Metamenu

Effective results for Kitasatospora setae KM-6054 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 503
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 83 eukaryotic-like domains, contained in 503 proteins (16 high, 487 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
452652.KSE_74700(PF02868) (PF02839) (PF07504) (PF01447)ER
452652.KSE_50520(PF02868) (PF07504) (PF01447)ER
452652.KSE_23340(PF02868) (PF01447) (PF07504)ER
452652.KSE_06740(PF02868) (PF07504) (PF01447)ER
452652.KSE_71920(PF02868) (PF01447) (PF07504)ER
452652.KSE_71940(PF02868) (PF07504) (PF01447)ER
452652.KSE_06670(PF02868) (PF01447) (PF07504)ER
452652.KSE_12330(PF02868) (PF07504) (PF01447)ER
452652.KSE_72440(PF02801) (PF00109)(ER)
452652.KSE_33620(PF03900) (PF01379)mitochondrial; (mitochondrial)
452652.KSE_02970(PF02839) (PF00704)ER
452652.KSE_72090PF02018 (PF00704)ER
452652.KSE_23210(PF01379) (PF03900)(mitochondrial)
452652.KSE_23300PF03423 (PF00686)mitochondrial; ER
452652.KSE_27260(PF08545) (PF08541)(ER)
452652.KSE_28130(PF02839) (PF00704)(mitochondrial)
452652.KSE_31480(PF17103) (PF11380) (PF17101) (PF17102)
452652.KSE_27600PF02018 (PF00704)ER
452652.KSE_49110PF02018 (PF00704)(ER)
452652.KSE_19480PF02018 (PF00704)(ER); plastid
452652.KSE_31460(PF17103) (PF11380) (PF17101) (PF17102)
452652.KSE_67380(PF02801) (PF00109)(ER)
452652.KSE_70570(PF02801) (PF00109)ER
452652.KSE_61910PF02018 (PF00704)ER
452652.KSE_24350(PF02839) (PF00704)mitochondrial
452652.KSE_27270(PF08545) (PF08541)(mitochondrial); mitochondrial
452652.KSE_73320(PF08545) (PF08541)(mitochondrial)
452652.KSE_65040(PF00042)(ER)
452652.KSE_11880(PF05977)(mitochondrial)
452652.KSE_09540(PF03403)(ER)
452652.KSE_09150(PF03704)(ER)
452652.KSE_17860(PF13535)ER
452652.KSE_03780(PF01648)(mitochondrial)
452652.KSE_47660PF02018 (PF00704)(ER)
452652.KSE_44530(PF05977)(mitochondrial)
452652.KSE_26420(PF00704)ER
452652.KSE_70020(PF03704)(mitochondrial)
452652.KSE_32830(PF03733)ER
452652.KSE_68370(PF13527)(mitochondrial)
452652.KSE_72230(PF14378)mitochondrial; (ER)
452652.KSE_18520(PF14099)ER
452652.KSE_75950t(PF08031)(mitochondrial); plastid
452652.KSE_69370(PF08031)(ER)
452652.KSE_06160(PF07228)(ER)
452652.KSE_02260(PF08840)ER
452652.KSE_51700(PF05977)mitochondrial
452652.KSE_25180(PF05977)(ER); ER
452652.KSE_63790(PF13671)(ER)
452652.KSE_02580(PF05977)(ER); (mitochondrial)
452652.KSE_12660(PF13535)ER; (ER)
452652.KSE_16480(PF01741)mitochondrial
452652.KSE_26210(PF00704)ER
452652.KSE_37760(PF12802)mitochondrial; (mitochondrial)
452652.KSE_29920(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_04010(PF05977)(mitochondrial)
452652.KSE_00790t(PF08031)(mitochondrial); plastid
452652.KSE_75830t(PF17124)(ER)
452652.KSE_01450(PF03318)ER
452652.KSE_56940PF02018ER
452652.KSE_23120(PF07228)ER
452652.KSE_32530(PF03733)(mitochondrial)
452652.KSE_53360(PF14378)(mitochondrial); (plastid)
452652.KSE_74210(PF02839)ER
452652.KSE_46910(PF00293)ER
452652.KSE_61550(PF05977)ER
452652.KSE_04060(PF07228)(ER)
452652.KSE_41540(PF13302)(mitochondrial)
452652.KSE_67350(PF02801) (PF00109)(ER)
452652.KSE_16140(PF05977)mitochondrial
452652.KSE_45890(PF13302)ER
452652.KSE_39740(PF00042)(mitochondrial)
452652.KSE_03520(PF07228)(ER); (mitochondrial)
452652.KSE_72660(PF12802)(ER)
452652.KSE_59930(PF02839)ER
