Effective results for Burkholderia sp. YI23 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 888
- Predicted by EffectiveT3: 254 (high confidence), 393 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 34 within, 15 before, 35 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 114
- Predicted by EffectiveELD: 17 eukaryotic-like domains, contained in 108 proteins (6 high, 102 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type III), (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
1097668.BYI23_B005610(PF08546) (PF02558)(ER)
1097668.BYI23_C005200+(ER)
1097668.BYI23_B012110(PF08546) (PF02558)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A005580+(ER)
1097668.BYI23_A016890(<)ER
1097668.BYI23_C013360+ER
1097668.BYI23_A021860+ER
1097668.BYI23_B001190(PF00083)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A000990+ER
1097668.BYI23_C012090(+)(>)(mitochondrial)
1097668.BYI23_B006560+ER
1097668.BYI23_B011230(>)mitochondrial
1097668.BYI23_A010780(<)ER
1097668.BYI23_A018690+ER
1097668.BYI23_A002030+ER
1097668.BYI23_A027020+ER
1097668.BYI23_C007970(PF01012)(mitochondrial); mitochondrial
1097668.BYI23_A009150+(ER)
1097668.BYI23_C006750(PF01012)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A000280PF11790ER
1097668.BYI23_A004070(>)ER
1097668.BYI23_C007330(PF01012)(mitochondrial); mitochondrial
1097668.BYI23_B008890+ER
1097668.BYI23_C003320+ER
1097668.BYI23_A003050+mitochondrial
1097668.BYI23_B005330(PF14347)ER
1097668.BYI23_A017610+ER
1097668.BYI23_B000940+ER
1097668.BYI23_A005530+(mitochondrial); (plastid)
1097668.BYI23_A013860(PF08546) (PF02558)(plastid)
1097668.BYI23_C005160(PF01012)(mitochondrial); mitochondrial
1097668.BYI23_B007770+(mitochondrial)
1097668.BYI23_C007440+ER
1097668.BYI23_B012450+(mitochondrial)
1097668.BYI23_C009340+mitochondrial
1097668.BYI23_A022050+(ER)
1097668.BYI23_C009640(<)(ER); (plastid)
1097668.BYI23_B007710(PF05544)mitochondrial
1097668.BYI23_B008720(PF08546) (PF02558)(ER)
1097668.BYI23_B006010+ER
1097668.BYI23_A013750(PF00083)(ER)
1097668.BYI23_A009710(>)ER
1097668.BYI23_C007210+ER
1097668.BYI23_B002060+mitochondrial
1097668.BYI23_A018080+mitochondrial
1097668.BYI23_B006440+(mitochondrial); (plastid)
1097668.BYI23_A014190(>)(mitochondrial); (plastid)
1097668.BYI23_C011100+mitochondrial
1097668.BYI23_C002990+(mitochondrial)
1097668.BYI23_A019390+ER
1097668.BYI23_C012760PF11790ER; (ER)
1097668.BYI23_A019700(PF01012)(mitochondrial); mitochondrial
1097668.BYI23_C005430+ER
1097668.BYI23_A006460+ER
1097668.BYI23_A008890(>)ER
1097668.BYI23_B006280+PF05637(plastid)
1097668.BYI23_A012050+ER
1097668.BYI23_B013990+ER
1097668.BYI23_B011590PF11790ER
1097668.BYI23_C004260(PF00083)(ER); ER
1097668.BYI23_A022490+(mitochondrial)
1097668.BYI23_A017450+(mitochondrial)
1097668.BYI23_C012450(>)(ER)
1097668.BYI23_C002150+(ER)
1097668.BYI23_C005370+ER
1097668.BYI23_C000300+ER
1097668.BYI23_B009600+ER; plastid
1097668.BYI23_A025970+(mitochondrial); plastid
1097668.BYI23_A026970(>)ER
1097668.BYI23_C002190(>)ER
1097668.BYI23_B008840+ER
1097668.BYI23_B005300+ER
1097668.BYI23_C012540(PF01012)mitochondrial
1097668.BYI23_C005990+(ER); ER
