0011(PF00872)
479437.Elen_2440(PF04991)
479437.Elen_2110PF14623
479437.Elen_1218PF00890
479437.Elen_2529PF00890
479437.Elen_2258(PF00196)
479437.Elen_2741PF00890
479437.Elen_2742(PF00196)
479437.Elen_0532PF00890
479437.Elen_0649(PF00872)
479437.Elen_0222(PF13187)
479437.Elen_1443(PF06541)
479437.Elen_1531(PF00958)
479437.Elen_2243(PF00872)
479437.Elen_2751(PF00872)
479437.Elen_2757PF00890
479437.Elen_0496(PF00196)
479437.Elen_0495(PF00037)
479437.Elen_0672(PF04371)
479437.Elen_0678(PF04371)
479437.Elen_0252PF00890
479437.Elen_0107PF00890
479437.Elen_0108(PF00196)
479437.Elen_1057(PF13187)
479437.Elen_2290(PF00196)
479437.Elen_2762(PF00196)
479437.Elen_2980(PF13597)
479437.Elen_0485(PF00196)
479437.Elen_0481(PF00037)
479437.Elen_0488PF00890
479437.Elen_2960(PF00872)
479437.Elen_1088PF02037
479437.Elen_1429PF00890
479437.Elen_2420(PF04991)
479437.Elen_2193(PF00196)
479437.Elen_2192(PF04371)
479437.Elen_1880(PF02357)
479437.Elen_2775(PF00196)
479437.Elen_2354PF00890
479437.Elen_2353(PF00196)
479437.Elen_0473(PF00196)
479437.Elen_0879(PF02643)
479437.Elen_0614(PF00872)
479437.Elen_0270PF00890
479437.Elen_0057(PF00037)
479437.Elen_0124PF00890
479437.Elen_0125PF00890
479437.Elen_1433(PF02361)
479437.Elen_1431(PF00196)
479437.Elen_1438(PF02873)
479437.Elen_2706(PF02274)
479437.Elen_0461(PF00196)
479437.Elen_0597(PF00196)
479437.Elen_0269(PF00196)
479437.Elen_0289(PF00196)
479437.Elen_0288PF00890
479437.Elen_1156(PF06541)
479437.Elen_1395PF00890
479437.Elen_2176(PF05697)
479437.Elen_2571(PF13597)
479437.Elen_2393(PF00872)
479437.Elen_3022(PF00196)
479437.Elen_0630(PF00196)
479437.Elen_0143(PF02274)
479437.Elen_1141(PF13187)
479437.Elen_1388PF00890
479437.Elen_2497(PF13187)
479437.Elen_1706(PF13187)
479437.Elen_2119PF00890
479437.Elen_1560(PF06541)
479437.Elen_2812(PF00196)
479437.Elen_2816(PF00196)
479437.Elen_2817PF00890
479437.Elen_2033(PF04991)
479437.Elen_2723(PF00196)
479437.Elen_0531(PF00196)
479437.Elen_3038(PF00196)
479437.Elen_2929(PF00196)
479437.Elen_2925(PF00196)
479437.Elen_0440(PF00196)
479437.Elen_0626PF00890
479437.Elen_0623(PF00872)
479437.Elen_0622(PF00037)
479437.Elen_0629PF00890
479437.Elen_0153(PF02274)
479437.Elen_0314(PF02361)
479437.Elen_2730(PF13597)
479437.Elen_2933PF00890
479437.Elen_2932(PF00196)
479437.Elen_1743(PF00196)
479437.Elen_1742(PF00037)
479437.Elen_0546(PF02643)
479437.Elen_0436(PF00196)
479437.Elen_0942(PF00958)
479437.Elen_0094(PF00872)
479437.Elen_0363PF00890
479437.Elen_0167(PF00196)
479437.Elen_1163(PF02274)
479437.Elen_1837(PF00196)
479437.Elen_2900(PF06414)
479437.Elen_0420(PF06414)
479437.Elen_0774(PF00037)
479437.Elen_2130(PF02357)
479437.Elen_1800(PF00872)
479437.Elen_2822(PF00196)
479437.Elen_2825PF00890
479437.Elen_2826PF00890
479437.Elen_0565(PF00196)
479437.Elen_0412(PF04371)
479437.Elen_0416(PF00037)
479437.Elen_0968PF00890
479437.Elen_0985(PF00196)
479437.Elen_0986PF00890
479437.Elen_0989(PF00196)
479437.Elen_0342PF00890
479437.Elen_0182PF00890
479437.Elen_0183PF00890
479437.Elen_2404(PF00037)
479437.Elen_1104PF00627
479437.Elen_1920(PF02357)
479437.Elen_1929(PF05697)
479437.Elen_2107PF00890
479437.Elen_2693(PF00196)
479437.Elen_2690PF00890
479437.Elen_2691PF00890
479437.Elen_2696(PF00196)
479437.Elen_2695PF00890
479437.Elen_2533PF00890
479437.Elen_2244(PF00872)
479437.Elen_3073(PF13187)
479437.Elen_0992(PF00196)
479437.Elen_0579PF00890
479437.Elen_0578(PF00196)
479437.Elen_0752(PF00872)
479437.Elen_2758(PF00196)
479437.Elen_1483(PF02361)
479437.Elen_1008(PF00196)
479437.Elen_1003(PF00872)
479437.Elen_2445(PF02357)
479437.Elen_2688(PF00196)
479437.Elen_1868(PF00037)
479437.Elen_0506(PF00196)
479437.Elen_1015(PF00196)
479437.Elen_1272(PF00872)
479437.Elen_1301(PF00037)
479437.Elen_2655(PF00196)
479437.Elen_2653PF00890
479437.Elen_2093(PF02873)
479437.Elen_2893PF00890
479437.Elen_0209(PF00196)
479437.Elen_0687PF00890
479437.Elen_1683PF04879
479437.Elen_2319(PF02361)
479437.Elen_1518(PF00872)
479437.Elen_2796PF00890
479437.Elen_2795(PF00196)
479437.Elen_2799(PF02361)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================