452652.KSE_15380(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_09340(PF13671)mitochondrial; (mitochondrial)
452652.KSE_65700(PF03403)ER
452652.KSE_12240(PF07228)ER
452652.KSE_63060(PF03704)mitochondrial; (mitochondrial)
452652.KSE_00780t(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_71550(PF14378)(mitochondrial); ER
452652.KSE_73540(PF03704)mitochondrial; (mitochondrial)
452652.KSE_17460(PF01161)ER
452652.KSE_02960(PF02839)ER; mitochondrial
452652.KSE_11870PF03423ER
452652.KSE_16860(PF00704)ER
452652.KSE_67890(PF13671)(ER)
452652.KSE_69490(PF07228)(ER)
452652.KSE_75760t(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_62780PF02018mitochondrial
452652.KSE_31270(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_11360(PF13302)(mitochondrial)
452652.KSE_17950(PF03900) (PF01379)(mitochondrial)
452652.KSE_69380(PF03403)ER
452652.KSE_69240(PF00686)ER
452652.KSE_75670(PF13518)(mitochondrial)
452652.KSE_45380(PF13350)ER; (ER)
452652.KSE_72950(PF13499)(mitochondrial); (plastid)
452652.KSE_60870(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_13190(PF02839)ER
452652.KSE_54020(PF00293)(ER)
452652.KSE_60850(PF03403)ER
452652.KSE_03900(PF00704)ER
452652.KSE_29040(PF13535)(mitochondrial)
452652.KSE_71640(PF00704)mitochondrial
452652.KSE_32540(PF03733)ER
452652.KSE_00980t(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_29360(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_73870PF02018mitochondrial
452652.KSE_75960t(PF02880) (PF02878) (PF02879)
452652.KSE_00910t(PF17124)(ER)
452652.KSE_68980(PF12802)(mitochondrial); mitochondrial
452652.KSE_37180(PF01161)(ER)
452652.KSE_54920(PF14099)ER
452652.KSE_60990(PF00079)(mitochondrial); (plastid)
452652.KSE_20240(PF13302)(ER)
452652.KSE_31390(PF01741)(ER)
452652.KSE_27210(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_42420(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_70610(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_36180(PF02403) (PF00587)
452652.KSE_37330(PF13350)(plastid)
452652.KSE_57540(PF13600)(ER)
452652.KSE_65550(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_27440(PF09924)(plastid)
452652.KSE_59090(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_36060(PF00293)(ER)
452652.KSE_65510(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_03930(PF02839)(plastid)
452652.KSE_73460(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_73440(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_32600(PF01678)(ER)
452652.KSE_43020(PF13551) (PF13592)
452652.KSE_27340(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_08280(PF12802)(ER)
452652.KSE_15950(PF13302)(ER)
452652.KSE_40970(PF02403) (PF00587)
452652.KSE_61080(PF07228)(ER)
452652.KSE_38030(PF13551) (PF13592)
452652.KSE_67490(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_42570PF02018 (PF00704)
452652.KSE_24980(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_27320(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_25000(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_03770(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_68480(PF07228)(ER)
452652.KSE_70580(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_16910(PF13671) (PF00293)
452652.KSE_65990(PF00109)(plastid)
452652.KSE_62950(PF05977)(ER)
452652.KSE_12890(PF01135)(mitochondrial)
452652.KSE_73480(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_69575(PF03704)(mitochondrial)