1097668.BYI23_C013460+mitochondrial
1097668.BYI23_B008790+(mitochondrial)
1097668.BYI23_B006350+ER
1097668.BYI23_A021740(>)ER
1097668.BYI23_A027560+ER
1097668.BYI23_B003580+(mitochondrial)
1097668.BYI23_A001550+ER
1097668.BYI23_A022000+ER
1097668.BYI23_A017840+ER
1097668.BYI23_B012540(PF01012)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A023540+(mitochondrial)
1097668.BYI23_B007060+ER
1097668.BYI23_A020680(<)ER
1097668.BYI23_A014370+mitochondrial; (mitochondrial)
1097668.BYI23_A007740(PF14347)ER
1097668.BYI23_B010450(PF08546) (PF02558)
1097668.BYI23_C006510(PF08546) (PF02558)
1097668.BYI23_C004910+(plastid)
1097668.BYI23_C001450(PF08546) (PF02558)
1097668.BYI23_C005320+(mitochondrial)
1097668.BYI23_C001320(+)ER
1097668.BYI23_C005960+(plastid)
1097668.BYI23_A011990(+)(mitochondrial); (plastid)
1097668.BYI23_A004350+(mitochondrial)
1097668.BYI23_C002520(PF00083)(plastid)
1097668.BYI23_C003380(+)ER
1097668.BYI23_A017440++
1097668.BYI23_B009390+(ER)
1097668.BYI23_A026510(<)+
1097668.BYI23_A001880++
1097668.BYI23_B008420+(plastid)
1097668.BYI23_B007670+(ER)
1097668.BYI23_C007780+(<)
1097668.BYI23_B002350+(plastid)
1097668.BYI23_B008140+(plastid)
1097668.BYI23_A017110+(ER)
1097668.BYI23_C009290(+)mitochondrial
1097668.BYI23_A001020+plastid
1097668.BYI23_A006940+(plastid)
1097668.BYI23_A017350(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_C004820(+)mitochondrial
1097668.BYI23_A025590+(plastid)
1097668.BYI23_B008100+plastid
1097668.BYI23_C011540+(ER)
1097668.BYI23_C012530(PF00766) (PF01012)
1097668.BYI23_B003270(+)ER
1097668.BYI23_C003890++
1097668.BYI23_B002040++
1097668.BYI23_B012550(PF00766) (PF01012)
1097668.BYI23_C013250+(PF01977)
1097668.BYI23_B004080(+)(ER); plastid
1097668.BYI23_A024110(+)(ER); (mitochondrial)
1097668.BYI23_A027490+(plastid)
1097668.BYI23_A009340+(mitochondrial)
1097668.BYI23_C002550+(plastid)
1097668.BYI23_B009580+(PF04952)
1097668.BYI23_A012720(+)(mitochondrial); plastid
1097668.BYI23_B004740++
1097668.BYI23_A001750(+)+(plastid)
1097668.BYI23_C005640+plastid
1097668.BYI23_B010070(+)+(mitochondrial)
1097668.BYI23_A004130(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_B004000+(ER)
1097668.BYI23_A013600+(mitochondrial)
1097668.BYI23_A024410(+)mitochondrial; (mitochondrial)
1097668.BYI23_C001270(+)mitochondrial
1097668.BYI23_A010560(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A022120+(mitochondrial)
1097668.BYI23_C007960(PF00766) (PF01012)
1097668.BYI23_C005050+(PF00083)
1097668.BYI23_A019570(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_C007320(PF00766) (PF01012)
1097668.BYI23_C006740(PF00766) (PF01012)
1097668.BYI23_C011410+(ER)
1097668.BYI23_A014280(+)(ER)
1097668.BYI23_A018050(+)mitochondrial; plastid
1097668.BYI23_A001030+(plastid)
1097668.BYI23_B005320(PF14347)(mitochondrial)
1097668.BYI23_C010460(PF00083)(ER)
1097668.BYI23_C007470+(PF00083)
1097668.BYI23_A000440+(>)
1097668.BYI23_B000760+plastid
1097668.BYI23_B006080(+)mitochondrial
1097668.BYI23_A009010(+)(mitochondrial); (plastid)
1097668.BYI23_C010850(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_C006130+(plastid)
1097668.BYI23_A013700(PF01968) (PF02538)
1097668.BYI23_C002840(+)(ER); (mitochondrial)
1097668.BYI23_C005150(PF00766) (PF01012)
1097668.BYI23_A014880+(mitochondrial)
1097668.BYI23_B012950+(>)
1097668.BYI23_A009700+(PF04952)
1097668.BYI23_B002380(+)(ER)
1097668.BYI23_A027640+(plastid)
1097668.BYI23_A009540(+)(ER)
1097668.BYI23_A019690(PF00766) (PF01012)
1097668.BYI23_B007880+(plastid)
1097668.BYI23_A010280+
1097668.BYI23_C001970+
1097668.BYI23_C005460+
1097668.BYI23_B007500+
1097668.BYI23_A027460+
1097668.BYI23_C012420(>)
1097668.BYI23_A009350+
1097668.BYI23_B000320+
1097668.BYI23_B011620+
1097668.BYI23_A008750(+)(PF00083)
1097668.BYI23_A022230+
1097668.BYI23_A002220+
1097668.BYI23_C008660+
1097668.BYI23_C008910+
1097668.BYI23_B000830+
1097668.BYI23_C008000+
1097668.BYI23_B015190+
1097668.BYI23_A023910+
1097668.BYI23_B005250+
1097668.BYI23_B012520+
1097668.BYI23_B011600+
1097668.BYI23_A026280(+)plastid
1097668.BYI23_B005440+
1097668.BYI23_C001020+
1097668.BYI23_C009510+
1097668.BYI23_A006430+
1097668.BYI23_A015290+
1097668.BYI23_C008020+
1097668.BYI23_C011150+
1097668.BYI23_B010390+
1097668.BYI23_A011190+
1097668.BYI23_C002730+
1097668.BYI23_A021390+
1097668.BYI23_A012500(+)(plastid)
1097668.BYI23_C006550(PF08501)
1097668.BYI23_B002430(+)plastid
1097668.BYI23_A027420+
1097668.BYI23_A027390+
1097668.BYI23_A005760+
1097668.BYI23_A004140(PF00083)
1097668.BYI23_B003680+
1097668.BYI23_A023090+
1097668.BYI23_C001850+
1097668.BYI23_A023890+
1097668.BYI23_A011500+
1097668.BYI23_C003910(+)(plastid)
1097668.BYI23_A026110+
1097668.BYI23_C009060(+)(PF04952)
1097668.BYI23_A005150(PF09298)
1097668.BYI23_C004010(+)(PF09298)
1097668.BYI23_C011010(+)(>)
1097668.BYI23_A011970+
1097668.BYI23_C013140+
1097668.BYI23_C013320(PF09298)
1097668.BYI23_B002180+
1097668.BYI23_A001660+
1097668.BYI23_B012020+
1097668.BYI23_A002570(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A000660+
1097668.BYI23_B001740(+)(plastid)
1097668.BYI23_A016780+
1097668.BYI23_C006380+
1097668.BYI23_A024790+
1097668.BYI23_A013000(PF00083)
1097668.BYI23_A014520+
1097668.BYI23_B004440(PF04952)
1097668.BYI23_B003490+
1097668.BYI23_A023460+
1097668.BYI23_A026150(+)(plastid)
1097668.BYI23_A011040(>)
1097668.BYI23_A022480+
1097668.BYI23_A008980+
1097668.BYI23_A024650(PF00083)
1097668.BYI23_C005220(PF02538)
1097668.BYI23_C009210+
1097668.BYI23_C005020(PF04444)
1097668.BYI23_A002550+
1097668.BYI23_B009530+
1097668.BYI23_C009680(>)
1097668.BYI23_A024910(PF00083)
1097668.BYI23_A004460(PF00083)
1097668.BYI23_A003010+
1097668.BYI23_A011930+
1097668.BYI23_C007350(>)
1097668.BYI23_A016480+
1097668.BYI23_B011560+
1097668.BYI23_B002490(PF00083)
1097668.BYI23_A006750(+)(>)
1097668.BYI23_A021150+
1097668.BYI23_C005590(PF08501)
1097668.BYI23_C008410(PF05544)
1097668.BYI23_B003720(PF04952)
1097668.BYI23_A005250+
1097668.BYI23_C007500+
1097668.BYI23_C000410+
1097668.BYI23_A018300+
1097668.BYI23_B008640+
1097668.BYI23_C002120+
1097668.BYI23_C000310(+)(PF00083)
1097668.BYI23_A019270(>)
1097668.BYI23_B005580+
1097668.BYI23_A022190+
1097668.BYI23_C012120+
1097668.BYI23_B005960+
1097668.BYI23_C008120+
1097668.BYI23_A020590+
1097668.BYI23_C005060(PF08501)
1097668.BYI23_A027060(+)(ER)
1097668.BYI23_A003200+