452652.KSE_65240(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_42470(PF03704)(plastid)
452652.KSE_72450(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_33380(PF05977)(mitochondrial)
452652.KSE_49980(PF00750)(plastid)
452652.KSE_70620(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_07780(PF13454)(mitochondrial)
452652.KSE_22340(PF13551) (PF13592)
452652.KSE_22350(PF13518) (PF13592)
452652.KSE_70600(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_65540(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_65090(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_65950(PF01648)(mitochondrial)
452652.KSE_69450(PF14864) (PF14863)
452652.KSE_65560(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_43150(PF01135)(ER)
452652.KSE_05560(PF01609)(mitochondrial)
452652.KSE_02980(PF02839)(plastid)
452652.KSE_05760(PF01609)(mitochondrial)
452652.KSE_24660(PF13551) (PF13592)
452652.KSE_58380(PF08031)(ER)
452652.KSE_73470(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_09490(PF13671)(plastid)
452652.KSE_37080(PF14864) (PF14863)
452652.KSE_73450(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_65120(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_59460(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_33320(PF01161)(ER)
452652.KSE_67710(PF13551) (PF13592)
452652.KSE_33040(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_28140PF02018 (PF00704)
452652.KSE_13500(PF00293)(ER)
452652.KSE_71440(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_65980(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_73360(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_32320(PF02873)(ER)
452652.KSE_70590(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_73340(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_05600(PF00587)mitochondrial
452652.KSE_39860(PF08545) (PF08541)
452652.KSE_15050(PF02801) (PF00109)
452652.KSE_43350(PF07228)(mitochondrial)
452652.KSE_17370(PF14078)
452652.KSE_51830(PF13302)
452652.KSE_02050(PF13302)
452652.KSE_41520(PF04525)
452652.KSE_39750(PF00293)
452652.KSE_16810(PF01648)
452652.KSE_08720(PF01409)
452652.KSE_65900(PF08541)
452652.KSE_65270(PF01648)
452652.KSE_22300(PF01609)
452652.KSE_58230(PF03704)
452652.KSE_38830(PF13527)
452652.KSE_24030(PF05147)
452652.KSE_70180(PF08445)
452652.KSE_33410(PF00750)
452652.KSE_07220(PF01135)
452652.KSE_32420(PF00293)
452652.KSE_37410(PF00042)
452652.KSE_60650(PF00293)
452652.KSE_68710(PF07228)
452652.KSE_74470(PF07228)
452652.KSE_60400(PF13302)
452652.KSE_64960(PF12802)
452652.KSE_69870(PF02350)
452652.KSE_58800(PF01135)
452652.KSE_52475PF12873
452652.KSE_02540(PF13302)
452652.KSE_01320(PF13499)
452652.KSE_18730(PF01609)
452652.KSE_15630(PF00079)
452652.KSE_34220(PF05977)
452652.KSE_09960(PF13302)
452652.KSE_29160(PF16321)
452652.KSE_04320(PF08445)
452652.KSE_59050(PF01474)
452652.KSE_43850(PF09924)
452652.KSE_33330(PF14864)
452652.KSE_37810(PF00587)
452652.KSE_00760t(PF02350)
452652.KSE_40140(PF01135)
452652.KSE_30680(PF12802)
452652.KSE_32850(PF01648)
452652.KSE_42630(PF13302)
452652.KSE_37640(PF07228)
452652.KSE_42820(PF07228)
452652.KSE_03010(PF13302)
452652.KSE_06080(PF12802)
452652.KSE_65750(PF05406)
452652.KSE_37870(PF11991)
452652.KSE_60050(PF12802)
452652.KSE_43390(PF00293)
452652.KSE_19120(PF00293)
452652.KSE_71080(PF00533)
452652.KSE_34390(PF03704)
452652.KSE_04360(PF13302)