1097668.BYI23_A012910+
1097668.BYI23_B007860+
1097668.BYI23_A019870+
1097668.BYI23_A009180+
1097668.BYI23_A004500+
1097668.BYI23_A019640+
1097668.BYI23_A017390+
1097668.BYI23_B001530(PF08501)
1097668.BYI23_B009830+
1097668.BYI23_A010250+
1097668.BYI23_B014340(+)(>)
1097668.BYI23_A023180+
1097668.BYI23_A019070+
1097668.BYI23_A008330+
1097668.BYI23_A012420(>)
1097668.BYI23_A019810+
1097668.BYI23_B002160(PF00083)
1097668.BYI23_A006550(+)(PF00083)
1097668.BYI23_A005050+
1097668.BYI23_A009680(+)+
1097668.BYI23_B001900+
1097668.BYI23_A012840(PF01968)
1097668.BYI23_A003240+
1097668.BYI23_A007540(<)
1097668.BYI23_B004800+
1097668.BYI23_A013710(PF04444)
1097668.BYI23_A016980(>)
1097668.BYI23_C006230(+)+
1097668.BYI23_C010040+
1097668.BYI23_B007750+
1097668.BYI23_C000110+
1097668.BYI23_B010730(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A008780+
1097668.BYI23_C010210+
1097668.BYI23_C002230(PF14588)
1097668.BYI23_C013230+
1097668.BYI23_A010740(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A007640(+)(PF08501)
1097668.BYI23_B009190(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A015470+
1097668.BYI23_A015650+
1097668.BYI23_C003130(+)(PF01977)
1097668.BYI23_A010970+
1097668.BYI23_B010630(PF00083)
1097668.BYI23_C012300+
1097668.BYI23_A017480+
1097668.BYI23_B003290+
1097668.BYI23_A006480+
1097668.BYI23_C012890+
1097668.BYI23_A000080+
1097668.BYI23_A019520+
1097668.BYI23_A023190+
1097668.BYI23_A011410(>)
1097668.BYI23_C005140+
1097668.BYI23_B003000+
1097668.BYI23_A009270+
1097668.BYI23_B003470(+)plastid
1097668.BYI23_A027320+
1097668.BYI23_A005590+
1097668.BYI23_C001640(PF01968)
1097668.BYI23_C000510(+)(PF04444)
1097668.BYI23_B004120(>)
1097668.BYI23_B010610(PF00083)
1097668.BYI23_A012830(+)(PF02538)
1097668.BYI23_A007040(PF01977)
1097668.BYI23_A026060+
1097668.BYI23_B001380(+)(PF00083)
1097668.BYI23_A007380(+)(plastid)
1097668.BYI23_C008790+
1097668.BYI23_B005540(PF08501)
1097668.BYI23_B010890+
1097668.BYI23_A017190+
1097668.BYI23_B002250+
1097668.BYI23_B004700(+)(plastid)
1097668.BYI23_A014420+
1097668.BYI23_B007050(PF08501)
1097668.BYI23_A015770+
1097668.BYI23_A004090+
1097668.BYI23_B014230+
1097668.BYI23_A002660(<)
1097668.BYI23_A016450(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_B009460(<)
1097668.BYI23_B006480+
1097668.BYI23_C005210(PF01968)
1097668.BYI23_A007900+
1097668.BYI23_C003260+
1097668.BYI23_A024800+
1097668.BYI23_A026180+
1097668.BYI23_B005560(+)+
1097668.BYI23_A022750+
1097668.BYI23_C005660(PF14588)
1097668.BYI23_C001540(<)
1097668.BYI23_C000760+
1097668.BYI23_A010290+
1097668.BYI23_C013350+
1097668.BYI23_C004780+
1097668.BYI23_C000200+
1097668.BYI23_B000060+
1097668.BYI23_B004650+
1097668.BYI23_B012980+
1097668.BYI23_C013030(PF05544)
1097668.BYI23_A007750+
1097668.BYI23_A006150+
1097668.BYI23_A015550(+)(plastid)
1097668.BYI23_B009400+
1097668.BYI23_C008070(+)(PF00083)
1097668.BYI23_A023630+
1097668.BYI23_C010080+
1097668.BYI23_C004230+
1097668.BYI23_A026140+
1097668.BYI23_C010690(PF04444)
1097668.BYI23_C001050+
1097668.BYI23_C007270(PF02538)
1097668.BYI23_A022520+
1097668.BYI23_C003590+
1097668.BYI23_B013700+
1097668.BYI23_A003650+
1097668.BYI23_B014040(+)(>)
1097668.BYI23_B005450+
1097668.BYI23_C006950+
1097668.BYI23_A020730+
1097668.BYI23_C005600(PF05544)
1097668.BYI23_A010580(>)
1097668.BYI23_A011980+
1097668.BYI23_A023410(+)(PF00083)
1097668.BYI23_A008460+
1097668.BYI23_B009970(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_A006320+
1097668.BYI23_A024660+
1097668.BYI23_A001670+
1097668.BYI23_B006510+
1097668.BYI23_A024080+
1097668.BYI23_A020500+
1097668.BYI23_A011570+
1097668.BYI23_C011940+
1097668.BYI23_B009560(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_B008610+
1097668.BYI23_B005430+
1097668.BYI23_A025450+
1097668.BYI23_C000820(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_C002880(>)
1097668.BYI23_C004020+
1097668.BYI23_B013510(+)(plastid)
1097668.BYI23_A010300+
1097668.BYI23_A011960+
1097668.BYI23_A019740+
1097668.BYI23_A008220+
1097668.BYI23_B002500+
1097668.BYI23_C002280+
1097668.BYI23_C003390(+)(plastid)
1097668.BYI23_B001080(+)(PF04952)
1097668.BYI23_A015110+
1097668.BYI23_A010320+
1097668.BYI23_A002950(+)(plastid)
1097668.BYI23_A019760+
1097668.BYI23_B009240+
1097668.BYI23_A018960(>)
1097668.BYI23_A020090+
1097668.BYI23_C005580(PF05544)
1097668.BYI23_C004080(PF00083)
1097668.BYI23_C004180(PF00083)
1097668.BYI23_A011200+
1097668.BYI23_B014310+
1097668.BYI23_A002720+
1097668.BYI23_B009520+
1097668.BYI23_C004060+
1097668.BYI23_B013550+
1097668.BYI23_B011570+
1097668.BYI23_B004620+
1097668.BYI23_A025330+
1097668.BYI23_C000960+
1097668.BYI23_C010280+
1097668.BYI23_A006740+
1097668.BYI23_B015060+
1097668.BYI23_A000030+
1097668.BYI23_B001670+
1097668.BYI23_C012470+
1097668.BYI23_C000880(PF08501)
1097668.BYI23_C005680(PF01968)
1097668.BYI23_A007820(PF14588)
1097668.BYI23_A000780+
1097668.BYI23_B001330+
1097668.BYI23_C001210(PF14588)
1097668.BYI23_B002730(+)(plastid)
1097668.BYI23_B013570+
1097668.BYI23_A024960+
1097668.BYI23_B012190+
1097668.BYI23_A010050+
1097668.BYI23_C010420+
1097668.BYI23_A023360+
1097668.BYI23_B012220+
1097668.BYI23_B011880+
1097668.BYI23_B004990(>)
1097668.BYI23_A020050(PF00083)
1097668.BYI23_C012710+
1097668.BYI23_B003610(+)+
1097668.BYI23_C008440+
1097668.BYI23_C011270(PF00083)
1097668.BYI23_C003490+
1097668.BYI23_A013520+
1097668.BYI23_A014550+
1097668.BYI23_A024940+
1097668.BYI23_A027260+
1097668.BYI23_A015600+
1097668.BYI23_B008860+
1097668.BYI23_A022340(PF08501)
1097668.BYI23_A016560(+)(>)
1097668.BYI23_B012740(PF00083)
1097668.BYI23_A003520+
1097668.BYI23_C005530+
1097668.BYI23_A022660+
1097668.BYI23_A015440+
1097668.BYI23_A017620+
1097668.BYI23_B014490(+)(plastid)
1097668.BYI23_B011510(>)
1097668.BYI23_C007610+
1097668.BYI23_C003100(PF01977)
1097668.BYI23_A002330+
1097668.BYI23_C003570+
1097668.BYI23_B002170+
1097668.BYI23_C010260(+)(plastid)
1097668.BYI23_B012460PF05637
1097668.BYI23_A020010+
1097668.BYI23_C009860(>)
1097668.BYI23_A027090+
1097668.BYI23_A001270+
1097668.BYI23_C004360+
1097668.BYI23_C007280(PF01968)
1097668.BYI23_A023730+
1097668.BYI23_B006650+
1097668.BYI23_B002090+
1097668.BYI23_A015460+
1097668.BYI23_A020350+
1097668.BYI23_A016340+
1097668.BYI23_B014610+
1097668.BYI23_C012370+
1097668.BYI23_B011930(<)
1097668.BYI23_A019460+
1097668.BYI23_C003350(PF05544)