452652.KSE_16660(PF13350)
452652.KSE_51090(PF00533)
452652.KSE_23680(PF13527)
452652.KSE_08650(PF12802)
452652.KSE_51970(PF00293)
452652.KSE_00860t(PF12802)
452652.KSE_41440(PF00293)
452652.KSE_34620(PF07228)
452652.KSE_23200(PF00293)
452652.KSE_76440t(PF01609)
452652.KSE_15190(PF01409)
452652.KSE_31240(PF01648)
452652.KSE_46810(PF00293)
452652.KSE_60970(PF02839)
452652.KSE_14840(PF08031)
452652.KSE_67980(PF13302)
452652.KSE_36920(PF12802)
452652.KSE_55600(PF12802)
452652.KSE_02700(PF00293)
452652.KSE_23550(PF03704)
452652.KSE_37090(PF14863)not used
452652.KSE_37890(PF03704)
452652.KSE_04640(PF14378)
452652.KSE_59130(PF03704)
452652.KSE_09030(PF09924)
452652.KSE_22560(PF07228)
452652.KSE_43000(PF01135)
452652.KSE_26770(PF00293)
452652.KSE_47780(PF03704)
452652.KSE_39630(PF07931)
452652.KSE_03980(PF13350)
452652.KSE_22420(PF01609)
452652.KSE_68070(PF12802)
452652.KSE_01940PF13405
452652.KSE_71370(PF07931)
452652.KSE_47760(PF07228)
452652.KSE_07810(PF07228)
452652.KSE_10700(PF05147)
452652.KSE_49030(PF00293)
452652.KSE_54990(PF12802)
452652.KSE_27300(PF00587)
452652.KSE_69890(PF03704)
452652.KSE_24340(PF12802)
452652.KSE_52890(PF12802)
452652.KSE_46350(PF12802)
452652.KSE_58710(PF13535)
452652.KSE_67550(PF03704)
452652.KSE_09210(PF00293)
452652.KSE_18930(PF08445)
452652.KSE_00090t(PF03457)
452652.KSE_07870(PF16321)
452652.KSE_69510(PF04525)
452652.KSE_67120(PF05977)
452652.KSE_23600(PF05977)
452652.KSE_54550(PF13302)
452652.KSE_02810(PF12802)
452652.KSE_19270(PF01609)
452652.KSE_03490(PF13302)
452652.KSE_24560(PF02458)
452652.KSE_53120(PF13302)
452652.KSE_26580(PF00533)
452652.KSE_00010t(PF03457)
452652.KSE_42960(PF00293)
452652.KSE_08320(PF05977)
452652.KSE_19590(PF07228)
452652.KSE_71670(PF12802)
452652.KSE_07440(PF07228)
452652.KSE_56620(PF13302)
452652.KSE_64310(PF03704)
452652.KSE_10680(PF05706)
452652.KSE_18050(PF01474)
452652.KSE_01470(PF00293)
452652.KSE_11950(PF12802)
452652.KSE_23360(PF14378)
452652.KSE_03750(PF05977)
452652.KSE_06700(PF16321)
452652.KSE_22710(PF13454)
452652.KSE_27490(PF03704)
452652.KSE_02410(PF13302)
452652.KSE_04950(PF01609)
452652.KSE_39460(PF13302)
452652.KSE_42000(PF00293)
452652.KSE_10030(PF07228)
452652.KSE_66230(PF03704)
452652.KSE_48120(PF07228)
452652.KSE_02650(PF07228)
452652.KSE_21560(PF01474)
452652.KSE_56660(PF12802)
452652.KSE_58080(PF01756)
452652.KSE_10740(PF13302)
452652.KSE_19760(PF01609)
452652.KSE_23900(PF07228)
452652.KSE_48930(PF00293)
452652.KSE_06290(PF12802)
452652.KSE_02040(PF12802)
452652.KSE_11340(PF12802)
452652.KSE_75980t(PF02350)
452652.KSE_41880(PF13350)
452652.KSE_16750(PF02839)
452652.KSE_71690(PF08840)
452652.KSE_05020(PF12802)
452652.KSE_58200(PF03704)
452652.KSE_42020(PF13518)
452652.KSE_59000(PF13454)
452652.KSE_19740(PF12802)
452652.KSE_17360(PF14078)
452652.KSE_58830(PF05147)
452652.KSE_17010(PF12802)
452652.KSE_32430(PF00293)
452652.KSE_37400(PF00042)
452652.KSE_14790(PF13302)
452652.KSE_04500(PF00293)
452652.KSE_39520(PF07228)
452652.KSE_68720(PF07228)
452652.KSE_15600(PF13499)
452652.KSE_50400(PF12802)
452652.KSE_46970(PF00293)
452652.KSE_33460(PF00750)
452652.KSE_07030(PF07228)
452652.KSE_02790(PF13302)
452652.KSE_51860(PF00587)
452652.KSE_48970(PF02178)
452652.KSE_28990(PF05977)
452652.KSE_26330(PF07228)
452652.KSE_53420(PF07228)
452652.KSE_05780(PF07228)
452652.KSE_00300t(PF01609)