1097668.BYI23_C004380+
1097668.BYI23_C010780+
1097668.BYI23_A015250+
1097668.BYI23_A011150(>)
1097668.BYI23_B014260(+)(PF01968)
1097668.BYI23_B004760+
1097668.BYI23_B013270+
1097668.BYI23_A015400+
1097668.BYI23_C001650(PF02538)
1097668.BYI23_A018230+
1097668.BYI23_B010600+
1097668.BYI23_A019180+
1097668.BYI23_C002670(+)(plastid)
1097668.BYI23_B009640+
1097668.BYI23_C004630+
1097668.BYI23_A000890+
1097668.BYI23_A006390+
1097668.BYI23_A000170+
1097668.BYI23_A026460(+)plastid
1097668.BYI23_A003150+
1097668.BYI23_A008080+
1097668.BYI23_A019410+
1097668.BYI23_A008880(+)(mitochondrial)
1097668.BYI23_C005830(PF00083)
1097668.BYI23_B006850(+)PF05637
1097668.BYI23_A026070+
1097668.BYI23_B013230+
1097668.BYI23_A007390(<)
1097668.BYI23_A024690+
1097668.BYI23_B003030(PF04952)
1097668.BYI23_C009780(+)+
1097668.BYI23_B015090+
1097668.BYI23_A004270(>)
1097668.BYI23_A007510+
1097668.BYI23_A012800+
1097668.BYI23_C009570+
1097668.BYI23_B004710+
1097668.BYI23_C005670(PF02538)
1097668.BYI23_C010720(+)+
1097668.BYI23_A023950+
1097668.BYI23_A018400+
1097668.BYI23_A011460+
1097668.BYI23_A026050+
1097668.BYI23_A027480+
1097668.BYI23_A007150+
1097668.BYI23_B011140+
1097668.BYI23_B010230(PF00083)
1097668.BYI23_A000130+
1097668.BYI23_B002820+
1097668.BYI23_C004930(+)(<)
1097668.BYI23_A008770+
1097668.BYI23_B010840(>)
1097668.BYI23_C009550+
1097668.BYI23_C001150+
1097668.BYI23_C005870+
1097668.BYI23_C010640+
1097668.BYI23_A020470+
1097668.BYI23_A008900(+)
1097668.BYI23_A007680(+)
1097668.BYI23_B003340(+)
1097668.BYI23_A019480(+)
1097668.BYI23_A006080(+)
1097668.BYI23_C003230(+)
1097668.BYI23_A010490(+)
1097668.BYI23_B000050(+)
1097668.BYI23_B008990(+)
1097668.BYI23_B004750(+)
1097668.BYI23_B004600(+)
1097668.BYI23_A000810(+)
1097668.BYI23_B004030(+)
1097668.BYI23_C012230(+)
1097668.BYI23_B010470(+)
1097668.BYI23_A012120(+)
1097668.BYI23_A024140(+)
1097668.BYI23_A024630(+)
1097668.BYI23_A013380(+)
1097668.BYI23_B014960(+)
1097668.BYI23_A012960(+)
1097668.BYI23_C004970(+)
1097668.BYI23_B014380(+)
1097668.BYI23_B009000(+)
1097668.BYI23_A007200(+)
1097668.BYI23_C012820(+)
1097668.BYI23_C008390(+)
1097668.BYI23_C004560(+)
1097668.BYI23_B006500(+)
1097668.BYI23_A015880(+)
1097668.BYI23_A008060(+)
1097668.BYI23_B001410(+)
1097668.BYI23_A001450(+)
1097668.BYI23_A019750(+)
1097668.BYI23_B000590(+)
1097668.BYI23_C009720(+)
1097668.BYI23_B002530(+)
1097668.BYI23_A027400(+)
1097668.BYI23_A003990(+)
1097668.BYI23_A001820(+)
1097668.BYI23_B007800(+)
1097668.BYI23_B009720(+)
1097668.BYI23_B006760(+)
1097668.BYI23_A013940(+)
1097668.BYI23_C002370(+)
1097668.BYI23_B001090(+)
1097668.BYI23_C008080(+)
1097668.BYI23_C000370(+)
1097668.BYI23_A023440(+)
1097668.BYI23_B012830(+)
1097668.BYI23_B006700(+)
1097668.BYI23_A015350(+)
1097668.BYI23_C011240(+)
1097668.BYI23_C003690(+)
1097668.BYI23_A023780(+)
1097668.BYI23_A003220(+)
1097668.BYI23_B011790(+)
1097668.BYI23_A016290(+)
1097668.BYI23_A007830(+)
1097668.BYI23_A014290(+)
1097668.BYI23_B000640(+)
1097668.BYI23_B012810(+)
1097668.BYI23_A011000(+)
1097668.BYI23_C011380(+)
1097668.BYI23_A006770(+)
1097668.BYI23_B012770(+)
1097668.BYI23_A000670(+)
1097668.BYI23_A026880(+)
1097668.BYI23_A024770(+)
1097668.BYI23_B010330(+)
1097668.BYI23_A027270(+)
1097668.BYI23_C000330(+)
1097668.BYI23_B000210(+)
1097668.BYI23_B014170(+)
1097668.BYI23_B010920(+)
1097668.BYI23_A021330(+)
1097668.BYI23_A026710(+)
1097668.BYI23_A002130(+)
1097668.BYI23_B001300(+)
1097668.BYI23_C001080(+)
1097668.BYI23_B011190(+)
1097668.BYI23_A008100(+)
1097668.BYI23_A000470(+)
1097668.BYI23_B014620(+)
1097668.BYI23_B014150(+)
1097668.BYI23_C002210(+)
1097668.BYI23_B011290(+)
1097668.BYI23_C008470(+)
1097668.BYI23_B009420(+)
1097668.BYI23_A015260(+)
1097668.BYI23_A003530(+)
1097668.BYI23_B001260(+)
1097668.BYI23_A018720(+)
1097668.BYI23_A012400(+)
1097668.BYI23_A025020(+)
1097668.BYI23_C007600(+)
1097668.BYI23_B003230(+)
1097668.BYI23_A017130(+)
1097668.BYI23_B003840(+)
1097668.BYI23_C008820(+)
1097668.BYI23_B000900(+)
1097668.BYI23_C003280(+)
1097668.BYI23_A022440(+)
1097668.BYI23_B014190(+)
1097668.BYI23_A011880(+)
1097668.BYI23_A026920(+)
1097668.BYI23_B000750(+)
1097668.BYI23_A008500(+)
1097668.BYI23_A016820(+)
1097668.BYI23_A021750(+)
1097668.BYI23_B007010(+)
1097668.BYI23_A004530(+)
1097668.BYI23_C004840(+)
1097668.BYI23_B003860(+)
1097668.BYI23_B013880(+)
1097668.BYI23_A017810(+)
1097668.BYI23_C006140(+)
1097668.BYI23_A021230(+)
1097668.BYI23_A020180(+)
1097668.BYI23_C005490(+)
1097668.BYI23_A014890(+)
1097668.BYI23_A000410(+)
1097668.BYI23_A004240(+)
1097668.BYI23_A023510(+)
1097668.BYI23_B012920(+)
1097668.BYI23_A020420(+)
1097668.BYI23_A003770(+)
1097668.BYI23_A017870(+)
1097668.BYI23_C006290(+)
1097668.BYI23_A024130(+)
1097668.BYI23_A006650(+)
1097668.BYI23_C006830(+)
1097668.BYI23_B000710(+)
1097668.BYI23_A004720(+)
1097668.BYI23_A002190(+)
1097668.BYI23_A016100(+)
1097668.BYI23_A019450(+)
1097668.BYI23_A017500(+)
1097668.BYI23_A025600(+)
1097668.BYI23_A021630(+)
1097668.BYI23_C008220(+)
1097668.BYI23_B014930(+)
1097668.BYI23_A016590(+)
1097668.BYI23_A008700(+)
1097668.BYI23_C012490(+)
1097668.BYI23_B007070(+)
1097668.BYI23_A009880(+)
1097668.BYI23_B009940(+)
1097668.BYI23_A003840(+)
1097668.BYI23_C001960(+)
1097668.BYI23_A011470(+)
1097668.BYI23_B010440(+)
1097668.BYI23_A001690(+)
1097668.BYI23_A027470(+)
1097668.BYI23_A011800(+)
1097668.BYI23_A018600(+)
1097668.BYI23_C013290(+)
1097668.BYI23_B001220(+)
1097668.BYI23_B010580(+)
1097668.BYI23_B010850(+)
1097668.BYI23_B000840(+)
1097668.BYI23_B006870(+)
1097668.BYI23_A023900(+)
1097668.BYI23_A003310(+)
1097668.BYI23_C008480(+)
1097668.BYI23_A019530(+)
1097668.BYI23_A006130(+)
1097668.BYI23_A006420(+)
1097668.BYI23_A021440(+)
1097668.BYI23_A017750(+)
1097668.BYI23_A002420(+)
1097668.BYI23_B004020(+)
1097668.BYI23_A023920(+)
1097668.BYI23_B008530(+)
1097668.BYI23_A003330(+)
1097668.BYI23_A024600(+)
1097668.BYI23_A001650(+)
1097668.BYI23_B002400(+)
1097668.BYI23_B002540(+)
1097668.BYI23_A015070(+)
1097668.BYI23_B015390(+)
1097668.BYI23_A005140(+)
1097668.BYI23_B011380(+)
1097668.BYI23_A014200(+)
1097668.BYI23_B000610(+)
1097668.BYI23_A022100(+)
1097668.BYI23_B011240(+)
1097668.BYI23_A008070(+)
1097668.BYI23_A016220(+)
1097668.BYI23_B009690(+)
1097668.BYI23_C009010(+)
1097668.BYI23_B011010(+)
1097668.BYI23_B009410(+)
1097668.BYI23_C001010(+)