452652.KSE_49760(PF13454)
452652.KSE_39500(PF09924)
452652.KSE_14970(PF01687)
452652.KSE_18620(PF12802)
452652.KSE_29450(PF01609)
452652.KSE_57550(PF13600)
452652.KSE_60460(PF03704)
452652.KSE_09140(PF00587)
452652.KSE_16450(PF13527)
452652.KSE_69860(PF00293)
452652.KSE_17850(PF13535)
452652.KSE_74810(PF12802)
452652.KSE_48870(PF07228)
452652.KSE_57940(PF05977)
452652.KSE_49700(PF12802)
452652.KSE_63000(PF05147)
452652.KSE_53160(PF01687)
452652.KSE_15640(PF00079)
452652.KSE_22370(PF01609)
452652.KSE_19070(PF13302)
452652.KSE_65370(PF07228)
452652.KSE_06420(PF02350)
452652.KSE_12960(PF13499)
452652.KSE_14690(PF13302)
452652.KSE_35090(PF13527)
452652.KSE_10640(PF00293)
452652.KSE_09300(PF05406)
452652.KSE_53750(PF01678)
452652.KSE_41210(PF13302)
452652.KSE_24640PF11715
452652.KSE_65350(PF08445)
452652.KSE_56310(PF12802)
452652.KSE_26490(PF13671)
452652.KSE_61500(PF00293)
452652.KSE_05170(PF07228)
452652.KSE_46840(PF13671)
452652.KSE_01270(PF05406)
452652.KSE_25130(PF01609)
452652.KSE_16080(PF00293)
452652.KSE_58730(PF13535)
452652.KSE_04820(PF07228)
452652.KSE_03280(PF07228)
452652.KSE_68170(PF13350)
452652.KSE_02080(PF01129)
452652.KSE_67520(PF01648)
452652.KSE_76730t(PF03457)
452652.KSE_04840(PF07228)
452652.KSE_15980(PF01135)
452652.KSE_14580(PF00587)
452652.KSE_02710(PF01609)
452652.KSE_04980(PF00293)
452652.KSE_06630(PF13671)
452652.KSE_14110(PF13671)
452652.KSE_44420(PF00293)
452652.KSE_32630(PF01678)
452652.KSE_27560(PF01648)
452652.KSE_24450(PF01648)
452652.KSE_17390(PF00704)
452652.KSE_41060(PF05977)
452652.KSE_51020(PF12802)
452652.KSE_17700(PF00293)
452652.KSE_25260(PF13302)
452652.KSE_52220(PF01609)
452652.KSE_09240(PF13527)
452652.KSE_31470(PF11380)
452652.KSE_68470(PF01609)
452652.KSE_73220(PF13671)
452652.KSE_60230(PF13499)
452652.KSE_44660(PF12802)
452652.KSE_65850(PF08541)
452652.KSE_19240(PF12802)
452652.KSE_52200(PF00293)
452652.KSE_58320(PF01474)
452652.KSE_52060(PF13518)
452652.KSE_05090(PF07228)
452652.KSE_08170(PF02350)
452652.KSE_54210(PF13302)
452652.KSE_08780(PF13302)
452652.KSE_29000(PF13535)
452652.KSE_72380(PF07228)
452652.KSE_31970(PF05406)
452652.KSE_41370(PF13302)
452652.KSE_56970(PF00533)
452652.KSE_04770(PF05147)
452652.KSE_57440(PF00293)
452652.KSE_54490(PF07228)
452652.KSE_03370(PF12802)
452652.KSE_76650t(PF03457)
452652.KSE_56630(PF00293)
452652.KSE_67670(PF01609)
452652.KSE_35330(PF13350)
452652.KSE_56950(PF07228)
452652.KSE_27290(PF03704)
452652.KSE_07590(PF07228)
452652.KSE_03740(PF12802)
452652.KSE_05190(PF07228)
452652.KSE_57910(PF01161)
452652.KSE_16250(PF00293)
452652.KSE_17780(PF08031)
452652.KSE_12570(PF01756)
452652.KSE_09980(PF00293)
452652.KSE_20390(PF13302)
452652.KSE_35350(PF00293)
452652.KSE_20970(PF13535)
452652.KSE_16060(PF01135)
452652.KSE_15440(PF00293)
452652.KSE_17330(PF00293)
452652.KSE_06950(PF13302)
452652.KSE_03720(PF13527)
452652.KSE_72750(PF13302)
452652.KSE_58130(PF05977)
452652.KSE_31130(PF09445)
452652.KSE_48130(PF07228)
452652.KSE_25390(PF00587)
452652.KSE_47050(PF01135)
452652.KSE_12880(PF00293)
452652.KSE_75880t(PF12802)
452652.KSE_28640(PF09924)
452652.KSE_42010(PF00293)
452652.KSE_37980(PF13518)
452652.KSE_01340(PF13499)
452652.KSE_48110(PF00293)
452652.KSE_32110(PF02873)
452652.KSE_22980(PF03704)
452652.KSE_45780(PF01741)
452652.KSE_62040(PF12802)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================