1097668.BYI23_A021830(+)
1097668.BYI23_B005220(+)
1097668.BYI23_B011820(+)
1097668.BYI23_A025840(+)
1097668.BYI23_A017470(+)
1097668.BYI23_A001850(+)
1097668.BYI23_A002560(+)
1097668.BYI23_B001730(+)
1097668.BYI23_C010360(+)
1097668.BYI23_B005410(+)
1097668.BYI23_A020950(+)
1097668.BYI23_C005930+
1097668.BYI23_A001130(+)
1097668.BYI23_B010340(+)
1097668.BYI23_C003090(+)
1097668.BYI23_A023450(+)
1097668.BYI23_A022320(+)
1097668.BYI23_A025860(+)
1097668.BYI23_A013970(+)not used
1097668.BYI23_A001090(+)
1097668.BYI23_C001750(+)
1097668.BYI23_B010560(+)
1097668.BYI23_B008650(+)
1097668.BYI23_A017200(+)
1097668.BYI23_A016260(+)
1097668.BYI23_C006240(+)
1097668.BYI23_C001230(+)
1097668.BYI23_A000570(+)
1097668.BYI23_B015250(+)
1097668.BYI23_C011390(+)
1097668.BYI23_B002480(+)
1097668.BYI23_B003280(+)
1097668.BYI23_A020210(+)
1097668.BYI23_B003750(+)
1097668.BYI23_B004360(+)
1097668.BYI23_A003210(+)
1097668.BYI23_A019590(+)
1097668.BYI23_C006480(+)
1097668.BYI23_A021530(+)
1097668.BYI23_B010930(+)
1097668.BYI23_C011960(+)
1097668.BYI23_C000940(+)
1097668.BYI23_A003900(+)
1097668.BYI23_A009110(+)
1097668.BYI23_B011180(+)
1097668.BYI23_B002110(+)
1097668.BYI23_B010910(+)
1097668.BYI23_A006780(+)
1097668.BYI23_A024520(+)
1097668.BYI23_C007110(+)
1097668.BYI23_A019000(+)
1097668.BYI23_A018710(+)
1097668.BYI23_B009140(+)
1097668.BYI23_A026560(+)
1097668.BYI23_A012410(+)
1097668.BYI23_A007140(+)
1097668.BYI23_A025660(+)
1097668.BYI23_C012170(+)
1097668.BYI23_A013280(+)
1097668.BYI23_B001680(+)
1097668.BYI23_A000040(+)
1097668.BYI23_C005190(+)
1097668.BYI23_C005770(+)
1097668.BYI23_C003290(+)
1097668.BYI23_B012280(+)
1097668.BYI23_B003200(+)
1097668.BYI23_C002860(+)
1097668.BYI23_B014840(+)
1097668.BYI23_B001980(+)
1097668.BYI23_C000710(+)
1097668.BYI23_A023710(+)
1097668.BYI23_B000170(+)
1097668.BYI23_B008360(+)
1097668.BYI23_A012450(+)
1097668.BYI23_A025070(+)
1097668.BYI23_C009120(+)
1097668.BYI23_C008740(+)
1097668.BYI23_B009790(+)
1097668.BYI23_A027350(+)
1097668.BYI23_A004230(+)
1097668.BYI23_B008770(+)
1097668.BYI23_B008110(+)
1097668.BYI23_A022900(+)
1097668.BYI23_A013130(+)
1097668.BYI23_B006370(+)
1097668.BYI23_A005000(+)
1097668.BYI23_A020410(+)
1097668.BYI23_C004850(+)
1097668.BYI23_B012320(+)
1097668.BYI23_A011130(+)
1097668.BYI23_B005550(+)
1097668.BYI23_A006250(+)
1097668.BYI23_A005930(+)
1097668.BYI23_A015210(+)
1097668.BYI23_B003810(+)
1097668.BYI23_C007990(+)
1097668.BYI23_C011720(+)
1097668.BYI23_A014350(+)
1097668.BYI23_B004150(+)
1097668.BYI23_A010980(+)
1097668.BYI23_A022940(+)
1097668.BYI23_A003720(+)
1097668.BYI23_B003520(+)
1097668.BYI23_C011090(+)
1097668.BYI23_B009470(+)
1097668.BYI23_A006600(+)
1097668.BYI23_A009950(+)
1097668.BYI23_C003210(+)
1097668.BYI23_C000230(+)
1097668.BYI23_A015020(+)
1097668.BYI23_A010470(+)
1097668.BYI23_B009590(+)
1097668.BYI23_A022210(+)
1097668.BYI23_C006650(+)
1097668.BYI23_B013160(+)
1097668.BYI23_A001740(+)
1097668.BYI23_C012860(+)
1097668.BYI23_C009330(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 0.4 (4/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 2.75 (22/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================